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鸡蛔虫线粒体cox1和nad4基因的遗传变异分析 被引量:15
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作者 郝桂英 何学谦 万润 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第1期113-122,共10页
为探究鸡蛔虫的种内遗传变异和系统发育关系,对分离自四川省西昌市的15个鸡蛔虫分离株的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅳ(nad4)基因全序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并用cox1... 为探究鸡蛔虫的种内遗传变异和系统发育关系,对分离自四川省西昌市的15个鸡蛔虫分离株的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅳ(nad4)基因全序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并用cox1和nad4基因部分序列构建鸡蛔虫与其他蛔虫的NJ树和贝叶斯树。测序结果显示,所获得的鸡蛔虫cox1和nad4基因全序列长度分别为1 152和1 236bp,分别有33和40个变异位点,碱基变异率分别为0~2.1%和0~2.3%;分别检测到8和11个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.733±0.124和0.933±0.054,核苷酸多样性分别为0.00433±0.00153和0.00541±0.00157,平均遗传距离分别为0.004和0.005。构建的种系发育树均显示15个鸡蛔虫西昌分离株与其他国家/地区的鸡蛔虫分离株聚类形成一个分支,与鸽蛔虫的亲缘关系最近,与其他蛔虫所属的分支相隔较远。研究结果表明鸡蛔虫西昌分离株的遗传变异程度低,且nad4基因比cox1基因更适合作为研究鸡蛔虫分离株遗传变异的分子标记。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 cox1基因 nad4基因 遗传变异
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湖南省蛇源裂头蚴线粒体nad4和nad5基因遗传多样性分析 被引量:7
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作者 龚腾芳 贺峻琳 +2 位作者 谭磊 谢李星 刘伟 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期35-39,共5页
目的了解湖南省蛇源裂头蚴种群遗传多样性及其系统发生关系。方法采用PCR技术扩增湖南省7株蛇源裂头蚴线粒体nad4基因和nad5基因部分序列(pnad4和pnad5),扩增产物测序后用DNAMAN 7.0、Meg Align、Dna SP 5.0和MEGA 5.0软件进行同源性和... 目的了解湖南省蛇源裂头蚴种群遗传多样性及其系统发生关系。方法采用PCR技术扩增湖南省7株蛇源裂头蚴线粒体nad4基因和nad5基因部分序列(pnad4和pnad5),扩增产物测序后用DNAMAN 7.0、Meg Align、Dna SP 5.0和MEGA 5.0软件进行同源性和系统进化分析。结果湖南省7株蛇源裂头蚴pnad4和pnad5基因序列长度分别约为578 bp和484 bp,其碱基变异率分别为0~2.8%和0~0.8%;均检测到4个单倍型,总单倍型多样性分别为0.810±0.016和0.905±0.011,核苷酸多样性分别为0.006±0.005和0.004±0.003,平均核苷酸差异为3.960和1.905。构建的系统进化树显示,7株裂头蚴分离株与来自不同地区或不同宿主的猬迭宫绦虫同在一个分支,属于猬迭宫绦虫;与阔节迭宫绦虫相隔较近,与其他绦虫相隔较远。结论湖南省蛇源猬迭宫绦虫遗传变异程度低,pnad4基因和pnad5基因均可作为检测猬迭宫绦虫的分子遗传标记。 展开更多
关键词 蛇源裂头蚴 nad4基因 nad5基因 种系发育关系 湖南省
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湖南省山羊脑多头蚴的线粒体nad1和nad4基因的序列测定及种系发育分析 被引量:6
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作者 何德肆 徐平源 彭运潮 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1763-1767,共5页
本研究旨在阐明脑多头蚴湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位1基因(nad1)部分序列(pnad1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad1和pnad4序列重构脑多头蚴... 本研究旨在阐明脑多头蚴湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位1基因(nad1)部分序列(pnad1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad1和pnad4序列重构脑多头蚴与其它带科绦虫的种群遗传关系。利用聚合酶链反应(PCR)扩增脑多头蚴的pnad1和pnad4,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,再用Phylip3.67程序MP法和Mage4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树,同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示所获得的pnad1和pnad4序列长度分别均为666和887bp,湖南分离株与已知多头带绦虫位于同一分枝。由于脑多头蚴pnad1和pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故均可作为种间遗传变异研究的标记,从而为脑多头蚴的分子流行病学和其相关疾病的诊断奠定基础。 展开更多
