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细菌系统分类学研究现状
被引量：
3
1
作者
关泽红
丁齐虹
达来
《内蒙古师范大学学报（自然科学汉文版）》
CAS
2000年第3期209-214,共6页
简述了C .Woese发现的古细菌和三域说的发展概况 .综述了根据rRNA序列建立的细菌系统分类和分子进化树的研究现状 .
关键词
古细菌
细胞系统分类
分子进化树
化工
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职称材料
大肠埃希氏菌及肺炎克雷伯氏菌超广谱β-内酰胺酶基因的核苷酸序列测定及分子进化树的构建
被引量：
1
2
作者
陈炫
范昕建
+2 位作者
吕晓菊
雷秉钧
张再伟
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期87-90,共4页
了解四川大学华西医院产ESBLs肺炎克雷伯氏菌和大肠埃希氏菌的TEM或SHV型ESBLs ,并探讨ESBLs进化及分类关系。方法 对用PCR法扩增的产ESBLs大肠埃希氏菌及肺炎克雷伯氏菌的TEM型及SHV型ESBLs基因进行核苷酸序列测定 ,通过网上相似性检...
了解四川大学华西医院产ESBLs肺炎克雷伯氏菌和大肠埃希氏菌的TEM或SHV型ESBLs ,并探讨ESBLs进化及分类关系。方法 对用PCR法扩增的产ESBLs大肠埃希氏菌及肺炎克雷伯氏菌的TEM型及SHV型ESBLs基因进行核苷酸序列测定 ,通过网上相似性检索确定其编码酶的亚型 ,并利用生物信息学软件ClustalX1.8构建分子进化树 ,对ESBLs进化及分类关系进行探讨。结果 本研究检出的ESBLs亚型为SHV 2和TEM 19。根据进化和同源关系 ,ESBLs可分为TEM型、SHV型、CTX M型、OXA型及一些不属于上述任何一个家族的类型 ,其中CTX M族酶分为四组。结论 本研究检出的ESBLs亚型以SHV 2为主。本研究构建的ESBLs的分子进化树较好地反映了ESBLs的进化和分类关系 ,是其分类研究的新手段。
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关键词
大肠埃希氏菌
肺炎克雷伯氏菌
超广谱Β-内酰胺
ESBLs
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职称材料
临床分离CRKP耐药和毒力基因检测及分子进化分析
被引量：
1
3
作者
陈祖阳
徐令清
何倩君
《中国感染控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期1060-1067,共8页
目的了解临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药和毒力基因携带情况,为临床防治提供依据。方法收集某院2020年3月—2021年3月临床标本分离的CRKP 36株,对菌株进行药敏鉴定,采用聚合酶链反应(PCR)扩增检测耐药基因、荚膜血清型基因...
目的了解临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药和毒力基因携带情况,为临床防治提供依据。方法收集某院2020年3月—2021年3月临床标本分离的CRKP 36株,对菌株进行药敏鉴定,采用聚合酶链反应(PCR)扩增检测耐药基因、荚膜血清型基因、毒力基因,采用多位点序列分型(MLST)方法对菌株进行序列分型(ST分型),基于wzi测序结果进行血清型分型和分子进化分析。结果36株CRKP均检出bla_(KPC)基因,未检出bla_(IMP)、bla_(VIM)、bla_(OXA-48)基因。黏液丝试验均为阴性,未检出K1、K2、K5、K20、K57五种常见荚膜血清型,36株CRKP rmp A2、wca G、ybt S、aerobactin、iut A、iro N、ycf、mrk D、mrk A、sil S、uge、P lvpk、fim H、wzi基因检出率为100%;Ter W为86.11%;fim A、mag A均为阴性。MLST结果分析显示,36株均为ST11型。仅32株成功测序wzi基因,wzi分型结果为K14.K6496.88%(31/32),K243.12%(1/32)。基于测序结果构建分子进化树,结果显示32株菌中31株100%同源,1株与浙江菌株KP1806999%同源。结论该院CRKP对碳青霉烯类耐药的主要机制是携带bla_(KPC)基因,优势ST分型为ST11,wzi分型以K14.K64为主,且携带了大量的毒力基因。分子进化树提示存在同源性感染,怀疑有输入性传播,应及时采取防控措施,防止耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌医院传播。
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关键词
耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌
耐药基因
毒力基因
分子进化树
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职称材料
削偶合今祖法的提出
被引量：
9
4
作者
李靖炎
《Zoological Research》
CAS
CSCD
1992年第4期387-396,共10页
以低等真核生物的5.8S rRNA为材料进行研究。发现在用今祖法消除了进化速度之差的影响所得到的差异矩阵d＇中,各组理应彼此相等的数值会因核苷酸偶合的影响而成为不等值的。取各组中各自的的最大值作为受偶合的影响最小者,以之对今祖法...
