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利用多重PCR技术同时检测6种棉花转化体的方法研究 被引量:4
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作者 李忆 尹全 刘勇 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期487-494,共8页
【目的】建立1种转基因棉花多重聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)检测方法。【方法】试验选择6种转基因棉花作为多重PCR检测对象,通过引物终浓度配比和引物退火温度的两要素全组合优化多重PCR反应体系,并分析方法灵敏度... 【目的】建立1种转基因棉花多重聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)检测方法。【方法】试验选择6种转基因棉花作为多重PCR检测对象,通过引物终浓度配比和引物退火温度的两要素全组合优化多重PCR反应体系,并分析方法灵敏度。【结果】多重PCR较优的MON1445、GHB614、MON15985、MON88913、LLCOTTON25、MON531引物终浓度为0.25、0.30、0.25、0.16、0.30、0.20μmol·L-1,较优引物退火温度为56℃,方法灵敏度为66个拷贝棉花基因组。利用盲样对上述体系的验证结果显示,所有盲样扩增条带与其含有的转基因转化体完全一致。【结论】本研究建立的体系可用于6种棉花转化体的快速检测。 展开更多
关键词 棉花 多重PCR 特异性引物 检测
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正交设计优化翼梗五味子ISSR-PCR反应体系 被引量:9
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作者 吴生 熊宇婷 +1 位作者 谢砚 顾蔚 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期976-979,共4页
目的对影响翼梗五味子ISSR-PCR扩增反应的各因素进行优化,建立稳定的反应体系。方法基于正交极差分析方法,以Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物5因素4水平的正交试验对翼梗五味子ISSR-PCR反应体系进行优化。结果翼梗五味子ISSR-PCR的最... 目的对影响翼梗五味子ISSR-PCR扩增反应的各因素进行优化,建立稳定的反应体系。方法基于正交极差分析方法,以Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物5因素4水平的正交试验对翼梗五味子ISSR-PCR反应体系进行优化。结果翼梗五味子ISSR-PCR的最佳反应体系(20μL)为:Taq酶1.00 U、Mg2+1.50 mmol/L、模板DNA 40.00 ng、dNTP 0.25mmol/L、引物0.50μmol/L。筛选出12条扩增稳定、多态性丰富的ISSR引物,并确定了每个引物的最佳退火温度。结论所建立的翼梗五味子ISSR反应体系具有标记位点清晰、反应系统稳定、重复性好等优点,为翼梗五味子的分子水平研究提供实验依据。 展开更多
关键词 翼梗五味子 ISSR-PCR 正交优化 多态性 退火温度
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5种温带果树SRAP-PCR退火温度的优化 被引量:7
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作者 王学军 刘国俭 +2 位作者 常瑞峰 韩继成 郭恩才 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期525-528,共4页
SRAP技术是一种多态性和信息量丰富的新型分子标记技术,近年来在植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图的构建以及比较基因组学研究等方面得到广泛应用。有关SRAP-PCR反应体系的优化很少涉及到退火温度。因此,我们利用梯度PCR技术,... SRAP技术是一种多态性和信息量丰富的新型分子标记技术,近年来在植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图的构建以及比较基因组学研究等方面得到广泛应用。有关SRAP-PCR反应体系的优化很少涉及到退火温度。因此,我们利用梯度PCR技术,对SRAP-PCR过程中的两步退火温度进行了研究,以期获得较好的退火温度组合。通过对第一步前5轮循环的退火温度梯度37~50℃的实验,其退火温度可提高到41℃;对第二步后30轮循环的退火温度梯度50~60℃的实验,其退火温度可提高到52℃。应用该程序在苹果、桃、板栗、梨和樱桃等5个树种各4个品种进行扩增,均获得了良好的结果。 展开更多
关键词 温带果树 SRAP—PCR 退火温度优化
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土壤微生物总DNA的V_3可变区PCR反应体系优化 被引量:5
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作者 殷全玉 郭夏丽 +1 位作者 赵铭钦 王岩 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第1期65-68,共4页
为了优化以土壤微生物DNA为模板的PCR反应条件,采用E.Z.N.A.soil DNA kit试剂盒提取土壤微生物总DNA,对16SrDNA V3可变区的PCR反应体系和反应条件进行优化。主要从DNA模板用量、引物浓度、退火温度、热启动方式4个方面进行筛选试验,最... 为了优化以土壤微生物DNA为模板的PCR反应条件,采用E.Z.N.A.soil DNA kit试剂盒提取土壤微生物总DNA,对16SrDNA V3可变区的PCR反应体系和反应条件进行优化。主要从DNA模板用量、引物浓度、退火温度、热启动方式4个方面进行筛选试验,最后得出最适宜的土壤DNA扩增体系为:10.5ng模板DNA、5μL 10×buffer、4μL 2.5mmol/L dNTP、10μmol/L引物各1.5μL,2.5UTaq酶,加无菌ddH2O补足至50μL;PCR循环程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,52℃退火1min,72℃延伸70s,29个循环;72℃延伸5min。试验结果表明:选择热启动方式和合适的退火温度是获得高质量PCR产物的关键。 展开更多
关键词 土壤微生物DNA 16SrDNA V3区 PCR扩增 优化 热启动方式 退火温度
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芒果SRAP-PCR反应体系的优化与退火温度的筛选 被引量:4
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作者 付海天 赵英 《福建农业学报》 CAS 2014年第4期345-349,共5页
以芒果为材料,通过单因子模板DNA含量、引物含量、2×Taq PCR Master Mix含量3种因素水平进行试验,建立了SRAP反应的优化体系。结果表明:最佳反应体系为20μL,包括24ng模板DNA,8pmL引物,2×Taq PCR Master Mix 10.0μL。该体系... 以芒果为材料,通过单因子模板DNA含量、引物含量、2×Taq PCR Master Mix含量3种因素水平进行试验,建立了SRAP反应的优化体系。结果表明:最佳反应体系为20μL,包括24ng模板DNA,8pmL引物,2×Taq PCR Master Mix 10.0μL。该体系对芒果扩增效果好,电泳结果显示扩增条带清晰,多态性高,而且操作简单。从81对引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的29对引物组合。在此基础上对退火温度进行探索,发现扩增结果对退火温度变化不敏感。 展开更多
关键词 芒果 SRAP 体系优化 引物筛选 退火温度
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