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厌氧氨氧化细菌及其群落内细菌互作关系研究进展 被引量:6
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作者 张亦弛 乔雪姣 余珂 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期737-755,共19页
厌氧氨氧化细菌具有的厌氧氨氧化反应是在厌氧条件下将氨氮和亚硝氮或一氧化氮转化为硝氮、生成氮气的过程,因其能够高效低能地处理低碳氮比废水而广受关注。目前,厌氧氨氧化细菌仍未实现纯培养,借助宏组学手段研究厌氧氨氧化细菌及其... 厌氧氨氧化细菌具有的厌氧氨氧化反应是在厌氧条件下将氨氮和亚硝氮或一氧化氮转化为硝氮、生成氮气的过程,因其能够高效低能地处理低碳氮比废水而广受关注。目前,厌氧氨氧化细菌仍未实现纯培养,借助宏组学手段研究厌氧氨氧化细菌及其群落内细菌之间的互作关系是近年来的研究趋势。本文介绍了厌氧氨氧化细菌的种类和特性,综述了厌氧氨氧化细菌的代谢多样性及其群落内细菌间的物质协同利用和信息交流方式,这对厌氧氨氧化群落的稳定具有重要影响,最后对值得进一步深入研究的问题做了总结和展望,以期为后续深入研究细菌间的互作关系提供参考,进而为构建稳定高效的厌氧氨氧化脱氮体系提供思路。 展开更多
关键词 厌氧氨氧化细菌 代谢多样性 厌氧氨氧化群落 代谢联系 信息交流
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抵抗素基因单核苷酸位点多态性及交互作用对宁夏人群代谢综合征的影响 被引量:2
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作者 曹国伟 李亚妮 +2 位作者 陈丽军 刘贺荣 宋辉 《宁夏医科大学学报》 2018年第11期1258-1263,共6页
目的探讨抵抗素(resistin)基因-420 C/G、-537 A/C、-358 G/A、299 G/A、rs7408174 T/C位点多态性及其交互作用与代谢综合征(metabolic syndrome,MS)之间的关联。方法采用病例-对照研究设计,选择376例无血缘关系的MS患者为MS组,408例无... 目的探讨抵抗素(resistin)基因-420 C/G、-537 A/C、-358 G/A、299 G/A、rs7408174 T/C位点多态性及其交互作用与代谢综合征(metabolic syndrome,MS)之间的关联。方法采用病例-对照研究设计,选择376例无血缘关系的MS患者为MS组,408例无血缘关系的健康人为对照组。采用飞行时间质谱法(sequenom)检测5个位点的多态性。采用SPSS、MDR、SHEsis等软件分析研究指标与MS的关系。结果 MS组平均年龄低于对照组(P=0.008),性别及民族构成差异无统计学意义(P>0.05)。MS组体质量指数(BMI)、腰围(WC)、臀围(HC)、腰臀比(WHR)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)和空腹血糖(FPG)均高于对照组,高密度脂蛋白(HDL-C)低于对照组(P均<0.05)。抵抗素基因5个位点基因型和等位基因频率在MS组和对照组间比较差异均无统计学意义(P均>0.05)。抵抗素基因5个位点间存在连锁不平衡,但这5个位点构成的单倍型与MS的易感性无关(P均>0.05)。抵抗素基因5个位点间存在多种交互作用(P均<0.05)。结论抵抗素基因-420 C/G、-537 A/C、-358 G/A、299 G/A、rs7408174 T/C单个位点多态性与宁夏人群MS的发病可能无关联,但这5个位点存在交互作用可增加MS发病风险。 展开更多
关键词 代谢综合征 抵抗素 单核苷酸多态性 连锁不平衡 交互作用
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新疆哈萨克族和汉族代谢综合征患者脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X单体型和连锁不平衡分析
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作者 杨志明 郭淑霞 +4 位作者 郭恒 张景玉 马儒林 芮东升 徐上知 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期163-169,共7页
目的探讨脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447x多态性位点之间的连锁不平衡和单体型对新疆哈萨克族和汉族人群代谢综合征(MS)的影响。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法检测802例研究对象(包括哈萨克族和汉族MS患者各200例和对照... 目的探讨脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447x多态性位点之间的连锁不平衡和单体型对新疆哈萨克族和汉族人群代谢综合征(MS)的影响。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法检测802例研究对象(包括哈萨克族和汉族MS患者各200例和对照各201例)的脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X基因多态性。结果(1)哈萨克族和汉族MS组H-和x等位基因频率均低于各自对照组[哈萨克族H-等位基因:22.0% vs 28.6%(P=0.031),X等位基因5.5%VS12.4%(P=0.001);汉族H-等位基因:18.0% vs 28.9%(P=0.000),X等位基因:4.0% vs 12.4%(P=0.000)],但两民族间无差别(P均〉0.05)。(2)脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X多态性位点之间存在强连锁不平衡。(3)该两个多态性位点之间只存在H+/S、H-/s和H-/x三种单体型,两个民族MS组与对照组之间单体型频率均有统计学差异(X^2哈萨克=13.17,P=0.001;X^2汉=20.68,P=0.000),两民族间无差别(P〉0.05)。(4)哈萨克族和汉族H+H-/H—H-基因型与SX/XX基因型的组合都有升高HDL—C水平和降低TG水平的作用(P〈0.05)。结论脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X多态性与MS相关,两位点之间存在强连锁不平衡,H-/X单体型可能是MS的保护因素,并对血脂水平产生有益的影响。 展开更多
关键词 代谢综合征 脂蛋白脂酶 多态性 基因 单体型 连锁不平衡
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新疆哈萨克族代谢综合征患者 PPARγ基因rs3856806、rs12490265、rs1797912和 rs1175543单体型和连锁不平衡分析
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作者 张眉 马儒林 +9 位作者 郭恒 丁玉松 张景玉 刘佳铭 徐上知 芮东升 何佳 闫贻忠 齐春娜 郭淑霞 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期93-97,共5页
