低氧对肥胖小鼠棕色脂肪组织相关基因表达的影响及其机制 被引量：6

1

作者 龚丽景 付鹏宇 +2 位作者 朱镕鑫 汪蕾 胡扬 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期88-92,I0004,共6页

目的:分析肥胖小鼠在低氧暴露后棕色脂肪组织的差异表达基因及通路,以探讨低氧影响棕色脂肪组织活化的机制。方法:30只雄性C57BL/6J小鼠,其中8只为普通对照组(N,n=8);其余饲喂高脂饲料8周后,肥胖建模成功小鼠随机分为两组:肥胖对照组(OB... 目的:分析肥胖小鼠在低氧暴露后棕色脂肪组织的差异表达基因及通路,以探讨低氧影响棕色脂肪组织活化的机制。方法:30只雄性C57BL/6J小鼠,其中8只为普通对照组(N,n=8);其余饲喂高脂饲料8周后,肥胖建模成功小鼠随机分为两组:肥胖对照组(OB,n=8)和肥胖低氧组(H,n=8)。H组进行11.2%氧浓度8 h/d,6天/周共4周的低氧暴露。4周后,测试血糖、血脂,取肩胛处棕色脂肪组织进行mRNA表达谱芯片扫描和生物信息学分析。利用KOBAS2.0软件对所筛选差异表达基因,并对参与关键生物过程和信号通路的差异基因进行实时荧光q PCR验证。结果:干预结束后,H组较OB组体重和血脂血糖水平显著降低;OB组较N组的上调差异基因802个,下调1 175个,差异基因的功能主要集中在糖脂合成代谢及免疫炎症反应过程;H组较OB组上调基因297个,下调228个,主要参与的生物过程有糖脂代谢、脂质转运过程、肌肉组织发育过程及脉管系统发育过程;低氧暴露调节肥胖机体棕色脂肪的通路主要集中在HIF-1、PI3K-Akt、F_(ox)O和Erb B信号通路等过程。结论:11.2%氧气暴露可通过调节一系列棕色脂肪相关基因表达而提高棕色脂肪活性,从而下调肥胖机体体重。 展开更多

关键词 mrna表达谱 棕色脂肪 低氧暴露 肥胖 小鼠

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有氧运动对肥胖小鼠棕色脂肪mRNA表达谱的影响 被引量：4

2

作者 付鹏宇 龚丽景 +4 位作者 朱镕鑫 段佳妍 邹世颖 汪蕾 胡扬 《北京体育大学学报》 CSSCI 北大核心 2016年第9期50-56,共7页

目的:通过mRNA表达谱芯片筛选有氧运动前后肥胖小鼠棕色脂肪差异表达基因及通路,探究运动活化棕色脂肪机制。方法:30只雄性C57BL/6J小鼠分为普通对照组(N,n=8)、肥胖对照组(OB,n≥6)和肥胖运动组(E,n≥6)。E组进行10 m/min,1 h/d,6 d/... 目的:通过mRNA表达谱芯片筛选有氧运动前后肥胖小鼠棕色脂肪差异表达基因及通路,探究运动活化棕色脂肪机制。方法:30只雄性C57BL/6J小鼠分为普通对照组(N,n=8)、肥胖对照组(OB,n≥6)和肥胖运动组(E,n≥6)。E组进行10 m/min,1 h/d,6 d/周的跑台训练。每周记录各组摄食量和体重。4周后,测试血糖血脂,取肩胛处棕色脂肪,提取的RNA逆转录合成c DNA后进行mRNA表达谱芯片杂交扫描和生物信息学分析。采用倍数法(≥2,P≤0.05)筛选上调、下调差异表达基因,用KOBAS2.0软件对差异基因进行基因功能注释和信号通路富集度统计分析。筛选参与关键生物过程和信号通路的重要差异基因进行RT-PCR验证。结果:与N组相比,OB组棕色脂肪组织上调的基因有445个,下调基因有796个,差异基因的生物功能主要集中在脂质、固醇、胆固醇和类固醇的合成代谢过程及白细胞和粒细胞趋药性过程;与OB组相比,E组的上调基因有486个,下调基因有286个,差异基因的生物过程主要集中在脂质、脂肪酸、固醇和胆固醇的合成代谢过程、羧酸和酮酸的代谢过程、辅酶的代谢过程和抗氧化过程;运动调节棕色脂肪功能的通路主要集中在PPAR,AMPK,Insulin和VEGF信号通路等过程。结论:有氧运动可能通过调节一系列基因和通路来提高棕色脂肪活性,促进肥胖机体减肥。 展开更多

