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土壤DNA提取技术在本科教学实验教学中的应用
1
作者
李亮
武洪庆
+2 位作者
郭子渝
崔忠信
胡海诚
《科教导刊》
2019年第16期124-125,共2页
开展科研训练、提高学生科学素养,一直是本科教学改革研究热点之一。以课题组常用的实验技术"土壤DNA提取"为基础,结合"大学生科技创新"等活动,设计综合创新实验,对可能参与课题组科研工作的学生进行选拔和培训。...
开展科研训练、提高学生科学素养,一直是本科教学改革研究热点之一。以课题组常用的实验技术"土壤DNA提取"为基础,结合"大学生科技创新"等活动,设计综合创新实验,对可能参与课题组科研工作的学生进行选拔和培训。综合创新实验提高了学生的科研能力、训练了学生的科研思维,使学生顺利的参与到教师的科研工作中,实现了教学与科研的相互融合。
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关键词
微生物
dna
提取
教学与科研融合
创新
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职称材料
高含固率木质纤维素厌氧发酵物总DNA的4种提取方法比较
被引量:
1
2
作者
马旭光
刘素君
+2 位作者
江滔
常佳丽
唐琼
《中国沼气》
2020年第2期28-35,共8页
不同的样本特性和提取方法对获得微生物总DNA的质量有重要影响。文章基于高含固率木质纤维素厌氧发酵物腐殖酸、酚类物质含量高、质地均一性差、微生物浓度低的特点,研究了4种方法提取不同高含固率粪秸厌氧发酵物中微生物总DNA的效果。...
不同的样本特性和提取方法对获得微生物总DNA的质量有重要影响。文章基于高含固率木质纤维素厌氧发酵物腐殖酸、酚类物质含量高、质地均一性差、微生物浓度低的特点,研究了4种方法提取不同高含固率粪秸厌氧发酵物中微生物总DNA的效果。结果表明,常规的十二烷基磺酸钠法(sodium dodecyl sulfate,SDS)、十二烷基磺酸钠和溴化十六烷基三甲铵结合法(sodium dodecyl sulfate and cetyltrimethyl ammonium bromide,SDS-CTAB)和商业的粪便试剂盒法提取的DNA质量均较差,SDS法和试剂盒法未能获得聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增目的条带,SDS-CTAB法得到的条带较模糊;改进SDS-CTAB法获得的DNA杂质少、纯度高,具有较好的稳定性,A260/A280和A260/A230值分别为1.74~1.86和1.65~1.86,每克样品的DNA浓度在50 ng·μL^-1以上,电泳条带单一齐整、清晰明亮,PCR扩增的目的条带清晰度高,适宜后续分子生物学技术的分析。林格氏液洗脱、聚乙烯吡咯烷酮-40(Polyvinyl Pyrrolidone-40,PVP-40)洗涤液除杂以及裂解液和多种酶联合破壁是改进SDS-CTAB法获得该类专一性样本高质量微生物总DNA的关键步骤。
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关键词
高含固率
木质纤维素厌氧发酵物
微生物
dna
提取方法
纯度
PCR扩增
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职称材料
紫色水稻土水稳性团聚体土壤微生物基因组DNA提取方法探讨
被引量:
1
3
作者
罗红燕
谢德体
蒋先军
《水土保持学报》
CSCD
北大核心
2009年第5期223-227,共5页
为了找到提取土壤微生物总DNA的最佳方法,通过OD值检验、凝胶电泳、PCR和DGGE分析,比较了Reddy法、基于DNAout kit试剂盒改进的实验方法、以及Kuske修订法、Edgcomb改进法、SDS高盐提取法、Eichner调整法等常用的不同土壤微生物基因组的...