目的:探讨PPARγ基因rs3856806、rs12490265、rs1797912和rs1175543位点连锁不平衡及单体型对新疆哈萨克族人群代谢综合征的影响。方法应用MALDI-TOF-MS检测245例代谢综合征患者和244例对照者 PPARγ基因位点多态性。结果(1) rs38568... 目的:探讨PPARγ基因rs3856806、rs12490265、rs1797912和rs1175543位点连锁不平衡及单体型对新疆哈萨克族人群代谢综合征的影响。方法应用MALDI-TOF-MS检测245例代谢综合征患者和244例对照者 PPARγ基因位点多态性。结果(1) rs3856806T 等位基因:12.53%对17.01%, rs12490265A等位基因:31.84%对38.52%,rs1797912C等位基因:35.31%对43.24%,rs1175543G等位基因:40.61%对47.54%,代谢综合征组上述等位基因频率均低于对照组(均P<0.05)。(2) rs1797912与rs1175543、rs12490265与rs1175543之间均存在强的连锁不平衡。(3) AGCC和GAAT单体型频率在两组间有差异(均P<0.05)。(4)同时携带rs3856806T、rs12490265A、rs1797912C、rs1175543G者患代谢综合征的风险是上述位点CGAA等位基因携带者的0.267倍。结论 PPARγ基因位点多态性与哈萨克族代谢综合征相关,rs1175543分别与rs1797912、rs12490265间均存在强的连锁不平衡,AGCC和GAAT单体型及同时携带TACG等位基因是代谢综合征的保护因素。 展开更多
关键词 哈萨克族 代谢综合征 PPARΓ 单体型 连锁不平衡
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Quantitative resistance against Bemisia tabaci in Solanum pennellii:Genetics and metabolomics 被引量:2
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作者 Floor van den Oever-van den Elsen Alejandro F.Lucatti +4 位作者 Sjaak van Heusden Colette Broekgaarden Roland Mumm Marcel Dicke Ben Vosman 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2016年第4期397-412,共16页
The whitefly Bemisia tabaci is a serious threat in tomato cultivation worldwide as all varieties grown today are highly susceptible to this devastating herbivorous insect.Many accessions of the tomato wild relative So... The whitefly Bemisia tabaci is a serious threat in tomato cultivation worldwide as all varieties grown today are highly susceptible to this devastating herbivorous insect.Many accessions of the tomato wild relative Solanum pennellii show a high resistance towards B. tabaci. A mapping approach was used to elucidate the genetic background of whiteflyresistance related traits and associated biochemical traits in this species. Minor quantitative trait loci(QTLs) for whitefly adult survival(AS) and oviposition rate(OR) were identified and some were confirmed in an F2BC1 population, where they showed increased percentages of explained variance(more than 30%). Bulked segregant analyses on pools of whiteflyresistant and-susceptible F2 plants enabled the identification of metabolites that correlate either with resistance or susceptibility. Genetic mapping of these metabolites showed that a large number of them co-localize with whiteflyresistance QTLs. Some of these whitefly-resistance QTLs are hotspots for metabolite QTLs. Although a large number of metabolite QTLs correlated to whitefly resistance or susceptibility, most of them are yet unknown compounds and further studies are needed to identify the metabolic pathways and genes involved. The results indicate a direct genetic correlation between biochemical-based resistance characteristics and reduced whitefly incidence in S. pennellii. 展开更多
关键词 Genetic linkage map life-history metabolic fingerprinting parameters tomato whitefly
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基于欧洲人群公共数据的代谢综合征多组分共享遗传研究
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作者 周泽宸 郑启文 +6 位作者 车前子 陈思 马雨佳 武轶群 吴涛 胡永华 陈大方 《中国慢性病预防与控制》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期90-93,100,共5页
目的研究代谢综合征各组分之间的遗传相关性,探讨不同性状共享的遗传组分对各性状贡献的大小,探索代谢综合征各组分间的共享遗传基础。方法利用欧洲人群收缩压、舒张压、空腹血糖、餐后2 h血糖、腰围、甘油三酯和高密度脂蛋白胆固醇的... 目的研究代谢综合征各组分之间的遗传相关性,探讨不同性状共享的遗传组分对各性状贡献的大小,探索代谢综合征各组分间的共享遗传基础。方法利用欧洲人群收缩压、舒张压、空腹血糖、餐后2 h血糖、腰围、甘油三酯和高密度脂蛋白胆固醇的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据以及连锁不平衡评分数据,采用R 3.5.0软件的GenomicSEM软件包构建跨性状连锁不平衡评分回归(cross-trait LDSC),计算各性状之间的遗传相关性。应用共同因子分析探讨不同性状共享的遗传组分对各性状贡献的大小。结果收缩压和舒张压具有显著正向的遗传相关性(r_g=0.81),高密度脂蛋白胆固醇与甘油三酯、腰围均具有负向的遗传相关性(r_g值分别为-0.61、-0.41),均有统计学意义(P<0.05)。共享因子分析结果显示,共享遗传因素对腰围、甘油三酯和高密度脂蛋白胆固醇这3个性状的因子载荷分别为0.456、0.678和-0.903。结论在代谢综合征多组分的相关性状中,欧洲人群收缩压与舒张压,腰围、高密度脂蛋白胆固醇与甘油三酯存在一定程度的共享遗传。 展开更多
关键词 代谢综合征 共享遗传 遗传相关性 连锁不平衡评分回归 共同因子分析
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