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环介导等温扩增技术的常见问题分析与研究进展 被引量:29
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作者 胡宗悦 须周恒 卢亦愚 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期659-665,共7页
环介导等温扩增(LAMP)技术是近年发展起来的新型核酸体外等温扩增技术,具有快速、特异、敏感、简便等特点,使该技术在核酸快速检测领域得到了广泛的应用,但LAMP技术也在不断完善与发展中。本文就LAMP扩增产物的污染,引物间非连续配对的... 环介导等温扩增(LAMP)技术是近年发展起来的新型核酸体外等温扩增技术,具有快速、特异、敏感、简便等特点,使该技术在核酸快速检测领域得到了广泛的应用,但LAMP技术也在不断完善与发展中。本文就LAMP扩增产物的污染,引物间非连续配对的假阳性问题的对策,以及在LAMP技术基础上发展起来的其他相关技术进行综述,为该技术在基层的推广应用提供参考。 展开更多
关键词 环介导等温扩增(LAMP) 非特异性 敏感性
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环介导等温扩增技术在下呼吸道感染常见病原体检测中的应用 被引量:25
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作者 陈愉生 王大璇 +9 位作者 李鸿茹 陈炆颖 张祥娥 邵慧 许能銮 林明 王璨 闫胜龙 胡辛兰 高占成 《中华结核和呼吸杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期270-273,共4页
目的 应用环介导等温扩增(LAMP)技术对下呼吸道感染患者痰标本中常见致病菌进行核酸检测,调查病原菌的分布,研究LAMP技术对下呼吸道感染病原体检测的临床意义.方法 收集福建省立医院呼吸科下呼吸道感染患者289例的合格痰标本289份,LAM... 目的 应用环介导等温扩增(LAMP)技术对下呼吸道感染患者痰标本中常见致病菌进行核酸检测,调查病原菌的分布,研究LAMP技术对下呼吸道感染病原体检测的临床意义.方法 收集福建省立医院呼吸科下呼吸道感染患者289例的合格痰标本289份,LAMP技术检测病原体,分析下呼吸道感染病原菌的分布,并与传统的培养法进行比较.将细菌浓度>1×103拷贝/ml的病例分为初治已覆盖病原体组和初治未覆盖病原体组,比较两组患者年龄、有无基础疾病、抗感染治疗时间、总住院时间、初治有效率及治愈率.结果 289例患者中培养法阳性44例(15.2%).LAMP技术检测以细菌浓度>1 ×103拷贝/ml为界值,判定为阳性结果的有124例(43.0%).下呼吸道分离的病原菌中细菌144株(77.8%),非典型病原菌41株(22.2%);革兰阴性杆菌为主要致病菌,依次为铜绿假单胞菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌及肺炎链球菌.初治已覆盖病原体组(95例)和初治未覆盖病原体组(29例)的总住院时间分别为(13.9±9.1)和(16.3±11.2)d,差异有统计学意义(t=-2.083,P=0.039);初治有效率两组分别为31.0%(29/95)和93.1%(27/29),差异有统计学意义(x2 =31.0,P<0.01);两组的抗感染治疗时间[(13.9±9.1)和(16.3±11.2)d]比较,差异无统计学意义(t=-1.073,P=0.285);两组的治愈率分别为84.2%(80/95)和95.7%(28/29),差异无统计学意义(x2 =0.6,P=0.4).结论 LAMP技术简便,可快速扩增肺部感染患者痰液中常见致病菌核酸,检出率明显高于传统的痰培养法.LAMP技术有利于治疗前明确致病菌并进行针对性治疗,缩短患者的住院时间,提高初始治疗的有效率. 展开更多
关键词 呼吸道感染 细菌 环介导等温扩增技术
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诺如病毒检测方法研究进展 被引量:23
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作者 李志凯 苏国成 +1 位作者 苏文金 周常义 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1417-1424,共8页
诺如病毒是引起人类非细菌性胃肠炎的主要病原之一,具有很高的传染性和变异性,可导致严重的公共卫生问题,尤其在抵抗力弱的人群中有很高的发病率,因此开发快速、准确的检测技术对预防和控制诺如病毒的传播是非常重要的。本文综述了近年... 诺如病毒是引起人类非细菌性胃肠炎的主要病原之一,具有很高的传染性和变异性,可导致严重的公共卫生问题,尤其在抵抗力弱的人群中有很高的发病率,因此开发快速、准确的检测技术对预防和控制诺如病毒的传播是非常重要的。本文综述了近年来RT-PCR、环介导等温扩增、实时荧光定量PCR、巢式PCR、ELISA、免疫层析、基因芯片等技术在诺如病毒检测中的应用及发展趋势。 展开更多
