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胃癌患者血浆PAX5和RNF180基因甲基化情况及其临床意义 被引量:5
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作者 谭智军 赵玉国 肖晓艳 《中华实用诊断与治疗杂志》 2021年第6期584-587,共4页
目的观察胃癌患者血浆配对盒蛋白5(paired box protein 5,PAX5)与环指蛋白180(ring finger protein 180,RNF180)基因甲基化情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法110例胃癌患者为胃癌组,同期体检健康者50例为对照组,采用甲基化... 目的观察胃癌患者血浆配对盒蛋白5(paired box protein 5,PAX5)与环指蛋白180(ring finger protein 180,RNF180)基因甲基化情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法110例胃癌患者为胃癌组,同期体检健康者50例为对照组,采用甲基化特异性PCR法检测血浆PAX5与RNF180基因甲基化状态,分析其与胃癌患者临床病理特征的关系。随访3年,采用Kaplan-Meier生存曲线分析PAX5、RNF180甲基化与患者预后的关系。结果胃癌患者血浆PAX5、RNF180基因启动子区甲基化发生率(70.00%、62.73%)高于对照组(32.00%、30.00%)(P<0.05),胃癌组TNM分期Ⅰ~Ⅱ期患者血浆PAX5、RNF180基因甲基化发生率(65.17%、57.30%)低于TNM分期Ⅲ~Ⅳ期患者(90.48%、85.71%)(P<0.05),胃癌组男性与女性、年龄<55岁与≥55岁、肿瘤直径<2.5 cm与≥2.5 cm、细胞低-中分化与高分化及有无淋巴结转移患者血浆PAX5、RNF180基因甲基化发生率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。发生PAX5基因甲基化的胃癌患者3年生存率(68.83%)低于未发生甲基化患者(84.85%)(P<0.05),发生RNF180基因甲基化的胃癌患者3年总体生存率(73.91%)与未发生甲基化胃癌患者(73.17%)比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论胃癌患者血浆PAX5与RNF180基因甲基化发生率增高,与肿瘤TNM分期有关,发生PAX5基因甲基化的患者3年总生存率低。 展开更多
关键词 胃癌 pax5基因 RNF180基因 DNA甲基化 生存率
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湘西黄牛Myf5和Pax7基因的SNPs检测及其与体尺性状的关联分析 被引量:5
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作者 王兴平 罗仍卓么 +2 位作者 李峰 李德才 都鑫 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1531-1537,共7页
本研究旨在检测湘西黄牛Myf5和Pax7基因的单核苷酸多态性(SNP),探讨湘西黄牛多态性位点的群体遗传特征,寻找与生长发育相关的分子标记。采用PCR和直接测序技术筛查湘西黄牛Myf5基因第2内含子和Pax7基因第3外显子的SNPs;以217头湘西黄牛... 本研究旨在检测湘西黄牛Myf5和Pax7基因的单核苷酸多态性(SNP),探讨湘西黄牛多态性位点的群体遗传特征,寻找与生长发育相关的分子标记。采用PCR和直接测序技术筛查湘西黄牛Myf5基因第2内含子和Pax7基因第3外显子的SNPs;以217头湘西黄牛为研究对象,采用PCR-RFLP方法对群体进行遗传多态性分析,运用最小二乘线性模型进行基因型与体尺性状的关联分析。结果表明,在湘西黄牛Myf5基因第2内含子中检测到9个SNPs,其中7个是本研究新发现的SNPs;在Pax7基因第3外显子检测到1个SNP。群体遗传多态性分析结果显示,湘西黄牛群体中Myf5基因g.1948A>G位点的AA、AG和GG基因型频率分别为0.046 1、0.235 0和0.718 9;A和G等位基因频率分别为0.163 6和0.836 4。