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人脑胶质瘤细胞系miRNA表达谱初步研究 被引量：29
1
作者 康春生 浦佩玉 +3 位作者 贾志凡 张安玲 周旋 王广秀 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2008年第6期468-470,共3页
目的确定部分人脑胶质瘤细胞系miRNA表达谱的初步特征。方法提取人脑胶质母细胞瘤细胞系U251、TJ861、TJ905、TJ899和A172以及星形细胞瘤细胞系H4细胞的miRNA，miRNA微阵列芯片杂交，扫描后分析差异表达的miRNA。选择差异表达的miR-21... 目的确定部分人脑胶质瘤细胞系miRNA表达谱的初步特征。方法提取人脑胶质母细胞瘤细胞系U251、TJ861、TJ905、TJ899和A172以及星形细胞瘤细胞系H4细胞的miRNA，miRNA微阵列芯片杂交，扫描后分析差异表达的miRNA。选择差异表达的miR-21设计反义寡核苷酸处理U251细胞后原位杂交和Western blot检查SEPT7的表达。结果在胶质瘤细胞系中hsa—miR-21等8种miRNA一致表达上调；hsa—miR-1等18种miRNA一致表达下调。miR-21锁核酸修饰反义寡核苷酸处理U251细胞72h后，原位杂交发现阳性信号集中在细胞核的miR-21表达显著下降，Western blot发现U251细胞中SEPT7的表达明显上调。结论miRNA的差异表达可能是胶质瘤的重要分子生物学标签，并在基因表达调控中具有潜在的研究价值。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 mirna 微阵列 表达谱
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结肠癌血清microRNA表达谱的检测及临床应用价值 被引量：27
2
作者 王亚南 陈昭华 陈卫昌 《中国现代医学杂志》 CAS 2018年第1期37-43,共7页
目的找寻潜在的新型的结肠癌血清micro RNA(miRNA)表达谱,探讨其临床应用价值。方法 miRNA微阵列芯片技术检测结肠癌患者和正常人血清中miRNA表达的差异,并对有差异表达的miRNA在60例结肠癌患者血清和60例正常对照组血清中的表达进行实... 目的找寻潜在的新型的结肠癌血清micro RNA(miRNA)表达谱,探讨其临床应用价值。方法 miRNA微阵列芯片技术检测结肠癌患者和正常人血清中miRNA表达的差异,并对有差异表达的miRNA在60例结肠癌患者血清和60例正常对照组血清中的表达进行实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证。结果(1)芯片杂交结果中共有87种miRNAs在结肠癌患者血清和正常人血清标本中有差异表达,其中上调表达有39个,下调表达有48个。(2)qRT-PCR对miRNAs进行验证,其中miR-31、miR-141、miR-224-3p、miR-576-5p和miR-4669这5个miR分子在结肠癌症患者中的表达相对于正常对照组差异具有统计学意义(P<0.05)。(3)miR-31、miR-141、miR-224-3p、miR-576-5p和miR-4669这5个miR分子组成的miR-表达谱诊断结肠癌的效率较高(ROC曲线下面积为0.992)。结论临床检测结肠癌患者miR-31、miR-141、miR-224-3p、miR-576-5p和miR-4669循环分子标志物表达谱有助于诊断结肠癌,有望成为结肠癌患者临床诊疗评估的重要指标。 展开更多
关键词 结肠癌 血清microRNA mirna
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微小RNA-146a上调cyclin D1表达诱导大鼠血管平滑肌细胞的增殖 被引量：12
3
作者 熊玮 骆瑜 +4 位作者 董少红 李江华 廖碧红 庞新利 罗林杰 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期974-978,共5页
目的:采用基因芯片技术研究小分子RNA-146a(miR-146a)促进血管平滑肌细胞增殖的作用靶点并进行验证。方法:原代培养大鼠血管平滑肌细胞,分成mimics组、inhibitor组、control组、sham组,分别体外转染miR-146a mimics(50nmol/L)、miR-146a... 目的:采用基因芯片技术研究小分子RNA-146a(miR-146a)促进血管平滑肌细胞增殖的作用靶点并进行验证。方法:原代培养大鼠血管平滑肌细胞,分成mimics组、inhibitor组、control组、sham组,分别体外转染miR-146a mimics(50nmol/L)、miR-146a inhibitor(50 nmol/L)、miR-146a错义链(50 nmol/L)、PBS,Real time PCR测定转染后miR-146a水平,CCK8法检测转染后血管平滑肌细胞增殖情况。采用基因芯片检测inhibitor组和control组基因表达谱,通过生物信息学技术筛选出差异基因和调控的信号通路。对筛选出来的信号通路用Real time PCR和Western blot进行验证。结果:转染48 h后,inhibitor组血管平滑肌细胞的miR-146a水平明显低于control组和sham组(P<0.01),inhibitor组血管平滑肌细胞的OD值明显低于control组、sham组(P<0.05)。通过对基因表达谱分析发现,p53信号通路被miR-146a上调。用Real time PCR和Western blot进行检测发现,p53信号通路中关键分子p53、caspase3、PTEN的mRNA和蛋白水平无明显变化(P>0.05),而mimics组VSMC中cyclin D1的mRNA和蛋白水平增加(与sham相比,P<0.05),inhibitor组VSMC中cyclin D1的mRNA和蛋白水平下降(与sham相比,P<0.05)。结论:miR-146a可能通过上调细胞周期蛋白cyclin D1的表达促进大鼠血管平滑肌细胞的增殖。 展开更多