关键词 mrna表达谱 棕色脂肪 有氧运动 肥胖

原文传递

黄芪多糖联合二甲双胍对衰老糖尿病小鼠肝脏mRNA表达谱的影响及功能分析 被引量：4

3

作者 刘佳佳 李丹丹 +2 位作者 赵翊 吴玉泓 王晶 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1043-1046,共4页

目的探讨黄芪多糖联合二甲双胍治疗衰老糖尿病的分子机制。方法高糖高脂饲料联合链脲佐菌素诱导自然衰老小鼠建立衰老糖尿病模型,将实验小鼠分为衰老对照组、衰老糖尿病模型组、二甲双胍治疗组、黄芪多糖联合二甲双胍治疗组。检测各组... 目的探讨黄芪多糖联合二甲双胍治疗衰老糖尿病的分子机制。方法高糖高脂饲料联合链脲佐菌素诱导自然衰老小鼠建立衰老糖尿病模型,将实验小鼠分为衰老对照组、衰老糖尿病模型组、二甲双胍治疗组、黄芪多糖联合二甲双胍治疗组。检测各组小鼠血清胰岛素变化,胰腺组织胰岛素分泌情况及胰腺组织的形态学变化;利用生物信息学工具分析衰老对照组、衰老糖尿病模型组、黄芪多糖联合二甲双胍治疗组小鼠的肝脏组织差异mRNA功能。结果黄芪多糖联合二甲双胍治疗相比二甲双胍单药组可显著升高衰老糖尿病小鼠的血清胰岛素含量(P<0.05),改善胰腺腺泡细胞水肿和促进胰岛形态的恢复。芯片结果显示,差异mRNA,Tob2、Tmem100及Usp15等显著差异表达且对它们的靶miRNA具有较强调控作用。经过功能注释,发现差异mRNA在BMP信号通路、cGMP-PKG信号通路及GnRH信号通路中显著富集。结论黄芪多糖联合二甲双胍可能通过调控BMP信号通路、cGMP-PKG信号通路,Tob2,Usp15及Tmem100基因改善肝脏组织损伤,对缓解衰老糖尿病所致损伤具有研究潜能。 展开更多

关键词 衰老糖尿病 二甲双胍 黄芪多糖 mrna表达谱

原文传递

香鱼LECT2基因的克隆及其组织表达差异 被引量：3

4

作者 杨红艳 陈炯 +1 位作者 史雨红 李明云 《细胞生物学杂志》 CAS CSCD 2009年第2期277-280,共4页

LECT2(leukocyte cell-derived chemotaxin 2)是一个多功能的蛋白质,其与细胞生长、分化、损伤修复及免疫等过程相关。本研究通过设计简并引物,从香鱼肝脏cDNA文库中筛选LECT2基因,该基因cDNA序列全长547个核苷酸,3'末端具有polyA尾... LECT2(leukocyte cell-derived chemotaxin 2)是一个多功能的蛋白质,其与细胞生长、分化、损伤修复及免疫等过程相关。本研究通过设计简并引物,从香鱼肝脏cDNA文库中筛选LECT2基因,该基因cDNA序列全长547个核苷酸,3'末端具有polyA尾,单一大开读框编码一个由156个氨基酸组成的分子量为17kDa的蛋白质。序列分析及系统进化树分析均表明,香鱼LECT2与虹鳟LECT2最相似,且各物种LECT2的进化关系与目前接受的物种分类关系基本一致。香鱼LECT2基因在香鱼许多组织中均有表达,而肝脏中的表达量最高,肾脏和脑中的表达量也较高。 展开更多

