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四种de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较
被引量：
1
1
作者
刘宗林
许金山
周泽扬
《蚕学通讯》
2012年第3期1-5,共5页
柞蚕是一类以柞树叶为食料的经济类吐丝结茧昆虫,柞蚕微孢子是寄生在柞蚕体内的一种微孢子虫,是柞蚕微粒子病的病原,其主要通过食下传染或者母体传染来感染柞蚕。目前在分子水平上对柞蚕微孢子虫的研究还很少,本研究通过比较分析四种常...
柞蚕是一类以柞树叶为食料的经济类吐丝结茧昆虫,柞蚕微孢子是寄生在柞蚕体内的一种微孢子虫,是柞蚕微粒子病的病原,其主要通过食下传染或者母体传染来感染柞蚕。目前在分子水平上对柞蚕微孢子虫的研究还很少,本研究通过比较分析四种常见的de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组的组装,结果显示不同的软件组装的结果相差甚远,由此表明由于柞蚕基因组本身结构的特殊性及组装软件的针对性,导致了组装质量的差异性。本研究对于今后昆虫微孢子虫基因组的组装软件的选择优化提供了重要的参考。
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关键词
微粒子病
柞蚕微孢子虫
de
novo
组装
基因组
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职称材料
题名
四种de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较
被引量：
1
1
作者
刘宗林
许金山
周泽扬
机构
重庆师范大学重庆市动物生物学重点实验室
重庆师范大学活性物质生物技术教育部工程研究中心
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
出处
《蚕学通讯》
2012年第3期1-5,共5页
基金
国家863项目(2012AA101301-3)
国家自然科学基金项目(No.31001037)
教育部科学技术重点项目(No.210180)
文摘
柞蚕是一类以柞树叶为食料的经济类吐丝结茧昆虫,柞蚕微孢子是寄生在柞蚕体内的一种微孢子虫,是柞蚕微粒子病的病原,其主要通过食下传染或者母体传染来感染柞蚕。目前在分子水平上对柞蚕微孢子虫的研究还很少,本研究通过比较分析四种常见的de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组的组装,结果显示不同的软件组装的结果相差甚远,由此表明由于柞蚕基因组本身结构的特殊性及组装软件的针对性,导致了组装质量的差异性。本研究对于今后昆虫微孢子虫基因组的组装软件的选择优化提供了重要的参考。
关键词
微粒子病
柞蚕微孢子虫
de
novo
组装
基因组
Keywords
pebrine
nosema
antheraeae
de
novo
assembly
genome
分类号
S885.1 [农业科学—特种经济动物饲养]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
四种de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较
刘宗林
许金山
周泽扬
《蚕学通讯》
2012
1
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