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基于水平集和凹点区域检测的粘连细胞分割方法 被引量:12
1
作者 杨辉华 赵玲玲 +1 位作者 潘细朋 刘振丙 《北京邮电大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第6期11-16,共6页
为解决具有灰度不均匀、低对比度以及边缘模糊等缺陷的粘连细胞分割问题,提出结合水平集方法的轮廓提取和凹点区域检测的细胞分割方法.利用水平集方法可很好地解决曲线演化过程中的拓扑变化问题,结合细胞图像的区域信息和边缘信息,能有... 为解决具有灰度不均匀、低对比度以及边缘模糊等缺陷的粘连细胞分割问题,提出结合水平集方法的轮廓提取和凹点区域检测的细胞分割方法.利用水平集方法可很好地解决曲线演化过程中的拓扑变化问题,结合细胞图像的区域信息和边缘信息,能有效提取细胞的边缘轮廓.该方法可最大限度地保留细胞边缘轮廓的几何特征.根据多边形的凹凸性,循环迭代检测粘连细胞轮廓上的凹点区域,确定细胞的粘连位置,最后确定粘连位置的分割连接线.对几十幅不同粘连细胞图像的分割实验结果表明,该方法易于实现,鲁棒性强,效果明显,细胞分割的平均准确率达到83.01%,优于分水岭及聚类分割方法. 展开更多
关键词 细胞分割 水平集方法 粘连细胞 多边形的凹凸性
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一种改进的重叠细胞图像分割研究 被引量:9
2
作者 黄文明 陈庆全 陆荣 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2009年第26期163-165,共3页
在医学细胞图像处理中,经常遇到细胞图像重叠现象。传统的分水岭算法存在严重的过分割现象。使用距离变换的分水岭算法能很好地避免过分割现象。考虑到细胞具有类圆形的特点,使用固定的结构元素进行极限腐蚀容易导致细胞失真。使用交替... 在医学细胞图像处理中,经常遇到细胞图像重叠现象。传统的分水岭算法存在严重的过分割现象。使用距离变换的分水岭算法能很好地避免过分割现象。考虑到细胞具有类圆形的特点,使用固定的结构元素进行极限腐蚀容易导致细胞失真。使用交替结构元素对重叠细胞进行腐蚀,能准确地标记出单个细胞种子,同时能避免细胞因腐蚀而失真。最后使用膨胀处理找出重叠细胞的分界线。实验结果表明,算法有效地避免了过分割现象,并提高了分割处理的准确度。 展开更多
关键词 重叠细胞 分水岭算法 距离变换 极限腐蚀
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基于细胞散点图构建的细胞核心自动提取技术 被引量:1
3
作者 傅蓉 申洪 《中国体视学与图像分析》 2007年第2期110-113,共4页
本文提出细胞散点图的概念和用途。通过分析比较经典的距离变换技术的原理和结果,提出基于细胞散点图构建的细胞核心提取技术,其基本思想是:如果是单个细胞,则根据区域内像素的平均坐标值来提取核心;如果是重叠细胞,则利用数学形态学的... 本文提出细胞散点图的概念和用途。通过分析比较经典的距离变换技术的原理和结果,提出基于细胞散点图构建的细胞核心提取技术,其基本思想是:如果是单个细胞,则根据区域内像素的平均坐标值来提取核心;如果是重叠细胞,则利用数学形态学的腐蚀操作,将重叠细胞边界一层剥离,直至分离成单个细胞,之后提取分离后单个细胞的核心作为重叠细胞区域中各个细胞的核心。实验结果证明这一提取技术可靠,准确度高。 展开更多
关键词 细胞散点图 核心提取 距离变换 数学形态学 重叠细胞
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一种粘连血细胞图像分割新方法 被引量:3
4
作者 印勇 李阿琼 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2009年第35期173-175,共3页