以低等真核生物的5.8S rRNA为材料进行研究。发现在用今祖法消除了进化速度之差的影响所得到的差异矩阵d＇中,各组理应彼此相等的数值会因核苷酸偶合的影响而成为不等值的。取各组中各自的的最大值作为受偶合的影响最小者,以之对今祖法所得到的分枝型式进行校正,即可得到更为正确的结果。在此基础上提出了对差异矩阵d＇进行最大值成聚以代替原法中的平均值成聚的削偶合今祖法。新法在结果的正确性、稳定性和一致性上都优于原法。
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关键词
今祖法
分子进化
分子进化树
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职称材料
基于EF1-a基因对常见禾本科作物的聚类分析
被引量：
1
5
作者
押辉远
李卫涛
+1 位作者
王卫东
焦贞
《郑州大学学报（理学版）》
CAS
北大核心
2012年第2期108-113,共6页
基于EF1-a基因核苷酸序列和氨基酸序列,利用分子进化遗传分析软件MEGA 5.0构建常见禾本科植物的最小进化法(ME)、邻接法(NJ)和算术平均数的非加权成组配对法(UPGMA)分子系统进化树.研究结果表明,EF1-a cDNA序列和氨基酸序列的聚类分析...
基于EF1-a基因核苷酸序列和氨基酸序列,利用分子进化遗传分析软件MEGA 5.0构建常见禾本科植物的最小进化法(ME)、邻接法(NJ)和算术平均数的非加权成组配对法(UPGMA)分子系统进化树.研究结果表明,EF1-a cDNA序列和氨基酸序列的聚类分析都能够反映所列禾本科植物的属间关系,3种进化树的聚类分析分支情况基本一致.基于EF1-a基因的cDNA序列和氨基酸序列构建的ME、NJ树适合用来研究禾本科作物种间或种内的遗传关系,而构建的氨基酸序列UPGMA树有待更多的数据研究.
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关键词
延伸因子EF1-a
禾本科作物
分子系统进化树
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职称材料
题名
细菌系统分类学研究现状
被引量：
3
1
作者
关泽红
丁齐虹
达来
机构
内蒙古医学院生化教研室
内蒙古血液中心
内蒙古大学生命科学学院
出处
《内蒙古师范大学学报（自然科学汉文版）》
CAS
2000年第3期209-214,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目!(3980 0 0 3)
文摘
简述了C .Woese发现的古细菌和三域说的发展概况 .综述了根据rRNA序列建立的细菌系统分类和分子进化树的研究现状 .
关键词
古细菌
细胞系统分类
分子进化树
化工
Keywords
Archaea
bacterial
systematics
molecular
evolutionary
tree
rRNA
sequence
分类号
Q939.1 [生物学—微生物学]
Q913.2 [天文地球—古生物学与地层学]
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职称材料
题名
大肠埃希氏菌及肺炎克雷伯氏菌超广谱β-内酰胺酶基因的核苷酸序列测定及分子进化树的构建
被引量：
1
2
作者
陈炫
范昕建
吕晓菊
雷秉钧
张再伟
机构
四川大学华西医院传染科
出处
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期87-90,共4页
基金
教育部高等学校博士学科点专项科研基金 (No.9847)。
文摘
了解四川大学华西医院产ESBLs肺炎克雷伯氏菌和大肠埃希氏菌的TEM或SHV型ESBLs ,并探讨ESBLs进化及分类关系。方法 对用PCR法扩增的产ESBLs大肠埃希氏菌及肺炎克雷伯氏菌的TEM型及SHV型ESBLs基因进行核苷酸序列测定 ,通过网上相似性检索确定其编码酶的亚型 ,并利用生物信息学软件ClustalX1.8构建分子进化树 ,对ESBLs进化及分类关系进行探讨。结果 本研究检出的ESBLs亚型为SHV 2和TEM 19。根据进化和同源关系 ,ESBLs可分为TEM型、SHV型、CTX M型、OXA型及一些不属于上述任何一个家族的类型 ,其中CTX M族酶分为四组。结论 本研究检出的ESBLs亚型以SHV 2为主。本研究构建的ESBLs的分子进化树较好地反映了ESBLs的进化和分类关系 ,是其分类研究的新手段。
关键词
大肠埃希氏菌
肺炎克雷伯氏菌
超广谱Β-内酰胺
ESBLs
Keywords
Extended-spectrum
β-lactamases
Classification
molecular
evolutionary
tree
分类号
R978.1 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
临床分离CRKP耐药和毒力基因检测及分子进化分析
被引量：
1
3
作者
陈祖阳
徐令清
何倩君
机构
广州医科大学附属第六医院/清远市人民医院检验医学部/输血科
广州医科大学附属第六医院/清远市人民医院检验医学部/检验科
出处
《中国感染控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期1060-1067,共8页
基金
广东省卫计委广东省医学科学技术研究基金项目(A2021490)
清远市人民医院医学科研基金项目(20190209)。
文摘
