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中国主栽水稻品种微卫星标记数据库的初步构建 被引量:96
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作者 庄杰云 施勇烽 +4 位作者 应杰政 鄂志国 曾瑞珍 陈洁 朱智伟 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期460-468,共9页
以前期筛选的微卫星标记为基础,并在4个染色体上增加新标记,进一步检测了63个主栽常规稻品种和杂交稻亲本,推荐了24个微卫星标记(每条染色体2个)作为水稻品种鉴别的标记;除了63个常规稻品种和杂交稻亲本外,这24个标记还应用于检测41个... 以前期筛选的微卫星标记为基础,并在4个染色体上增加新标记,进一步检测了63个主栽常规稻品种和杂交稻亲本,推荐了24个微卫星标记(每条染色体2个)作为水稻品种鉴别的标记;除了63个常规稻品种和杂交稻亲本外,这24个标记还应用于检测41个主栽杂交稻组合,并确定了各个标记在试验材料中检测到的等位基因类型。通过杂交稻组合与其亲本的标记匹配性检验,确认了杂交稻母本的高真实性,提高了恢复系数据的可靠性,剔除了1个假杂交稻,建立了103个水稻材料×24个标记的主栽水稻品种微卫星标记数据库,并分析了数据库中各个标记、各组材料的多态性表现。此外,还讨论了材料真实性和典型性对数据库构建的影响,提出了水稻品种间差异判别标准的建议及其应用风险和解决途径。 展开更多
关键词 微卫星标记 水稻 品种鉴定 多态性频率 数据库
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微卫星DNA在分子遗传标记研究中的应用 被引量:19
2
作者 安瑞生 谭声江 陈晓峰 《昆虫知识》 CSCD 北大核心 2002年第3期165-172,共8页
随着种群遗传学的发展 ,分子遗传标记特别是微卫星标记已经成为研究种群遗传的有力工具。本文就微卫星遗传标记的研究背景、技术应用以及优势与不足等方面进行了综述。
关键词 微卫星DNA 分子遗传标记 应用 多态性
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棉蚜(Aphis gossypii)种群寄主分化和季节分化的微卫星引物PCR研究 被引量:37
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作者 龚鹏 杨效文 +2 位作者 张孝羲 刘向东 陈晓峰 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期765-771,共7页
通过对棉蚜群体进行室外观察、室内培养和分子遗传标记的 DNA多态性分析 (用 3个微卫星序列为引物进行PCR)等研究 ,结果表明 :1 .冬寄主 (木槿、石榴和花椒 )上棉蚜种群分化较小 (种群相似性指数在 0 .833~ 0 .91 7之间 ) ,而冬寄主种... 通过对棉蚜群体进行室外观察、室内培养和分子遗传标记的 DNA多态性分析 (用 3个微卫星序列为引物进行PCR)等研究 ,结果表明 :1 .冬寄主 (木槿、石榴和花椒 )上棉蚜种群分化较小 (种群相似性指数在 0 .833~ 0 .91 7之间 ) ,而冬寄主种群和夏寄主 (棉花和南瓜 )种群之间有较大的分化 (种群相似性指数在 0 .589~ 0 .756之间 )。2 .棉蚜自然种群是由体色不变的生物型 (干母为黄色 ,其后代始终为黄色 )和体色可变型生物型 (干母为绿色 ,其后代有绿色和黄色两种体色 )组成的混合种群。3.黄色小型蚜 (伏蚜 )来源于混合类群 ,但主要来自绿色干母多代选择分化的黄色后代 。 展开更多
关键词 棉蚜 微卫星引物 PCR DNA多态性 种群分化 寄主
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3个山羊群体中4个微卫星DNA多态性及其与杂种优势的关系 被引量:36
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作者 张英杰 赵有璋 +3 位作者 刘月琴 李玉 孙少华 孙洪新 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期631-636,共6页