Pax7基因g.31G>A位点只检测到AG和GG 2种基因型,基因型频率分别为0.073 7和0.926 3;A和G等位基因频率分别为0.036 9和0.963 1。这2个位点均处于低度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,Myf5基因g.1948A>G位点的AA和AG型个体的体重显著高于GG型个体的体重(P<0.05),A等位基因对体重为正效应;而各基因型间的体高、体长和胸围的差异均不显著(P>0.05)。结果提示,湘西黄牛Myf5基因的SNP位点较多,g.1948A>G位点可能为湘西黄牛体重性状的分子遗传标记位点。 展开更多
关键词 湘西黄牛 Myf5基因 pax7基因 单核苷酸多态性 体尺性状
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血浆PAX5、SEPT9和WIF-1基因启动子甲基化在原发性胃癌中的诊断价值
3
作者 朱磊磊 朱冰 +3 位作者 管佳佳 骆杰 杭群 傅军 《中华普通外科学文献(电子版)》 CAS 2023年第4期288-292,共5页
目的通过测定胃癌患者血浆中细胞内游离DNA中PAX5、SEPT9和WIF-1基因启动子的甲基化情况,分析它们与胃癌疾病特征间的联系,并探讨三种基因启动子甲基化在筛查原发性胃癌中的协同检测功能。方法利用巢氏甲基化特异性PCR技术(MDA-nMSP)检... 目的通过测定胃癌患者血浆中细胞内游离DNA中PAX5、SEPT9和WIF-1基因启动子的甲基化情况,分析它们与胃癌疾病特征间的联系,并探讨三种基因启动子甲基化在筛查原发性胃癌中的协同检测功能。方法利用巢氏甲基化特异性PCR技术(MDA-nMSP)检测2020年12月至2021年12月收治的81例胃癌患者(胃癌组)血液样本中的PAX5、SEPT9和WIF-1基因启动子的甲基化率。另选取同期年龄构成相似的39名健康者作为对照组,比较两组各基因甲基化率的差异,并通过受试者工作特征(ROC)曲线评估血浆甲基化PAX5、SEPT9和WIF-1对胃癌的预测价值。结果胃癌组血浆PAX5、SEPT9及WIF-1甲基化率分别为38.3%、34.6%、46.9%,高于对照组的7.7%、10.3%、5.1%,差异均有统计学意义(χ2=12.123、7.956、20.683,均P<0.01)。PAX5和WIF-1基因启动子甲基化的发生与患者年龄相关(P<0.05),SEPT9基因启动子甲基化的发生与肿瘤大小相关(P<0.05)。作为诊断靶点,甲基化PAX5诊断胃癌的敏感度为38.27%,特异度为92.31%,曲线下面积(AUC)为0.653;SEPT9分别为34.57%、89.74%、0.622,WIF-1分别为46.91%、94.87%、0.709,三者联合诊断胃癌的敏感度、特异度分别为61.73%(95%CI:50.3%~72.3%)、84.62%(95%CI:69.5%~94.1%),AUC为0.732(95%CI:0.653~0.810)。结论原发性胃癌患者血浆PAX5、SEPT9和WIF-1基因启动子甲基化率较高,三种甲基化基因联合诊断胃癌的特异度与单一基因诊断相似,但敏感度有较大提升,有望成为新的胃癌检测基因组合。 展开更多
关键词 胃肿瘤 甲基化 肿瘤抑制基因 pax5 SEPT9 WIF-1
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2-甲氧基雌二醇诱导骨髓瘤细胞分化的分子机制研究 被引量:2
4
作者 高巍然 侯健 熊红 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期598-601,共4页
目的研究2-甲氧基雌二醇(2ME2)诱导骨髓瘤细胞系分化的分子机制。方法应用细胞形态学方法、流式细胞术分析、ELISA法和RT-PCR方法,观察2ME2对于骨髓瘤细胞系LP-1、CZ-1、NCI-H929细胞分化的影响,同时检测细胞分化时X盒结合蛋白1(XBP-1)m... 目的研究2-甲氧基雌二醇(2ME2)诱导骨髓瘤细胞系分化的分子机制。方法应用细胞形态学方法、流式细胞术分析、ELISA法和RT-PCR方法,观察2ME2对于骨髓瘤细胞系LP-1、CZ-1、NCI-H929细胞分化的影响,同时检测细胞分化时X盒结合蛋白1(XBP-1)mRNA的改变情况。