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柑桔溃疡病菌滚环扩增检测体系的建立 被引量:23
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作者 黄冠军 殷幼平 +4 位作者 张仑 李小焦 葛建军 陈洪俊 王中康 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期375-379,共5页
根据柑桔溃疡病菌(Xanthomonas axonopodis pv.citri,Xac)独有的蛋白基因序列和锁式探针公共连接序列分别设计特异性的锁式探针及其扩增引物,优化系列反应条件,建立了特异性的柑桔溃疡病菌滚环扩增体系。初步检测结果表明该体系能够特... 根据柑桔溃疡病菌(Xanthomonas axonopodis pv.citri,Xac)独有的蛋白基因序列和锁式探针公共连接序列分别设计特异性的锁式探针及其扩增引物,优化系列反应条件,建立了特异性的柑桔溃疡病菌滚环扩增体系。初步检测结果表明该体系能够特异性地检出Xac的菌体细胞及其DNA,而检测不出供试的其它植物病原细菌和柑桔叶面常见的多种附生细菌;对Xac靶片段克隆质粒DNA的检测灵敏度为102copy/μL,对Xac菌悬液的检测灵敏度为20cfu/μL,比常规PCR的检测灵敏度稍高。用滚环扩增技术和常规PCR技术对田间采集的实际样品进行了检测,两种方法的检测结果没有显著差异(P>0.01)。由于锁式探针的公共连接序列对扩增的条件要求一致,本体系的建立可以为植物病原微生物多靶标检测和病害检疫检验提供新的技术支撑。 展开更多
关键词 柑桔溃疡病菌 锁式探针 滚环扩增 多靶标检测
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HRCA技术在转基因植物检测中的应用 被引量:15
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作者 陶震 蔡兴锋 +3 位作者 颜志强 胡小波 杨胜利 龚毅 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期294-300,共7页
超分支滚环扩增技术 (Hyperbranchedrollingcycleamplification ,HRCA)在近几年中逐渐引起人们的注意 ,并越来越多的用于基础研究和实际检测中。在本文中我们对该技术在转基因植物检测中的应用情况作了较全面的探索 ;根据 4种转基因植... 超分支滚环扩增技术 (Hyperbranchedrollingcycleamplification ,HRCA)在近几年中逐渐引起人们的注意 ,并越来越多的用于基础研究和实际检测中。在本文中我们对该技术在转基因植物检测中的应用情况作了较全面的探索 ;根据 4种转基因植物中常用的外源基因或DNA片段设计了 4条锁式探针 (Padlockprobe) ,利用质粒pKK2 32 8中的一段序列作为锁式探针中的共同连接部分 ,并根据该共同的连接部分序列设计一对通用的HRCA引物 ;利用同位素标记的锁式探针对HRCA反应中的连接一步的特异性研究表明 ,只有当锁式探针和相应的检测靶DNA同时存在于连接体系中时 ,锁式探针才能被有效地进行连接 ,从线性分子变为环型分子 ,在没有相应靶DNA存在时锁式探针仅以线性形式存在 ;连接时间的研究表明 ,如果所检测的靶DNA是质粒或较短的DNA片段时 ,较短的连接时间 (5~ 10min)就可以取得理想的最终检测效果 ,如果检测的靶DNA是复杂的植物基因组DNA时 ,连接时间需要较大程度的延长 (30~ 6 0min)才能取得理想的最终检测结果 ;HRCA的反应时间研究表明 ,较长的反应时间可以明显增加最终产物的量 ;对BstDNA聚合酶大片段酶用量的研究表明 ,在其它条件不变的情况下酶的用量可以在较大的范围内变化 (0 .5u~ 4u)而不影响最终检测结果 ;? 展开更多
关键词 HRCA技术 转基因植物 检测 锁式探针
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基于锁式探针的番茄溃疡病菌实时荧光PCR快速检测 被引量:10
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作者 王念武 王婷 +1 位作者 沈建国 胡方平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期903-911,共9页