提出一种基于血细胞近圆形特征的粘连血细胞分割方法。用形态学腐蚀得到距离图和图像的边缘,并利用灰度重建得到细胞的中心区域和圆心,在此基础上基于细胞圆形特征对细胞的边缘进行搜索,得到粘连细胞的分离点,从而求得分离线,完成对粘... 提出一种基于血细胞近圆形特征的粘连血细胞分割方法。用形态学腐蚀得到距离图和图像的边缘,并利用灰度重建得到细胞的中心区域和圆心,在此基础上基于细胞圆形特征对细胞的边缘进行搜索,得到粘连细胞的分离点,从而求得分离线,完成对粘连血细胞的精确分割。实验表明,该分离方法是有效可行的。 展开更多
关键词 粘连细胞 图像分割 圆形特征 分离点 分离线
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CB法微核图像中粘连淋巴细胞的自动分离 被引量:3
5
作者 闫学昆 陈英 +2 位作者 杜杰 曹珍山 骆亿生 《中国体视学与图像分析》 2009年第3期296-301,共6页
CB法微核图像中淋巴细胞的粘连情况可分为串联、并联、串并联三类。首先利用面积阈值、圆度阈值、延展度阈值提取串联的淋巴细胞区域;然后采用改进的基于凹点搜寻的分离方法对串联淋巴细胞区域进行分离,同时克服了崎岖边界的干扰问题;... CB法微核图像中淋巴细胞的粘连情况可分为串联、并联、串并联三类。首先利用面积阈值、圆度阈值、延展度阈值提取串联的淋巴细胞区域;然后采用改进的基于凹点搜寻的分离方法对串联淋巴细胞区域进行分离,同时克服了崎岖边界的干扰问题;对于分离后的细胞,再判断其是否为双核淋巴细胞。这为CB法微核图像自动分析中串联淋巴细胞的判别和分离提供了一种切实可行的解决方法,有助于提高CB法微核图像分析的准确度和可靠性,而不影响自动分析的速度。 展开更多
关键词 淋巴细胞 CB法微核试验 微核图像 粘连细胞 自动分离 最短距离 凹点
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基于最短距离的粘连细胞分离点对的自动配对 被引量:3
6
作者 闫学昆 陈英 +2 位作者 杜杰 曹珍山 骆亿生 《中国体视学与图像分析》 2009年第3期308-313,共6页
利用基于凹点搜索和最短距离的构造分离线的方法分离串联淋巴细胞时,需要自动实现相应凹区域的配对。对于两个细胞粘连的情况,由于恰好存在两个凹区域,故不存在自动配对问题;对于三个细胞串联、存在三个凹区域的情况,通过判断分离线是... 利用基于凹点搜索和最短距离的构造分离线的方法分离串联淋巴细胞时,需要自动实现相应凹区域的配对。对于两个细胞粘连的情况,由于恰好存在两个凹区域,故不存在自动配对问题;对于三个细胞串联、存在三个凹区域的情况,通过判断分离线是否与核心三角形相交实现自动配对;对于三个细胞串联、存在四个凹区域的情况,先计算各凹区域到核心钝角三角形的最短距离、同时获得四个端点,然后利用其坐标与核心坐标的关系进行自动配对。设计的分离方法能够满足两个细胞粘连和三个细胞串联情况的准确、快速、自动分离。 展开更多
关键词 粘连细胞 自动分离 最短距离 凹点 自动配对
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一种改进的重叠细胞分离算法 被引量:1
7
作者 卢艳芝 刘相滨 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2008年第24期172-174,共3页
在细胞图像识别中,经常会遇到细胞重叠的现象,需要有一种有效的方法将重叠在一起的细胞分离成单个的细胞。目前很多分离算法都是基于数学形态学的,但这些算法都存在着一定的局限性。为此,提出了一种改进的基于数学形态学的分离算法,该... 在细胞图像识别中,经常会遇到细胞重叠的现象,需要有一种有效的方法将重叠在一起的细胞分离成单个的细胞。目前很多分离算法都是基于数学形态学的,但这些算法都存在着一定的局限性。为此,提出了一种改进的基于数学形态学的分离算法,该算法首先采用一种简单、快速的边界剥离方法得到距离变换结果,然后再用分水岭方法对细胞图像进行分离。实验结果表明,算法获得了较好的分离效果。 展开更多
关键词 重叠细胞 分离 距离变换 分水岭
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基于语义分割及主动轮廓的宫颈细胞实例分割方法