继而采用XBP-1、Blimp-1、pax-5硫代反义寡核苷酸(ASODN)作为干预手段,观察其对于2ME2诱导骨髓瘤细胞系分化作用的影响及mRNA水平的变化。结果2ME2可诱导骨髓瘤细胞系LP-1、CZ-1、NCI-H929细胞向成熟阶段分化,伴随着细胞分化的过程XBP-1mRNA的表达水平上调。XBP-1ASODN和Blimp-1ASODN可以部分抑制2ME2促骨髓瘤细胞系分化作用,而pax-5ASODN可以加强2ME2促骨髓瘤细胞系分化作用。经pax-5ASODN作用72h,经形态学观察,细胞向成熟阶段分化,表现为细胞胞核缩小,胞浆丰富,核浆比例下降,核仁减少或消失,核染色质变粗、变密;细胞表面标志CD49e表达率增高;同时细胞分泌轻链蛋白升高。经Blimp-1ASODN作用72h后,pax-5mRNA水平显著升高;而XBP-1mRNA水平下降。结论2ME2可诱导骨髓瘤细胞系LP-1、CZ-1、NCI-H929细胞向成熟阶段分化,伴随着细胞的分化XBP-1mRNA的表达水平上调。Blimp-1可通过抑制pax-5mRNA的表达上调XBP-1mRNA的表达水平,促进骨髓瘤细胞分化。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 雌二醇 基因 XBP-1 Blimp-1 pax-5 细胞系 寡核苷酸类 反义 细胞分化 骨髓瘤细胞系 2-甲氧基雌二醇 分子机制
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人类pax-5基因外显子1B的5′侧翼区碱基序列分析(英文)
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作者 刘茂林 Mizanur Rahman +1 位作者 平林泰彦 佐佐木毅 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2002年第2期100-103,共4页
pax 5基因是B细胞生成和B细胞发育中的重要转录因子。为了更好的理解 pax 5基因表达的调节机制 ,对 pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区进行了分离克隆及序列测定。整段碱基序列 (6 6 71bp)分析表明 ,无TATAbox共同序列存在 ,近侧启动子包... pax 5基因是B细胞生成和B细胞发育中的重要转录因子。为了更好的理解 pax 5基因表达的调节机制 ,对 pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区进行了分离克隆及序列测定。整段碱基序列 (6 6 71bp)分析表明 ,无TATAbox共同序列存在 ,近侧启动子包括 3CATboxs,1SP1和 1Ebox ,上游进一步推测的调节位点显示 6LMO2 COM ,5NFAT ,2LPOLYA B ,3GATA1,2AP4 ,10MZF1,1ETS1 B ,1GATA3,1NKX2 5 ,2RORA1,1LYF1,2Ikaros2 ,2TCF11,1GATA C和 1FREAC7,并确定在序列上。因此 ,pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区与 pax 5表达的调节有关 。 展开更多
关键词 pax-5基因 pax-5外显子1B 5′侧翼区序列 碱基序列分析 B细胞
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全外显子组测序技术对两个眼前节发育不良家系致病基因检测 被引量:2
6
作者 王凯 张丹 +3 位作者 郝朋 王犁明 李宁东 李轩 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2017年第3期235-238,243,共5页
