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氧化应激状态下心肌细胞中长链非编码RNA的差异表达谱分析
被引量:
2
1
作者
李哲
刘子倩
+2 位作者
王胤
曾焕玉
李培峰
《青岛大学学报(自然科学版)》
CAS
2021年第4期9-15,共7页
为了寻找氧化应激状态下与心脏疾病有关的lncRNA,采用基因芯片法对正常心肌细胞和H2O2诱导的心肌细胞进行lncRNA和mRNA表达图谱分析,通过基因本体论和通路分析探索差异表达基因的功能,构建lncRNA和mRNA共表达网络,从差异表达的lncRNA中...
为了寻找氧化应激状态下与心脏疾病有关的lncRNA,采用基因芯片法对正常心肌细胞和H2O2诱导的心肌细胞进行lncRNA和mRNA表达图谱分析,通过基因本体论和通路分析探索差异表达基因的功能,构建lncRNA和mRNA共表达网络,从差异表达的lncRNA中选取10组上调和10组下调差异显著的lncRNA进行RT-qPCR验证。研究结果表明,在正常心肌细胞和氧化应激下的心肌细胞中,lncRNA和mRNA的表达均有差异,在差异上调显著的10组lncRNA中,RT-qPCR检测结果与芯片结果一致,这表示它们可能是心脏疾病的潜在治疗靶点。
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关键词
芯片分析
lncRNA
基因本体论分析
通路分析
共表达网络
RT-QPCR
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职称材料
题名
氧化应激状态下心肌细胞中长链非编码RNA的差异表达谱分析
被引量:
2
1
作者
李哲
刘子倩
王胤
曾焕玉
李培峰
机构
青岛大学基础医学院转化医学研究院
出处
《青岛大学学报(自然科学版)》
CAS
2021年第4期9-15,共7页
基金
国家自然科学基金海外青年基金(批准号:82050410450、81850410551)资助
山东省自然科学基金(批准号:ZR2019BH014)资助。
文摘
为了寻找氧化应激状态下与心脏疾病有关的lncRNA,采用基因芯片法对正常心肌细胞和H2O2诱导的心肌细胞进行lncRNA和mRNA表达图谱分析,通过基因本体论和通路分析探索差异表达基因的功能,构建lncRNA和mRNA共表达网络,从差异表达的lncRNA中选取10组上调和10组下调差异显著的lncRNA进行RT-qPCR验证。研究结果表明,在正常心肌细胞和氧化应激下的心肌细胞中,lncRNA和mRNA的表达均有差异,在差异上调显著的10组lncRNA中,RT-qPCR检测结果与芯片结果一致,这表示它们可能是心脏疾病的潜在治疗靶点。
关键词
芯片分析
lncRNA
基因本体论分析
通路分析
共表达网络
RT-QPCR
Keywords
microarray
lncRNA
Go
analysis
pathaway
analysis
co-expression
network
RT-qPCR
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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被引量
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1
氧化应激状态下心肌细胞中长链非编码RNA的差异表达谱分析
李哲
刘子倩
王胤
曾焕玉
李培峰
《青岛大学学报(自然科学版)》
CAS
2021
2
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参考文献
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