关键词 诺如病毒 检测方法 RT-PCR 环介导等温扩增 实时荧光定量PCR 巢式PCR ELISA 免疫层析 基因芯片
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LAMP法在阪崎肠杆菌快速检测中的应用 被引量:14
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作者 张淑红 吴清平 +2 位作者 徐晓可 张菊梅 郭伟鹏 《食品与机械》 CSCD 北大核心 2011年第5期111-114,共4页
针对阪崎肠杆菌的ompA基因设计4条特异性引物(2条内引物、2条外引物),建立一种快速检测阪崎肠杆菌的DNA环介导恒温扩增法(LAMP)。通过对2株阪崎肠杆菌标准菌株、24株阪崎肠杆菌分离株和18株非阪崎肠杆菌测试,结果表明此方法具有很高的... 针对阪崎肠杆菌的ompA基因设计4条特异性引物(2条内引物、2条外引物),建立一种快速检测阪崎肠杆菌的DNA环介导恒温扩增法(LAMP)。通过对2株阪崎肠杆菌标准菌株、24株阪崎肠杆菌分离株和18株非阪崎肠杆菌测试,结果表明此方法具有很高的特异性;对其灵敏度进行检验,发现该方法的最低检测限可以达到8CFU/mL,具有较好的敏感性。在1份实验室能力验证盲样和26份实际奶粉样品中应用发现,该方法与传统生化方法结果吻合,具有较好的可靠性。 展开更多
关键词 阪崎肠杆菌 ompA基因 环介导恒温扩增方法
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沙门氏菌LAMP检测方法的建立 被引量:12
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作者 李佳桐 王楠 +3 位作者 金贞爱 许尧 邵洪泽 金鑫 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第3期91-94,共4页
本试验旨在建立一种能快速、灵敏、特异的检测沙门氏菌的LAMP方法。据GenBank公布的沙门氏菌高度保守的STN基因序列设计引物,继而进行一系列的LAMP反应条件的优化、特异性、敏感性、稳定性、酶切试验,并将LAMP与常规PCR进行比较。结果显... 本试验旨在建立一种能快速、灵敏、特异的检测沙门氏菌的LAMP方法。据GenBank公布的沙门氏菌高度保守的STN基因序列设计引物,继而进行一系列的LAMP反应条件的优化、特异性、敏感性、稳定性、酶切试验,并将LAMP与常规PCR进行比较。结果显示,LAMP方法最佳反应温度为65℃,只扩增沙门氏菌,最低可检出浓度为101 CFU/mL,比常规PCR的最低检出浓度高1个数量级。本试验结果表明LAMP方法对沙门氏菌的检测特异性强、敏感性高、耗时短、方法简便,有望发展成为快速检测沙门氏菌的有效手段。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 沙门氏菌 检测 STN
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环介导等温扩增检测技术的应用与方法改进 被引量:11
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作者 杨粤 付博宇 +2 位作者 张蕴哲 马晓燕 张伟 《食品安全质量检测学报》 CAS 2016年第4期1526-1530,共5页
环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是近些年发展起来的一种新型核酸扩增技术,其原理是利用在线软件设计4条特异性引物,在具有强链置换活性的DNA聚合酶作用下,使模板两端引物的结合处循环出现环状单链结构,... 环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是近些年发展起来的一种新型核酸扩增技术,其原理是利用在线软件设计4条特异性引物,在具有强链置换活性的DNA聚合酶作用下,使模板两端引物的结合处循环出现环状单链结构,以实现恒温条件下的连续快速扩增,该方法具有特异性强、灵敏度高、耗时短且无需昂贵的热循环设备等优点。目前该技术在国内外已经广泛应用于细菌、病毒及寄生虫等病原体的检测以及鉴定胚胎性别。本文从LAMP技术的原理、方法改造、检测应用以及与其他检测方法的比较这4方面进行综述,为今后LAMP技术的应用提供理论依据并对未来的发展进行了展望。 展开更多
关键词 环介导等温扩增技术 核酸扩增 检测方法 应用
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荧光环介导恒温扩增技术检测嗜肺军团菌方法的建立 被引量:11
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作者 李辉腾 郭旭光 +1 位作者 陈瑞娟 柯茂彬 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第22期3136-3138,共3页
