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质谱多反应监测技术筛查先天性心脏畸形蛋白标志物的价值 被引量:2
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作者 陈骊珠 张墨 +1 位作者 马巍 袁正伟 《中华实用诊断与治疗杂志》 2018年第1期14-17,共4页
目的探讨质谱多反应监测技术(multiple reaction monitoring-mass spectrometry,MRM-MS)对先天性心脏畸形(congenital heart diseases,CHD)蛋白标志物的筛查价值。方法 CHD胎儿孕妇30例为CHD组,正常胎儿孕妇20例为对照组,分别采用MRM-M... 目的探讨质谱多反应监测技术(multiple reaction monitoring-mass spectrometry,MRM-MS)对先天性心脏畸形(congenital heart diseases,CHD)蛋白标志物的筛查价值。方法 CHD胎儿孕妇30例为CHD组,正常胎儿孕妇20例为对照组,分别采用MRM-MS法及ELISA法检测2组血清LMNA、TPM4、MYH9、TLN1、APOC1、PF4V1、SAA4和HP蛋白表达水平,Pearson法分析ELISA法与MRM-MS定量检测结果的相关性,ROC曲线评估候选蛋白标志物诊断CHD的效能。结果MRM-MS定量检测CHD组血清LMNA[(0.18±0.16)fmol/mL]、TPM4[(0.94±0.46)fmol/mL]水平低于对照组[(0.30±0.19)、(1.56±0.88)fmol/mL](P<0.05),APOC1[(33.89±13.65)fmol/mL]高于对照组[(22.81±10.49)fmol/mL](P<0.05),MYH9、TLN1、PF4V1、HP、SAA4表达水平与对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05);血清LMNA以0.14fmol/mL为最佳截断值,诊断CHD的AUC为0.800(95%CI:0.662~0.938,P<0.001),准确率为78.6%,灵敏度为100.0%,特异度为54.5%;血清TPM4以0.87fmol/mL为最佳截断值,诊断CHD的AUC为0.752(95%CI:0.601~0.904,P=0.001),准确率为73.8%,灵敏度为90.0%,特异度为54.6%;血清APOC1以22.8fmol/mL为最佳截断值,诊断CHD的AUC为0.777(95%CI:0.621~0.933,P<0.001),准确率为81.0%,灵敏度为80.0%,特异度为81.8%;LMNA、TPM4、APOC1分别以0.80、0.79、67.78fmol/mL为最佳截断值时,3种蛋白联合诊断CHD的准确率最高(88.1%),灵敏度为85.0%,特异度为90.9%;Pearson相关分析结果显示,MRM-MS定量与ELISA检测的LMNA、TPM4、APOC1蛋白水平均呈正相关(r=0.74,P=0.002;r=0.75,P=0.001;r=0.78,P=0.001)。结论 MRM-MS定量技术可获得LMNA、TPM4、APOC1 3种蛋白分子标志物,其联合诊断CHD具有较高的准确率。 展开更多
关键词 先天性心脏畸形 产前诊断 质谱多反应监测技术 血清标志物
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细胞间黏附分子1的MRM-MS测定方法建立与优化 被引量:1
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作者 黄东萍 李洪涛 +4 位作者 曾小云 龙静铧 臧宁 周怡 仇小强 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1102-1105,共4页
目的建立并优化室间隔缺损潜在生物标记物细胞间黏附分子1(ICAM-1)MRM-MS测定方法。方法借助Uni Prot数据库和辅助软件Skyline建立ICAM-1多重反应监测质谱定量(MRM-MS)方法,进一步筛选其各肽段及母子离子对,并通过改变MS的碰撞能量CE值... 目的建立并优化室间隔缺损潜在生物标记物细胞间黏附分子1(ICAM-1)MRM-MS测定方法。方法借助Uni Prot数据库和辅助软件Skyline建立ICAM-1多重反应监测质谱定量(MRM-MS)方法,进一步筛选其各肽段及母子离子对,并通过改变MS的碰撞能量CE值和去簇电压DP值进一步优化其MRM质谱扫描方法。结果从ICAM-1的11个肽段88对离子对中优选出3个肽段9对离子对作为ICAM-1的定量依据。采用优化后的MRMMS进行检测,10个血清样本中ICAM-1蛋白含量为(318.40±97.20)ng/m L,与经酶联免疫法测定的结果(330.30±130.24)ng/m L相比差异无统计学意义(P>0.05)。结论借助Uni Prot数据库和辅助软件Skyline,经过多个循环可以建立并优化ICAM-1蛋白的MRM-MS测定方法。 展开更多