关键词 血管平滑肌细胞 MIR-146A 基因谱 P53 CYCLIN D1
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续苓健骨方对骨质疏松模型大鼠miRNA表达谱的作用研究 被引量：11
4
作者 李生强 陈赛楠 +5 位作者 谢冰颖 陈娟 谢丽华 叶云金 黄景文 葛继荣 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1561-1566,共6页
目的通过分析骨质疏松症大鼠模型miRNA表达谱变化,探讨续苓健骨方治疗骨质疏松症的分子机制。方法建立去卵巢法骨质疏松模型大鼠12只,分为模型组6只、续苓健骨方组6只。假手术组6只为对照。造模1个月后,续苓健骨方灌胃12周,检测大鼠胫... 目的通过分析骨质疏松症大鼠模型miRNA表达谱变化,探讨续苓健骨方治疗骨质疏松症的分子机制。方法建立去卵巢法骨质疏松模型大鼠12只,分为模型组6只、续苓健骨方组6只。假手术组6只为对照。造模1个月后,续苓健骨方灌胃12周,检测大鼠胫骨骨密度,检测腰椎miRNA表达谱,对差异表达的miRNAs进行生物信息学分析。结果与假手术组比较,模型组腰椎miRNAs 58条显著下调、97条显著上调;与模型组比较,续苓健骨方组腰椎miRNAs下调的50条显著上调、上调的60条显著下调;与假手术组比较,续苓健骨方组腰椎miRNAs仅8条有差异。生物信息学分析发现,差异miRNAs靶基因主要参与HIF-1、甲状腺激素、Hedgehog、GnRH、自噬、cAMP及MAPK等信号通路。结论建立了续苓健骨方治疗骨质疏松模型大鼠的miRNA表达谱;差异miRNAs可能通过调控HIF-1、甲状腺激素、Hedgehog、GnRH、自噬、cAMP及MAPK等信号通路参与续苓健骨方对骨质疏松大鼠的治疗过程。 展开更多
关键词 中医中药 续苓健骨方 骨质疏松 动物实验 mirna表达谱
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食管鳞癌放射抗拒的相关microRNA筛选 被引量：10
5
作者 陈鑫 车少敏 +1 位作者 惠蓓娜 张晓智 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期296-301,共6页
目的探索放射抗拒对食管癌细胞microRNA(miRNA)表达的影响,筛选差异表达miRNAs,为靶向miRNAs的放射增敏研究提供理论依据。方法食管鳞癌Eca-109、TE-1细胞分别经2Gy/次的X-线照射处理,照射累积剂量达64Gy,分别命名细胞株为Eca-109R、TE-... 目的探索放射抗拒对食管癌细胞microRNA(miRNA)表达的影响,筛选差异表达miRNAs,为靶向miRNAs的放射增敏研究提供理论依据。方法食管鳞癌Eca-109、TE-1细胞分别经2Gy/次的X-线照射处理,照射累积剂量达64Gy,分别命名细胞株为Eca-109R、TE-1R;克隆形成实验检测细胞放射抗拒能力;芯片检测放射抗拒细胞与母代细胞miRNA表达谱,qRT-PCR验证miRNAs表达水平。结果照射剂量40Gy后,Eca-109、TE-1细胞出现分裂受阻、多核巨型细胞、树枝状异形细胞等毒性反应,经多次传代培养完成累计剂量64Gy,恢复上皮细胞形态;0、1、2、4、6、8Gy照射后,放射抗拒细胞株Eca-109R、TE-1R增殖能力均较母代细胞增强,差异具有统计学意义(P<0.001);放射抗拒细胞株Eca-109R、TE-1R的克隆形成率中的N、Dq、D0等参数较母代细胞具有更强的放射抗拒性,差异具有统计学意义(P<0.05);miRNA芯片检测并经qRT-PCR验证,TE-1R与Eca-109R细胞较母代细胞均存在多个明显差异表达的miRNA,两放射抗拒细胞株间比较,仅miR-21在放射抗拒形成前后具有共同的表达改变趋势,且差异具有统计学意义(P<0.05)。结论放射抗拒细胞株Eca-109R、TE-1R构建成功,且与母代细胞存在差异表达的miR-NAs,放射抗拒细胞株中miR-21的表达可能与放射抗拒特性相关。 展开更多
关键词 mirna 食管癌 放射抗拒 表达谱 放射增敏
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甜杨低温响应microRNAs的克隆与分析 被引量：10
6
作者 孙润泽 侯琦 +3 位作者 章文乐 钮俊 张志毅 林善枝 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期204-211,共8页