目的探讨利用环介导恒温扩增技术(LAMP)建立可以准确快速检测嗜肺军团菌的方法。方法选取嗜肺军团菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞杆菌、大肠埃希氏菌、阪崎肠杆菌、单核细胞增生李斯特氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、福氏志贺氏菌、副溶血性弧... 目的探讨利用环介导恒温扩增技术(LAMP)建立可以准确快速检测嗜肺军团菌的方法。方法选取嗜肺军团菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞杆菌、大肠埃希氏菌、阪崎肠杆菌、单核细胞增生李斯特氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、福氏志贺氏菌、副溶血性弧菌菌株,根据嗜肺军团菌毒力mip基因的6个特殊区域,使用Primer Explorer Version 4软件设计LAMP引物(mip-1、mip-2、mip-3),提取病原菌基因组DNA进行LAMP,评价其特异性、最低检测限和稳定性。结果筛选出mip-3引物在测定嗜肺军团菌的LAMP反应体系中扩增约10min出峰且峰值较高;非嗜肺军团菌菌株没有扩增反应;LAMP检测限可达100fg/μL;mip-3引物在10次重复检测中几乎同时出峰,稳定性良好。结论建立的LAMP检测方法具有特异性强、稳定性高特点,能快速、准确检测出嗜肺军团菌,具有较大的推广及应用前景。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 荧光环介导恒温扩增 快速检测方法
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基于颜色判定的环介导等温扩增技术检测HPV6和HPV16 被引量:9
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作者 芦春斌 罗乐 +3 位作者 杨梦婕 聂凯 王淼 马学军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期64-70,共7页
建立了一种基于颜色判定的简单、快速和灵敏的检测方法,即环介导等温核酸扩增技术(LAMP)应用于HPV6和HPV16亚型的检测。该技术设计分别对应于HPV6和16的E6和E7基因序列中6个区段的4条特异引物,在等温条件下(63℃)进行核酸扩增反应1h,在... 建立了一种基于颜色判定的简单、快速和灵敏的检测方法,即环介导等温核酸扩增技术(LAMP)应用于HPV6和HPV16亚型的检测。该技术设计分别对应于HPV6和16的E6和E7基因序列中6个区段的4条特异引物,在等温条件下(63℃)进行核酸扩增反应1h,在扩增前加入HNB染料(羟基萘酚蓝)作为反应指示剂,以HNB染料颜色的变化做为结果判定的标准,并经LA-320实时浊度仪和琼脂糖电泳证实。文中利用这种技术对13份已知的单重感染13种HPV不同亚型的临床样本进行了特异性分析,同时对2个含目的片段的克隆质粒的系列稀释物进行了灵敏度分析。结果显示LAMP方法特异性高,颜色法判断的灵敏度均为1000个拷贝DNA分子水平,比Real-time PCR低10~20倍,对62份宫颈刮片临床标本的HPV6和HPV16检出率和HPV分型试剂盒一致。因此,基于颜色判定的环介导等温扩增方法有望应用于人乳头瘤病毒HPV6和HPV16感染的快速筛选,具有在基层疾病预防控制中心和医院推广和应用的潜力。 展开更多
关键词 等温扩增 人乳头瘤病毒(HPV)
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环介导等温扩增技术及其在病原生物检测中的应用 被引量:8
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作者 黄枝妙 翁育伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1075-1080,共6页
环介导等温扩增(LAMP)技术是近年来发展起来的一种新型核酸扩增技术,具有操作简便、快速、特异性高、灵敏性高等特点,自2000年开发以来,在短短的十几年内被广泛应用于细菌、病毒和寄生虫等病原生物的检测,在即时检验和基层实验室推广中... 环介导等温扩增(LAMP)技术是近年来发展起来的一种新型核酸扩增技术,具有操作简便、快速、特异性高、灵敏性高等特点,自2000年开发以来,在短短的十几年内被广泛应用于细菌、病毒和寄生虫等病原生物的检测,在即时检验和基层实验室推广中有重要意义。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 病原生物 检测
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可视化-环介导等温扩增技术检测肠出血性大肠杆菌O157:H 被引量:7
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作者 夏学峰 张碧成 +2 位作者 王警 张红印 张雪寒 《食品安全质量检测学报》 CAS 2020年第5期1561-1565,共5页