关键词 LECT2 克隆 序列分析 mrna表达谱

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正常生育男性成熟精子mRNA的种类和特征 被引量：1

5

作者 赵仰星 李巧丽 +3 位作者 王朝霞 王一飞 王莲芸 乔中东 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2006年第10期900-903,共4页

目的:剖析具有正常生育能力男性成熟精子mRNA的种类和丰度。方法:健康并育有后代的成年男性10例,禁欲1周后取精液,上游法优化精子,Trizol试剂提取精子总RNA。混合所有总RNA进行基因表达系列分析(SAGE)。结果:所建SAGE文库共获877个克隆... 目的:剖析具有正常生育能力男性成熟精子mRNA的种类和丰度。方法:健康并育有后代的成年男性10例,禁欲1周后取精液,上游法优化精子,Trizol试剂提取精子总RNA。混合所有总RNA进行基因表达系列分析(SAGE)。结果:所建SAGE文库共获877个克隆,测序得到21 052个标签,出现两次以上的独特性标签有2 712种。经与SAGEm ap数据库比对,19.7%的独特性标签没有基因匹配,代表新基因;其余能匹配的基因中,67%具有蛋白质结合或核酸结合能力,41%具有催化活性,13%与信号转导有关,与细胞运输、精子结构、转录调节相关者分别达到10%左右。结论:人成熟精子中存在数量庞大、种类繁多的mRNA。 展开更多

关键词 人成熟精子 mrna表达谱 基因表达系列分析 男性生殖

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全基因组DNA甲基化分析骨关节炎中特征性基因和功能信号通路

6

作者 胥伯勇 阿不都赛米·艾买提 +3 位作者 汪斐 张晓岗 李国庆 曹力 《新疆医科大学学报》 CAS 2022年第9期947-952,共6页

目的研究骨关节炎患者关节软骨中DNA甲基化的特征,分析甲基化基因的表达在骨关节炎发生发展中的作用。方法收集2018年3月—2019年1月在新疆医科大学附属第一医院关节中心3例接受全膝人工关节置换术的骨关节炎(Osteoarthritis,OA)患者(OA... 目的研究骨关节炎患者关节软骨中DNA甲基化的特征,分析甲基化基因的表达在骨关节炎发生发展中的作用。方法收集2018年3月—2019年1月在新疆医科大学附属第一医院关节中心3例接受全膝人工关节置换术的骨关节炎(Osteoarthritis,OA)患者(OA组),3例膝关节软骨正常截肢患者(对照组)软骨组织标本。采用Illumina Infinium Methylation EPIC Bead Chip(850K芯片)对软骨进行甲基化分析。应用InCroMAP软件进行关节软骨中全基因组DNA甲基化及mRNA表达扩增谱的整合途径富集分析。基于DAVID数据库进行基因本体论(Gene ontology,GO)分析和京都基因及基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析。结果单基因分析结果显示,本研究共获得1299个差异甲基化基因;整合DNA甲基化的mRNA表达谱发现,64个基因显著改变,包括远中缺失同源盒基因5(DLX5)、同源异型盒基因5(HOXA5)、软骨酸性蛋白1(CRTAC1)和可溶性富含半胱氨酸结构域的清道夫受体蛋白(SSC5D);GO分析发现,上述基因功能与免疫应答、炎症反应、细胞增殖等有关;KEGG分析发现,上述基因介导与OA发病密切相的丝裂原活化蛋白激酶(MAKP)信号通路和Hippo信号通路。结论OA生物信息学分析发现可能的异常甲基化差异表达基因和信号通路,这可能会对OA发生和发展过程中的表观遗传学机制的阐明提供新的思路。 展开更多

