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瓜类果斑病菌致病基因及靶标基因的预测
被引量:
1
1
作者
严婉荣
王铁霖
+3 位作者
戴良英
杨玉文
王建玉
赵廷昌
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期100-104,共5页
哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌...
哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、劳尔氏菌属、土壤杆菌属、木质部小菌属中的致病基因和参考文献中已报道的致病基因,下载相关致病基因的氨基酸序列,与瓜类果斑病菌的全氨基酸序列进行localblast,取E<10-5的为候选基因,得到果斑病菌中与致病性相关的基因,并对未知蛋白进行产物预测。同时,根据已经公布的靶标基因,用同样的比对方法,得到果斑病菌中潜在的靶标基因。本研究通过保守估计,得到77个致病性相关蛋白,预测了其中7个未知蛋白的产物,得到46个靶标蛋白。致病基因和靶标基因的分析预测,对以后研究此类基因提供了指导作用,为更好地防治该病害提供了理论基础。
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关键词
瓜类果斑病菌
致病基因
靶标基因
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职称材料
哈密瓜细菌性果斑病病原菌鉴定
被引量:
81
2
作者
赵廷昌
孙福在
+1 位作者
王兵万
回文广
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第4期357-364,共8页
20 0 0年在内蒙古和新疆的哈密瓜上发现一种新细菌病害—哈密瓜细菌性果斑病 ,从病叶和病果上分离到 33个细菌菌株 ,接种哈密瓜、西瓜和甜瓜后 ,发病症状与自然发病症状完全一致 ,而且从接种病株上又重新分离到了此病原细菌 ,这 33个细...
20 0 0年在内蒙古和新疆的哈密瓜上发现一种新细菌病害—哈密瓜细菌性果斑病 ,从病叶和病果上分离到 33个细菌菌株 ,接种哈密瓜、西瓜和甜瓜后 ,发病症状与自然发病症状完全一致 ,而且从接种病株上又重新分离到了此病原细菌 ,这 33个细菌菌株经柯赫法则证明均为该病的致病菌。各菌株致病力无明显差异。经革兰氏染色反应、菌体形态、培养性状、生理生化反应、细胞化学成分分析(糖、蛋白质、氨基酸、脂肪酸、mol% G+ C)、DNA- DNA杂交 ,确认该病原菌为燕麦食酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp. citrulli Willems et al. 1992 ) =类产碱假单胞菌西瓜亚种 (Pseudomonaspseudoalcaligenes subsp.citrulli Schaad et al.1978)。该病菌除侵染哈密瓜外 ,人工接种尚能侵染多种葫芦科及番茄。
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关键词
燕麦食酸菌西瓜亚种
哈密瓜果斑病
致病性
鉴定
病原菌
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职称材料
哈密瓜细菌性果斑病菌快速检测方法的建立
被引量:
25
3
作者
回文广
赵廷昌
+2 位作者
Schaad N W
孙福在
王建荣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第11期2495-2501,共7页
【目的】哈密瓜细菌性果斑病在中国为新发生的病害,其病原菌为燕麦食酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.Citrulli),危害瓜果造成品质下降。该病为典型的种传细菌性病害,因此种子检疫成为防治此病害的重要手段。【方法】通过实验,将...