目的建立可视化的环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)联合横向流动试纸条(lateral flow dipstick,LFD)方法检测肠出血性大肠杆菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)0157:H7的分析方法。方法以EHE... 目的建立可视化的环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)联合横向流动试纸条(lateral flow dipstick,LFD)方法检测肠出血性大肠杆菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)0157:H7的分析方法。方法以EHEC 0157:H7的遗传标志性基因z3276基因序列为检测靶标设计6条LAMP特异性引物,其中2条环引物分别标记异硫氰酸荧光素和地高辛,用LFD检测扩增产物,建立EHEC0157:H7 LAMP-LFD检测方法。结果所建立的检测方法能够特异性的检测EHEC 0157:H7,与试验对照菌株EHEC 026、0145、045、0121,及其他主要大肠杆菌血清型025、078、0103、O111、0127、0138、0139、0141,及禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli,APEC)E058、肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)SEC627、EPEC SEC689、K12-MG1655、BL21,和其他种属的受试菌,不存在交叉反应;对EHEC 0157:H7纯培养物的最低检测限为1.3 CFU/mL。结论本研究所建立的LAMP-LFD检测方法特异性和敏感性良好,操作简单,结果可视。 展开更多
关键词 肠出血性大肠杆菌 z3276基因序列 环介导等温扩增技术 横向流动试纸条
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抗草甘膦转基因大豆及其加工产品的环介导等温扩增检测技术 被引量:6
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作者 田芳 王秀敏 +4 位作者 滕达 杨雅麟 管庆丰 敖长金 王建华 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期480-485,共6页
本研究旨在建立抗草甘膦转基因大豆及其加工产品中外源基因的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测技术。根据转基因大豆外源CP4-EPSPS基因的6个区域设计4条特异性引物,利用LAMP法对选取的大豆、豆粕及... 本研究旨在建立抗草甘膦转基因大豆及其加工产品中外源基因的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测技术。根据转基因大豆外源CP4-EPSPS基因的6个区域设计4条特异性引物,利用LAMP法对选取的大豆、豆粕及含有大豆成分的饲料样品进行检测。结果提示,LAMP法能够成功检测CP4-EPSPS基因,灵敏度为PCR方法的100~1 000倍,且该法操作简单,适用于转基因大豆及其加工产品的快速检测。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 转基因大豆 加工产品
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免疫磁珠-环介导等温扩增联用技术快速检测副溶血性弧菌方法的建立 被引量:7
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作者 刘涛 俞骅 +2 位作者 张蔚 楼秀芹 斯国静 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 2017年第4期266-271,共6页
目的建立一种快速且质优价廉的检测副溶血性弧菌的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。方法制备副溶血性弧菌跨膜转录调控蛋白toxR多克隆抗体,鉴定纯化后,进行磁珠包被制成免疫磁珠。利用免疫磁珠... 目的建立一种快速且质优价廉的检测副溶血性弧菌的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。方法制备副溶血性弧菌跨膜转录调控蛋白toxR多克隆抗体,鉴定纯化后,进行磁珠包被制成免疫磁珠。利用免疫磁珠分离法和环介导等温扩增联用完成对副溶血性弧菌的检测,扩增产物经SYBR Green I染色肉眼观察和电泳鉴定。将副溶血性弧菌菌液作一系列稀释后,运用LAMP法进行敏感性检测,利用副溶血性弧菌和非副溶血性弧菌来验证LAMP方法的特异性。结果LAMP检测副溶血性弧菌的检测下限为10~5 CFU/ml。副溶血性弧菌出现LAMP特征性扩增反应,非副溶血性弧菌未出现LAMP扩增。结论 LAMP检测方法为快速诊断试剂盒打下实验基础,适合日常监测,可满足快速检测的需要。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 ToxR基因 环介导等温扩增 免疫磁珠
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牛乳中蜡样芽孢杆菌高效环介导扩增检测方法建立 被引量:6