8
作者 朱琳琳 杜泓 《沈阳航空航天大学学报》 2022年第2期55-63,共9页
宫颈细胞图像的分割问题研究对宫颈癌筛查诊断具有重要意义,但大量的重叠细胞给这项研究带来了巨大挑战。针对这一问题提出了新的宫颈细胞实例分割方法,该方法在语义分割的基础上,根据先验信息为细胞初始化轮廓并建立能量函数,通过最小... 宫颈细胞图像的分割问题研究对宫颈癌筛查诊断具有重要意义,但大量的重叠细胞给这项研究带来了巨大挑战。针对这一问题提出了新的宫颈细胞实例分割方法,该方法在语义分割的基础上,根据先验信息为细胞初始化轮廓并建立能量函数,通过最小化能量函数完成轮廓演化,解决复杂宫颈细胞图像中细胞实例分割问题。首先,改进U-net神经网络,完成宫颈细胞图像精确语义分割,将图像像素分为细胞、细胞核及背景3类;其次,在语义分割的基础上,识别图像中的游离细胞与细胞团块,并直接提取游离细胞的轮廓;最后,对于包含重叠细胞的细胞团块,使用Snake主动轮廓模型完成细胞团块中每个细胞的轮廓提取,实现细胞的实例分割。实验结果表明,算法可对包含重叠细胞的宫颈细胞图像进行有效实例分割。 展开更多
关键词 宫颈细胞图像 U-net网络 主动轮廓 重叠细胞 实例分割 语义分割
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斑马鱼视网膜细胞图像的分割研究
9
作者 杜培明 汪宁宁 史晓丽 《微型机与应用》 2012年第4期34-36,共3页
针对斑马鱼视网膜细胞图像分割时细胞粘连比较严重的情况,采用了边界距离变换和模拟浸水原理的分水岭变换相结合的方法。首先采用距离变换的方法提取细胞区域的局部极小值作为种子点,合并距离过小的错误种子点,然后使用分水岭算法进行... 针对斑马鱼视网膜细胞图像分割时细胞粘连比较严重的情况,采用了边界距离变换和模拟浸水原理的分水岭变换相结合的方法。首先采用距离变换的方法提取细胞区域的局部极小值作为种子点,合并距离过小的错误种子点,然后使用分水岭算法进行分割。实验结果表明,该方法能够有效地分割斑马鱼视网膜细胞图像,成功地解决了分水岭变换中粘连细胞的过分割问题,且计算速度快。 展开更多
关键词 粘连细胞 距离变换 分水岭变换
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基于曲率和活动轮廓模型的重叠细胞分割算法 被引量:3
10
作者 杨秀杰 李法平 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第4期41-47,共7页
提出了一种基于曲率和活动轮廓模型的重叠细胞分割算法,用于解决重叠细胞显微图像边界难以自动分离的问题.该算法使用Otsu算法和形态学滤波得到重叠细胞整体轮廓,并根据其曲率信息来定位细胞边界接触点,再采用活动轮廓模型分割得到重叠... 提出了一种基于曲率和活动轮廓模型的重叠细胞分割算法,用于解决重叠细胞显微图像边界难以自动分离的问题.该算法使用Otsu算法和形态学滤波得到重叠细胞整体轮廓,并根据其曲率信息来定位细胞边界接触点,再采用活动轮廓模型分割得到重叠区域轮廓,最后结合边界接触点信息将其与整体轮廓拼接得到单个细胞轮廓.实验结果表明,算法实现了重叠细胞的分割,分割得到的细胞完整度高,且算法具有一定的鲁棒性,表明该算法用于重叠细胞的分割是可行、有效的. 展开更多
关键词 重叠细胞分割 曲率 活动轮廓模型 OTSU算法
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基于凹点搜寻的重叠细胞图像自动分离的算法研究 被引量:28
11
作者 傅蓉 申洪 陈浩 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第17期21-23,28,共4页
提出了一种重叠细胞图像自动分离的新算法。根据重叠细胞的凹凸性,从细胞重叠区域的凹区域中寻找到凹点,根据凹点数与细胞个数的关系,判断是细胞串联还是细胞并联:如果是串联的情况,则直接将成对的凹点连成直线分离重叠区域;如果是并联... 提出了一种重叠细胞图像自动分离的新算法。根据重叠细胞的凹凸性,从细胞重叠区域的凹区域中寻找到凹点,根据凹点数与细胞个数的关系,判断是细胞串联还是细胞并联:如果是串联的情况,则直接将成对的凹点连成直线分离重叠区域;如果是并联的情况,则将凹点与重叠区域的中心连接成直线分离重叠区域。该算法在Matlab环境下对重叠细胞图像进行了自动分离,实验结果表明该算法实现简单,效果理想,且能基本保持原细胞的大小和形状。 展开更多