关键词 多头带绦虫 线粒体DNA nad1基因 nad4基因 种系发育关系
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鸡蛔虫COX2和NAD4rDNA的序列测定及分析 被引量:8
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作者 李淼 侯强红 +3 位作者 蔡丝丝 李奔 李林波 侯利兰 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期19-21,共3页
本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pna... 本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pnad4,应用clustalx1.81程序对序列进行比对,结果显示,所获得的cox2(pcox2)and nad4(pnad4)序列长度一致,为350bp(pcox2)and 400bp(pnad4)。由于鸡蛔虫pcox2and pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为鸡蛔虫的分类鉴定及进一步的分子流行病学调查提供了基础。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 线粒体DNA cox2基因 nad4基因 种系发育关系
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猬裂头蚴线粒体nad4基因的克隆及序列分析 被引量:7
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作者 伍慧兰 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第12期61-63,共3页
以从湖南长沙和湘西黑斑蛙大腿肌肉中采集的2条猬裂头蚴作为研究对象,用引物ND4F及ND4R扩增猬裂头蚴的pnad4片段,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,同时利用DNA Star5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示,来自湖南长沙和湘西... 以从湖南长沙和湘西黑斑蛙大腿肌肉中采集的2条猬裂头蚴作为研究对象,用引物ND4F及ND4R扩增猬裂头蚴的pnad4片段,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,同时利用DNA Star5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示,来自湖南长沙和湘西的2条猬裂头蚴的pnad4序列均为640 bp。研究结果为猬裂头蚴进一步的分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猬裂头蚴 线粒体DNA nad4基因 序列分析
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猪囊尾蚴西昌分离株线粒体Cytb和nad4基因的序列测定与种系发育分析 被引量:6
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作者 郝桂英 《动物医学进展》 北大核心 2015年第5期59-63,共5页
利用PCR技术对2个猪囊尾蚴西昌分离株的线粒体细胞色素b(Cytb)基因全序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)进行扩增,分析其遗传变异,并用MEGA 5.0程序NJ法绘制种系发育树,探讨不同地区来源的猪囊尾蚴种系... 利用PCR技术对2个猪囊尾蚴西昌分离株的线粒体细胞色素b(Cytb)基因全序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)进行扩增,分析其遗传变异,并用MEGA 5.0程序NJ法绘制种系发育树,探讨不同地区来源的猪囊尾蚴种系发育关系。测序结果显示,2个猪囊尾蚴分离株的Cytb基因全序列长度均为1 068bp,nad4基因部分序列长度均为815bp,核苷酸序列同源性均为99.8%。种系发育分析结果显示,所有猪囊尾蚴分离株形成一个分支,2个西昌分离株均属于猪带绦虫亚洲基因型。结果表明,Cytb和nad4基因均可用于猪带绦虫的分子分类,为猪带绦虫病/猪囊尾蚴病的分子诊断奠定基础。 展开更多
关键词 猪囊尾蚴 CYTB基因 nad4基因 种系发育
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羊毛尾线虫线粒体nad4基因的序列变异分析 被引量:3
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作者 王燕 杨言川 +3 位作者 张悦文 李佳缘 朱兴全 刘国华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第4期81-84,共4页