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作者 张童 徐之雯 +2 位作者 时逸莹 杨捷琳 蒋原 《食品安全质量检测学报》 CAS 2020年第11期3454-3459,共6页
目的建立稳定的环介导恒温扩增体系(loop mediated isothermal amplification,LAMP)检测乳制品中蜡样芽孢杆菌的分析方法。方法设计5组引物,通过特异性、灵敏度等指标测试筛选出较好的引物对。后通过优化反应中关键试剂及浓度,检出蜡样... 目的建立稳定的环介导恒温扩增体系(loop mediated isothermal amplification,LAMP)检测乳制品中蜡样芽孢杆菌的分析方法。方法设计5组引物,通过特异性、灵敏度等指标测试筛选出较好的引物对。后通过优化反应中关键试剂及浓度,检出蜡样芽孢杆菌。通过基因组干扰实验排除引物的假阳性干扰。并在牛奶中验证该方法的检测效率。结果最终筛选出一组特异性好的引物,该扩增方法经过优化后,在最适扩增体系可以检出10 fg/μL纯基因组DNA,用实时荧光定量实验进行对比验证可以检测出100 ag/μL的基因组DNA。抗干扰实验结果显示干扰组基因组核酸和培养菌液均对标准组无影响。该方法在检测牛乳中混合的菌落时呈现出良好的检测效果,可以检测出2.1×10^2 CFU/mL。结论本研究建立了高效、稳定、灵敏的恒温扩增体系,可以应用与牛奶中中蜡样芽孢杆菌的快速检测。 展开更多
关键词 环介导恒温扩增 蜡样芽孢杆菌 牛乳 灵敏度
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环介导等温扩增法检测粪样中日本血吸虫虫卵DNA的效果评估 被引量:6
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作者 冯婷 秦志强 +6 位作者 许静 周杰 钱颖骏 祝红庆 吕山 曹淳力 李石柱 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期230-234,共5页
目的评估环介导等温扩增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)法检测粪样中日本血吸虫(Schistosoma japonicum)虫卵DNA的效果,并评价其检测流行区现场牛野外粪样的效果。方法取1 g新鲜的日本血吸虫虫卵阴性牛粪,分别加入5个... 目的评估环介导等温扩增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)法检测粪样中日本血吸虫(Schistosoma japonicum)虫卵DNA的效果,并评价其检测流行区现场牛野外粪样的效果。方法取1 g新鲜的日本血吸虫虫卵阴性牛粪,分别加入5个新鲜日本血吸虫虫卵、50μl日本血吸虫虫卵排泄分泌产物(egg secretion product,ESP)制备人工模拟阳性粪样。用粪DNA提取试剂盒分别提取加入虫卵的未经研磨或研磨2 min后的人工模拟阳性粪样、加入虫卵ESP的粪样和阴性粪样的DNA,以日本血吸虫28S核糖体DNA(r DNA)为检测靶基因,用LAMP法、PCR法检测,评估LAMP法检测粪样中日本血吸虫虫卵DNA的效果。收集2012-2014年湖南、湖北、江西、安徽等4省日本血吸虫病流行区的牛野外粪样221份,研磨后同法提取DNA,用LAMP法检测,并与PCR法、孵化法的检测结果进行比较,评价其检测流行区现场野外粪样的效果。结果LAMP法检测加入虫卵粪样并经研磨后提取的DNA、加入虫卵ESP粪样提取的DNA均为阳性反应,呈绿色;而加入虫卵粪样未经研磨提取的DNA、阴性粪样DNA则为阴性反应,呈棕色;PCR检测的结果与LAMP法检测结果相近。LAMP法、PCR法和孵化法检测血吸虫病流行区牛野外粪样的阳性率分别为5.43%(12/221)、4.52%(10/221)、0.90%(2/221)。LAMP法的阳性率明显高于孵化法(P<0.05),LAMP法与PCR法阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。结论 LAMP法可用于检测流行区现场野外粪样的日本血吸虫虫卵DNA,其现场应用价值有待进一步验证。 展开更多
关键词 日本血吸虫 虫卵 核酸 环介导等温扩增 效果评估
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副溶血弧菌现场检测系统的研发及应用
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作者 李琪 高倩 +1 位作者 田浩 石超 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期55-62,共8页