关键词 重叠细胞 凹点 细胞串联 细胞并联 自动分离
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结合距离变换与边缘梯度的分水岭血细胞分割 被引量:31
12
作者 缪慧司 梁光明 +1 位作者 刘任任 丁建文 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期192-198,共7页
目的针对医学图像中细胞提取和粘连细胞分割问题,提出一种结合距离变换利用边缘梯度的分水岭血细胞显微图像分割方法。方法首先,通过距离变换由细胞二值图生成距离地形图,取其局部极值点或点集作为前景标记,进行第1次距离分水岭变换;接... 目的针对医学图像中细胞提取和粘连细胞分割问题,提出一种结合距离变换利用边缘梯度的分水岭血细胞显微图像分割方法。方法首先,通过距离变换由细胞二值图生成距离地形图,取其局部极值点或点集作为前景标记,进行第1次距离分水岭变换;接着将第一步骤所得的分水岭脊线作为背景区域的标记,前景标记不变,视梯度幅度图为地形图,再一次进行梯度分水岭变换,得到细胞分割结果。两次分水岭变换前,均采用强制极小值的方法修改地形图,来控制地形图只在选取的标记处存在局部极小值。结果该方法由距离图提取前景标记,将距离分水岭变换所得的脊线作为梯度分水岭变换的背景标记,能有效地分离粘连目标。相比于基于距离图分水岭变换,本文方法不过多依赖二值图像信息,保留了基于梯度图像的分水岭变换边缘定位准确的优点,又解决了其无法分割粘连目标和过分割的问题。结论经多幅临床细胞图像分割实验验证,该方法可以实现图像中细胞的提取以及粘连细胞的自动分割,满足医学图像分割的要求。 展开更多
关键词 粘连细胞 图像分割 分水岭变换 边缘梯度 距离变换
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基于种子点替代像素块算法的粘连细胞图像分割 被引量:4
13
作者 陈名 杨慧中 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期266-270,共5页
提出了1种基于像素块扫描的种子点替代算法用于粘连细胞图像的分割。首先确定单个细胞平均面积,然后确定正方形像素块边长,并以此像素块对二值化图像进行扫描。将与像素块匹配的地方替换为1个种子点,得到种子点图像。采用分水岭分割算... 提出了1种基于像素块扫描的种子点替代算法用于粘连细胞图像的分割。首先确定单个细胞平均面积,然后确定正方形像素块边长,并以此像素块对二值化图像进行扫描。将与像素块匹配的地方替换为1个种子点,得到种子点图像。采用分水岭分割算法得到分割图像并计数。实验结果表明,该文方法适用于细胞面积相差不大的各种粘连度的细胞图像,分割效果显著,准确率高于98%。 展开更多
关键词 显微细胞图像 种子点 像素块 粘连细胞 细胞分割 分水岭分割算法
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结合细胞散点图和改进Snake模型的重叠细胞分割修复的方法 被引量:2
14
作者 邹刚 姚伟 +1 位作者 孙即祥 敖永红 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期41-45,52,共6页
针对医学显微图像中常出现细胞重叠的现象,提出一种组合细胞散点图和改进Snake模型的分割方法:先使用可变腐蚀元的迭代腐蚀方法,获取细胞散点和分离细胞;再利用原始边缘信息,初始化活动轮廓;最后结合细胞散点信息,利用加入约束能量的改... 针对医学显微图像中常出现细胞重叠的现象,提出一种组合细胞散点图和改进Snake模型的分割方法:先使用可变腐蚀元的迭代腐蚀方法,获取细胞散点和分离细胞;再利用原始边缘信息,初始化活动轮廓;最后结合细胞散点信息,利用加入约束能量的改进Snake算法,获取细胞的完整边界。在获取边界重叠掩膜图像的基础上,针对因重叠导致重叠区域图像信息变化的情况,采用一种自适应迭代卷积的快速图像修复方法。实验表明,该方法能有效地分离重叠细胞,并能准确快速地获取细胞的完整边界,并在重叠掩膜图像的基础上快速修复重叠部分。 展开更多