【目的】从口岸进境番茄种子中检测番茄溃疡病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,CMM),一直以来都受检测周期的限制,快速、特异地从种子中检测该病原细菌需要新的方法。研究在锁式探针扩增方式上,选择连接酶依赖的PCR... 【目的】从口岸进境番茄种子中检测番茄溃疡病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,CMM),一直以来都受检测周期的限制,快速、特异地从种子中检测该病原细菌需要新的方法。研究在锁式探针扩增方式上,选择连接酶依赖的PCR扩增方式,并结合实时荧光PCR技术,旨在建立番茄溃疡病菌基于锁式探针技术的实时荧光PCR快速检测方法,为口岸番茄种子快速检疫提供技术支持。【方法】根据番茄溃疡病菌的一段特异基因Pat-1序列,设计锁式探针的T1和T2臂,使之与CMM的特异性片段碱基序列互补,再按照锁式探针的设计原则设计锁式探针和扩增引物以及荧光探针。试验时,先将锁式探针与CMM以及参照菌株的DNA模板在DNA连接酶作用下分别进行环化连接,再用核酸外切酶Ⅰ和核酸外切酶Ⅲ消化未环化的线性锁式探针,最后以环化的锁式探针为模板,在扩增引物的作用下进行实时荧光PCR试验。建立CMM基于锁式探针技术的实时荧光PCR检测方法,分别比较该方法的特异性和灵敏度与常规PCR方法的差异,并用该方法对收集的来自日本、韩国和中国台湾的番茄种子以及国内采集的共45份样品进行检测。【结果】基于锁式探针技术的实时荧光PCR检测方法能够从供试的菌株中特异性地检出CMM,在供试的10种菌株中,只有靶标细菌能被特异性地检测到阳性,空白对照和其他参试菌株均没有荧光信号的增加,检测为阴性。比较该检测方法与常规PCR方法,其特异性和常规PCR方法一致。该检测方法检测灵敏度高,DNA最低浓度检测为50 fg·μL-1,而常规PCR方法检测DNA最低浓度为5 pg·μL-1,灵敏度高于常规PCR两个数量级。对收集的样品进行检测,结果显示,45份样品中共有5份样品CMM检测结果为阳性,分别是日本的番茄种子样品2份(编号Jap1214、Jap1102),永泰采集的样品2份(编号为Yongt1001、Yongt1002)和闽清采集的样品 展开更多
关键词 番茄细菌性溃疡病菌 锁式探针 实时荧光PCR 超分支滚环扩增 快速检测 番茄种子
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小肠结肠炎耶尔森氏菌滚环扩增检测方法的建立 被引量:7
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作者 姜英辉 张健 +2 位作者 雷质文 贾俊涛 唐静 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2013年第22期61-63,87,共4页
根据滚环扩增的原理设计引物、锁式探针以及反应体系,建立和优化了滚环扩增(Rolling Cycle Amplification,RCA)检测体系,构建可快速检测食品中的小肠结肠炎耶尔森氏菌的RCA检测方法,并进行了特异性和灵敏度试验。结果表明:所建立的RCA... 根据滚环扩增的原理设计引物、锁式探针以及反应体系,建立和优化了滚环扩增(Rolling Cycle Amplification,RCA)检测体系,构建可快速检测食品中的小肠结肠炎耶尔森氏菌的RCA检测方法,并进行了特异性和灵敏度试验。结果表明:所建立的RCA检测方法,具有很好的特异性,灵敏度为1.7×102CFU/mL,高于普通PCR方法。小肠结肠炎耶尔森氏菌RCA检测方法具有较高的灵敏度和特异性,适合在细菌快速检测方面应用。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森氏菌 滚环扩增 锁式探针
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用滚环扩增技术检测污染细胞的5种支原体 被引量:6
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作者 王辉 周小勇 +2 位作者 孔繁荣 王玮蓁 段逸群 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期949-952,共4页