关键词 骨关节炎 DNA甲基化谱 mrna表达谱 整合分析

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基因表达系列分析及其在寄生虫学研究中的应用

7

作者 李巧丽 张志明 乔中东 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期504-509,共6页

基因表达系列分析(serialanalysisofgeneexpression,SAGE)是一种高通量、快速定量分析真核细胞基因表达信息的技术。它通过抽取距离每个mRNA中3′端polyA尾最近的一个锚定酶识别位点下游的10～14bp片段作为其代表性标签,连成长串,克隆... 基因表达系列分析(serialanalysisofgeneexpression,SAGE)是一种高通量、快速定量分析真核细胞基因表达信息的技术。它通过抽取距离每个mRNA中3′端polyA尾最近的一个锚定酶识别位点下游的10～14bp片段作为其代表性标签,连成长串,克隆到载体中,进行高效测序,统计出研究对象中的mRNA的种类和丰度。SAGE技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因并得到这些基因表达丰度的数量信息,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异。本文将综述基因表达系列分析技术的原理、特点、方法、进展及其在寄生虫学研究中的应用。 展开更多

关键词 基因表达系列分析 mrna表达谱 寄生虫学

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苯并(a)芘诱导恶性转化的BEAS-2B细胞中miRNA和mRNA表达谱的改变

8

作者 栗振凯 李中秋 +2 位作者 孟丽雅 张佳彤 张巧 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2021年第6期762-767,共6页

目的:探索与苯并(a)芘[B(a)P]诱导永生化人支气管上皮细胞(BEAS-2B细胞)恶性转化相关的miRNA和mRNA。方法:采用5 mg/L的B(a)P对BEAS-2B细胞进行染毒。取染毒和未染毒细胞,分别采用平板克隆形成实验、划痕实验、MTT法检测克隆形成能力、... 目的:探索与苯并(a)芘[B(a)P]诱导永生化人支气管上皮细胞(BEAS-2B细胞)恶性转化相关的miRNA和mRNA。方法:采用5 mg/L的B(a)P对BEAS-2B细胞进行染毒。取染毒和未染毒细胞,分别采用平板克隆形成实验、划痕实验、MTT法检测克隆形成能力、迁移能力和增殖活性;采用芯片技术检测miRNA和mRNA表达谱,以FC≥2.0且P<0.05为标准筛选出差异表达miRNA和mRNA,对其进行GO注释及KEGG通路分析。采用实时荧光定量PCR法检测两组细胞中hsa-miR-2115-3p和hsa-miR-4521的表达。结果:染毒组细胞克隆形成能力、迁移能力和增殖活性均明显增强(P<0.05)。芯片分析结果显示,染毒组和未染毒组细胞在不同的簇中;共筛选出127种差异表达miRNA(29种表达上调,98种表达下调)和159种差异表达mRNA(99种表达上调,60种表达下调)。GO注释及KEGG通路分析结果显示,差异表达mRNA可能参与了细胞活素-受体相互作用介导的信号通路、p53信号通路介导的细胞凋亡等。染毒组细胞中hsa-miR-2115-3p和hsa-miR-4521的表达低于未染毒组(P<0.05),与芯片结果一致。结论:筛选出B(a)P诱导BEAS-2B恶性转化相关的miRNA和mRNA。 展开更多

关键词 苯并(A)芘 BEAS-2B细胞 miRNA表达谱 mrna表达谱 肺癌

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健康人成熟精子中mRNA的种类特征

9

作者 药晨江 赵仰星 +5 位作者 李巧丽 徐汪节 王朝霞 周颖 乔中东 王一飞 《中国男科学杂志》 CAS CSCD 2007年第12期16-20,共5页

目的分析具有正常生育能力男性成熟精子mRNA的种类特征。方法健康并育有后代的成年男性11例,禁欲3～5d后取精液,上游法纯化精子,Trizol试剂提取精子总RNA。混合所有总RNA进行基因表达系列分析(SAGE),随后对所得SAGE文库进行功能聚类性... 目的分析具有正常生育能力男性成熟精子mRNA的种类特征。方法健康并育有后代的成年男性11例,禁欲3～5d后取精液,上游法纯化精子,Trizol试剂提取精子总RNA。混合所有总RNA进行基因表达系列分析(SAGE),随后对所得SAGE文库进行功能聚类性分析。结果所建SAGE文库共获877个克隆,测序得到21052个标签,出现两次以上的独特性标签有2712种。SAGE文库用DAVID软件进行功能性聚类分析,高丰度的389个基因能聚合成25组功能性的基因。最突出的是一组核蛋白基因、参与DNA依赖的基因转录和转录调节;其次是与胞质,核糖体蛋白以及蛋白质合成相关的基因;其他基因类别还包括蛋白多肽水解相关蛋白;具有蛋白激酶活性,蛋白氨基酸磷酸化、蛋白修饰相关蛋白;免疫相关蛋白等。结论人成熟精子中存在数量庞大、种类繁多的mRNA,这些mRNA可能并不仅仅是在精子形成过程中残留下来的,它的功能可能包括重新翻译以替代降解的蛋白、染色质的重组装,受精过程中传递一些父系必须的RNAs到卵子中以进行表观遗传。 展开更多