【目的】哈密瓜细菌性果斑病在中国为新发生的病害,其病原菌为燕麦食酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.Citrulli),危害瓜果造成品质下降。该病为典型的种传细菌性病害,因此种子检疫成为防治此病害的重要手段。【方法】通过实验,将生物学、免疫学和分子生物学检测技术有机结合,建立了一套针对哈密瓜果斑病的种子带菌检测方法Bio-IMS-Real-timePCR。【结果】经过人工模拟种子带菌检测实验,结果表明该方法可成功地检测出1000粒种子中的1粒带菌种子(带菌量约为1.04×105CFU/种子,经计算,可以检测的最初浓度为2CFU·ml-1ASCM培养液),且信号较强。【结论】该检测方法的建立,大大提高了对哈密瓜细菌性果斑病菌检测的精度,也为生产实践中哈密瓜果斑病的防治提供了重要的技术支持。
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关键词
哈密瓜细菌性果斑病
快速
检测
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职称材料
哈蜜瓜种子带细菌性果斑病菌检测技术的研究
被引量:
22
4
作者
任毓忠
李晖
+2 位作者
李国英
王晓东
万刚
《植物检疫》
北大核心
2004年第2期65-68,共4页
哈蜜瓜细菌性果斑病是世界性的检疫对象之一 ,主要以种子带菌进行远距离传播 ,本文通过温室育苗、室内分离和PCR(聚合酶链式反应 )技术对哈蜜瓜种子带菌情况和主要带菌部位进行了检验 ,结果表明 :3种方法都可以对种子带菌情况进行检测 ...
哈蜜瓜细菌性果斑病是世界性的检疫对象之一 ,主要以种子带菌进行远距离传播 ,本文通过温室育苗、室内分离和PCR(聚合酶链式反应 )技术对哈蜜瓜种子带菌情况和主要带菌部位进行了检验 ,结果表明 :3种方法都可以对种子带菌情况进行检测 ,分离检测和PCR检测还可以确定种子的带菌部位 ,PCR技术具有特异性强、灵敏度高、检测时间短等特点。另外检测结果也表明种子带菌以种皮为主 ,种仁的带菌量较少。
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关键词
哈蜜瓜
种子
细菌性果斑病
检测技术
PCR技术
检疫
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职称材料
题名
瓜类果斑病菌致病基因及靶标基因的预测
被引量:
1
1
作者
严婉荣
王铁霖
戴良英
杨玉文
王建玉
赵廷昌
机构
湖南农业大学生物安全科学技术学院
中国农业科学院植物保护研究所
新疆兵团农六师农科所
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期100-104,共5页
基金
公益性行业(农业)科研专项(201003066)
国家西甜瓜产业技术体系(CARS-26)
文摘
哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、劳尔氏菌属、土壤杆菌属、木质部小菌属中的致病基因和参考文献中已报道的致病基因,下载相关致病基因的氨基酸序列,与瓜类果斑病菌的全氨基酸序列进行localblast,取E<10-5的为候选基因,得到果斑病菌中与致病性相关的基因,并对未知蛋白进行产物预测。同时,根据已经公布的靶标基因,用同样的比对方法,得到果斑病菌中潜在的靶标基因。本研究通过保守估计,得到77个致病性相关蛋白,预测了其中7个未知蛋白的产物,得到46个靶标蛋白。致病基因和靶标基因的分析预测,对以后研究此类基因提供了指导作用,为更好地防治该病害提供了理论基础。
关键词
瓜类果斑病菌
致病基因
靶标基因
Keywords
melon
fruit
blotch
pathogenic
gene
target
gene
分类号
S432.42 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
哈密瓜细菌性果斑病病原菌鉴定
被引量:
81
2
作者
赵廷昌
孙福在
王兵万
回文广
机构
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第4期357-364,共8页
文摘
20 0 0年在内蒙古和新疆的哈密瓜上发现一种新细菌病害—哈密瓜细菌性果斑病 ,从病叶和病果上分离到 33个细菌菌株 ,接种哈密瓜、西瓜和甜瓜后 ,发病症状与自然发病症状完全一致 ,而且从接种病株上又重新分离到了此病原细菌 ,这 33个细菌菌株经柯赫法则证明均为该病的致病菌。各菌株致病力无明显差异。经革兰氏染色反应、菌体形态、培养性状、生理生化反应、细胞化学成分分析(糖、蛋白质、氨基酸、脂肪酸、mol% G+ C)、DNA- DNA杂交 ,确认该病原菌为燕麦食酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp. citrulli Willems et al. 1992 ) =类产碱假单胞菌西瓜亚种 (Pseudomonaspseudoalcaligenes subsp.citrulli Schaad et al.1978)。该病菌除侵染哈密瓜外 ,人工接种尚能侵染多种葫芦科及番茄。
关键词
燕麦食酸菌西瓜亚种
哈密瓜果斑病
致病性
鉴定
病原菌
Keywords
Acidovorax
avenae
subsp.
citrulli
Willems
et
al
.