目的 建立滚环扩增技术检测5种常见的细胞污染支原体(猪鼻支原体、发酵支原体、口腔支原体、精氨酸支原体、莱氏无胆甾原体)的方法.方法 使用细胞污染支原体16S-23SrRNA间隔区公共引物(SPS1,SPA2)扩增间隔区靶基因.设计每一种支原... 目的 建立滚环扩增技术检测5种常见的细胞污染支原体(猪鼻支原体、发酵支原体、口腔支原体、精氨酸支原体、莱氏无胆甾原体)的方法.方法 使用细胞污染支原体16S-23SrRNA间隔区公共引物(SPS1,SPA2)扩增间隔区靶基因.设计每一种支原体特异性锁式探针,锁式探针与扩增的靶基因杂交结合形成环化单链分子,加入特异性引物在Corbett RotorGeneTM 6000扩增仪滚动扩增环化单链分子,观察结果.结果 滚环扩增技术能敏感和特异的检测上述5种支原体标准株,并能敏感的检测10个拷贝的靶基因.在62个细胞培养物样本的检测中,37个样本检测出一种支原体,14个样本检测出两种支原体,11个样本为支原体阴性.滚环扩增方法检测结果与支原体种特异性PCR检测结果一致.结论 滚环扩增作为一种新的扩增技术能敏感和特异的检测细胞污染支原体. 展开更多
关键词 滚环扩增 锁式探针
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基于滚环扩增技术的纸基显色传感器用于致病菌快速检测 被引量:6
6
作者 黄梦琪 刘芳 周小明 《激光生物学报》 CAS 2017年第6期527-533,共7页
近年来,食源性致病菌在全球范围内大面积传播,给人类的生存健康与发展带来了巨大的威胁。因此为了保证食品的安全,快速的、高特异性且高灵敏地检测食品致病菌方法已经成为科学研究的热点话题。在本研究中,我们构建了一种基于滚环扩增技... 近年来,食源性致病菌在全球范围内大面积传播,给人类的生存健康与发展带来了巨大的威胁。因此为了保证食品的安全,快速的、高特异性且高灵敏地检测食品致病菌方法已经成为科学研究的热点话题。在本研究中,我们构建了一种基于滚环扩增技术的纸基显色传感器用于可视化检测致病菌的检测平台。通过滚环扩增对单增李斯特菌的hly A mRNA进行高效特异性扩增,扩增后的单链产物经过Hhal酶进行特异位点酶切后,形成与锁式探针长度相同的片段。将酶切后的单链产物不经过预变性杂交,可直接进行试纸条检测。在优化的实验条件下,可以检测到100 pg/μL总RNA。整个过程实验包括连接,扩增,酶切,检测等反应均可在恒温条件下进行,且可在几个小时内完成。这种方法适用于快速的现场检测,此外,这项研究强调了纸基显色诊断平台的潜在价值和应用前景。 展开更多
关键词 纸基显色传感器 滚环扩增 恒温扩增 食源性致病菌
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滚环扩增原理及其在医药领域的应用 被引量:5
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作者 乔婉琼 周东蕊 +1 位作者 杨耀 陆祖宏 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期201-205,共5页
滚环扩增(rolling circle amplification,RCA)是新近发展起来的一种恒温核酸扩增方法。这种方法不仅可以直接扩增DNA和RNA,还可以实现对靶核酸的信号放大,灵敏度达到一个拷贝的核酸分子,因此在核酸检测中具有很大的应用价值和潜力。本... 滚环扩增(rolling circle amplification,RCA)是新近发展起来的一种恒温核酸扩增方法。这种方法不仅可以直接扩增DNA和RNA,还可以实现对靶核酸的信号放大,灵敏度达到一个拷贝的核酸分子,因此在核酸检测中具有很大的应用价值和潜力。本文结合了滚环扩增技术在医药领域中的最新研究进展,介绍了滚环扩增的原理及其在医药领域中的应用。 展开更多
关键词 滚环扩增 超分支滚环扩增 锁式探针 全基因组扩增
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基于锁式探针技术的菜豆晕疫病菌检测技术研究 被引量:4
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作者 李志锋 王忠文 +4 位作者 冯建军 郑耘 王颖 李一农 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2016年第2期63-68,共6页
根据菜豆晕疫病菌的一段特异促旋酶亚组B(gyr B)基因序列,设计锁式探针和扩增引物,优化体系反应条件,建立了基于锁式探针菜豆晕疫病菌滚环扩增特异性检测体系。试验结果表明该检测体系能够从供试菌株中特异性检测出菜豆晕疫病菌。该... 根据菜豆晕疫病菌的一段特异促旋酶亚组B(gyr B)基因序列,设计锁式探针和扩增引物,优化体系反应条件,建立了基于锁式探针菜豆晕疫病菌滚环扩增特异性检测体系。试验结果表明该检测体系能够从供试菌株中特异性检测出菜豆晕疫病菌。该体系检测DNA的阈值为600 fg/μL,与传统PCR相当;检测菌悬液检测阈值1.3×10~3 cfu/m L,比传统PCR高10倍,在模拟样品检测中也显示了更适合于样品的检测。 展开更多