目的筛查两个眼前节发育不良(anterior segment dysgenesis,ASD)家系的致病基因突变。方法对2个来自河北和河南的ASD家系进行分析。在获得受检者同意后,对家系成员进行详细的眼科检查,采集外周静脉血,提取全基因组DNA。依据测序需求选... 目的筛查两个眼前节发育不良(anterior segment dysgenesis,ASD)家系的致病基因突变。方法对2个来自河北和河南的ASD家系进行分析。在获得受检者同意后,对家系成员进行详细的眼科检查,采集外周静脉血,提取全基因组DNA。依据测序需求选取家系1中2例患者及1名正常对照、家系2中1例患者及1名正常对照进行全外显子组测序,对测序结果筛选候选基因,运用Sanger测序进行验证。利用Poly Phen-2,SIFT Human Splicing Finder软件进行突变危害性预测。结果家系1连续3代均有患者发病,符合常染色体显性遗传特征,9例患者有均不同程度的双眼ASD。得到13个SNV和55个In Del候选突变,在候选基因PAX6中,家系1发现一已知错义突变c.T2A(p.M1K);家系2中共8名成员,其中2例患者,在测序中发现一已知剪切位点突变c.357+1g>c。3个预测软件作出危害性预测。结论外显子测序技术快速检测出PAX6基因中T2A(p.M1K)和c.357+1g>c突变,并确定其为ASD的致病突变。 展开更多
关键词 全外显子组测序 眼前节发育不良 pax6基因
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Pax5基因在野生型斑马鱼全胚胎发育早期的表达 被引量:1
7
作者 姚冬静 舒莉萍 +3 位作者 何志旭 马建娟 李涛 黄惠敏 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期21-25,共5页
目的为了深入了解在胚胎发育过程中,尤其是在早期B淋巴细胞的生成和中脑的发育过程中pax5基因可能的作用及其机制,选择斑马鱼作为实验动物,构建野生型斑马鱼pCS2+-pax5重组质粒,并观察pax5基因在野生型斑马鱼胚胎中的表达。方法提取斑... 目的为了深入了解在胚胎发育过程中,尤其是在早期B淋巴细胞的生成和中脑的发育过程中pax5基因可能的作用及其机制,选择斑马鱼作为实验动物,构建野生型斑马鱼pCS2+-pax5重组质粒,并观察pax5基因在野生型斑马鱼胚胎中的表达。方法提取斑马鱼胚胎总RNA后经RT-PCR克隆斑马鱼pax5基因片段,将得到的pax5基因片段和pCS2+质粒经EcoRⅠ、XbaⅠ双酶切后,在T4DNA连接酶的作用下插入pCS2+质粒中,通过对重组质粒进行双酶切、菌落PCR以及插入片段序列测定鉴定后,经T3RNA体外转录体系合成地高辛标记的pax5基因的反义mRNA探针。将得到的探针用全胚胎原位杂交技术检测pax5基因在斑马鱼早期发育过程中的表达。结果成功构建pCS2+-pax5重组质粒并制备了pax5基因的反义mRNA探针,通过斑马鱼原位杂交技术,发现在斑马鱼受精后18~72小时(18~72hpf)胚胎头部的小脑、中脑后脑交界处均可观察到pax5基因阳性杂交信号;在24~72hpf胚胎的耳蜗均可观察到pax5基因的阳性杂交信号,且随着时相的增长其表达逐渐增多;在18~48hpf胚胎的脊索部位可见pax5基因的阳性杂交信号。结论明确了pax5基因在斑马鱼胚胎的脑部、脊索神经系统高表达,并首次证实其在耳蜗听神经的早期发育过程中有表达,可能对斑马鱼早期胚胎神经系统的发育起着某些至关重要的作用。 展开更多
关键词 斑马鱼 pCS2+载体 pax5基因 反义mRNA 原位杂交
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伴有9p异常的急性B淋巴细胞白血病患者PAX5基因重排及缺失的研究 被引量:1
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作者 郑积富 董莎莎 +3 位作者 王谦 潘金兰 陈苏宁 仇惠英 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期549-552,共4页
目的探讨PAX5基因重排或缺失在伴有9p异常[abnormalities at chromosome 9p,abn(9p)]成人急性B淋巴细胞白血病(B—lineage acute lymphoblastic leukemia,B-ALL)中的发生情况及临床意义。方法选取横跨PAX5基因的RP11-344823和RP11... 目的探讨PAX5基因重排或缺失在伴有9p异常[abnormalities at chromosome 9p,abn(9p)]成人急性B淋巴细胞白血病(B—lineage acute lymphoblastic leukemia,B-ALL)中的发生情况及临床意义。