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多粒度PPI网络描述模型及其蚁群优化的功能模块检测方法
被引量:
1
1
作者
冀俊忠
吕嘉伟
《中国科技论文》
CAS
北大核心
2014年第7期762-769,共8页
针对蚁群算法在大规模蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络中进行功能模块检测所暴露的时间性能方面的不足,提出了一种基于多粒度描述和蚁群优化的快速求解算法。首先,从粒度计算的角度,给出了一种新的多粒度PPI网络...
针对蚁群算法在大规模蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络中进行功能模块检测所暴露的时间性能方面的不足,提出了一种基于多粒度描述和蚁群优化的快速求解算法。首先,从粒度计算的角度,给出了一种新的多粒度PPI网络描述模型;然后,基于该模型,设计了融合功能和结构信息的粒度划分,粗粒度的蚁群寻优,解的还原与优化3个阶段的求解过程。在大规模PPI网络上的实验表明:算法在保证检测质量的同时,能显著降低利用蚁群算法进行功能模块检测的求解时间,而且与近年来的一些经典算法相比在检测精度上也具有一定的优势。
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关键词
蛋白质相互作用网络
功能模块检测
多粒度描述模型
蚁群优化
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职称材料
Peer-to-Peer环境下多粒度Trust模型构造
被引量:
71
2
作者
张骞
张霞
+2 位作者
文学志
刘积仁
Ting Shan
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2006年第1期96-107,共12页
信任是多方面的,在不同的应用场景中,同一节点在不同领域具有不同的可信度.现有信任模型粒度过于粗糙,不能很好地解决同一Peer节点在不同领域、不同方面的可信度计算问题.据此,提出一种新的Peer-to-Peer环境下的多粒度信任模型,并给出...
信任是多方面的,在不同的应用场景中,同一节点在不同领域具有不同的可信度.现有信任模型粒度过于粗糙,不能很好地解决同一Peer节点在不同领域、不同方面的可信度计算问题.据此,提出一种新的Peer-to-Peer环境下的多粒度信任模型,并给出该模型的数值分析和分布式实现方法.分析及仿真结果表明,该模型与已有模型相比,在可信度计算的粒度、模型的安全性等方面有较大的提高.
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关键词
对等网络
本体
信任树
档案点
多粒度信任模型
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职称材料
基于多粒度的旅行商问题描述及其蚁群优化算法
被引量:
19
3
作者
冀俊忠
黄振
+1 位作者
刘椿年
代启国
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2010年第3期434-444,共11页
针对蚁群算法在求解大规模旅行商问题(Traveling Salesman Problems,TSP)中时间性能方面的不足,提出了一种快速的求解算法.首先,从TSP问题描述入手,给出了一种新的多粒度的问题描述模型;然后,基于该模型,设计了包括基于密度聚类的粒度...
针对蚁群算法在求解大规模旅行商问题(Traveling Salesman Problems,TSP)中时间性能方面的不足,提出了一种快速的求解算法.首先,从TSP问题描述入手,给出了一种新的多粒度的问题描述模型;然后,基于该模型,设计了包括基于密度聚类的粒度划分、粗粒度的蚁群寻优、粒度间的连接、细粒度的蚁群寻优、粒度间可行解的合成以及循环分段优化6个阶段在内的求解算法.算法的复杂度分析及在中、大规模TSP问题上的实验表明:本算法的时间性能不仅比经典的蚁群算法有显著的提高,而且与近年来的一些同类算法相比也具有一定的优势,显示了快速求解大规模TSP问题的能力.
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关键词
旅行商问题
多粒度城市模型
蚁群算法
聚类算法
分段优化
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职称材料
题名
多粒度PPI网络描述模型及其蚁群优化的功能模块检测方法
被引量:
1
1
作者
冀俊忠
吕嘉伟
机构
北京工业大学计算机学院
出处
《中国科技论文》
CAS
北大核心
2014年第7期762-769,共8页
基金
高等学校博士学科点专项科研基金资助项目(20121103110031)
文摘
针对蚁群算法在大规模蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络中进行功能模块检测所暴露的时间性能方面的不足,提出了一种基于多粒度描述和蚁群优化的快速求解算法。首先,从粒度计算的角度,给出了一种新的多粒度PPI网络描述模型;然后,基于该模型,设计了融合功能和结构信息的粒度划分,粗粒度的蚁群寻优,解的还原与优化3个阶段的求解过程。在大规模PPI网络上的实验表明:算法在保证检测质量的同时,能显著降低利用蚁群算法进行功能模块检测的求解时间,而且与近年来的一些经典算法相比在检测精度上也具有一定的优势。
关键词
蛋白质相互作用网络
功能模块检测
多粒度描述模型
蚁群优化
Keywords
protein-protein
interaction
network
functional
module
detection
multiple
grain
model
ACO
algorithm
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
Peer-to-Peer环境下多粒度Trust模型构造
被引量:
71
2
作者
张骞
张霞
文学志
刘积仁
Ting Shan
机构
东北大学计算机软件国家工程研究中心
School of Information Technology and Electronical Engineering
出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2006年第1期96-107,共12页
基金
国家自然科学基金
江苏省自然科学基金~~
文摘
信任是多方面的,在不同的应用场景中,同一节点在不同领域具有不同的可信度.现有信任模型粒度过于粗糙,不能很好地解决同一Peer节点在不同领域、不同方面的可信度计算问题.据此,提出一种新的Peer-to-Peer环境下的多粒度信任模型,并给出该模型的数值分析和分布式实现方法.分析及仿真结果表明,该模型与已有模型相比,在可信度计算的粒度、模型的安全性等方面有较大的提高.
关键词
对等网络
本体
信任树
档案点
多粒度信任模型
Keywords
peer-to-peer
ontology
trust
tree
documentary
point
multiple
-
grain
trust
model
分类号
TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
基于多粒度的旅行商问题描述及其蚁群优化算法
被引量:
19
3
作者
冀俊忠
黄振
刘椿年
代启国
机构
北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室
出处
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2010年第3期434-444,共11页
基金
国家自然科学基金重大基金项目(60496322)
北京市自然科学基金项目(4083034
4102010)
文摘
针对蚁群算法在求解大规模旅行商问题(Traveling Salesman Problems,TSP)中时间性能方面的不足,提出了一种快速的求解算法.首先,从TSP问题描述入手,给出了一种新的多粒度的问题描述模型;然后,基于该模型,设计了包括基于密度聚类的粒度划分、粗粒度的蚁群寻优、粒度间的连接、细粒度的蚁群寻优、粒度间可行解的合成以及循环分段优化6个阶段在内的求解算法.算法的复杂度分析及在中、大规模TSP问题上的实验表明:本算法的时间性能不仅比经典的蚁群算法有显著的提高,而且与近年来的一些同类算法相比也具有一定的优势,显示了快速求解大规模TSP问题的能力.
关键词
旅行商问题
多粒度城市模型
蚁群算法
聚类算法
分段优化
Keywords
TSP
multiple
-
grain
city
model
ACO
algorithm
clustering
algorithm
subsection
optimization
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多粒度PPI网络描述模型及其蚁群优化的功能模块检测方法
冀俊忠
吕嘉伟
《中国科技论文》
CAS
北大核心
2014
1
下载PDF
职称材料
2
Peer-to-Peer环境下多粒度Trust模型构造
张骞
张霞
文学志
刘积仁
Ting Shan
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2006
71
下载PDF
职称材料
3
基于多粒度的旅行商问题描述及其蚁群优化算法
冀俊忠
黄振
刘椿年
代启国
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2010
19
下载PDF
职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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