为满足现场检测海产品中的副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的需求,本文建立了一种基于电化学检测和环介导等温扩增方法的副溶血弧菌现场检测系统,设备核心电路的尺寸仅为7 cm×4 cm,质量为30 g,易于携带,可以在30 min内出检测... 为满足现场检测海产品中的副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的需求,本文建立了一种基于电化学检测和环介导等温扩增方法的副溶血弧菌现场检测系统,设备核心电路的尺寸仅为7 cm×4 cm,质量为30 g,易于携带,可以在30 min内出检测结果,且可以对样本中的副溶血弧菌进行定量分析,检测限可达103 CFU/mL。同时,利用该系统对加标虾样品中副溶血弧菌进行检测,检测限低至3.6×103 CFU/g。随着核酸扩增反应的进行,核酸扩增体系的pH降低,本文制备的pH敏感电极可以实时监测核酸扩增体系的pH微量变化,精度为0.016个pH单位,本系统的检测限与荧光检测的检测限一致。本系统具有便携、快速、特异性好、灵敏度高、成本低、可现场检测等优点,本研究有利于食品安全中分子诊断技术的基层下沉,满足公共卫生安全的战略需求。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 即时检测 环介导等温扩增 电化学检测 便携设备
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LAMP在下呼吸道感染病原菌快速检测中的临床应用
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作者 雷星 龙丽 《中国现代医生》 2024年第12期60-63,共4页
目的利用环介导等温扩增检测(loop mediated isothermal amplification,LAMP)即呼吸道病原菌核酸联合检测法(13联)分析痰标本病原菌的检出情况,为临床诊疗提供病原学循证依据。方法选取2022年1月至12月铜仁市人民医院收治的1642例下呼... 目的利用环介导等温扩增检测(loop mediated isothermal amplification,LAMP)即呼吸道病原菌核酸联合检测法(13联)分析痰标本病原菌的检出情况,为临床诊疗提供病原学循证依据。方法选取2022年1月至12月铜仁市人民医院收治的1642例下呼吸道感染患者作为研究对象,采集痰标本/肺泡灌洗液进行LAMP(13联)检测,分析呼吸道病原菌检出情况及其与性别、年龄、季节的关系。结果13种呼吸道病原菌的总体检出率男性明显高于女性(P<0.01)。在不同年龄组中,3~6岁患者流感嗜血杆菌和肺炎链球菌的检出率、6~18岁患者肺炎支原体的检出率、>60岁患者耐甲氧西林葡萄球菌、嗜麦芽窄食单胞菌和肺炎克雷伯菌的检出率均明显高于其他组(P<0.05)。在不同季节组中,肺炎链球菌和肺炎衣原体好发于春季,肺炎支原体在秋节感染率最高,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论LAMP可快速检测出病原菌,为下呼吸道感染的预防及临床诊疗提供病原学依据。 展开更多
关键词 下呼吸道感染 常见病原菌 环介导等温扩增检测
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猪圆环病毒2型LAMP检测方法的建立与评价 被引量:5
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作者 史利军 张锦秀 +3 位作者 章金刚 李伟 范晓娟 李刚 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期174-176,共3页
根据猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)Rep和Cap基因保守区设计2对引物,1对外引物和1对内引物;利用设计的4条引物,在Bst大片段聚合酶的作用下,对PCV2 DNA进行恒温扩增;扩增条件为63℃恒温反应1h;建立了PCV2环媒恒温扩增技... 根据猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)Rep和Cap基因保守区设计2对引物,1对外引物和1对内引物;利用设计的4条引物,在Bst大片段聚合酶的作用下,对PCV2 DNA进行恒温扩增;扩增条件为63℃恒温反应1h;建立了PCV2环媒恒温扩增技术(LAMP)检测方法。对检测方法特异性评价表明,检测方法只能检测PCV2 DNA,对猪圆环病毒1型(Porcine circovirus type 1,PCV1)、猪细小病毒(Porcine parvovirus,PPV)及猪伪狂犬病病毒(Porcine pseudorabies virus,PRV)检测无交叉反应。灵敏度评价表明,该检测方法可以检测到样品中10个拷贝的PCV2 DNA含量。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 Rep基因 Cap基因 环媒恒温扩增技术
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环介导恒温扩增芯片法检测下呼吸道感染病原菌的临床应用 被引量:2
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作者 杨小燕 邹翠美 +1 位作者 赵菊芬 杨志伟 《宁夏医科大学学报》 2023年第2期161-165,共5页