MicroRNAs(miRNAs)作为一类21碱基左右的非编码小RNAs,参与植物生长发育的调控,并在植物对生物与非生物胁迫的应答过程中发挥重要作用。本研究依据miRNA高度保守特点,利用已公布的毛果杨(Populus trichocarpa)基因组序列设计引物,从甜杨... MicroRNAs(miRNAs)作为一类21碱基左右的非编码小RNAs,参与植物生长发育的调控,并在植物对生物与非生物胁迫的应答过程中发挥重要作用。本研究依据miRNA高度保守特点,利用已公布的毛果杨(Populus trichocarpa)基因组序列设计引物,从甜杨(Populus suaveolens)基因组中克隆获得了12个miRNA基因座序列。序列比对结果表明,这些miRNA基因均为毛果杨低温响应miRNA基因的同源序列。同时,以低温(0℃)处理0～48h的甜杨幼苗为试材,通过半定量RT-PCR法对miRNA基因的成熟体序列在不同处理时间下的表达谱进行分析,结果显示,大多数miRNA成熟体序列在甜杨低温胁迫下的表达模式与其在毛果杨中的表达极为相似,由此可推测这些保守性miRNAs可能在甜杨和毛果杨两物种对低温胁迫的应答反应中发挥相似的功能,而miR168a、miR168b和miR475a在两物种间表达现象的差异,表明它们可能通过调控多种靶基因而发挥不同作用。本文结果将为进一步研究甜杨基因功能提供基础。 展开更多
关键词 甜杨 MICRORNA 低温胁迫 表达谱
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乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞MicroRNAs表达谱的差异性分析 被引量：8
7
作者 张辉 苏式兵 +1 位作者 周钱梅 陆亦宇 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第5期493-499,共7页
背景与目的:已有研究表明,MicroRNAs(miRNAs)的异常表达参与了乳腺癌的发生和发展,常起到抑癌基因或癌基因作用。本研究旨在探讨乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异性表达,并预测异常表达的miRNAs可能调控的靶基因。方法:培养乳腺癌... 背景与目的:已有研究表明,MicroRNAs(miRNAs)的异常表达参与了乳腺癌的发生和发展,常起到抑癌基因或癌基因作用。本研究旨在探讨乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异性表达,并预测异常表达的miRNAs可能调控的靶基因。方法:培养乳腺癌细胞株MCF-7和正常乳腺上皮细胞株HBL-100,分别提取细胞总RNA,并进行质检;利用miRNAs芯片技术,检测乳腺癌细胞和正常乳腺上皮细胞miRNAs的表达,对其表达谱进行差异性分析;采用实时定量RT-PCR进行验证;运用MiRanda、TargetScan、PicTar、DIANA-microT软件预测miRNAs可能调控的靶基因。结果:从MCF-7细胞与HBL-100细胞提取到的总RNA纯度较高,其A260/A280为1.90,A260/A230为2.0;琼脂糖凝胶实验结果显示总RNA完整性好。通过miRNAs表达谱的差异性分析,获得173个与乳腺癌相关的miRNAs,其中113个表达上调,60个表达下调;实时定量PCR检测到mir-18a和mir-195在MCF-7细胞中高表达;对乳腺癌细胞显著异常表达的mir-200b进行信息学分析,共筛选出68个靶基因。结论:获得了乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异表达谱,其中部分miRNAs可能通过调控其靶基因而参与乳腺癌的发病机制。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 MCF-7细胞 mirna 表达谱 差异 性分析
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广东汉族妊娠期糖尿病妇女胎盘组织microRNA差异表达谱分析 被引量：8
8
作者 李伟 胡宝春 龚照 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第3期298-302,共5页
目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就... 目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就诊并分娩的GDM孕妇20例作为观察组(GDM组),均为粤籍汉族并且相互之间无亲缘关系,随机选取同期无妊娠合并症的正常广东汉族孕妇20例作为对照组。胎儿分娩后收集胎盘组织,用TRIzol法进行总RNA提取,经过质量和纯度分析鉴定合格后分别选取5个样本混合成GDM和对照组,采用逆转录法构建小RNA文库,使用第二代高通量测序采用边合成边测序的方法对miRNA进行测序并分析结果。结果:从胎盘组织提取到的总RNA纯度较高,D(260 nm)/D(280 nm)>1.90,并成功构建小RNA的c DNA文库。采用高通量测序得到长度为10~35 nt的小RNA片段,其中文库数量最多的小RNA长度21~24 nt,miRNA量占所有小RNA总量的30%以上,最终获得洁净的片段超过10 000 000。将得到的片段与Genebank及Rfram数据库比对,去除其他小RNA筛选出miRNA达7 000多种。通过样本两两比较分析,与对照组相比,发现GDM组有138种已知的miRNA表达明显上调,包括hsa-miR-548au-5p、hsa-miR-95a-5p、hsa-miR-373-5p、hsa-miR-216-5p等(log2-ratio>1,P<0.01);16种已知miRNAs明显表达下调,如hsa-miR-5699-5p、hsa-miR-4286等(log2-ratio<-1,P<0.01)。Mireap软件预测出27种新miRNA,其中有9种在GDM表达升高,6种表达降低。结论:GDM的胎盘组织miRNAs与对照组存在表达差异,胎盘组织miRNA可能在GDM发病过程中起一定的调节作用。 展开更多
关键词 妊娠期糖尿病 mirna 差异表达谱 高通量测序