关键词 菜豆晕疫病菌 锁式探针 滚环扩增 检测
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超分支滚环扩增技术快速检测番茄溃疡病菌 被引量:4
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作者 王念武 王婷 +1 位作者 沈建国 胡方平 《植物检疫》 北大核心 2013年第5期66-70,共5页
根据番茄溃疡病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,cmm)的一段特异致病基因pat-1序列,按照锁式探针的设计原理设计探针和扩增引物,优化系列反应条件,建立了特异性的cmm超分支滚环扩增技术。实验结果表明该检测技术能够... 根据番茄溃疡病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,cmm)的一段特异致病基因pat-1序列,按照锁式探针的设计原理设计探针和扩增引物,优化系列反应条件,建立了特异性的cmm超分支滚环扩增技术。实验结果表明该检测技术能够从供试的10种菌中特异性地检出番茄溃疡病菌,检测灵敏度高,DNA最低检测浓度为500 fg/μL。 展开更多
关键词 番茄溃疡病菌 超分支滚环扩增 锁式探针 检测
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滚环扩增技术最新研究动态及展望 被引量:3
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作者 孙亚军 王亮 蔡俊 《生物技术进展》 2016年第2期130-136,共7页
滚环扩增技术(rolling circle amplification,RCA)的建立模拟了自然界中环状病原生物DNA通过滚环模型方式自我复制的原理,经长期科学研究和实践应用,取得了诸多突破性成果。对最近几年在滚环扩增技术研究领域的最新动态进行了较全面的总... 滚环扩增技术(rolling circle amplification,RCA)的建立模拟了自然界中环状病原生物DNA通过滚环模型方式自我复制的原理,经长期科学研究和实践应用,取得了诸多突破性成果。对最近几年在滚环扩增技术研究领域的最新动态进行了较全面的总结,其中包括了网状RCA、锁式探针RCA、目标成环RCA和跨越式RCA,也对滚环扩增中存在的问题进行了探讨,重点介绍了该技术在基础研究、实际检测、医疗诊断及纳米材料等方面的应用,最后对核酸等温扩增技术产业化的发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 RCA 纳米材料 转基因 锁式探针
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应用锁式探针结合斑点杂交技术检测甜瓜细菌性叶斑病 被引量:3
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作者 徐瑞 胡白石 +5 位作者 田艳丽 黄艳宁 谢进 曹亮 彭斯文 朱校奇 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期679-688,共10页
【目的】甜瓜细菌性叶斑病是危害甜瓜的重要种传细菌病害,是由丁香假单胞杆菌流泪病致病变种甜瓜菌株(Pseudomonas syringae pv.lachrymans)引起的。论文旨在建立高效、快捷、操作简单的检测技术以防止此病原菌传播。【方法】以Gen Ban... 【目的】甜瓜细菌性叶斑病是危害甜瓜的重要种传细菌病害,是由丁香假单胞杆菌流泪病致病变种甜瓜菌株(Pseudomonas syringae pv.lachrymans)引起的。论文旨在建立高效、快捷、操作简单的检测技术以防止此病原菌传播。【方法】以Gen Bank公布的甜瓜细菌性叶斑病菌的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因序列为靶标,设计甜瓜细菌性叶斑病菌特异性锁式探针,建立锁式探针与斑点杂交技术结合的检测体系。以保存的目的菌株为材料,提取DNA作为模板进行锁式探针连接反应、酶切反应和扩增反应,并将锁式探针连接反应、酶切反应和扩增反应的反应温度和反应时间分别进行优化。利用优化的锁式探针连接反应、酶切反应和扩增反应分别对健康的甜瓜种子、带有甜瓜细菌性叶斑病的甜瓜种子、无菌水及25株其他参试菌株进行检测,测定该体系的特异性。