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诺如病毒GⅡ型流行病学研究进展 被引量:7
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作者 于晓楠 王斌 《健康教育与健康促进》 2020年第6期648-651,共4页
诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。监测显示,全球75%~100%的诺如病毒病例都是由GⅡ型引起。诺如病毒GⅡ型急性肠胃炎已成为公共卫生领域的热点问题。本文对诺如病毒G... 诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。监测显示,全球75%~100%的诺如病毒病例都是由GⅡ型引起。诺如病毒GⅡ型急性肠胃炎已成为公共卫生领域的热点问题。本文对诺如病毒GⅡ型病原学、流行概况及流行病学特征等方面研究进行综述。 展开更多
关键词 诺如病毒g 流行特征 研究进展
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2021—2022年上海<5岁住院儿童病毒性腹泻的病原学特征
2
作者 匡小舟 肖文佳 +2 位作者 潘浩 陈敏 滕峥 《上海预防医学》 CAS 2024年第2期143-149,共7页
【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状... 【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒进行分子检测,对主要病原体进行分子分型和序列分析。【结果】共收集546份标本,总体病毒阳性检出率为37.55%,依次为诺如病毒GⅡ型(22.16%)、A组轮状病毒(16.12%)、星状病毒(2.93%)、肠道腺病毒(2.38%)、札如病毒(0.92%)和诺如病毒GⅠ型(0.18%)。诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.4[P16]为主要流行株(占比分别为24.79%和14.05%),其中GⅡ.4[P31]检出占比明显下降(χ2=16.140,P<0.001)。此外,还发现国内罕见轮状病毒基因型G8P[8]型在本地的首次流行,且占比呈上升趋势,总体达到7.95%。该基因型代表株在基因进化分析上与东南亚的DS⁃1⁃like G8P[8]毒株进化距离更近。【结论】诺如病毒基因亚型的分布变化和轮状病毒罕见型别的发现都凸显持续性病原监测和基因分型检测的重要性。少见株的本地化流行对上市疫苗的效果评价和潜在疫苗的开发提出了新的要求。 展开更多
关键词 住院儿童 A组轮状病毒 基因型 诺如病毒g
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不同水源中GⅡ型诺如病毒实时荧光逆转录聚合酶链式反应检测方法建立及应用 被引量:5
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作者 李楠 王佳慧 +1 位作者 李凤琴 江涛 《中国食品卫生杂志》 北大核心 2018年第6期597-602,共6页
目的建立不同水源中GⅡ型诺如病毒(NoV GⅡ)实时荧光逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测方法 ,对某市疾病预防控制中心送检的10份疑似引起诺如病毒中毒的水样进行NoV GⅡ检测。方法以瓶装水、河水和生活污水为研究对象,采用硝酸纤维素膜... 目的建立不同水源中GⅡ型诺如病毒(NoV GⅡ)实时荧光逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测方法 ,对某市疾病预防控制中心送检的10份疑似引起诺如病毒中毒的水样进行NoV GⅡ检测。方法以瓶装水、河水和生活污水为研究对象,采用硝酸纤维素膜-聚乙二醇(PEG)沉淀法富集病毒,对取样体积、病毒洗脱条件、PEG终浓度及PEG沉淀条件等进行了优化,提取病毒RNA、建立实时荧光RT-PCR检测方法 ;通过外加MS2计算方法的回收率,评价所建方法对水样中诺如病毒的回收效果。结果建立的方法对瓶装水、河水和生活污水中NoV GⅡ的平均回收率分别为(60.1±8.0)%、(22.0±6.5)%和(35.7±8.1)%,10份送检水样中3份检出NoV GⅡ。结论建立的实时荧光RT-PCR方法适用于瓶装水、河水和生活污水中NoV GⅡ的检测,饮用水被NoV GⅡ是引发某市人员中毒的原因之一。 展开更多
关键词 实时荧光逆转录聚合酶链式反应 g型诺如病毒 检测方法
