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玉米产量相关性状定位和Meta-QTL整合
被引量：
9
1
作者
马娟
王浩
+5 位作者
王利锋
曹言勇
李晶晶
Thomas Lubberstedt
王丽艳
李会勇
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期37-47,共11页
以自交系PHB47为轮回亲本,美国GEM种质YUCATAN TOL389 ICA为供体,构建包含115个株系的BC3F4群体为材料,利用玉米56K SNP芯片鉴定基因型,采用基于似然比测验的逐步回归分析法,对产量相关性状进行QTL定位分析。共获得7个穗粒数、穗长、粒...
以自交系PHB47为轮回亲本,美国GEM种质YUCATAN TOL389 ICA为供体,构建包含115个株系的BC3F4群体为材料,利用玉米56K SNP芯片鉴定基因型,采用基于似然比测验的逐步回归分析法,对产量相关性状进行QTL定位分析。共获得7个穗粒数、穗长、粒宽、株高和穗位高加性QTL,解释3.72%～21.90%的表型变异;5个控制单穗重、百粒重、穗长和株高的显性QTL,表型变异解释率为8.40%～21.90%。同时,利用Meta-QTL分析方法,对2005-2018年已发表的不同环境条件下产量相关性状QTL的定位结果进行了整合分析。在正常田间管理条件和营养胁迫条件分别获得37个和16个MQTL。本研究中穗位高加性位点AX-116871591位于MQTL16区段内,并且与MQTLNP7位置相近,该区段内包含生长素/脱落酸转录因子IAA5。穗粒数加性位点AX-86281411,粒宽加性位点AX-86267702和株高显性位点AX-116875920均位于MQTLNP9区段内,该区段内包含NAC转录因子NACTF36。NAC转录因子、MYB转录因子和SOD基因均存在于两个环境条件MQTL区段内。
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关键词
玉米
产量
56KSNP芯片
meta
-
qtl
分析
下载PDF
职称材料
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
被引量：
5
2
作者
周小静
董洋
+9 位作者
张芳
任小平
陈玉宁
黄莉
陈伟刚
廖伯寿
雷永
晏立英
罗怀勇
姜慧芳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期750-756,共7页
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对...
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%-13.77%,LOD值介于2.59-7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。
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关键词
花生
出仁率
qtl
定位
SNP标记图谱
meta
-
qtl
分析
下载PDF
职称材料
题名
玉米产量相关性状定位和Meta-QTL整合
被引量：
9
1
作者
马娟
王浩
王利锋
曹言勇
李晶晶
Thomas Lubberstedt
王丽艳
李会勇
机构
河南省农业科学院粮食作物研究所
美国爱荷华州立大学农学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期37-47,共11页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0100103-10-2)
河南省重大科技专项(161100110500)~~
文摘
以自交系PHB47为轮回亲本,美国GEM种质YUCATAN TOL389 ICA为供体,构建包含115个株系的BC3F4群体为材料,利用玉米56K SNP芯片鉴定基因型,采用基于似然比测验的逐步回归分析法,对产量相关性状进行QTL定位分析。共获得7个穗粒数、穗长、粒宽、株高和穗位高加性QTL,解释3.72%～21.90%的表型变异;5个控制单穗重、百粒重、穗长和株高的显性QTL,表型变异解释率为8.40%～21.90%。同时,利用Meta-QTL分析方法,对2005-2018年已发表的不同环境条件下产量相关性状QTL的定位结果进行了整合分析。在正常田间管理条件和营养胁迫条件分别获得37个和16个MQTL。本研究中穗位高加性位点AX-116871591位于MQTL16区段内,并且与MQTLNP7位置相近,该区段内包含生长素/脱落酸转录因子IAA5。穗粒数加性位点AX-86281411,粒宽加性位点AX-86267702和株高显性位点AX-116875920均位于MQTLNP9区段内,该区段内包含NAC转录因子NACTF36。NAC转录因子、MYB转录因子和SOD基因均存在于两个环境条件MQTL区段内。
关键词
玉米
产量
56KSNP芯片
meta
-
qtl
分析
Keywords
maize
grain yield
56K SNP chip
meta
-
qtl
analysis
分类号
S513 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
被引量：
5
2
作者
周小静
董洋
张芳
任小平
陈玉宁
黄莉
陈伟刚
廖伯寿
雷永
晏立英
罗怀勇
姜慧芳
机构
中国农业科学院油料作物研究所
全国农业技术推广服务中心
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期750-756,共7页
基金
国家自然科学基金(31301362
31471534
+1 种基金
31271764)
农作物种质资源保护项目(NB2010-2130135-28B)
文摘
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%-13.77%,LOD值介于2.59-7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。
关键词
花生
出仁率
qtl
定位
SNP标记图谱
meta
-
qtl
分析
Keywords
Cultivated peanut
Shelling percentage
qtl
mapping
SNP- based map
meta
-
qtl
analysis
分类号
S565.203 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米产量相关性状定位和Meta-QTL整合
马娟
王浩
王利锋
曹言勇
李晶晶
Thomas Lubberstedt
王丽艳
李会勇
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
9
下载PDF
职称材料
2
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
周小静
董洋
张芳
任小平
陈玉宁
黄莉
陈伟刚
廖伯寿
雷永
晏立英
罗怀勇
姜慧芳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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