将甜瓜细菌性叶斑病菌的DNA按10倍梯度稀释,依次稀释为1 ng·μL^(-1)、100 pg·μL^(-1)、10 pg·μL^(-1)、1 pg·μL^(-1)、100 fg·μL^(-1)、10 fg·μL^(-1)和1 fg·μL^(-1)作为模板,利用优化的锁式探针连接反应、酶切反应和扩增反应,测定灵敏度。将探针与斑点杂交技术结合建立高通量检测体系,将上述反应过程中的扩增产物固定于尼龙膜上,将锁式探针上Zipcode序列的反向互补序列合成c Zipcode(检测探针),检测探针(c Zipcode)用地高辛标记后与产物进行杂交。锁式探针结合斑点杂交技术分别进行特异性检测和灵敏度测定。探针与斑点杂交技术结合建立的高通量检测体系进行人工模拟种子带菌检测,进一步验证该体系的可靠性。利用建立的高通量检测方法对205份市售疑似带病的甜瓜种子进行检测。【结果】锁式探针特异性测定结果表明,26株甜瓜细菌性叶斑病菌均能得到一条105 bp的特异性条带,而剩余25株参试菌 展开更多
关键词 甜瓜细菌性叶斑病 锁式探针 斑点杂交 种子
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向日葵白锈病菌的Padlock探针及检测方法研究 被引量:1
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作者 李秀琴 乾义柯 陈卫民 《植物检疫》 北大核心 2014年第3期38-42,共5页
本研究设计了向日葵白锈病菌(Albugo tragopogi(Persoon)Schr?ter var.helianthi Novotelnova)的Padlock探针,并对探针的灵敏度和特异性进行了验证。结果表明:该探针特异性强,只能从目标病原菌扩增出102 bp的片段,而在非目标病原菌中不... 本研究设计了向日葵白锈病菌(Albugo tragopogi(Persoon)Schr?ter var.helianthi Novotelnova)的Padlock探针,并对探针的灵敏度和特异性进行了验证。结果表明:该探针特异性强,只能从目标病原菌扩增出102 bp的片段,而在非目标病原菌中不能扩增出该片段,探针的灵敏度可达10 pg/μL。将设计的探针与基因芯片技术相结合,对田间向日葵种子进行检测,实现了对向日葵白锈病菌的高通量检测,本研究建立的检测技术可为口岸和田间开展向日葵其他重要病原菌检测提供参考。 展开更多
关键词 向日葵白锈病菌 padlock 探针 基因芯片 检测
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滚环扩增技术在病原微生物检测中的应用 被引量:2
13
作者 张世佳 冯建军 +2 位作者 郭松林 王艺磊 林鹏 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1538-1544,共7页
滚环扩增(RCA)技术是一种简单的恒温DNA扩增技术,在DNA聚合酶的催化下通过扩增闭合环状模板产生成千上万的重复序列。相较于变温核酸扩增技术如聚合酶链式反应(PCR),RCA无需昂贵的变温仪器,更适合现场检测。该文介绍了RCA技术的原理和分... 滚环扩增(RCA)技术是一种简单的恒温DNA扩增技术,在DNA聚合酶的催化下通过扩增闭合环状模板产生成千上万的重复序列。相较于变温核酸扩增技术如聚合酶链式反应(PCR),RCA无需昂贵的变温仪器,更适合现场检测。该文介绍了RCA技术的原理和分类,综述了其在细菌、病毒以及其它病原微生物检测方面的应用现状,并展望了RCA检测病原微生物的应用前景。RCA在检测病原微生物领域有着巨大潜力,同时可为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的快速检测提供思路和补充。 展开更多
关键词 滾环扩增 锁式探针 病原微生物 检测
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香蕉细菌性枯萎病菌超分支滚环扩增快速检测技术 被引量:2
14
作者 王念武 陈劲松 +2 位作者 沈建国 黄振 翁瑞泉 《亚热带农业研究》 2015年第1期1-5,共5页
根据香蕉细菌性枯萎病菌(Ralstonia solanacearum race 2)的特异插入序列ISRso19设计滚环扩增的锁式探针,并对超分支滚环扩增的反应条件进行优化,建立了香蕉细菌性枯萎病菌超分支滚环扩增技术。结果表明,该检测技术能够从供试的9种病原... 根据香蕉细菌性枯萎病菌(Ralstonia solanacearum race 2)的特异插入序列ISRso19设计滚环扩增的锁式探针,并对超分支滚环扩增的反应条件进行优化,建立了香蕉细菌性枯萎病菌超分支滚环扩增技术。结果表明,该检测技术能够从供试的9种病原菌中特异性地检测出香蕉细菌性枯萎病菌,检测的DNA最低浓度为500 fg·μL-1,高于常规PCR的灵敏度。 展开更多