利用4个微卫星标记(OarFCB11,OarAE101,McM218,McM38)对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了遗传检测,并测定了波尔山羊与河北奶山羊及太行山羊的杂交效果。结果... 利用4个微卫星标记(OarFCB11,OarAE101,McM218,McM38)对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了遗传检测,并测定了波尔山羊与河北奶山羊及太行山羊的杂交效果。结果表明:4个微卫星标记在波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊3个品种中存在多态性,可以用于山羊遗传多样性的评估;从不同品种来看,太行山羊的遗传变异程度最大,而波尔山羊的遗传变异程度相对较小;波尔山羊与河北奶山羊的遗传距离大于与太行山羊,波尔山羊与河北奶山羊的杂种优势高于与太行山羊,与实际杂种优势测定结果相符。 展开更多
关键词 山羊 微卫星DNA 遗传多态性 杂种优势
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微卫星标记在种群生物学研究中的应用 被引量:30
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作者 盛岩 郑蔚虹 +1 位作者 裴克全 马克平 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第z1期119-126,共8页
微卫星是以几个碱基 (一般为 1~ 6个 )为重复单位组成的简单的串联重复序列 ,具有丰度高、多态性高、共显性标记、选择中性、可自动检测等优点。本文着重介绍了微卫星在种群生物学研究中的应用。微卫星位点可以提供具高分辨率的遗传信... 微卫星是以几个碱基 (一般为 1~ 6个 )为重复单位组成的简单的串联重复序列 ,具有丰度高、多态性高、共显性标记、选择中性、可自动检测等优点。本文着重介绍了微卫星在种群生物学研究中的应用。微卫星位点可以提供具高分辨率的遗传信息 ,这一特点使微卫星既适合于个体水平上的研究 ,又适合于种群水平上的研究。在个体水平上包括个体识别、交配系统和亲本分析、基因流等研究。微卫星是常用的个体识别手段 ,但在克隆植物遗传结构研究方面的应用还很有限 ;微卫星提高了交配系统和亲本分析、基因流等研究的准确性。在种群水平上微卫星可用于遗传结构、有效种群大小、种群的系统发育重建等研究。微卫星在很多物种 (包括珍稀物种 )的遗传结构研究中得到应用 ;利用微卫星标记确定有效种群大小、检测有效种群大小的波动可以促使我们正确理解种群遗传结构动态和种群进化过程 ;微卫星在种群的系统发育重建研究方面有很大的应用潜力。然而微卫星并不是研究所有问题的唯一选择。 展开更多
关键词 微卫星 多态性 等位基因 种群
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利用微卫星DNA多态性预测引进肉用绵羊品种杂种优势 被引量:28
6
作者 张英杰 刘月琴 +2 位作者 孙洪新 孙少华 李玉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期1076-1082,共7页
目的利用微卫星DNA在不同绵羊群体中的多态性预测引进肉用绵羊品种与小尾寒羊的杂种优势。方法利用5个微卫星基因座对4个国外引进肉羊品种及小尾寒羊5个群体的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了... 目的利用微卫星DNA在不同绵羊群体中的多态性预测引进肉用绵羊品种与小尾寒羊的杂种优势。方法利用5个微卫星基因座对4个国外引进肉羊品种及小尾寒羊5个群体的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了遗传检测,并测定4个引进肉羊与小尾寒的杂交效果。结果5个微卫星基因座在白头萨福克、黑头萨福克、道赛特、得克赛儿及小尾寒羊5个群体中存在多态性,可以用于绵羊遗传多样性的评估;从不同品种看,道赛特羊的遗传变异程度最大,而小尾寒羊的遗传变异程度相对较小;经遗传关系分析,在引进的4个肉羊品种中,与小尾寒羊杂交优势由大到小依次为白头萨福克、黑头萨福克、道赛特、得克赛儿,与实际杂种优势测定结果相符。结论利用微卫星DNA多态性预测引进肉用绵羊品种与小尾寒羊的杂种优势是可行的,将对今后绵羊育种具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 绵羊 微卫星DNA 遗传多态性 杂种优势
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用微卫星引物PCR分析棉蚜不同蚜型的DNA多态性 被引量:18
7
作者 龚鹏 张孝羲 +1 位作者 杨效文 陈晓峰 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期416-421,共6页