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糖尿病神经病变过程中非编码RNA的作用及机制 被引量：2
9
作者 刘涛 何志军 +5 位作者 李金鹏 宋渊 姚兴璋 陈文 李岩 白璧辉 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第7期1124-1129,共6页
背景:持续性高血糖症被确认为促进神经血管功能障碍,导致不可逆的内皮细胞功能障碍、神经细胞凋亡增加、氧化应激和炎症。这些协同和单独作用导致微血管和大血管病变,以及造成进行性神经病变。非编码RNAs可能为了解该疾病的病因、发病... 背景:持续性高血糖症被确认为促进神经血管功能障碍,导致不可逆的内皮细胞功能障碍、神经细胞凋亡增加、氧化应激和炎症。这些协同和单独作用导致微血管和大血管病变,以及造成进行性神经病变。非编码RNAs可能为了解该疾病的病因、发病机制、治疗方法提供新的策略。目的:查阅国内外相关文献,综述非编码RNAs在糖尿病神经病变发生发展中的作用和机制,为非编码RNA在糖尿病神经病变预防和诊疗中提供新的思路和途径。方法:检索中国知网、PubMed数据库建库至2022年所发表的文献,中文关键词“非编码RNA;lncRNA;miRNA;糖尿病周围神经病变;表达谱”;英文关键词“Noncoding RNA;lncRNA;miRNA;Diabetes peripheral neuropathy;Expression profile”,将检索到的文献进行归纳、总结、分析,选取61篇文章进行综述。结果与结论:(1)非编码RNA在调节糖尿病周围神经病变的病理生理过程中起着核心作用。在研究最广泛的调节性非编码RNA物种中,有长链非编码RNAs(lncRNAs)、环状RNAs(circRNAs)和微小RNAs(miRNAs)。(2)通过非编码RNA的调节作用,引起相关细胞通路、炎症基因及下游相关细胞因子的激活或抑制,将抑制细胞凋亡,改善炎症水平,从而改变靶基因表达来参与糖尿病神经痛的进程。(3)尽管已发现多种微小RNA、长链非编码RNAs参与糖尿病神经病变疾病,但许多非编码RNAs的作用机制仍不清楚,相同的非编码RNAs可能在不同的模型中发挥不同的作用。因此,有必要进一步研究它们在疾病病因学和病理学中的作用模式,以阐明它们在糖尿病神经病变发病机制中的作用。然而,尚未建立评估非编码RNA活性的标准,需要进一步研究哪些特定非编码RNA在调节中起主导作用。(4)微小RNAs、长链非编码RNAs及其靶基因能够调节进行性神经病变,有望成为临床防治糖尿病周围神经病变的新靶点和预警糖尿病周围神经病 展开更多
关键词 非编码RNA 长链非编码RNAs lncRNA mirna 糖尿病神经病变 表达谱
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BMP-2诱导人牙髓细胞分化过程中miRNA表达谱的变化 被引量：7
10
作者 包丽荣 赵文青 +2 位作者 林田 陆彦玲 吴煜 《上海口腔医学》 CAS CSCD 2017年第5期476-483,共8页
目的:筛选出骨形态发生蛋白2(bone morphogenetic protein-2,BMP-2)诱导人牙髓细胞(human dental pulp cells,h DPCs)成牙本质向分化时差异表达的微小RNA(miRNAs)。方法:以BMP-2诱导液培养h DPCs 14 d作为诱导组,以未诱导的h DPCs为对照... 目的:筛选出骨形态发生蛋白2(bone morphogenetic protein-2,BMP-2)诱导人牙髓细胞(human dental pulp cells,h DPCs)成牙本质向分化时差异表达的微小RNA(miRNAs)。方法:以BMP-2诱导液培养h DPCs 14 d作为诱导组,以未诱导的h DPCs为对照组,实时定量PCR检测成牙本质相关基因:牙本质涎磷蛋白(dentin sialophosphoprotein,DSPP)、牙本质基质蛋白1(dentin matrix protein-1,DMP-1)、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)的表达;通过miRNA芯片筛选h DPCs向成牙本质细胞分化过程中差异表达的miRNAs,采用实时定量PCR对结果进行验证;应用生物信息学软件进行靶基因预测,初步推测BMP-2诱导h DPCs分化过程中涉及的通路及功能。采用SPSS 18.0软件包对数据进行统计学分析。结果:实时定量PCR结果显示,各目的基因(DSPP、DMP-1、ALP)在诱导组的表达均高于对照组(P<0.05)。基因芯片结果显示,h DPCs成牙本质向诱导后,差异表达的miRNAs有36个,包括上调20个和下调16个。实时定量PCR对其中5个miRNAs的验证结果与芯片结果基本一致。生物信息学分析显示,基因的功能分布为37.8%与生物过程有关,29%与细胞成分有关,33%与分子功能有关,约有0.2%的基因未检测出具体功能和作用。结论:在h DPCs经BMP-2诱导向成牙本质细胞分化过程中,存在miRNA表达谱变化,为进一步研究差异表达的miRNAs在h DPCs分化过程中的作用及其靶基因的生物学效应奠定了基础。 展开更多
关键词 牙髓细胞 BMP-2 mirna 牙本质细胞 基因表达谱
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变应性鼻炎患者鼻黏膜微小RNA的表达谱及其意义 被引量：7
11
作者 冯娟 张秀利 +2 位作者 阳玉萍 王燕 张华 《新疆医科大学学报》 CAS 2019年第10期1284-1289,共6页