目的探讨环介导恒温扩增芯片(loop mediated isothermal amplification,LAMP)法快速检测下呼吸道感染病原菌的临床应用价值。方法收集本院2019年1月至2021年12月下呼吸道感染患者的下呼吸道标本,对同一份样本先进行常规培养再进行LAMP... 目的探讨环介导恒温扩增芯片(loop mediated isothermal amplification,LAMP)法快速检测下呼吸道感染病原菌的临床应用价值。方法收集本院2019年1月至2021年12月下呼吸道感染患者的下呼吸道标本,对同一份样本先进行常规培养再进行LAMP病原菌检测,比较两种方法对下呼吸道感染病原菌的检出率。结果一共收集1612例样本,LAMP对12种病原菌和MecA均有检出,检出阳性665例,其中单一病原菌感染474例,多重感染191例。常规培养法检出阳性310例,其中单一病原菌感染281例,多重感染29例。其中228例为两种方法检出一致,通过Kappa检验分析Pae、Aba基本一致,Kpn、Eco、Sma和Sau中等一致,Spn和Hin一般一致。经分析不同性别不同年龄间下呼吸道感染的病原菌检出率差异有统计学意义(P<0.05)。LAMP和常规培养法同时检出金黄色葡萄球菌29例,比较金黄色葡萄球菌MecA和苯唑西林最小抑菌浓度(MIC)值对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的检出一致性,显示检测结果差异有统计学意义(χ^(2)=9.815,P<0.05)。结论LAMP法较常规培养法可快速检测病原菌且能提高阳性检出率。依据LAMP法的金黄色葡萄球菌和MecA检测结果可早期快速排除MRSA的定植和感染,有助于临床诊治及合理用药。 展开更多
关键词 环介导恒温扩增芯片法 下呼吸道感染 病原菌
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环介导恒温扩增技术检测新型冠状病毒研究进展 被引量:1
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作者 冯茹荔 刘迪 滕新栋 《口岸卫生控制》 2023年第4期35-39,共5页
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)在全球范围的大流行对世界公共卫生体系提出了巨大挑战。环介导恒温扩增技术(loop mediated isothermal amplification,LAMP)作为一种灵敏度高、特异性强的检测技术,被认为是金标准PCR技术的可行替代方案。本... 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)在全球范围的大流行对世界公共卫生体系提出了巨大挑战。环介导恒温扩增技术(loop mediated isothermal amplification,LAMP)作为一种灵敏度高、特异性强的检测技术,被认为是金标准PCR技术的可行替代方案。本文从原理、产物检测方法、在SARSCoV-2检测中的应用及商品化试剂盒方面对LAMP技术进行详细阐述。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 新型冠状病毒感染 环介导恒温扩增技术
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生殖道病原菌LAMP检测的环引物设计与优化
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作者 贾义国 徐小芳 +3 位作者 陈尚贤 王新博 余跃 孙群 《中国测试》 CAS 北大核心 2023年第11期60-67,共8页
孕期生殖道病原菌感染是威胁妇女和胎儿健康的常见疾病之一,为改进现有检测方法耗时长的缺陷,对基于环介导等温扩增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)的生殖道病原菌快速检测方法进行优化。在Gardnerella vaginalis的LAMP... 孕期生殖道病原菌感染是威胁妇女和胎儿健康的常见疾病之一,为改进现有检测方法耗时长的缺陷,对基于环介导等温扩增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)的生殖道病原菌快速检测方法进行优化。在Gardnerella vaginalis的LAMP检测体系中,通过对不同环引物组扩增速率(Ct值)进行统计学分析,验证了环引物在LAMP反应中提升扩增速率的能力,同时探究了环引物长度和GC含量对扩增速率的影响,并将其作为环引物筛选参数应用于3种生殖道病原菌(G.vaginalis、Streptococcus agalactiae、Enterococcus faecalis)检测的环引物设计。结果表明,不同GC含量的环引物扩增速率差异不显著,而环引物的长度是影响其扩增效果的关键因素,碱基数较少的环引物有利于提高LAMP反应速率(p<0.05),设计出的引物组GV-1、GBS-132和EF-3可以在105 CFU/mL扩增浓度下在30 min内呈现完整“S”扩增曲线,具有较好的临床病原菌筛查应用潜力。 展开更多
关键词 病原菌检测 环引物 环介导等温扩增 生殖道感染 快速检测
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