关键词 精子 mrna表达谱 基因表达系列分析 功能聚类性分析

原文传递

结肠腺癌及正常黏膜mRNA表达谱的构建

10

作者 张小龙 高枫 李卫 《结直肠肛门外科》 2010年第2期65-68,共4页

目的构建结肠腺癌和正常黏膜基因的mRNA表达谱,探讨其表达差异,为进一步研究提供线索。方法用SAGE(Serial analysis of geneexpression)方法构建两者的mRNA表达文库,挑选一定数量克隆进行测序,结果用SAGE2000软件分析并进行比较。结果... 目的构建结肠腺癌和正常黏膜基因的mRNA表达谱,探讨其表达差异,为进一步研究提供线索。方法用SAGE(Serial analysis of geneexpression)方法构建两者的mRNA表达文库,挑选一定数量克隆进行测序,结果用SAGE2000软件分析并进行比较。结果构建了同一患者结肠正常黏膜和腺癌的SAGE表达文库,软件分析分别获得标签7926和7672个。癌组织与正常黏膜组织及与国外先期构建的结肠腺癌SAGE文库相比较其高表达基因之间均存在明显的表达差异。结论 SAGE技术是构建mRNA表达谱的有效方法 ;结肠腺癌与正常黏膜高表达基因之间存在明显差别;中国人结肠腺癌的基因表达可能具有自身的特点。 展开更多

关键词 基因表达系列分析 结肠腺癌 结肠正常黏膜 mrna表达谱

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基于mRNA表达谱比较胃癌和房颤的分子生物特征

11

作者 曾伟 董昌龙 +3 位作者 高枫林 王光斌 曾红娟 饶妮妮 《计算生物学》 2020年第1期1-14,共14页

有研究显示,新发房颤患者的癌症风险显著增加,新发癌症患者的房颤风险也有所增加,说明两种疾病之间可能存在一定的联系。传统上,有关癌症和房颤的机制研究大多是独立开展的。本研究以胃癌为例,基于mRNA表达谱,采用生物信息学工具比较分... 有研究显示,新发房颤患者的癌症风险显著增加,新发癌症患者的房颤风险也有所增加,说明两种疾病之间可能存在一定的联系。传统上,有关癌症和房颤的机制研究大多是独立开展的。本研究以胃癌为例,基于mRNA表达谱,采用生物信息学工具比较分析胃癌与房颤在分子水平上的生物特征,为癌症与房颤共病的机制研究提供一定的理论基础。首先从mRNA表达谱中分别筛选胃癌与房颤相关的差异表达mRNAs,再采用差异表达mRNAs分别富集胃癌与房颤的生物特征;然后通过分别构建胃癌与房颤的蛋白质–蛋白质相互作用网络,识别胃癌与房颤相关的重要靶向分子;最后,比较与分析胃癌与房颤在分子水平上的联系。研究结果表明,胃癌与房颤有一些相同的分子生物特征,二者相关的重要靶向分子也存在一定联系。 展开更多

