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基于COI和16S rRNA的库页岛马珂蛤遗传多样性和分子系统进化研究 被引量：7
1
作者 孙明媛 朱锐 +4 位作者 孙晓晴 张研 李尚琪 王红伟 李炯棠 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期891-901,共11页
本研究以库页岛马珂蛤(Pseudocardium sachalinense)为研究对象,讨论COI和16S rRNA两种DNA条形码在贝类的遗传多样性、分子进化和种类鉴定的适用性,并利用两种条形码评估库页岛马珂蛤的遗传多样性。本文在获得库页岛马珂蛤线粒体全基因... 本研究以库页岛马珂蛤(Pseudocardium sachalinense)为研究对象,讨论COI和16S rRNA两种DNA条形码在贝类的遗传多样性、分子进化和种类鉴定的适用性,并利用两种条形码评估库页岛马珂蛤的遗传多样性。本文在获得库页岛马珂蛤线粒体全基因组的基础上,测序获得库页岛马珂蛤群体的COI和16S rRNA序列,发现COI基因核苷酸多样性为0.00195,高于16S rRNA核苷酸多样性(0.00073)。基于COI基因的单倍型多样性为0.76,大于16S rRNA的单倍型多样性(0.318)。其次,用全线粒体基因组构建8种贝类的系统进化树为参考,发现基于COI和16S rRNA的系统进化树与参考一致,提示这两种条形码片段可用于推断贝类的分子进化关系。最后,分别对马珂蛤科和帘蛤科15属17种贝类的COI基因和16Sr DNA进行序列比较,发现COI基因和16S rRNA的种间遗传距离均是种内距离的62倍。以上结果说明,16S rRNA与COI基因一样,能有效地构建马珂蛤科和帘蛤科的系统发育关系和物种鉴定,但在分析库页岛马珂蛤的遗传多样性时利用COI基因比16S rRNA能发现更多的遗传变异。 展开更多
关键词 DNA条形码 COI 16S RRNA 马珂蛤科 帘蛤科 遗传多样性
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蛤蜊科贝类的研究进展 被引量：4
2
作者 郭春阳 徐善良 《生物学杂志》 CAS CSCD 2016年第1期86-91,103,共7页
蛤蜊科(Mactridae)属于双壳纲帘蛤目贝类,全世界已发现有35属199种。主要从蛤蜊科贝类的分类及地理分布、形态学特征、核型研究、生态习性、繁殖生物学、遗传多样性及系统发生研究、环境毒理学、养殖现状对蛤蜊科贝类的影响等,综述了蛤... 蛤蜊科(Mactridae)属于双壳纲帘蛤目贝类,全世界已发现有35属199种。主要从蛤蜊科贝类的分类及地理分布、形态学特征、核型研究、生态习性、繁殖生物学、遗传多样性及系统发生研究、环境毒理学、养殖现状对蛤蜊科贝类的影响等,综述了蛤蜊科贝类的研究进展,并总结了目前研究阶段中尚未解决的问题,以期为以后的蛤蜊科贝类养殖提供科学依据。 展开更多
关键词 蛤蜊科 贝类 研究进展
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