目的探讨变应性鼻炎(AR)患者鼻黏膜微小RNAs(miRNAs)的表达谱特点,阐明miRNAs在AR的发病、诊断及治疗中的作用。方法研究设AR组及非变应性鼻炎患者(对照组),对其鼻黏膜进行总RNA抽提,应用RNA-seq技术对鼻黏膜miRNA进行差异表达谱的分析... 目的探讨变应性鼻炎(AR)患者鼻黏膜微小RNAs(miRNAs)的表达谱特点,阐明miRNAs在AR的发病、诊断及治疗中的作用。方法研究设AR组及非变应性鼻炎患者(对照组),对其鼻黏膜进行总RNA抽提,应用RNA-seq技术对鼻黏膜miRNA进行差异表达谱的分析。利用芯片技术,对miRNA进行二级结构的预测,从而判断和预测新的miRNA。比较2组新预测的miRNA的异常表达,筛选其miRNA,构建AR的新预测miRNA异常表达谱。结果将所有序列与rfam数据库进行比对,得到其中miRNA的具体分布情况。通过miRNA芯片,检测共有172个新预测的miRNA在2组鼻黏膜组织中表达,而AR组标本中表达的miRNA共有351个,有84个预测的miRNA在AR组共同表达。在对照组样品中表达的有342个,有85个预测的miRNA在对照组共同表达。本研究数据得到的6个新预测的miRNA在样本间差异表达(P<0.05)。对于得到的新预测的miRNA,使用软件miRand、RNAhybrid预测其靶基因。以新预测的128883为例,其对应的miRNA靶基因为34个。差异表达miRNA靶基因富集,得到差异表达新的miRNA与8条通路有关,分别是轴突指导、突触小泡循环、急性髓性白血病、胞吞作用、ErbB信号通路、Ras信号通路、黑色素瘤和赖氨酸降解。结论变应性鼻炎患者涉及多个新预测的miRNA,以及不同的信号通路,可能为AR患者的发病机制的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 变应性鼻炎(AR) 微小RNA(mirna) 表达谱 靶基因预测 京都基因和基因组百科全书(KEGG)
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内毒素血症大鼠心肌组织miRNA差异表达 被引量：6
12
作者 丁桃 李阳 +4 位作者 唐睿珠 张旋 云雨 李健 王殿华 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期213-217,共5页
目的分析内毒素又称脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)血症大鼠心肌组织mi RNA表达谱变化,探讨mi RNA在内毒素血症心肌损伤中的作用。方法 20只雄性SD大鼠随机分为对照组(n=10)和LPS组(n=10)。LPS组腹腔注射LPS 10 mg/kg,对照组腹腔注射... 目的分析内毒素又称脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)血症大鼠心肌组织mi RNA表达谱变化,探讨mi RNA在内毒素血症心肌损伤中的作用。方法 20只雄性SD大鼠随机分为对照组(n=10)和LPS组(n=10)。LPS组腹腔注射LPS 10 mg/kg,对照组腹腔注射等量生理盐水。24 h后颈脱臼处死大鼠,取心肌组织。Real-time PCR检测TLR4、TNF-α、IL-1β表达水平,透射电镜观察其超微结构变化。mi RNA芯片筛选心肌组织中差异表达的mi RNA,Real-time PCR验证候选mi RNA实际表达水平。结果LPS组大鼠心肌组织TLR4、TNF-α、IL-1β表达明显升高,心肌细胞发生胞质空泡,线粒体水肿、结构破坏等超微结构改变。芯片技术及Real-time PCR证实LPS组大鼠心肌组织中mi R-194-3p,mi R-344a-3p,mi R-465-3p,mi R-501-5p,mi R-3596c,mi R-185-3p,mi R-877显著上调,mi R-208b-3p,mi R-547-3p,mi R-141-3p,mi R-28-5p,mi R-3585-5p显著下调。结论内毒素血症大鼠心肌组织中发现的这些差异表达mi RNA可能与其心肌损伤发生有关。 展开更多
关键词 内毒素血症 脂多糖 心肌损伤 mirna 基因表达谱
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有翅和无翅豌豆蚜中翅型分化信号通路相关微小RNA及其靶基因的表达差异 被引量：5
13
作者 杨宗霖 王艺 +4 位作者 马田田 霍春月 刘晓 阚云超 李丹丹 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1260-1270,共11页
【目的】前期研究发现麦长管蚜Sitobion avenae孤雌蚜有翅和无翅个体中存在很多差异表达的微小RNA(microRNA,miRNA),本研究旨在进一步明确这些miRNA在豌豆蚜Acyrthosiphon pisum中发挥作用的发育阶段,探索miRNA调控孤雌蚜翅两型性分化... 【目的】前期研究发现麦长管蚜Sitobion avenae孤雌蚜有翅和无翅个体中存在很多差异表达的微小RNA(microRNA,miRNA),本研究旨在进一步明确这些miRNA在豌豆蚜Acyrthosiphon pisum中发挥作用的发育阶段,探索miRNA调控孤雌蚜翅两型性分化的机制。【方法】选择在麦长管蚜有翅蚜和无翅蚜中显著差异表达,且靶基因为蜕皮激素、胰岛素信号通路及翅型发育关键基因的5个miRNA(Let-7,miR-92a,miR-92b,miR-92a-1-p5和miR-277),利用qPCR检测这些miRNA及其靶标基因在豌豆蚜3-4龄若蚜和成虫有翅和无翅个体中的表达谱;同时利用双荧光素酶活性检测法对上述miRNA的靶基因进行验证。