关键词 细胞散点图 数学形态学 重叠细胞 SNAKE算法 自适应迭代卷积
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基于瓶颈点探测与椭圆拟合的细胞图像分割方法探究 被引量:1
15
作者 张竣凯 《电子测试》 2013年第5X期100-102,共3页
针对显微图像中常出现的细胞重叠现象,提出了一种基于瓶颈点探测与椭圆拟合的细胞图像自动分割方法。首先,对重叠细胞图像进行闽值分割并得到边缘特征点,然后通过计算特征点间瓶颈率选出候选瓶颈点对,并使用椭圆拟合法对瓶颈点对进行判... 针对显微图像中常出现的细胞重叠现象,提出了一种基于瓶颈点探测与椭圆拟合的细胞图像自动分割方法。首先,对重叠细胞图像进行闽值分割并得到边缘特征点,然后通过计算特征点间瓶颈率选出候选瓶颈点对,并使用椭圆拟合法对瓶颈点对进行判断,最后使用正确瓶颈点对分割重叠细胞。实验结果表明本文算法能够有效地抑制过分割和欠分割现象,且分割准确率高。 展开更多
关键词 图像分割 瓶颈点检测 椭圆拟合 重叠细胞
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监控量测技术在暗挖单洞重叠隧道中的应用 被引量:4
16
作者 曹正喜 《现代隧道技术》 EI 北大核心 2005年第6期57-62,共6页
深圳地铁一期工程3C标段(国-老区间北段)暗挖单洞重叠隧道穿越了高层建筑物及交通主干道,环境条件复杂,地质条件差,高跨比大(近似为2),结构稳定性差,施工难度大,文章主要论述了施工监测在信息化施工中的重要作用。
关键词 地铁隧道 重叠隧道 监控量测 环境保护
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人源抗菌肽LL-37及其改良体串联体的原核表达及纯化 被引量:2
17
作者 杨浩 姚海燕 +4 位作者 陈圆圆 阎波 郭鹏 马驰 韩跃武 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2012年第5期570-573,共4页
目的克隆人源抗菌肽(Antimicrobial peptide,AMP)LL-37及其改良体串联体基因,原核表达并纯化重组蛋白。方法利用生物信息学手段,对人源抗菌肽LL-37基因序列进行改良设计,合成人源抗菌肽LL-37及其改良体基因片段,经重叠延伸PCR获得人源... 目的克隆人源抗菌肽(Antimicrobial peptide,AMP)LL-37及其改良体串联体基因,原核表达并纯化重组蛋白。方法利用生物信息学手段,对人源抗菌肽LL-37基因序列进行改良设计,合成人源抗菌肽LL-37及其改良体基因片段,经重叠延伸PCR获得人源抗菌肽LL-37及其改良体串联体基因,克隆至原核表达载体pET-28a(+)中,构建重组表达质粒pET-28a-dLL-37,转化大肠杆菌BL21(DE3)pLysS,IPTG诱导表达,Tricine SDS-PAGE分析重组蛋白的表达形式,镍金属螯合亲和层析纯化重组蛋白。结果改良后的人源抗菌肽LL-37的等电点、稳定性及其在大肠杆菌中的半衰期均显著提高;重组表达质粒pET-28a-dLL-37经测序鉴定构建正确;表达的重组蛋白相对分子质量约为11 000,主要以包涵体形式存在;纯化的重组蛋白纯度可达95%,浓度为0.473 mg/ml。结论已成功在大肠杆菌中表达并纯化了人源抗菌肽LL-37及其改良体串联体,为其后续生物学活性的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 抗菌肽 串联体 重叠延伸PCR 原核细胞 基因表达 纯化
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