关键词 香蕉细菌性枯萎病菌 超分支滚环扩增 锁式探针
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番茄细菌性叶斑病菌超分支滚环扩增快速检测技术 被引量:2
15
作者 王念武 王婷 +1 位作者 沈建国 胡方平 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期90-94,122,共6页
根据番茄细菌性叶斑病菌(Pseudomonas syringae pv.tomato,Pst)的一段特异蛋白基因序列,按照锁式探针的设计原理设计探针和扩增引物,优化系列反应条件,建立了特异性的Pst超分支滚环扩增技术。试验结果表明:该检测技术能够从供试的10种... 根据番茄细菌性叶斑病菌(Pseudomonas syringae pv.tomato,Pst)的一段特异蛋白基因序列,按照锁式探针的设计原理设计探针和扩增引物,优化系列反应条件,建立了特异性的Pst超分支滚环扩增技术。试验结果表明:该检测技术能够从供试的10种不同的病原菌中特异性地检测出番茄细菌性叶斑病菌,DNA检测的最低浓度为500fg/μL,检测灵敏度高于常规PCR。 展开更多
关键词 番茄细菌性叶斑病菌 超分支滚环扩增 锁式探针
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额外的错配碱基提高T4 DNA连接酶等位特异性连接(英文) 被引量:1
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作者 李书亚 郜艳敏 +2 位作者 胡亚赛 郝敏 齐浩 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期854-860,共7页
连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生... 连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生的影响。设计了超过150组DNA/DNA或DNA/RNA带有的额外错配碱基对的组合。结果发现,引入额外的错配碱基对后,T4 DNA连接酶在DNA/DNA连接中特异性可提高60倍以上,而在DNA/RNA连接中特异性只能提高2倍。在等位特异性连接中,有的错配碱基对可使T4 DNA连接酶的特异性提高600多倍。 展开更多
关键词 等位特异性连接 错配 T4 DNA连接酶 锁式探针
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白斑综合症病毒超分支滚环检测试纸的构建及应用 被引量:1
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作者 赵玉然 尹伟力 +1 位作者 岳志芹 李八方 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期79-86,共8页
依据白斑综合症病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的囊膜蛋白VP28基因核苷酸序列设计特异的锁式探针,建立了WSSV超分支滚环扩增检测方法并构建试纸条.结果表明,WSSV超分支滚环扩增锁式探针在T4DNA连接酶作用下37℃连接30min,而后在B... 依据白斑综合症病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的囊膜蛋白VP28基因核苷酸序列设计特异的锁式探针,建立了WSSV超分支滚环扩增检测方法并构建试纸条.结果表明,WSSV超分支滚环扩增锁式探针在T4DNA连接酶作用下37℃连接30min,而后在Bst DNA聚合酶大片段作用下61℃反应50min,即能够实现病毒靶序列的有效检出.灵敏度实验表明,WSSV超分支滚环扩增试纸最低检出限为10拷贝/μL,是常规PCR(聚合酶链式反应)法灵敏度的100倍.特异性实验表明,该方法能够保证对WSSV的特异性检测.利用该试纸检测68份虾样本,与PCR方法检测结果基本一致,但更为灵敏和直观. 展开更多
关键词 锁式探针 对虾白斑综合症病毒 超分支滚环扩增 检测试纸
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超分支滚环扩增试纸检测对虾黄头病毒 被引量:1
