期刊导航
期刊开放获取
cqvip
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
靶向mrp1基因shRNA表达载体构建
1
作者
邵淑丽
崔婷婷
+3 位作者
刘迁
陈丽
贾红双
吴敏
《现代肿瘤医学》
CAS
2010年第2期250-252,共3页
目的:构建靶向mrp1基因的shRNA表达载体。方法:根据mrp1基因序列设计并合成编码shRNA的DNA模板,将其定向克隆到psilencer2.1U6-neo质粒上,构建重组载体。经菌落PCR和DNA测序分析检测重组载体构建结果。结果:成功构建靶向mrp1基因shRNA...
目的:构建靶向mrp1基因的shRNA表达载体。方法:根据mrp1基因序列设计并合成编码shRNA的DNA模板,将其定向克隆到psilencer2.1U6-neo质粒上,构建重组载体。经菌落PCR和DNA测序分析检测重组载体构建结果。结果:成功构建靶向mrp1基因shRNA表达载体。结论:为进一步研究mrp1基因在肺癌多药耐药中的作用以及探索肺癌的基因治疗奠定了基础。
展开更多
关键词
mrp1基因
psilencer2.1U6-neo质粒
SHRNA
表达载体
下载PDF
职称材料
基于加权基因表达网络和LASSO回归筛选骨肉瘤预后和转移相关基因
2
作者
张毅
姚士军
刘朝旭
《生物医学工程与临床》
CAS
2022年第3期351-358,共8页
目的运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法筛选出与骨肉瘤转移和预后相关的基因,为骨肉瘤患者是否发生转移及其预后提供参考依据。方法利用UCSC Xena网站下载癌症基因组图谱-产生有效治疗方法研究项目...
目的运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法筛选出与骨肉瘤转移和预后相关的基因,为骨肉瘤患者是否发生转移及其预后提供参考依据。方法利用UCSC Xena网站下载癌症基因组图谱-产生有效治疗方法研究项目(TCGA-TARGET)骨肉瘤患者基因表达谱和临床相关资料(检索时间:建库至2021年5月31日),数据库内含有84例骨肉瘤患者,其中男性37例,女性47例;平均年龄14.99岁(标准差7.80岁)。采用WGCNA和LASSO对84例骨肉瘤患者基因表达谱进行分析并筛选与预后和骨肉瘤转移相关基因;利用ONCOMINE数据库(检索时间:建库至2021年5月31日)进行外部验证。采用基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析筛选模块涉及功能和通路,基因组富集分析(GSEA)分析核心基因所涉及通路。结果通过WGCNA筛选一共获得67个模块,其中深蓝模块为核心模块,对深蓝模块中所包含的214基因进行LASSO分析,结合蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析和复杂分子关联分析(MOCDE)得分,筛选出线粒体核糖体蛋白48基因(MRPL48)、核糖体RNA加工8基因(RRP8)、核糖体RNA加工9基因(RRP9)作为核心靶基因。利用受试者工作特性(ROC)曲线分析核心基因预测骨肉瘤转移概率,结果提示RRP8,曲线下面积(AUC)=0.504,P=0.955;RRP9,AUC=0.509,P=0.913;MRPL48,AUC=0.663,P=0.025。可以明确MRPL48在骨肉瘤患者中的表达高低与其发生、预后明确相关。结论基于WGCNA并结合LASSO、PPI、MOCDE方法共同筛选获得的MRPL48与骨肉瘤发生和患者生存相关,可为骨肉瘤发生、转移和治疗的研究提供参考依据。
展开更多
关键词
骨肉瘤
癌症基因组图谱数据库
线粒体核糖体蛋白48基因(
mrpl
48)
加权基因共表达网络分析
下载PDF
职称材料
题名
靶向mrp1基因shRNA表达载体构建
1
作者
邵淑丽
崔婷婷
刘迁
陈丽
贾红双
吴敏
机构
齐齐哈尔大学生命科学与工程学院
出处
《现代肿瘤医学》
CAS
2010年第2期250-252,共3页
基金
黑龙江省自然科学基金(编号:C200624)
黑龙江省教育厅科学技术项目(编号:11511447)