【结果】表达谱分析发现,这5个miRNA在豌豆蚜成虫中表达量均高于其在若蚜中的表达量,而其预测的靶基因在4龄若蚜中的表达量均高于其在成虫中的表达量,表明miRNA对其靶基因的调控作用可能集中在成虫阶段。分析豌豆蚜有翅和无翅个体中5个miRNA的表达情况发现,在成虫有翅个体中5个miRNA的表达量均高于无翅个体中的,其中miR-277表达差异最显著,成虫有翅个体中的表达量是无翅个体中表达量的7.5倍;其次为Let-7,表达差异达3倍。而Let-7在3龄有翅若蚜和无翅若蚜中表达差异最显著,有翅个体中的表达量是无翅个体中的37.8倍;其次为miR-277,表达差异达7.6倍。比较5个miRNA与其靶基因在豌豆蚜3-4龄若蚜及成虫有翅和无翅个体中的表达发现,miRNA Let-7和miR-92b的表达趋势分别与其靶基因abrupt和Foxo的基本相反。荧光素酶活性检测结果显示,Let-7的真实靶标为abrupt,共转染Let-7模拟物后与对照相比,荧光素酶活性下降53%,达极显著水平。其他miRNA与靶标基因的互作不显著。【结论】首次发现miRNA对豌豆蚜孤雌蚜翅型分化相关基因的调控可能发生在成虫阶段。Let-7可能通过调控abrupt基因参与孤雌蚜翅型分化。该研究为进一步探索miRNA参与� 展开更多
关键词 豌豆蚜 孤雌生殖 翅型分化 mirna 靶基因 表达谱
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肠易激综合征血循环microRNA的表达谱 被引量：4
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作者 熊青 徐龙 +5 位作者 李强 李慧敏 娄婷 汪安江 刘丕 吕农华 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2013年第5期392-396,共5页
目的:探讨腹泻型肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)、便秘型IBS和正常人体血循环中微小核糖核酸(microRNA,miRNA)的表达差异,寻找潜在的IBS异常miRNA表达谱.方法:按罗马Ⅲ标准临床诊断IBS,根据临床特点分为腹泻型IBS和便秘型I... 目的:探讨腹泻型肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)、便秘型IBS和正常人体血循环中微小核糖核酸(microRNA,miRNA)的表达差异,寻找潜在的IBS异常miRNA表达谱.方法:按罗马Ⅲ标准临床诊断IBS,根据临床特点分为腹泻型IBS和便秘型IBS.分别选取3份腹泻型IBS、3份便秘型IBS和3份正常人的混合血清标本,miRNA表达芯片检测血清标本中miRNA的表达水平,并进行聚类分析.结果:miRNA表达芯片分析发现,与正常人相比较,腹泻型IBS血循环中2种miRNA表达下调,2种miRNA表达上调;便秘型IBS血循环中4种miRNA表达下调,59种miRNA表达上调;只在腹泻型IBS血循环中差异表达的miRNA有1种,只在便秘型IBS血循环中差异表达的miRNA有60种,miR-23b在两种IBS血循环中都表达显著下调,hcmv-miR-US5-2、hsv2-miR-H11都表达显著上调.与腹泻型IBS相比较,便秘型IBS血循环中1种miRNA表达下降,26种miRNA表达上调.结论:IBS血循环具有异常的miRNA表达谱,提示血循环miRNA可作为IBS潜在的诊断标志. 展开更多
关键词 肠易激综合征 mirna 表达谱
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禽致病性大肠杆菌(APEC)感染对雏鸡脾脏miRNA表达谱的影响 被引量：4
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作者 宋祥军 邱明宇 +4 位作者 蒋胡艳 涂健 邵颖 刘红梅 祁克宗 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2373-2379,共7页
基于miRNA测序技术研究感染禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli,APEC)雏鸡脾脏microRNA(miRNA)的差异表达,为深入了解APEC的致病机制奠定理论基础。将14日龄罗曼鸡随机分为2组,分别腿部肌肉注射APEC分离株AE17和生理... 基于miRNA测序技术研究感染禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli,APEC)雏鸡脾脏microRNA(miRNA)的差异表达,为深入了解APEC的致病机制奠定理论基础。将14日龄罗曼鸡随机分为2组,分别腿部肌肉注射APEC分离株AE17和生理盐水后采集脾脏组织,制作病理切片并进行miRNA测序,用miRanda算法预测差异表达miRNA的靶基因,并进行GO和KEGG分析。切片结果显示,与对照组相比,AE17株感染组脾脏组织有病变。通过miRNA测序总共筛选了21个差异表达miRNA的靶基因,其中8个下调和13个上调;对预测靶基因进行GO分析发现其显著富集在细胞、细胞器、膜等功能上;KEGG分析显示其参与Toll样受体信号通路和MAPK信号通路等免疫系统过程。本研究在AE17株感染组脾脏病理切片中发现病理变化,并利用miRNA测序技术成功获取了APEC感染鸡脾脏的miRNA表达谱,发现雏鸡脾脏组织miRNA表达丰富且表达量各异,为探讨APEC致病机制提供新思路。 展开更多
关键词 雏鸡 禽致病性大肠杆菌(APEC) 脾脏 致病性 mirna 表达谱