目的了解临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药和毒力基因携带情况,为临床防治提供依据。方法收集某院2020年3月—2021年3月临床标本分离的CRKP 36株,对菌株进行药敏鉴定,采用聚合酶链反应(PCR)扩增检测耐药基因、荚膜血清型基因、毒力基因,采用多位点序列分型(MLST)方法对菌株进行序列分型(ST分型),基于wzi测序结果进行血清型分型和分子进化分析。结果36株CRKP均检出bla_(KPC)基因,未检出bla_(IMP)、bla_(VIM)、bla_(OXA-48)基因。黏液丝试验均为阴性,未检出K1、K2、K5、K20、K57五种常见荚膜血清型,36株CRKP rmp A2、wca G、ybt S、aerobactin、iut A、iro N、ycf、mrk D、mrk A、sil S、uge、P lvpk、fim H、wzi基因检出率为100%;Ter W为86.11%;fim A、mag A均为阴性。MLST结果分析显示,36株均为ST11型。仅32株成功测序wzi基因,wzi分型结果为K14.K6496.88%(31/32),K243.12%(1/32)。基于测序结果构建分子进化树,结果显示32株菌中31株100%同源,1株与浙江菌株KP1806999%同源。结论该院CRKP对碳青霉烯类耐药的主要机制是携带bla_(KPC)基因,优势ST分型为ST11,wzi分型以K14.K64为主,且携带了大量的毒力基因。分子进化树提示存在同源性感染,怀疑有输入性传播,应及时采取防控措施,防止耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌医院传播。
关键词
耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌
耐药基因
毒力基因
分子进化树
Keywords
carbapenem-resistant
hypervirulent
Klebsiella
pneumoniae
antimicrobial
resistance
gene
virulence
gene
molecular
evolutionary
tree
分类号
R181.3 [医药卫生—流行病学]
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职称材料
题名
削偶合今祖法的提出
被引量：
9
4
作者
李靖炎
机构
中国科学院昆明动物研究所
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
1992年第4期387-396,共10页
文摘
以低等真核生物的5.8S rRNA为材料进行研究。发现在用今祖法消除了进化速度之差的影响所得到的差异矩阵d＇中,各组理应彼此相等的数值会因核苷酸偶合的影响而成为不等值的。取各组中各自的的最大值作为受偶合的影响最小者,以之对今祖法所得到的分枝型式进行校正,即可得到更为正确的结果。在此基础上提出了对差异矩阵d＇进行最大值成聚以代替原法中的平均值成聚的削偶合今祖法。新法在结果的正确性、稳定性和一致性上都优于原法。
关键词
今祖法
分子进化
分子进化树
Keywords
Constructing
molecular
evolutionary
tree
,
Present-day
ancestor
(PDA)
method,
Coincidences
between
homologous
macromolecules,
Unicellular
eukaryotes,
5.8S
rRNA
分类号
Q951.3 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
基于EF1-a基因对常见禾本科作物的聚类分析
被引量：
1
5
作者
押辉远
李卫涛
王卫东
焦贞
机构
洛阳师范学院生命科学系
郑州大学河南省离子束生物工程重点实验室
出处
《郑州大学学报（理学版）》
CAS
北大核心
2012年第2期108-113,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目,编号30800204
文摘
基于EF1-a基因核苷酸序列和氨基酸序列,利用分子进化遗传分析软件MEGA 5.0构建常见禾本科植物的最小进化法(ME)、邻接法(NJ)和算术平均数的非加权成组配对法(UPGMA)分子系统进化树.研究结果表明,EF1-a cDNA序列和氨基酸序列的聚类分析都能够反映所列禾本科植物的属间关系,3种进化树的聚类分析分支情况基本一致.基于EF1-a基因的cDNA序列和氨基酸序列构建的ME、NJ树适合用来研究禾本科作物种间或种内的遗传关系,而构建的氨基酸序列UPGMA树有待更多的数据研究.
关键词
延伸因子EF1-a
禾本科作物
分子系统进化树
Keywords
elongation
factor
EFI-a
gramineous
plant
molecular
system
evolutionary
tree
分类号
Q37 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
细菌系统分类学研究现状
关泽红
丁齐虹
达来
《内蒙古师范大学学报（自然科学汉文版）》
CAS
2000
3
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职称材料
2
大肠埃希氏菌及肺炎克雷伯氏菌超广谱β-内酰胺酶基因的核苷酸序列测定及分子进化树的构建
陈炫
范昕建
吕晓菊
雷秉钧
张再伟
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003
1
下载PDF
职称材料
3
临床分离CRKP耐药和毒力基因检测及分子进化分析
陈祖阳
徐令清
何倩君
《中国感染控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
4
削偶合今祖法的提出
李靖炎
《Zoological Research》
CAS
CSCD
1992
9
下载PDF
职称材料
5
基于EF1-a基因对常见禾本科作物的聚类分析
押辉远
李卫涛
王卫东
焦贞
《郑州大学学报（理学版）》
CAS
北大核心
2012
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
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