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抑制剂去除对冷冻草莓中诺如病毒RT-PCR检测的影响 被引量:4
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作者 徐文斐 房保海 +5 位作者 林超 王宫璞 王群 郑小龙 梁成珠 岳志芹 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第4期296-300,共5页
目的:设计对比实验,以冷冻草莓为材料,研究样品中所含抑制剂对诺如病毒荧光定量逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测结果的影响,优化提高检测灵敏度与准确率。方法:GⅡ型诺如病毒便悬液... 目的:设计对比实验,以冷冻草莓为材料,研究样品中所含抑制剂对诺如病毒荧光定量逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测结果的影响,优化提高检测灵敏度与准确率。方法:GⅡ型诺如病毒便悬液的制备与RNA提取,已知阴性冷冻草莓样品进行前处理、病毒富集、病毒RNA提取纯化,分组(对照组、实验组),抑制剂去除,荧光定量RT-PCR检测。结果:随着病毒浓度的梯度递减,抑制剂影响作用呈明显增强趋势,导致在高于正常检测最低限度两个数量级的水平,即出现假阴性结果;抑制剂去除的实验组检测结果,随着病毒浓度梯度的递减明显优于未经处理的对照组;抑制剂去除的实验组稳定检出限为10-6(Ct值小于40),最低检出限为10-7(诺如病毒(norovirus,No V)浓度梯度检测最低检出限为10-5)。结论:抑制剂去除可明显优化冷冻草莓中No V荧光定量RT-PCR检测,提高检测方法的灵敏度,且操作简便快捷,检测成本浮动不大,期望应用于日常检测工作中。 展开更多
关键词 冷冻草莓 诺如病毒 荧光定量RT-PCR 抑制剂
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粪便标本中诺如病毒GⅡ拷贝数定量检测方法的建立和应用 被引量:2
5
作者 赵跃丽 饶清 +1 位作者 孙强明 张兰胜 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期864-870,共7页
目的构建诺如病毒GⅡ(Norovirus GenogroupⅡ,NoV GⅡ)拷贝数标准质粒及其检测体系。方法将合成高度保守的NoV GⅡ基因序列片段克隆至pUC57载体上,构建NoV GⅡ标准质粒,采用聚合酶链反应(PCR)进行验证。通过实时荧光定量PCR扩增曲线结... 目的构建诺如病毒GⅡ(Norovirus GenogroupⅡ,NoV GⅡ)拷贝数标准质粒及其检测体系。方法将合成高度保守的NoV GⅡ基因序列片段克隆至pUC57载体上,构建NoV GⅡ标准质粒,采用聚合酶链反应(PCR)进行验证。通过实时荧光定量PCR扩增曲线结果绘制C t值与病毒拷贝数的标准曲线,求得其相应的标准曲线方程。采用建立的标准质粒及其检测体系对2018年12月昆明市儿童医院4份临床粪便标本进行检测。结果经PCR验证,NoV GⅡ拷贝数的标准质粒构建正确。采用实时荧光定量PCR的扩增曲线获得C t值与病毒拷贝数相对应的标准曲线方程为Y=-3.972X+39.03,R^2=0.991,4份粪便标本原液NoV GⅡ病毒拷贝数分别为30443.45、9468.40、53176.69、4493.12 copies/μL。结论成功建立用于检测粪便标本中NoV GⅡ病毒拷贝数的标准质粒及其检测体系,可为疾病的预防控制和相关试验研究提供有效的定量检测方法。 展开更多
关键词 诺如病毒g 病毒拷贝数 实时荧光定量PCR 标准曲线
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基于RT-RAPID和CRISPR-Cas12a的诺如病毒GⅡ.6亚型核酸检测方法的建立
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作者 冉红志 樊成 +4 位作者 王雪飞 刘静 康婕 钱卫东 王婷 《动物医学进展》 北大核心 2023年第9期44-50,共7页
