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基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析
被引量:
18
1
作者
张雨恬
伍振峰
+5 位作者
黄艺
章俊
张询
林瑞华
万娜
杨明
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第24期7538-7549,共12页
目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥“咳、喘、痰”作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶...
目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥“咳、喘、痰”作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶点及通路,结合文献数据库分析确定“咳、喘、痰”病症的靶基因;取药物与疾病交集基因,将交集基因上传String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,利用Rstudio的clusterProfiler功能对交集基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;预测鲜竹沥的Q-Marker,并运用分子对接软件对部分关键靶点及其对应成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果采用指纹图谱研究得到8批干馏法、火烤法的鲜竹沥主要活性成分,经网络药理学及分子对接分析鲜竹沥对“咳、喘、痰”病症的治疗作用,推测鲜竹沥的Q-Marker为香草酸、对乙基苯酚、丁香醛、二氢丁香酚、对乙烯基愈创木酚,主要通过调节炎症反应、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、缺氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等重要生物通路来发挥止咳、平喘、化痰的作用。结论通过预测鲜竹沥的Q-Marker,为提升其质量控制标准奠定了基础,同时也为鲜竹沥功效关联物质的研究及作用机制的阐释提供参考,为其二次开发以及扩大临床使用范围提供参考依据。
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关键词
鲜竹沥
网络药理学
质量标志物
分子对接
止咳
化痰
平喘
香草酸
对乙基苯酚
丁香醛
二氢丁香酚
对乙烯基愈创木酚
原文传递
题名
基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析
被引量:
18
1
作者
张雨恬
伍振峰
黄艺
章俊
张询
林瑞华
万娜
杨明
机构
江西中医药大学现代中药制剂教育部重点实验室
江西中医药大学附属医院
江西中医药大学药学院
南昌大学第一附属医院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第24期7538-7549,共12页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFC1707203)
江西省科学技术协会项目(赣科协字[2018]117号)
+2 种基金
国家级大学生创新创业计划项目(202010412011)
江西省中医药管理局科技计划项目(2019A031)
江西省教育厅科学研究青年项目(GJJ180692)。
文摘
目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥“咳、喘、痰”作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶点及通路,结合文献数据库分析确定“咳、喘、痰”病症的靶基因;取药物与疾病交集基因,将交集基因上传String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,利用Rstudio的clusterProfiler功能对交集基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;预测鲜竹沥的Q-Marker,并运用分子对接软件对部分关键靶点及其对应成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果采用指纹图谱研究得到8批干馏法、火烤法的鲜竹沥主要活性成分,经网络药理学及分子对接分析鲜竹沥对“咳、喘、痰”病症的治疗作用,推测鲜竹沥的Q-Marker为香草酸、对乙基苯酚、丁香醛、二氢丁香酚、对乙烯基愈创木酚,主要通过调节炎症反应、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、缺氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等重要生物通路来发挥止咳、平喘、化痰的作用。结论通过预测鲜竹沥的Q-Marker,为提升其质量控制标准奠定了基础,同时也为鲜竹沥功效关联物质的研究及作用机制的阐释提供参考,为其二次开发以及扩大临床使用范围提供参考依据。
关键词
鲜竹沥
网络药理学
质量标志物
分子对接
止咳
化痰
平喘
香草酸
对乙基苯酚
丁香醛
二氢丁香酚
对乙烯基愈创木酚
Keywords
fresh bamboo sa
p
network
p
harmacology
quality marker
molecular docking
relieving cough
resolving
p
hlegm
relieving asthma
vanillic acid
p
-ethyl
p
henol
syringaldehyde
dihydroeugenol
p
-
vinylguaiacol
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析
张雨恬
伍振峰
黄艺
章俊
张询
林瑞华
万娜
杨明
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021
18
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