方法选取横跨PAX5基因的RP11-344823和RP11—652D9克隆,常规抽提DNA,采用缺口平移法标记荧光素,应用荧光原位杂交技术对50例伴有abn(9p)异常的BALL患者进行PAX5基因重排或缺失的筛选,并分析其临床及实验室特征。结果50例伴有abn(9p)异常的B-ALL患者中,PAX5完全缺失的患者有23例(46%),PAX5部分缺失的患者有2例(4%),PAX5基因易位1例(2%),总的异常率为52%(26/50)。PAX5重排或缺失组患者与PAX5正常组患者的主要临床特征的差异无统计学意义。结论abn(9p)的B-ALL患者中PAX5缺失或重排的发生率为52%,PAX5异常患者(26例)与PAX5检测正常患者(24例)之间生物学特征无显著差异。 展开更多
关键词 急性B淋巴细胞白血病 pax5基因 9p异常
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转录因子PAX5对多发性骨髓瘤细胞IM9的抗凋亡及促增生作用
9
作者 傅杰 王旻实 肖卫华 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期886-890,共5页
目的:应用DNA介导的RNA干扰技术使核转录因子PAX5基因沉默,观察PAX5对下游基因调节以及细胞增殖和抗凋亡的影响。方法:筛选高表达PAX5的肿瘤细胞株。构建针对PAX5的siRNA表达载体并转染入多发性骨髓瘤细胞IM9,筛选稳转细胞系。RT-PCR分... 目的:应用DNA介导的RNA干扰技术使核转录因子PAX5基因沉默,观察PAX5对下游基因调节以及细胞增殖和抗凋亡的影响。方法:筛选高表达PAX5的肿瘤细胞株。构建针对PAX5的siRNA表达载体并转染入多发性骨髓瘤细胞IM9,筛选稳转细胞系。RT-PCR分析PAX5敲低细胞中p53、XBP-1和c-Myc等重要基因表达水平的影响,同时用MTT和流式分析分别检测细胞增殖和细胞凋亡率。结果:PAX5在多发性骨髓瘤细胞株IM9中特异性表达,而KAS6和前列腺癌细胞DU145和PC3中没有表达。利用RNA干扰技术敲低IM9细胞中PAX5,不仅可使p53、XBP-1的表达增加,同时观察到c-Myc的表达下降。MTT实验证实PAX5基因沉默的IM9细胞增殖速率明显低于对照组细胞,同时对5-FU的药物敏感性增加。结论:PAX5在多发性骨髓瘤细胞株IM9中特异性的表达,并可促进肿瘤的生长和抗药性。本研究中进一步发现,PAX5除可调节p53和XBP-1基因的表达,c-Myc的表达也随PAX5敲低而下降,提示PAX5有可能直接参与c-Myc的转录调节并在肿瘤发生中起到作用。 展开更多
关键词 转录因子pax5 RNA干扰 P53基因 多发性骨髓瘤 C-MYC基因
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人类Pax-5基因外显子1B的5'侧翼区碱基序列分析
10
作者 刘茂林 Mizanur Rahman +1 位作者 平林泰彦 佐佐木毅 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期318-321,共4页
目的:探讨Pax- 5基因表达在B细胞分化发育的调节机制。方法:利用分子克隆及亚克隆技术对Pax-5基因外显子1B的5’侧翼区分离克隆。用双链双脱氧终止法进行核苷酸序列测定,并对侧序资料进行序列程序分析。结果:整段碱基序列(6671 hp... 目的:探讨Pax- 5基因表达在B细胞分化发育的调节机制。方法:利用分子克隆及亚克隆技术对Pax-5基因外显子1B的5’侧翼区分离克隆。用双链双脱氧终止法进行核苷酸序列测定,并对侧序资料进行序列程序分析。结果:整段碱基序列(6671 hp)分析表明:无TATA盒共同序列存在,近段启动子包括3个CAT盒,1个SP1和1个E盒;上游进一步推测的调节位点显示6个LMO2COM,5个NFAT,2个LPOLYA-B,3个GATA1,2个AP4,10个AZF1,1个ETS1-B,1个GATA3,1个NKX25,2个RORA1,1个LYFI,2个Ikaros2,2个ICF11,1个GATA-C和1个FREAC7确定在序列上。结论:Pax-5基因外显子1B的5’侧翼区与Pax-5表达的调节有关,且对保证B细胞谱系和B细胞发育起重要调节作用。 展开更多
关键词 pax-5基因 5′侧翼区序列 启动子 推测调节位点 基因表达
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