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山羊乳及绵羊乳外泌体miRNAs表达谱的分析与差异比较
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作者 鲁曦 任珂 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期134-140,共7页
为揭示山羊乳和绵羊乳外泌体的潜在功能差异,对山羊乳和绵羊乳外泌体进行提取和鉴定,利用Illumina平台对羊乳外泌体中非编码小RNA(sRNA)进行高通量测序,并对微小RNA(miRNA)表达谱和功能进行注释。在山羊乳外泌体中鉴定出161种已知miRNA... 为揭示山羊乳和绵羊乳外泌体的潜在功能差异,对山羊乳和绵羊乳外泌体进行提取和鉴定,利用Illumina平台对羊乳外泌体中非编码小RNA(sRNA)进行高通量测序,并对微小RNA(miRNA)表达谱和功能进行注释。在山羊乳外泌体中鉴定出161种已知miRNAs序列和5种新型miRNAs序列;绵羊乳外泌体中鉴定出80种已知miRNAs序列和7种新型miRNAs序列,其中miR-148a、miR-26a和let-7b在2种羊乳样本中表达量较高。miR-151只在山羊乳外泌体样本中检出。通路富集发现山羊乳miRNAs靶基因分子功能集中在结合和催化活性等方面,而绵羊乳外泌体miRNAs靶基因具有肠菌素结合的功能,且对宿主发育具有一定促进作用。结果提示山羊乳和绵羊乳来源的miRNAs可能具有某些共性和独特的靶基因类型,可能在缓解病原微生物感染、炎症、抑制癌细胞增殖迁移等方面发挥不同功能。上述miRNAs测序与分析研究可为羊乳外泌体的后续功能开发提供参考。 展开更多
关键词 山羊乳外泌体 绵羊乳外泌体 mirna Illumina测序 表达谱
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miRNA基因在骨肉瘤患者外周血中的差异表达 被引量：4
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作者 马草源 镐英杰 +2 位作者 刘亚伟 王正义 于磊 《河南医学研究》 CAS 2018年第8期1366-1370,共5页
目的研究微小核糖核酸(microRNA,miRNA)基因在骨肉瘤患者外周血中的差异表达。方法收集郑州大学第一附属医院2013年3月至2015年4月收治的40例股骨远端和胫骨近端骨肉瘤患者,同期选择40例健康体检者。分别收集两组患者空腹静脉血,肿瘤组... 目的研究微小核糖核酸(microRNA,miRNA)基因在骨肉瘤患者外周血中的差异表达。方法收集郑州大学第一附属医院2013年3月至2015年4月收治的40例股骨远端和胫骨近端骨肉瘤患者,同期选择40例健康体检者。分别收集两组患者空腹静脉血,肿瘤组织及对照组相应部位组织,利用miRNA基因芯片对其进行分析,观察miRNA在外周血及骨肉瘤组织中的差异表达。结果筛查出骨肉瘤肿瘤组织中相关异常表达基因270个,上调miRNA基因15个,下调miRNA基因255个。上调及下调倍数大于2.5的miRNA 19个,上调大于2.5倍的miRNA基因8个:miR-21、miR-451、miR-218、miR-18a、miR-148a、miR-198、miR-195、miR-497。下调大于2.5倍11个:miR-29、miR-223、miR-183、miR-31、miR-654、miR-495、miR-493、miR-410、miR-409-5p、miR-409-3p、miR-382。外周血中异常表达基因178个,上调19个,下调159个。上调及下调倍数大于2.5的miRNA 21个,上调大于2.5倍的miRNA基因12个:miR-21、miR-451、miR-199a、miR-18a、miR-18b、miR-148a、miR-195、miR-497、miR-130b、miR-182、miR-374a、miR-301b。下调大于2.5倍的有9个:miR-29、miR-223、miR-410、miR-133b、miR-31、miR-206、miR-144、miR-493、miR-142-3p。两组结果有较高的重合性。其中表达特异性最明显的是miR-21(上调),miR-29(下调)。结论骨肉瘤肿瘤组织与外周血在miRNA表达上存在一定程度相关性和一致性,其中miR-21和miR-29特异性最明显,并预测其作为生物学标志物的可能性。 展开更多
关键词 骨肉瘤 mirna基因 基因表达谱 差异表达
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血浆miRNA在先天性心脏病继发肺动脉高压的差异表达 被引量：4
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作者 郭建洲 王志伟 马琰琰 《心脏杂志》 CAS 2018年第4期442-445,共4页