用微卫星引物PCR方法 ,对棉蚜Aphisgossypii干母、干雌、孤雌蚜 (有翅迁飞孤雌蚜和无翅孤雌蚜 )、性母、性雌蚜和雄蚜的DNA多态性进行分析。结果表明 :①棉蚜的有性蚜型和无性蚜型之间在遗传上有较大的差异 ;②性母与性雌蚜和雄蚜的遗... 用微卫星引物PCR方法 ,对棉蚜Aphisgossypii干母、干雌、孤雌蚜 (有翅迁飞孤雌蚜和无翅孤雌蚜 )、性母、性雌蚜和雄蚜的DNA多态性进行分析。结果表明 :①棉蚜的有性蚜型和无性蚜型之间在遗传上有较大的差异 ;②性母与性雌蚜和雄蚜的遗传关系都十分接近 ,说明同一性母既产性雌蚜 ,也产雄蚜 ;③干母和干雌的遗传关系很近 ,但孤雌蚜已与二者有分化。 展开更多
关键词 棉蚜 蚜型 微卫星引物 PCR DNA多态性
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藏鸡群体遗传多样性研究 被引量:22
8
作者 杜志强 曲鲁江 +4 位作者 李显耀 胡晓湘 黄银花 李宁 杨宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期167-171,共5页
藏鸡的体型外貌和生活习性与红色原鸡非常相似,是具有自己独特群体遗传特性的高原地方鸡种。为了有效保护并合理利用这一遗传资源,我们采用多重PCR与半自动荧光标记微卫星聚丙烯酰胺凝胶电泳相结合的方法检测了20个微卫星基因座的多态性... 藏鸡的体型外貌和生活习性与红色原鸡非常相似,是具有自己独特群体遗传特性的高原地方鸡种。为了有效保护并合理利用这一遗传资源,我们采用多重PCR与半自动荧光标记微卫星聚丙烯酰胺凝胶电泳相结合的方法检测了20个微卫星基因座的多态性,并随机抽取藏鸡群体中部分个体进行个体体形特征与生产性能的统计。结果表明藏鸡群体的20个微卫星基因座的多态等位基因数为4~10个,平均值为7 25个/基因座,多态信息含量(CPI)和杂合度(H)平均值分别为0 67、0 74。大染色体较小染色体的微卫星标记多态性程度要高。藏鸡群体的微卫星基因座多态性丰富,也解释了生产性能不均,外貌表现迥异的群体遗传特性。 展开更多
关键词 藏鸡 群体 遗传多样性 多重PCR 微卫星标记 基因座
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黄鳝微卫星引物筛选及其在保护遗传学上的应用 被引量:25
9
作者 鲁双庆 刘少军 +2 位作者 刘红玉 刘臻 刘筠 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期612-618,共7页
研究了远缘种鲤的微卫星引物对黄鳝的适用性.结果显示,31对鲤微卫星引物中有11对引物能对黄鳝DNA模板扩增出特异性带谱.每对引物扩增的等位基因数在3~13个,平均每个位点有5.6个等位基因,显示了较高的多态性.其中引物P1最理想,其PCR扩... 研究了远缘种鲤的微卫星引物对黄鳝的适用性.结果显示,31对鲤微卫星引物中有11对引物能对黄鳝DNA模板扩增出特异性带谱.每对引物扩增的等位基因数在3~13个,平均每个位点有5.6个等位基因,显示了较高的多态性.其中引物P1最理想,其PCR扩增产物能区分来自湖南、广东和孟加拉3个不同地域的黄鳝种群.应用微卫星技术对3个不同地域的黄鳝基因组DNA多态性分析结果显示,湖南、广东和孟加拉黄鳝群体内平均相似率依次为95.5%,95.8%和93.5%,平均变异度依次为0.045,0.042,0.063.群体间的相似率及变异度分析显示:湖南黄鳝和广东黄鳝群体间平均相似率为91.0%,变异度为0.045; 湖南黄鳝和孟加拉黄鳝群体间平均相似率和变异度分别为55.7%和0.443;广东黄鳝和孟加拉黄鳝群体间平均相似率和变异度分别为58.6%和0.414.综合微卫星分析结果、黄鳝的外形特征及地理位置,可以推测,广东黄鳝与湖南黄鳝为同一个生物种的不同地理种群,而孟加拉黄鳝为同属中另一个种. 展开更多
关键词 黄鳝 微卫星 引物 遗传多样性
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牙鲆微卫星标记的筛选及群体多态性分析 被引量:22
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作者 陈微 张全启 +3 位作者 于海洋 胡景杰 齐洁 包振民 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期682-687,共6页
以牙鲆(Paralichthys olivaceus Temminck et Schegel)为材料,基因组DNA经Sau3A Ⅰ进行部分酶切后,选取400~1 200bp大小的片段连接到经BamHⅠ酶切的pUC19质粒中,连接产物转化大肠杆菌DH5α,构建牙鲆酶切片段基因组文库.采用菌落杂交的... 以牙鲆(Paralichthys olivaceus Temminck et Schegel)为材料,基因组DNA经Sau3A Ⅰ进行部分酶切后,选取400~1 200bp大小的片段连接到经BamHⅠ酶切的pUC19质粒中,连接产物转化大肠杆菌DH5α,构建牙鲆酶切片段基因组文库.采用菌落杂交的方法,以(AC)10、(AG)10为探针从文库中筛选阳性克隆16个,共得到20个微卫星序列,其中完全型13个,不完全型5个,复合型2个.对其中18个进行引物设计,有11对引物扩增出目的片段,其中8对引物在群体中具有扩增多态性.在威海野生牙鲆30个个体中,各座位上得到的等位基因数为4~19个,观测杂合度(Ho)为0.413 8~0.965 5.其中有3对引物扩增的等位基因数超过17个,表现出高度多态性.本研究旨为进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等提供基础依据. 展开更多