本研究旨在阐明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体NADH脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad4序列构建其与其他鞭虫的进化关系。应用PCR扩增羊鞭虫虫株的pnad4,将所获得的序列应用ClustalX 1.8... 本研究旨在阐明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体NADH脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad4序列构建其与其他鞭虫的进化关系。应用PCR扩增羊鞭虫虫株的pnad4,将所获得的序列应用ClustalX 1.81程序进行比对,然后用Mega 5.0程序NJ法绘制种系发育树。本试验扩增所获得的pnad4序列长度一致,均为827bp,种内变异在0~1.5%之间。种系发育分析结果表明,12个羊鞭虫分离株位于同一分支。由于羊鞭虫nad4序列种内相对保守,种间差异较大(37.8%~45.6%),故可作为种间鉴定检测研究的遗传标记,本研究结果为进一步研究羊鞭虫的群体遗传结构奠定了基础。 展开更多
关键词 羊鞭虫 线粒体DNA nad4基因 种系发育关系
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基于线粒体nad1和nad4基因对四川省多头带绦虫种群遗传多样性的分析 被引量:2
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作者 郝桂英 杨应东 +1 位作者 周英姿 杨光友 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期251-257,共7页
为探讨多头带绦虫的种群遗传多样性,应用PCR方法扩增20株分离自四川省攀枝花市、雅安市、成都市的山羊脑部和肌间的多头蚴的线粒体nadl基因和nad4基因的部分序列,并进行分析。序列分析结果显示,20株多头蚴的pnadl基因和pnad4基因序... 为探讨多头带绦虫的种群遗传多样性,应用PCR方法扩增20株分离自四川省攀枝花市、雅安市、成都市的山羊脑部和肌间的多头蚴的线粒体nadl基因和nad4基因的部分序列,并进行分析。序列分析结果显示,20株多头蚴的pnadl基因和pnad4基因序列分别有2个和8个变异位点,长度分别为753bp和801bp,变异率分别为0~0.3%和0~0.8%,检测出3个和6个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.574±0.055和0.742±0.074,核苷酸多样性分别为0.00082±0.00053和0.00288±0.001,平均遗传距离分别为0.002和0.003。构建的种系发育树显示,四川分离株与已知多头带绦虫位于同一分支,且与分布的地理区域、寄生部位没有直接的相关性。结果表明,四川多头带绦虫的遗传多样性水平低,其中nadl基因的遗传多样性水平低于nad4基因的遗传多样性。 展开更多
关键词 多头带绦虫 nad1基因 nad4基因 遗传多样性 四川省
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枝睾阔盘吸虫凉山州分离株nad4基因部分序列测定与种系发育分析
9
作者 郝桂英 易利 +1 位作者 潘用清 何学谦 《现代农业科技》 2019年第12期200-201,208,共3页
为探究山羊源枝睾阔盘吸虫的种内遗传变异和系统发育关系,对采集自四川省凉山州的5个吸虫样品nad4基因部分序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并构建种系发育树。测序结果显示,所测得的5个山羊源枝睾阔盘吸虫nad4基因部分序列长度均为789... 为探究山羊源枝睾阔盘吸虫的种内遗传变异和系统发育关系,对采集自四川省凉山州的5个吸虫样品nad4基因部分序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并构建种系发育树。测序结果显示,所测得的5个山羊源枝睾阔盘吸虫nad4基因部分序列长度均为789bp,核苷酸同源性为99.5%~100.0%,共检测到4个单倍型、4个变异位点。系统发育树显示,5个山羊源枝睾阔盘吸虫凉山州分离株聚在同一小支上,未与胰阔盘吸虫聚类在一支上,能与其他吸虫相鉴别。本研究结果为枝睾阔盘吸虫的分子分类和种群遗传的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 枝睾阔盘吸虫 山羊 nad4基因 种系发育
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玉米花粉发育过程中线粒体nad4基因的转录规律
10
作者 李晨东 陈德富 张俊 《河北工业大学学报》 CAS 2000年第1期91-93,共3页
以玉米花粉为材料,提取总RNA后通过定量斑点杂交技术研究花粉发育过程中线 粒体nad4基因的转录规律.结果表明,在幼叶及不同发育时期的花粉中,线粒体nad4基 因的转录不存在其他线粒体基因那样的高度时空特异性;而是表现... 以玉米花粉为材料,提取总RNA后通过定量斑点杂交技术研究花粉发育过程中线 粒体nad4基因的转录规律.结果表明,在幼叶及不同发育时期的花粉中,线粒体nad4基 因的转录不存在其他线粒体基因那样的高度时空特异性;而是表现出等量转录规律.因此 我们认为花粉发育过程中线粒体基因的转录随基因种类、组织种类及植物种类而不同,或 表现时空特异性,或表现稳定的转录规律,同时对玉米不同发育阶段花粉总RNA的分离 技术进行了研究. 展开更多
关键词 玉米 花粉 发育过程 线粒体 nad4基因 转录规律
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