关键词 mrna表达谱 胃癌 房颤 分子生物特征 靶向分子

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金华猪肌肉组织发育的基因表达模式

12

作者 胡斌 蔡淑芳 +7 位作者 楼芳芳 章啸君 屠平光 杜喜忠 项云 李秀金 李剑豪 胡旭进 《广东畜牧兽医科技》 2021年第5期41-49,共9页

肌肉和肌内脂肪是影响猪肉味觉品质的关键因素。本研究旨在探究金华猪不同发育阶段腿部肌肉组织发育的分子机制。采用RNA测序技术,对30日龄、90日龄、150日龄和240日龄金华猪腿部肌肉组织进行转录组分析。通过基因表达模式分析,揭示了... 肌肉和肌内脂肪是影响猪肉味觉品质的关键因素。本研究旨在探究金华猪不同发育阶段腿部肌肉组织发育的分子机制。采用RNA测序技术,对30日龄、90日龄、150日龄和240日龄金华猪腿部肌肉组织进行转录组分析。通过基因表达模式分析,揭示了肌肉发育的两个阶段:早期发育阶段(0~90天)和后期稳定阶段(90~240天)。早期,肌肉发育相关基因较为活跃。后期脂肪代谢和沉积相关基因表达上调,240天时衰老相关基因激活。油红染色结果观察发现,30日龄猪肌肉组织中的散在脂滴随着饲养时间的延长合并成大脂滴。本研究提供了金华猪不同发育阶段基因表达谱的全基因组图谱,有助于更好地理解金华猪的肌肉发育机制和改进育种策略。 展开更多

关键词 金华猪 mrna表达谱 肌肉发育 肉质

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精子发生中Alu序列的返座作用

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作者 王黎熔 李建民 单玉喜 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2001年第5期292-295,共4页

目的 :克隆人类精原细胞和初级精母细胞特异表达的基因。　方法 :应用改良的mRNA表达图谱分析技术 ,对正常男性、唯支持细胞综合征和生精阻滞在初级精母细胞病人的睾丸进行mRNA表达图谱分析的差异显示 ,选择唯支持细胞综合征缺失的表达... 目的 :克隆人类精原细胞和初级精母细胞特异表达的基因。　方法 :应用改良的mRNA表达图谱分析技术 ,对正常男性、唯支持细胞综合征和生精阻滞在初级精母细胞病人的睾丸进行mRNA表达图谱分析的差异显示 ,选择唯支持细胞综合征缺失的表达基因并克隆测序。　结果 :正常男性、唯支持细胞综合征和生精阻滞在初级精母细胞症病人的睾丸组织表达图谱存在显著的表达差异 ,目前已获得唯支持细胞综合征缺失的片段 88个。在已分析的 6个片段中 ,1个与人类的Alu序列家族 (Alufamily) 98%同源。　 结论 :Alu序列在生精细胞中通过返座作用形成新Alu序列 。 展开更多

关键词 精子发生 mrna表达图谱 Alu序列家族

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应用solexa技术研究脐血干细胞体外诱导的巨核细胞mRNA表达谱

14

作者 何吉 王芳 +5 位作者 朱发明 刘晋辉 秦斐 陈舒 徐罡 严力行 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期87-87,共1页

关键词 体外诱导 脐血干细胞 mrna表达谱 solexa 巨核细胞 人脐带血 细胞分化 密度梯度离心 免疫磁珠 细胞特异性

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大白猪和二花脸猪肝脏miRNA和mRNA表达谱的共分析及其与品种间性状的关系

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作者 李润生 孙钦伟 +5 位作者 贾逸敏 丛日华 倪迎冬 杨晓静 姜志华 赵茹茜 《畜牧与兽医》 北大核心 2012年第S1期174-174,共1页

MicroRNA(miRNA)对肝脏的代谢过程有着重要的调控作用,但是对于猪的品种间肝脏miRNA表达谱,及其对mRNA表达产生了什么样的影响仍属未知。本实验选用了新生的雄性大白猪和二花脸猪,使用芯片和测序的方法检测了其肝脏中差异表达的miRNA,... MicroRNA(miRNA)对肝脏的代谢过程有着重要的调控作用,但是对于猪的品种间肝脏miRNA表达谱,及其对mRNA表达产生了什么样的影响仍属未知。本实验选用了新生的雄性大白猪和二花脸猪,使用芯片和测序的方法检测了其肝脏中差异表达的miRNA,同时使用芯片检测了mRNA表达的差异,并通过miRNA和mRNA的靶向关系。 展开更多

关键词 大白猪 mrna表达谱 二花脸猪 差异表达 芯片检测 靶向 蛋白水解 背景值 上调和 皮质醇水平

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