1992
Hami
melon
bacterial
fruit
blotch
pathogenicity
identification
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
哈密瓜细菌性果斑病菌快速检测方法的建立
被引量:
25
3
作者
回文广
赵廷昌
Schaad N W
孙福在
王建荣
机构
中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室
United States Department of Agricultural Research Service Foreign Disease-Weed Science Research Unit MD
新疆生产建设兵团农六师科委
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第11期2495-2501,共7页
基金
国家自然基金项目(30370949)
农业部"948"项目(2003-Z51)
新疆生产建设兵团博士资金课题资助
文摘
【目的】哈密瓜细菌性果斑病在中国为新发生的病害,其病原菌为燕麦食酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.Citrulli),危害瓜果造成品质下降。该病为典型的种传细菌性病害,因此种子检疫成为防治此病害的重要手段。【方法】通过实验,将生物学、免疫学和分子生物学检测技术有机结合,建立了一套针对哈密瓜果斑病的种子带菌检测方法Bio-IMS-Real-timePCR。【结果】经过人工模拟种子带菌检测实验,结果表明该方法可成功地检测出1000粒种子中的1粒带菌种子(带菌量约为1.04×105CFU/种子,经计算,可以检测的最初浓度为2CFU·ml-1ASCM培养液),且信号较强。【结论】该检测方法的建立,大大提高了对哈密瓜细菌性果斑病菌检测的精度,也为生产实践中哈密瓜果斑病的防治提供了重要的技术支持。
关键词
哈密瓜细菌性果斑病
快速
检测
Keywords
Hami
melon
bacterial
fruit
blotch
Rapid
Detection
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
哈蜜瓜种子带细菌性果斑病菌检测技术的研究
被引量:
22
4
作者
任毓忠
李晖
李国英
王晓东
万刚
机构
石河子大学新疆兵团绿洲生态农业重点实验室
出处
《植物检疫》
北大核心
2004年第2期65-68,共4页
文摘
哈蜜瓜细菌性果斑病是世界性的检疫对象之一 ,主要以种子带菌进行远距离传播 ,本文通过温室育苗、室内分离和PCR(聚合酶链式反应 )技术对哈蜜瓜种子带菌情况和主要带菌部位进行了检验 ,结果表明 :3种方法都可以对种子带菌情况进行检测 ,分离检测和PCR检测还可以确定种子的带菌部位 ,PCR技术具有特异性强、灵敏度高、检测时间短等特点。另外检测结果也表明种子带菌以种皮为主 ,种仁的带菌量较少。
关键词
哈蜜瓜
种子
细菌性果斑病
检测技术
PCR技术
检疫
Keywords
PCR
reaction,Detection
of
seed,Aami
melon
bacterial
fruit
blotch
分类号
S41 [农业科学—植物保护]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
瓜类果斑病菌致病基因及靶标基因的预测
严婉荣
王铁霖
戴良英
杨玉文
王建玉
赵廷昌
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
下载PDF
职称材料
2
哈密瓜细菌性果斑病病原菌鉴定
赵廷昌
孙福在
王兵万
回文广
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001
81
下载PDF
职称材料
3
哈密瓜细菌性果斑病菌快速检测方法的建立
回文广
赵廷昌
Schaad N W
孙福在
王建荣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007
25
下载PDF
职称材料
4
哈蜜瓜种子带细菌性果斑病菌检测技术的研究
任毓忠
李晖
李国英
王晓东
万刚
《植物检疫》
北大核心
2004
22
下载PDF
职称材料
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