黑龙江省教育厅研究生创新科研项目(编号:YJSCX2009-106HLJ)
文摘
目的:构建靶向mrp1基因的shRNA表达载体。方法:根据mrp1基因序列设计并合成编码shRNA的DNA模板,将其定向克隆到psilencer2.1U6-neo质粒上,构建重组载体。经菌落PCR和DNA测序分析检测重组载体构建结果。结果:成功构建靶向mrp1基因shRNA表达载体。结论:为进一步研究mrp1基因在肺癌多药耐药中的作用以及探索肺癌的基因治疗奠定了基础。
关键词
mrp1基因
psilencer2.1U6-neo质粒
SHRNA
表达载体
Keywords
mrpl
gene
psilencer
2.1
U6
-
neo
plasmid
shRNA
expression
vector
分类号
R730 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
基于加权基因表达网络和LASSO回归筛选骨肉瘤预后和转移相关基因
2
作者
张毅
姚士军
刘朝旭
机构
泰康同济(武汉)医院
华中科技大学同济医学院附属同济医院
出处
《生物医学工程与临床》
CAS
2022年第3期351-358,共8页
基金
国家自然科学基金面上项目(51877097)。
文摘
目的运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法筛选出与骨肉瘤转移和预后相关的基因,为骨肉瘤患者是否发生转移及其预后提供参考依据。方法利用UCSC Xena网站下载癌症基因组图谱-产生有效治疗方法研究项目(TCGA-TARGET)骨肉瘤患者基因表达谱和临床相关资料(检索时间:建库至2021年5月31日),数据库内含有84例骨肉瘤患者,其中男性37例,女性47例;平均年龄14.99岁(标准差7.80岁)。采用WGCNA和LASSO对84例骨肉瘤患者基因表达谱进行分析并筛选与预后和骨肉瘤转移相关基因;利用ONCOMINE数据库(检索时间:建库至2021年5月31日)进行外部验证。采用基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析筛选模块涉及功能和通路,基因组富集分析(GSEA)分析核心基因所涉及通路。结果通过WGCNA筛选一共获得67个模块,其中深蓝模块为核心模块,对深蓝模块中所包含的214基因进行LASSO分析,结合蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析和复杂分子关联分析(MOCDE)得分,筛选出线粒体核糖体蛋白48基因(MRPL48)、核糖体RNA加工8基因(RRP8)、核糖体RNA加工9基因(RRP9)作为核心靶基因。利用受试者工作特性(ROC)曲线分析核心基因预测骨肉瘤转移概率,结果提示RRP8,曲线下面积(AUC)=0.504,P=0.955;RRP9,AUC=0.509,P=0.913;MRPL48,AUC=0.663,P=0.025。可以明确MRPL48在骨肉瘤患者中的表达高低与其发生、预后明确相关。结论基于WGCNA并结合LASSO、PPI、MOCDE方法共同筛选获得的MRPL48与骨肉瘤发生和患者生存相关,可为骨肉瘤发生、转移和治疗的研究提供参考依据。
关键词
骨肉瘤
癌症基因组图谱数据库
线粒体核糖体蛋白48基因(
mrpl
48)
加权基因共表达网络分析
Keywords
osteosarcoma
cancer
genome
atlasdatabase
mitochondrial
ribosomal
protein
L48
gene
(
mrpl
48)
weighted
gene
coexpression
network
analysis
分类号
R738.1 [医药卫生—肿瘤]
R446.7 [医药卫生—临床医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
靶向mrp1基因shRNA表达载体构建
邵淑丽
崔婷婷
刘迁
陈丽
贾红双
吴敏
《现代肿瘤医学》
CAS
2010
0
下载PDF
职称材料
2
基于加权基因表达网络和LASSO回归筛选骨肉瘤预后和转移相关基因
张毅
姚士军
刘朝旭
《生物医学工程与临床》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部