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作者 赵玉然 尹伟力 +4 位作者 谭乐义 李诺 岳志芹 房保海 王宫璞 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第5期100-107,共8页
依据对虾黄头病毒(Yellow head virus,YHV)的非结构蛋白N基因序列,设计特异的锁式探针(Padlock probe,PLP)、检测探针及引物,建立YHV超分支滚环扩增(Hyper-branched rolling circle amplification,HRCA)检测试纸。灵敏度实验显示,... 依据对虾黄头病毒(Yellow head virus,YHV)的非结构蛋白N基因序列,设计特异的锁式探针(Padlock probe,PLP)、检测探针及引物,建立YHV超分支滚环扩增(Hyper-branched rolling circle amplification,HRCA)检测试纸。灵敏度实验显示,YHV HRCA检测试纸能检测出的最低模板量为101拷贝,是RT-PCR灵敏度的100倍。特异性实验结果表明,该试纸能够特异性地对YHV进行检测。利用该检测试纸对进出口80批次虾样本进行检测,并将检测结果与常规RT-PCR相比较,结果显示,YHV HRCA检测试纸灵敏度方面优于常规RT-PCR方法,且操作简便、结果直观易读。 展开更多
关键词 对虾黄头病毒 超分支滚环扩增法 锁式探针 检测试纸
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超分支滚环扩增法检测美洲鳗鲡嗜水气单胞菌
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作者 张世佳 冯建军 +2 位作者 郭松林 王艺磊 林鹏 《集美大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第3期193-199,共7页
建立了基于锁式探针的超分支滚环扩增检测嗜水气单胞菌的新方法。根据嗜水气单胞菌ARE基因上的一段高保守基因序列,设计锁式探针和对应的扩增引物,并优化了反应条件。探针在T4 DNA连接酶作用下,16℃连接1 h、63℃扩增1 h,其扩增产物电... 建立了基于锁式探针的超分支滚环扩增检测嗜水气单胞菌的新方法。根据嗜水气单胞菌ARE基因上的一段高保守基因序列,设计锁式探针和对应的扩增引物,并优化了反应条件。探针在T4 DNA连接酶作用下,16℃连接1 h、63℃扩增1 h,其扩增产物电泳后得到明显条带。在8种水产养殖病原菌中,只有嗜水气单胞菌可以特异性检出,并且特异性良好,灵敏度(1.0×10^(3) cfu/mL)高于免疫法以及常规的PCR法。对嗜水气单胞菌人工感染的美洲鳗鲡肌肉样品进行检测,发现条带清晰可见。该方法的反应过程是在恒温条件下进行,不需要PCR仪,此外,样品处理过程简单,应用水煮法即可进行。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 锁式探针 超分支滚环扩增 检测
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基于锁式探针的荧光定量PCR技术快速检测肉制品中鸭源性成分
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作者 满岳 王溪桥 +3 位作者 周小平 Nazariyah Yahaya 丁功涛 李冰 《中国食品工业》 2019年第4期60-65,共6页
【目的】肉类掺假是食品行业面临的严峻挑战,其中羊肉和牛肉用鸭肉掺假较为常见。本研究主要目的是为检测掺假肉制品中的鸭源性成分提供一个新的检测方法。【方法】本研究根据鸭线粒体基因组16s rDNA中的特异性序列设计鸭源锁式探针和... 【目的】肉类掺假是食品行业面临的严峻挑战,其中羊肉和牛肉用鸭肉掺假较为常见。本研究主要目的是为检测掺假肉制品中的鸭源性成分提供一个新的检测方法。【方法】本研究根据鸭线粒体基因组16s rDNA中的特异性序列设计鸭源锁式探针和扩增引物,并结合荧光定量PCR技术,建立肉制品中鸭源性成分检测的新方法。【结果】基于锁式探针的荧光定量PCR技术检测肉制品中鸭源性成分的检测灵敏度达到70fg·μL^-1。【结论】本研究建立的基于锁式探针的荧光定量PCR检测鸭源性成分方法检测特异性强,灵敏度高,为肉类掺假鉴定提供了新的技术手段。 展开更多
关键词 锁式探针 荧光定量PCR 鸭源性成分 肉类掺
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