为了找到提取土壤微生物总DNA的最佳方法,通过OD值检验、凝胶电泳、PCR和DGGE分析,比较了Reddy法、基于DNAout kit试剂盒改进的实验方法、以及Kuske修订法、Edgcomb改进法、SDS高盐提取法、Eichner调整法等常用的不同土壤微生物基因组的DNA提取方法在亚热带地区长期免耕紫色水稻土水稳性团聚体0.25-2.0 mm粒径上的提取效果。结果表明,6种方法都可以从团聚体中提取到长度大于23.1 kb的DNA片段,但不同方法提取的DNA的产量存在明显差异,土壤总DNA均不需纯化就可以用于PCR扩增,使用细菌16S rDNA基因V3区的通用引物可扩增得到相应的片段。研究表明,改进的DNAout kit试剂盒法是长期免耕紫色水稻土水稳性团聚体中微生物基因组DNA的最佳提取方法。
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关键词
免耕紫色土水稻田土壤
微生物
dna
提取
方法比较
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职称材料
题名
土壤DNA提取技术在本科教学实验教学中的应用
1
作者
李亮
武洪庆
郭子渝
崔忠信
胡海诚
机构
河北工业大学化学工程与技术学院
出处
《科教导刊》
2019年第16期124-125,共2页
基金
河北省高等学校科学技术研究青年基金(QN2018014)
国家自然科学基金(31801948)
“河北工业大学大学生创新创业训练计划”项目(201810080013)
文摘
开展科研训练、提高学生科学素养,一直是本科教学改革研究热点之一。以课题组常用的实验技术"土壤DNA提取"为基础,结合"大学生科技创新"等活动,设计综合创新实验,对可能参与课题组科研工作的学生进行选拔和培训。综合创新实验提高了学生的科研能力、训练了学生的科研思维,使学生顺利的参与到教师的科研工作中,实现了教学与科研的相互融合。
关键词
微生物
dna
提取
教学与科研融合
创新
Keywords
microbial
dna
extraction
integration
of
teaching
and
scientific
research
innovation
分类号
G424 [文化科学—课程与教学论]
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职称材料
题名
高含固率木质纤维素厌氧发酵物总DNA的4种提取方法比较
被引量:
1
2
作者
马旭光
刘素君
江滔
常佳丽
唐琼
机构
乐山师范学院化学学院
出处
《中国沼气》
2020年第2期28-35,共8页
基金
国家自然基金项目(51508258)
四川省科技厅应用基础项目(2017JY0175)
+1 种基金
乐山市科技局重点项目(15NZD106)
乐山师范学院人才引进计划项目(Z1410)。
文摘
不同的样本特性和提取方法对获得微生物总DNA的质量有重要影响。文章基于高含固率木质纤维素厌氧发酵物腐殖酸、酚类物质含量高、质地均一性差、微生物浓度低的特点,研究了4种方法提取不同高含固率粪秸厌氧发酵物中微生物总DNA的效果。结果表明,常规的十二烷基磺酸钠法(sodium dodecyl sulfate,SDS)、十二烷基磺酸钠和溴化十六烷基三甲铵结合法(sodium dodecyl sulfate and cetyltrimethyl ammonium bromide,SDS-CTAB)和商业的粪便试剂盒法提取的DNA质量均较差,SDS法和试剂盒法未能获得聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增目的条带,SDS-CTAB法得到的条带较模糊;改进SDS-CTAB法获得的DNA杂质少、纯度高,具有较好的稳定性,A260/A280和A260/A230值分别为1.74~1.86和1.65~1.86,每克样品的DNA浓度在50 ng·μL^-1以上,电泳条带单一齐整、清晰明亮,PCR扩增的目的条带清晰度高,适宜后续分子生物学技术的分析。林格氏液洗脱、聚乙烯吡咯烷酮-40(Polyvinyl Pyrrolidone-40,PVP-40)洗涤液除杂以及裂解液和多种酶联合破壁是改进SDS-CTAB法获得该类专一性样本高质量微生物总DNA的关键步骤。
关键词
高含固率
木质纤维素厌氧发酵物
微生物
dna
提取方法
纯度
PCR扩增
Keywords
high
solid
content
lignocellulosic
digestate
microbial
dna
extraction
method
purity
PCR
amplification
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
X712 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
紫色水稻土水稳性团聚体土壤微生物基因组DNA提取方法探讨
被引量:
1
3
作者
罗红燕
谢德体
蒋先军
机构
西南大学资源环境学院
出处
《水土保持学报》
CSCD
北大核心
2009年第5期223-227,共5页
基金
国家自然科学基金项目(40501033)
国家"十一.五"科技支撑计划(2007BAD87B10)
文摘
为了找到提取土壤微生物总DNA的最佳方法,通过OD值检验、凝胶电泳、PCR和DGGE分析,比较了Reddy法、基于DNAout kit试剂盒改进的实验方法、以及Kuske修订法、Edgcomb改进法、SDS高盐提取法、Eichner调整法等常用的不同土壤微生物基因组的DNA提取方法在亚热带地区长期免耕紫色水稻土水稳性团聚体0.25-2.0 mm粒径上的提取效果。结果表明,6种方法都可以从团聚体中提取到长度大于23.1 kb的DNA片段,但不同方法提取的DNA的产量存在明显差异,土壤总DNA均不需纯化就可以用于PCR扩增,使用细菌16S rDNA基因V3区的通用引物可扩增得到相应的片段。研究表明,改进的DNAout kit试剂盒法是长期免耕紫色水稻土水稳性团聚体中微生物基因组DNA的最佳提取方法。
关键词
免耕紫色土水稻田土壤
微生物
dna
提取
方法比较
Keywords
no-tillage
purple
paddy
soil
microbial
dna
extraction
comparison
of
methods
分类号
Q939.96 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
土壤DNA提取技术在本科教学实验教学中的应用
李亮
武洪庆
郭子渝
崔忠信
胡海诚
《科教导刊》
2019
0
下载PDF
职称材料
2
高含固率木质纤维素厌氧发酵物总DNA的4种提取方法比较
马旭光
刘素君
江滔
常佳丽
唐琼
《中国沼气》
2020
1
下载PDF
职称材料
3
紫色水稻土水稳性团聚体土壤微生物基因组DNA提取方法探讨
罗红燕
谢德体
蒋先军
《水土保持学报》
CSCD
北大核心
2009
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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