目的探究先天性心脏病继发肺动脉高压(PAH)患者血浆中miRNA表达谱的差异,从而探究其与PAH的相关性。方法先天性心脏病患者80例,根据肺动脉压力进行分组:肺动脉压正常者22例(无PAH组);轻、中度PAH者37例(轻中度PAH组);重度PAH者21例(重度... 目的探究先天性心脏病继发肺动脉高压(PAH)患者血浆中miRNA表达谱的差异,从而探究其与PAH的相关性。方法先天性心脏病患者80例,根据肺动脉压力进行分组:肺动脉压正常者22例(无PAH组);轻、中度PAH者37例(轻中度PAH组);重度PAH者21例(重度PAH组)。另外选取门诊体检的志愿者20例作为对照组。采用定量聚合酶链反应(PCR)分析对比各组患者血浆miR-18a、miR-27b、miR-130a和miR-204的表达差异。分析miRNA表达水平与肺动脉压力的相关性。结果与对照组相比,无PAH组、轻中度PAH组、重度PAH组患者miR-18a、miR-27b和miR-130a表达水平上调,miR-204的表达水平下调,差异有统计学意义(P<0.05);与无PAH组相比,轻中度PAH组、重度PAH组患者miR-18a、miR-27b和miR-130a表达水平上调,miR-204的表达水平下调,差异有统计学意义(P<0.05);与轻中度PAH组相比,重度PAH组患者miR-18a、miR-27b和miR-130a表达水平上调,miR-204的表达水平下调,差异有统计学意义(P<0.05)。Spearman线性相关分析显示血浆miR-18a、miR-27b和miR-130a表达水平与PAH呈正相关(r=0.845,r=0.912,r=0.933,P<0.05);血浆miR-204的表达水平与PAH呈负相关(r=-0.629,P<0.05)。结论 miRNA在先天性心脏病继发PAH患者血浆中存在差异表达,miRNA的表达水平与肺动脉压力具有相关性。 展开更多
关键词 心脏病 先天性 肺动脉高压 微小核糖核酸 表达谱 相关性
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EB病毒miRNAs在鼻咽癌细胞株C666-1和CNE-2Z中的差异性表达分析 被引量：4
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作者 揭伟 罗泊涛 +2 位作者 陈锦 姜汉国 申志华 《现代肿瘤医学》 CAS 2010年第6期1064-1069,共6页
目的:探讨ebv-miRNA在低分化NPC细胞株C666-1(EBV+)和CNE-2Z(EBV表达水平随传代次数增加而逐渐降低)中的差异性表达进而分析其功能。方法:常规培养NPC细胞株C666-1和CNE-2Z,分别提取总RNA并进行质检;RT-PCR检测LMP-1和LMP-2A mRNA的表... 目的:探讨ebv-miRNA在低分化NPC细胞株C666-1(EBV+)和CNE-2Z(EBV表达水平随传代次数增加而逐渐降低)中的差异性表达进而分析其功能。方法:常规培养NPC细胞株C666-1和CNE-2Z,分别提取总RNA并进行质检;RT-PCR检测LMP-1和LMP-2A mRNA的表达以判断EBV的感染情况;miRNA芯片技术检测EBV miRNAs的表达并对其表达谱进行差异性分析;荧光定量RT-PCR进行验证;复习文献了解ebv-miRNA调控的靶基因以了解其功能。结果:从C666-1和CNE-2Z两株细胞抽提的总RNA纯度高,A260/A280>2.0,A260/A230>2.1,RNA完整性好。C666-1具有比CNE-2Z更高的LMP-1和LMP-2A mRNA表达。ebv-miRNA表达谱的差异分析表明39个ebv-miRNAs中19个在两株细胞显著差异性表达;荧光定量RT-PCR结果证实ebv-miR-BHRF1-1和ebv-miR-BART14*在C666-1中表达升高而ebv-miR-BART8*表达降低,与芯片结果趋势一致;复习文献,EBV miRNAs功能远不清楚,少数已知的靶基因涉及信号转导、转录调控、细胞凋亡、增殖、免疫反应和病毒DNA复制等方面。结论:ebv-miRNA在低分化NPC中具有差异性表达并广泛参与基因调控。不同NPC细胞中EBV miRNA表达差异预示着基于ebv-miRNA的NPC个性化治疗的可能性。 展开更多
关键词 鼻咽癌 EPSTEIN Barr病毒 微小RNA 表达谱 差异分析
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生物芯片检测细胞中microRNA的表达 被引量：1
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作者 马卓娅 李欣 +1 位作者 汤华 刘民 《生物技术通讯》 CAS 2007年第6期955-957,共3页
目的:制备microRNA(miRNA)检测芯片,检测细胞中miRNA的表达。方法:将210个(206个miRNA,4个阳性对照)与已知人类和小鼠miRNA互补的序列作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片;提取肿瘤细胞(HeLa,MCF-7,A549,HT-29,ES-2,K562)的miRNA,用荧... 目的:制备microRNA(miRNA)检测芯片,检测细胞中miRNA的表达。方法:将210个(206个miRNA,4个阳性对照)与已知人类和小鼠miRNA互补的序列作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片;提取肿瘤细胞(HeLa,MCF-7,A549,HT-29,ES-2,K562)的miRNA,用荧光染料Cy3标记,并与制备好的芯片杂交;用ScanArrayTM Express1.0扫描仪扫描荧光信号,采用ScanArray3.0和Cluster3.0软件分析处理扫描结果,并用RT-PCR方法对芯片检测结果进行验证。结果:建立了利用生物芯片检测miRNA表达的方法;发现不同细胞miRNA表达谱各异。结论:应用生物芯片技术检测细胞中miRNA的表达是可行的,可为研究miRNA的生理功能和作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 microRNA(mirna) 表达谱
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