顺铂作为干预细胞周期的非特异性药物,广泛应用于临床抗肿瘤治疗中,但顺铂可诱导肾细胞死亡,损害肾功能。调节性细胞死亡(regulated all death,RCD)是指具有明确病理机制的受控细胞程序性死亡的过程。近年来,对于各种类型急性肾损伤(acu...顺铂作为干预细胞周期的非特异性药物,广泛应用于临床抗肿瘤治疗中,但顺铂可诱导肾细胞死亡,损害肾功能。调节性细胞死亡(regulated all death,RCD)是指具有明确病理机制的受控细胞程序性死亡的过程。近年来,对于各种类型急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)发病机制相关的细胞死亡方式研究较多,但细胞死亡在顺铂诱导的肾损伤中的作用及机制研究仍存在空缺。因此,全面了解顺铂诱导的肾毒性中细胞死亡的机制可能会为顺铂诱导的肾病提供新的治疗靶点。综述了顺铂诱导的肾损伤中的细胞死亡方式,包括细胞凋亡、坏死性凋亡、焦亡和铁死亡,以期为在肿瘤治疗中制定降低肾损伤的顺铂用药方案提供参考。展开更多
目的基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)构建结肠腺癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)临床预测模型与验证。方法从TCGA下载结肠腺癌转录组和临床数据,从基因集富集分析(gene set enrichm...目的基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)构建结肠腺癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)临床预测模型与验证。方法从TCGA下载结肠腺癌转录组和临床数据,从基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库及检索文献得到坏死性凋亡相关基因。运用R软件通过共表达筛选出差异坏死性凋亡相关LncRNA,采用单因素分析筛选出预后相关坏死性凋亡LncRNA,运用Lasso回归分析和多因素分析构建预后风险模型。通过差异分析、Kaplan-Meier生存分析、风险分析、受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)、临床分组模型验证以评价该模型的可行性和准确性。采用多因素进行模型的独立预后分析,同时绘制Nomogram图预测患者1年、3年和5年的生存率,凭借校准曲线评价其准确性和预测能力。结果坏死性凋亡LncRNA共1039个,预后相关的坏死性凋亡LncRNA共46个。Lasso回归分析以AP005264.1、ALMS1-IT1、AL354993.2、LINC00513、AC145423.2、AC008764.8构建预后风险模型,模型评价显示可区分高低风险组的患者,高风险的患者较低风险预后较差(P<0.05);AUC显示模型具有较高的准确性;多因素分析显示风险评分可作为结肠腺癌的独立预后因子;临床分组的模型验证显示模型同时适用于不同年龄、性别、Stage、N、T等临床症状;Nomgarm分析内部验证中显示校准曲线显示具有良好的拟合度,提示该列线图预测模型具有良好预测能力。GSEA富集分析结果显示在高风险组中活跃的功能或通路有缺口信号通路、磷脂酰肌醇信号系统、癌症的途径、JAKSTAT信号通路等,在低风险组中活跃的功能或通路有阿尔茨海默病、柠檬酸循环、亨廷顿病、氧化磷酸化等。结论本研究建立了6个坏死性凋亡展开更多
文摘顺铂作为干预细胞周期的非特异性药物,广泛应用于临床抗肿瘤治疗中,但顺铂可诱导肾细胞死亡,损害肾功能。调节性细胞死亡(regulated all death,RCD)是指具有明确病理机制的受控细胞程序性死亡的过程。近年来,对于各种类型急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)发病机制相关的细胞死亡方式研究较多,但细胞死亡在顺铂诱导的肾损伤中的作用及机制研究仍存在空缺。因此,全面了解顺铂诱导的肾毒性中细胞死亡的机制可能会为顺铂诱导的肾病提供新的治疗靶点。综述了顺铂诱导的肾损伤中的细胞死亡方式,包括细胞凋亡、坏死性凋亡、焦亡和铁死亡,以期为在肿瘤治疗中制定降低肾损伤的顺铂用药方案提供参考。
文摘目的基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)构建结肠腺癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)临床预测模型与验证。方法从TCGA下载结肠腺癌转录组和临床数据,从基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库及检索文献得到坏死性凋亡相关基因。运用R软件通过共表达筛选出差异坏死性凋亡相关LncRNA,采用单因素分析筛选出预后相关坏死性凋亡LncRNA,运用Lasso回归分析和多因素分析构建预后风险模型。通过差异分析、Kaplan-Meier生存分析、风险分析、受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)、临床分组模型验证以评价该模型的可行性和准确性。采用多因素进行模型的独立预后分析,同时绘制Nomogram图预测患者1年、3年和5年的生存率,凭借校准曲线评价其准确性和预测能力。结果坏死性凋亡LncRNA共1039个,预后相关的坏死性凋亡LncRNA共46个。Lasso回归分析以AP005264.1、ALMS1-IT1、AL354993.2、LINC00513、AC145423.2、AC008764.8构建预后风险模型,模型评价显示可区分高低风险组的患者,高风险的患者较低风险预后较差(P<0.05);AUC显示模型具有较高的准确性;多因素分析显示风险评分可作为结肠腺癌的独立预后因子;临床分组的模型验证显示模型同时适用于不同年龄、性别、Stage、N、T等临床症状;Nomgarm分析内部验证中显示校准曲线显示具有良好的拟合度,提示该列线图预测模型具有良好预测能力。GSEA富集分析结果显示在高风险组中活跃的功能或通路有缺口信号通路、磷脂酰肌醇信号系统、癌症的途径、JAKSTAT信号通路等,在低风险组中活跃的功能或通路有阿尔茨海默病、柠檬酸循环、亨廷顿病、氧化磷酸化等。结论本研究建立了6个坏死性凋亡