关键词 牙鲆 菌落杂交 微卫星 多态性
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水稻Wx基因的遗传多态性及其与主要米质指标的相关性分析 被引量:23
11
作者 万映秀 邓其明 +3 位作者 王世全 刘明伟 周华强 李平 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期603-609,共7页
利用RM190和484/W2R-ACCⅠ标记分析了50个水稻非糯品种的Wx基因的等位性变异。其中,RM190揭示出7种(CT)n纯合变异类型和1种杂合类型,分别为(CT)20、(CT)19、(CT)18、(CT)17、(CT)14、(CT)11、(CT)10和(CT)11/(CT)18,并以(CT)11和(CT)18... 利用RM190和484/W2R-ACCⅠ标记分析了50个水稻非糯品种的Wx基因的等位性变异。其中,RM190揭示出7种(CT)n纯合变异类型和1种杂合类型,分别为(CT)20、(CT)19、(CT)18、(CT)17、(CT)14、(CT)11、(CT)10和(CT)11/(CT)18,并以(CT)11和(CT)18两种类型为主;484/W2R-ACCⅠ共揭示出2种纯合类型和1种杂合类型,分别为G/G型、T/T型及G/T型;(CT)11大多为G/G型,(CT)18大多为T/T型,这两个标记可将供试材料划分为10种等位基因变异类型。进一步分析表明,RM190揭示的Wx基因多态性可以解释直链淀粉含量变异的59.3%;484/W2R-ACCⅠ揭示的Wx基因多态性可以分别解释直链淀粉含量及胶稠度变异的56.1%和24.6%;而两标记共同可解释直链淀粉含量变异的72.4%。还对这两个标记在育种实践中的应用前景进行了探讨。 展开更多
关键词 蜡质基因 微卫星标记 酶切扩增多态性序列标记 糊化温度 胶稠度 直链淀粉含量 水稻 多态性
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利用微卫星标记分析我国13个地方灰羽鹅品种的遗传多样性 被引量:18
12
作者 屠云洁 陈宽维 +4 位作者 汤青萍 王金玉 高玉时 顾荣 葛庆联 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期152-158,共7页
我国地方鹅品种具有很多优良性状,但长期以来由于没有形成科学的选育制度和培育方法,品种的遗传多样性没有得到完整保存。为了深入了解我国地方鹅品种的遗传结构,使之得到更好的保护和利用,作者选用31个多态性较高的微卫星标记(其中19... 我国地方鹅品种具有很多优良性状,但长期以来由于没有形成科学的选育制度和培育方法,品种的遗传多样性没有得到完整保存。为了深入了解我国地方鹅品种的遗传结构,使之得到更好的保护和利用,作者选用31个多态性较高的微卫星标记(其中19个是首次用磁珠富集法从AFLP片段中分离),检测了我国13个地方灰羽鹅(An-sercygnnoides)品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(DA)。结果表明:13个地方灰羽鹅品种中,平均多态信息含量为0.323–0.398,平均杂合度为0.4985–0.6727,各品种的杂合度都较高,最高的是狮头鹅(0.6727),最低的是雁鹅(0.4985)。用UPGMA法进行聚类分析的结果显示,13个品种被聚为4类:丰城灰鹅、武冈铜鹅、兴国灰鹅、狮头鹅、乌棕鹅、阳江鹅、马冈鹅、钢鹅、雁鹅聚为第1类;伊犁鹅自聚为第2类;长乐鹅、右江鹅聚为第3类;永康灰鹅自聚为第4类。本研究为鹅遗传育种提供了参考资料。 展开更多
关键词 微卫星标记 遗传多样性
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7个微卫星座位与北京荷斯坦母牛体细胞评分关系的研究 被引量:18
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作者 储明星 周国利 +5 位作者 金海国 石万海 曹福存 方丽 叶素成 朱颜 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期471-475,共5页
