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题名川崎病患儿差异表达基因筛选及相应蛋白表达观察
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作者
崔晓鸣
刘力
张博
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机构
天津市儿童医院天津大学儿童医院检验科
天津市儿童医院天津大学儿童医院风湿免疫科
天津医科大学基础医学院免疫学系
天津市细胞与分子免疫重点实验室
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出处
《山东医药》
CAS
2021年第18期44-47,共4页
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基金
国家自然科学基金面上项目(82070687)。
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文摘
目的运用生物信息学方法分析川崎病(KD)患儿差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并观察KD患儿血清中相应DEGs蛋白的表达变化。方法①KD患儿DEGs筛选:从KD数据库中获取KD的基因组数据,通过R软件中edge R软件包分析KD患儿及健康儿童DEGs。②KD患儿DEGs蛋白表达观察:典型KD患儿40例,健康儿童15例,抽取外周静脉血,采用ELISA双抗体夹心法检测基质金属蛋白酶8(MMP-8)、嗅介蛋白-4(OLFM4)蛋白。结果与健康儿童相比,KD患儿存在288个DEGs,其中表达明显上调基因186个、明显下调基因102个。MMP-8基因和OLFM4基因差异最为明显(P均<0.05)。KD患儿外周血MMP-8、OLFM4蛋白表达水平分别为(73.21±13.66)、(26.37±5.88)ng/mL,健康儿童分别为(46.32±9.38)、(9.37±5.23)ng/mL,二者比较,P均<0.05。结论KD患儿有MMP-8、OLFM4等288个DEGs。KD患儿外周血中MMP-8、OLFM4蛋白表达水平升高。
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关键词
差异表达基因
基质金属蛋白酶8
嗅介蛋白-4蛋白
川崎病
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Keywords
differentially expressed genes
matrix metalloproteinases 8
olfactomedin-4 protein
Kawasaki disease
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分类号
R725.9
[医药卫生—儿科]
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