为建立一种特异性强、灵敏度高且简单方便的诺如病毒GⅡ.6核酸快速检测方法,下载诺如病毒GⅡ.6基因组序列,用Mega7.0对基因组进行比对分析获得高度保守序列;基于保守序列设计诺如病毒GⅡ.6的反转录重组酶和聚合酶等温检测(RT-RAPID)技... 为建立一种特异性强、灵敏度高且简单方便的诺如病毒GⅡ.6核酸快速检测方法,下载诺如病毒GⅡ.6基因组序列,用Mega7.0对基因组进行比对分析获得高度保守序列;基于保守序列设计诺如病毒GⅡ.6的反转录重组酶和聚合酶等温检测(RT-RAPID)技术扩增引物、荧光探针、crRNA和报告分子;优化RT-RAPID的反应引物、反应温度和反应时间及Cas12a检测用的crRNA,并分析RT-RAPID-Cas12a方法的特异性和灵敏度。基于RT-RAPID荧光法和RT-RAPID-Cas12a荧光法的诺如病毒GⅡ.6亚型核酸快速检测方法能在1 h内完成检测并得出结果,灵敏度分别为10 copies/μL和0.5 copies/μL,且两个方法均与诺如病毒GⅡ.17型、鼻病毒、偏肺病毒和博卡病毒无交叉反应。2个检测方法与RT-qPCR阳性样本一致率均为90%,阴性样本一致率均为100%。论文建立的基于RT-RAPID和Cas12a的诺如病毒GⅡ.6核酸快速检测方法均可高效快速地检测出诺如病毒GⅡ.6,具有灵敏度高、特异性强、操作便捷且快速等特点。 展开更多
关键词 诺如病毒g.6亚型 反转录重组酶聚合酶扩增 规律间隔成簇短回文重复序列的/相关蛋白12a 核酸检测
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基于中和表位的GⅡ.4型重组诺如病毒VP1蛋白病毒样颗粒抗原含量检测方法的建立及验证 被引量:1
7
作者 唐芳 韩子泊 +5 位作者 侯俊伟 杜丽芳 栗子谦 靳玉琴 雷泽华 李启明 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第11期1257-1262,共6页
目的建立基于中和表位的GⅡ.4型重组诺如病毒(Norovirus,NoV)VP1蛋白病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)抗原含量检测方法,并进行验证,以用于重组NoV疫苗质量控制。方法应用ELISA和HBGA-VLP阻断试验筛选中和性单克隆抗体,并筛选配对抗... 目的建立基于中和表位的GⅡ.4型重组诺如病毒(Norovirus,NoV)VP1蛋白病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)抗原含量检测方法,并进行验证,以用于重组NoV疫苗质量控制。方法应用ELISA和HBGA-VLP阻断试验筛选中和性单克隆抗体,并筛选配对抗体,分别作为包被抗体和检测抗体,建立GⅡ.4型重组NoV VP1蛋白VLP双抗夹心ELISA抗原定量检测方法。确定方法的线性检测范围,并对方法的专属性、准确性和精密性进行验证。结果27株GⅡ.4 VLP特异性ELISA检测阳性的杂交瘤细胞克隆中,有12株GⅡ.4型阻断抗体检测呈阳性,选择具有GⅡ.4型阻断活性的特异性单抗2H7-C5和2E6-B3作为双抗夹心抗体对,用于建立GⅡ.4型重组NoV VP1蛋白VLP双抗夹心ELISA抗原定量检测方法。该方法的线性测定范围为15.63~250 ng/mL,标准曲线R2均>0.98;准确性验证的加标回收率在72.23%~134.03%之间;重复性验证的相对标准偏差(relative standard deviation,RSD)为7.06%,中间精密性验证的RSD分别为8.04%和9.14%。结论建立了基于中和表位的GⅡ.4型重组NoV VP1蛋白VLP抗原含量检测方法,该方法专属性、准确性、精密性良好,可用于GⅡ.4型重组NoV VP1蛋白VLP定量检测,为GⅡ.4抗原相关疫苗研发中质量控制和检定提供了技术支持。 展开更多
关键词 g.4型诺如病毒 VP1蛋白 病毒样颗粒 中和表位 酶联免疫吸附测定
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青岛市GⅡ.15型诺如病毒的分子流行病学特征
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作者 赵丹 于维森 +3 位作者 张晓月 苏志磊 孙睿 汪照国 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2019年第12期754-759,共6页
目的了解青岛市GⅡ.15型诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2016年1月至2018年12月青岛市疑似诺如病毒腹泻患者的粪便标本1412份,采用实时定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)进行诺如病毒检测,反转录PCR扩增诺如病毒... 目的了解青岛市GⅡ.15型诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2016年1月至2018年12月青岛市疑似诺如病毒腹泻患者的粪便标本1412份,采用实时定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)进行诺如病毒检测,反转录PCR扩增诺如病毒可读框1和2结合区基因片段和VP1基因全长,进行序列测定、系统进化分析和同源建模。