关键词 ICAM-1 多重反应监测质谱定量(MRM-MS) 优化
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质谱MRM技术结合稳定同位素标记法的应用进展 被引量:2
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作者 齐林玉 姜淼 +2 位作者 郭艳 王迎 陈平 《生命科学研究》 CAS CSCD 2015年第5期444-451,共8页
定量检测是生物化学研究中最常见的一种分析方法,可以显示蛋白质的差异表达及翻译后修饰情况,有助于了解酶的活性状态、信号通路及活性分子间相互作用网络。生物质谱以其高通量、高灵敏度、高分辨率等特点使定量检测技术有了质的飞跃,... 定量检测是生物化学研究中最常见的一种分析方法,可以显示蛋白质的差异表达及翻译后修饰情况,有助于了解酶的活性状态、信号通路及活性分子间相互作用网络。生物质谱以其高通量、高灵敏度、高分辨率等特点使定量检测技术有了质的飞跃,促进了蛋白质组学各个领域的发展。近年来出现的质谱多反应监测技术引起了众多研究者的关注,已被广泛应用在目标定量蛋白质组学研究中。通过查阅文献资料,综述了质谱多反应监测技术结合稳定同位素标记法在蛋白质组学研究中的应用原理及特点,总结了近年来的一些研究进展,最后分析了该技术的局限性及可能优化改进的方面,以便使该项技术能够被相关研究人员很好利用。 展开更多
关键词 质谱多反应监测技术 稳定同位素标记法 SID-MRM-MS 蛋白质组学 应用进展
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18O同位素标记定量肽段串联体蛋白质结合同位素稀释-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法 被引量:2
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作者 李楠楠 周廉淇 +7 位作者 毛心丽 张姣 卫军营 林虹君 李佳斌 田芳 张养军 钱小红 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期522-530,共9页
建立了定量肽段串联体蛋白质(concatamers of Q peptides,QconCATs)结合18O同位素标记-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法。首先对QconCAT重组蛋白质进行了纯度表征,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)表征结果表明重组... 建立了定量肽段串联体蛋白质(concatamers of Q peptides,QconCATs)结合18O同位素标记-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法。首先对QconCAT重组蛋白质进行了纯度表征,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)表征结果表明重组蛋白质的纯度在99%以上,相对分子质量约为63.4 kDa。对QconCAT重组蛋白质酶切后的肽段混合物进行质谱分析,并经pFind和pLabel软件处理,验证了目标肽段。还考察了QconCAT重组蛋白质的酶切效率和18O标记效率,并对QconCAT蛋白质结合18O标记-同位素稀释-多反应监测质谱方法进行了评价。实验结果表明,采用该方法对腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tengcongensis,TTE)中选定蛋白质的肽段进行绝对含量测定时,相对标准偏差小于20%,准确度较高,说明该方法可用于复杂生物样本中蛋白质的绝对定量。更重要的是所建方法不仅解决了细胞培养氨基酸稳定同位素标记(SILAC)技术的重标试剂价格昂贵的问题,也为定量蛋白质组学提供了一种新的方法。 展开更多
关键词 定量肽段串联体蛋白质 同位素稀释 多反应监测质谱 18O标记 蛋白质组学
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