选择与体细胞评分紧密连锁的7个微卫星座位BM1818、BM1258、BM1443、BM1905、BM302、BM4505和CYP21,用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析其在240头北京荷斯坦母牛中的遗传变异。计算了7个微卫星座位的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和... 选择与体细胞评分紧密连锁的7个微卫星座位BM1818、BM1258、BM1443、BM1905、BM302、BM4505和CYP21,用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析其在240头北京荷斯坦母牛中的遗传变异。计算了7个微卫星座位的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数,并利用最小二乘法拟合线性模型初步探索了这7个微卫星座位与北京荷斯坦母牛体细胞评分的关系。结果表明:微卫星BM1818座位284bp/284bp、BM1258座位106bp/92bp、BM1443座位166bp/160bp、BM1905座位187bp/187bp、BM302座位142bp/140bp、BM4505座位240bp/236bp和CYP21座位215bp/198bp所对应的体细胞评分最小二乘均值较低,对乳房炎抗性而言它们是各自座位上的最有利基因型;微卫星BM1818座位286bp/286bp、BM1258座位102bp/102bp、BM1443座位170bp/160bp、BM1905座位197bp/195bp、BM302座位154bp/145bp、BM4505座位240bp/238bp和CYP21座位204bp/192bp所对应的体细胞评分最小二乘均值较高,对乳房炎抗性而言它们是各自座位上的最不利基因型。 展开更多
关键词 荷斯坦母牛 体细胞评分 微卫星座位 遗传多态性
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微卫星标记OarAE101和MCM38在三个山羊品种中的遗传多态性研究 被引量:17
14
作者 张英杰 赵有璋 +3 位作者 刘月琴 李玉 孙少华 李菲 《草食家畜》 2003年第2期24-26,共3页
本文利用两个微卫星标记OarAE10 1和MCM 38对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测 ,结果表明 :微卫星位点OarAE10 1和MCM38在三个山羊品种中存在多态性 ,可以用于... 本文利用两个微卫星标记OarAE10 1和MCM 38对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测 ,结果表明 :微卫星位点OarAE10 1和MCM38在三个山羊品种中存在多态性 ,可以用于山羊遗传多样性的评估 ;位点OarAE10 1比位点MCM 38变异较大 ,从不同品种来看 ,波尔山羊的遗传变异程度最大 ,而河北奶山羊的遗传变异程度相对较小。 展开更多
关键词 微卫星标记 OarAE101 MCM38 波尔山羊 太行山羊 河北奶山羊 等位基因频率 群体多态信息含量 有效等位基因数 杂合度 遗传多态性
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Microsatellite Variations Among Four Populations of Eriocheir sinensis 被引量:21
15
作者 马海涛 常玉梅 +1 位作者 于冬梅 孙效文 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期126-133,共8页
Using microsatellite markers, we analysed genetic polymorphism in four populations of Eriocheir sinensis, sampled from Jiangsu, Anhui, Liaoning and Tianjin. Twenty-four pairs of primers were used to amplify the target... Using microsatellite markers, we analysed genetic polymorphism in four populations of Eriocheir sinensis, sampled from Jiangsu, Anhui, Liaoning and Tianjin. Twenty-four pairs of primers were used to amplify the target fragments ranging from 80 bp