结果共7株GⅡ.15型诺如病毒株被检出,散发性病例4例和聚集性疫情1起,其VP1基因高度同源,与早期毒株J23/US/1999相比变异不大。青岛市GⅡ.15型毒株之间的氨基酸差异主要有位点第300位天冬酰胺和天冬氨酸的转换及第302位脯氨酸和丝氨酸的转换。同源建模推测,GⅡ.15型毒株VP1蛋白质由S区和P区(P1区包括第224位至276位和第431位至555位;P2区包括第277位至430位)组成。S区包含8个反平行β-夹心和2个α-螺旋;P1区包含1个α-螺旋和7个β-折叠片;P2区中6个反平行β-折叠形成桶状结构。P2区具有精氨酸-甘氨酸-缬氨酸模体(第289至291位)和第313位谷氨酰胺、第349位天冬酰胺、第389位谷氨酰胺3个特异性位点。天冬酰胺-甘氨酸-精氨酸模体位于精氨酸-甘氨酸-缬氨酸模体上游22个氨基酸处(第265至267位)。与人组织性血型抗原(histo-blood group antigens,HBGA)结合界面的主要特征位点分为位点Ⅰ(丝氨酸-苏氨酸-精氨酸-丙氨酸-组氨酸,第357至361位)、位点Ⅱ(第388位天冬氨酸)和位点Ⅲ(甘氨酸-甘氨酸,第454至455位),可能与GⅡ.4型VA387毒株和HBGA结合模式类似。结论GⅡ.15型诺如病毒虽然变异不大,但仍具有成为流行株的风险,需要对其加强监控和进一步研究。 展开更多
关键词 诺如病毒g.15型 流行病学 分子
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GⅡ.17型诺如病毒多克隆抗体的制备及应用 被引量:3
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作者 王文辉 万鑫 +5 位作者 霍玉奇 凌同 丁力 孟胜利 王泽鋆 申硕 《微生物学免疫学进展》 2017年第2期1-7,共7页
目的制备兔抗GⅡ.17型诺如病毒(GⅡ.17norovirus,GⅡ.17 NoV)病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)多克隆抗体(兔抗GⅡ.17 NoV VLPs多克隆抗体),用其建立组织血型抗原(histo-blood group antigen,HBGA)-GⅡ.17 NoV VLPs阻断试验,并对... 目的制备兔抗GⅡ.17型诺如病毒(GⅡ.17norovirus,GⅡ.17 NoV)病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)多克隆抗体(兔抗GⅡ.17 NoV VLPs多克隆抗体),用其建立组织血型抗原(histo-blood group antigen,HBGA)-GⅡ.17 NoV VLPs阻断试验,并对其进行初步应用。方法制备并纯化GⅡ.17 NoV VLPs,采用SDS-PAGE、电镜观察和粒径检测方法对其进行鉴定。将其免疫家兔制备兔抗GⅡ.17 NoV VLPs多克隆抗体,经Western blot对其进行鉴定,并用ELISA检测其效价及特异性。筛选与GⅡ.17 NoV VLPs结合力强的唾液HBGA受体类型,优化GⅡ.17NoV VLPs质量浓度及多克隆抗体稀释度,用兔抗GⅡ.17 NoV VLPs多克隆抗体建立HBGA-GⅡ.17 NoV VLPs阻断试验,并进行特异性验证及初步应用。结果 GⅡ.17 NoV VLPs经检测纯度为95%,且颗粒形态完整,粒径均一。制备的多克隆抗体在Western blot可见特异性条带,效价可达1∶25 600 000,并对其他基因型(GⅠ.2、GⅠ.7、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.7)VLPs的交叉反应较弱。GⅡ.17 NoV VLPs和A、B、O和AB 4种血型的唾液HBGA均能结合,差异无统计学意义(P>0.05);以GⅡ.17 NoV VLPs质量浓度为0.25μg/m L,多克隆抗体的稀释度为1∶160 000建立了HBGA-GⅡ.17 NoV VLPs阻断试验,并应用该方法对不同剂量GⅡ.17 NoV VLPs免疫的小鼠血清进行了半数阻断滴度检测。结论成功制备了高效价兔抗GⅡ.17 NoV VLPs多克隆抗体,建立了HBGA-GⅡ.17NoV VLPs阻断试验,且该方法特异性良好,可用于GⅡ.17 NoV VLPs免疫效果的评价。 展开更多
关键词 g.17型诺如病毒 病毒样颗粒 多克隆抗体 HBgA-g.17 NOV VLPs阻断试验
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