to 445 bp, which included 16 pairs designed in our laboratory and eight pairs published internationally. Two to 10 alleles per locus in four populations were amplified, and there were 155 alleles in all populations. The average number of alleles per locus was 6.458. The average number of effective alleles per locus (Ne) was 4.349l to 4.7234; the average observed heterozygosity (Ho) was 0.5690 to 0.6722; and the average expected heterozygosity (He) was 0.7238 to 0.7546. Hardy-Weinberg equilibrium analysis (Z2 test, P 〈 0.05) revealed that seven loci in the four populations were in equilibrium. The genetic distances between the four populations were calculated and revealed that the Anhui, Jiangsu and Tianjin crabs belong to a Yangtse River population, while the Liaohe crabs form another branch. 展开更多
关键词 Eriocheir sinensis microsatellite Population polymorphism
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微卫星DNA标记在三个山羊品种中的遗传多态性研究 被引量:12
16
作者 张英杰 赵有璋 +2 位作者 刘月琴 李玉 孙少华 《中国草食动物》 2003年第4期7-9,共3页
利用四个微卫星标记对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测。结果表明 :四个微卫星位点在波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊三个品种中存在多态性 ,可以用于山羊遗传... 利用四个微卫星标记对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测。结果表明 :四个微卫星位点在波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊三个品种中存在多态性 ,可以用于山羊遗传多样性的评估 ;位点OarFCB11变异最大 ,位点MCM38变异最小 ,从不同品种来看 ,太行山羊的遗传变异程度最大 ,而波尔山羊的遗传变异程度相对较小。 展开更多
关键词 微卫星DNA标记 山羊 品种 遗传多态性 等位基因 杂合度
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湖北地区德国牧羊犬10个微卫星DNA基因座遗传多态性研究 被引量:18
17
作者 王海生 王祥 +6 位作者 张文平 康远方 李孟华 朱传红 陈家琳 刘榜 李奎 《刑事技术》 2003年第2期12-14,共3页
目的研究85头德国牧羊犬的10个基因座多态性。方法选用美国应用生物系统公司的10个商用犬微卫星基因座荧光标记复合扩增试剂盒进行PCR、并进行统计学分析。结果对85头德国牧羊犬的10个基因座的多态性研究表明,10个基因座累积DP值在0.999... 目的研究85头德国牧羊犬的10个基因座多态性。方法选用美国应用生物系统公司的10个商用犬微卫星基因座荧光标记复合扩增试剂盒进行PCR、并进行统计学分析。结果对85头德国牧羊犬的10个基因座的多态性研究表明,10个基因座累积DP值在0.9999972,非父排除率在0.9399,微卫星DNA基因座PEZ6、PEZ8、FHC2054的等位基因数均在8个以上,DP值接近或超过0.9,杂合度接近或超过0.7,能有效地应用犬的个体识别和亲权关系鉴定,其它7个基因座均未达到理想的个体识别和亲权鉴定使用条件。结论联合使用多个犬微卫星基因座,可以用于犬的个体识别和亲权鉴定。 展开更多
关键词 湖北地区 德国牧羊犬 遗传多态性 警犬 微卫星基因座 亲权鉴定 生物物证 DNA基因
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畜禽微卫星多态性的银染法显色 被引量:8
18
作者 张细权 刘敬顺 吴显华 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第A00期112-115,共4页
为了确定一种安全、有效而快速的显示畜禽微卫星多态性的染色方法,以广东地方鸡种及优质黄羽肉鸡品系种鸡基因组DNA为材料,用5对微卫星引物进行PCR扩增,并将扩增产物置于变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳分离,通过对比溴化乙锭染色... 为了确定一种安全、有效而快速的显示畜禽微卫星多态性的染色方法,以广东地方鸡种及优质黄羽肉鸡品系种鸡基因组DNA为材料,用5对微卫星引物进行PCR扩增,并将扩增产物置于变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳分离,通过对比溴化乙锭染色和银染法显色确定理想显色法,结果认为银染法是一种可行、安全的理想方法。 展开更多
关键词 微卫星多态性 银染法 畜禽
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中国美利奴(新疆军垦型)绵羊9个微卫星基因座多态性研究 被引量:13
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作者 赵宗胜 王根林 +1 位作者 郭继刚 李大全 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期939-944,共6页
利用PCR技术和复合电泳银染技术检测中国美利奴(新疆军垦型)绵羊第1号染色体上BM6506,BM1824,BM6438,ILSTS004和OarDB6等5个基因座和第6号染色体上BM4621,OarHH55,BM143和OarJMP8等4个基因座,共9个基因座的基因频率(Pi)、个体鉴别力(DP... 利用PCR技术和复合电泳银染技术检测中国美利奴(新疆军垦型)绵羊第1号染色体上BM6506,BM1824,BM6438,ILSTS004和OarDB6等5个基因座和第6号染色体上BM4621,OarHH55,BM143和OarJMP8等4个基因座,共9个基因座的基因频率(Pi)、个体鉴别力(DP)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、和非父排除概率(PE)。结果显示:9个微卫星基因座的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,绵羊中9个微卫星基因座中BM4621基因座的DP、H、PIC和PE都为最高。9个微卫星基因座的累积个体鉴别力(CDP)为0.99999,累积非父排除能力(CPE)为0.99915。结果显示:9个微卫星基因座适用于中国美利奴(新疆军垦型)绵羊的遗传连锁分析、个体识别和亲权鉴定等研究领域。 展开更多
关键词 微卫星基因座 中国美利奴(新疆军垦型)绵羊 遗传多态性
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利用微卫星标记鉴定扁蓿豆种质资源 被引量:20
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作者 李鸿雁 李志勇 +2 位作者 米福贵 卢新雄 师文贵 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期67-71,共5页
对扁蓿豆种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为育种者选择亲本和种质资源的开发提供理论依据。采用微卫星分子标记对来自内蒙古野生扁蓿豆种质资源50份材料进行鉴定。用8份扁蓿豆基因组DNA从89对截形苜蓿SSR引物中鉴定筛选出扩增... 对扁蓿豆种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为育种者选择亲本和种质资源的开发提供理论依据。采用微卫星分子标记对来自内蒙古野生扁蓿豆种质资源50份材料进行鉴定。用8份扁蓿豆基因组DNA从89对截形苜蓿SSR引物中鉴定筛选出扩增带单一、稳定清晰且多态性强的18对引物。用这18对引物,对扁蓿豆材料的DNA进行SSR扩增,以研究其遗传多态性。结果共检测到109个等位位点,平均每对引物扩增出6.1个等位位点。6对SSR引物B14803,MTIC272,MAL369471,MTIC237,MTIC188和MTIC27对于检测扁蓿豆遗传变异最有效。供试材料间遗传距离介于0.0236~0.8075,平均遗传距离为0.1778。聚类分析构建了亲缘关系树状图,大致分为9大类。 展开更多
关键词 扁蓿豆 微卫星标记 多态性聚类分析
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