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基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
被引量:
1
1
作者
吕利
王晓利
+1 位作者
张文娟
韩芝侠
《宝鸡文理学院学报(自然科学版)》
CAS
2023年第1期54-61,共8页
目的指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷,并提出改进措施,以提高组装的准确率与运行效率。方法深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法,包括基于“校正后组装”策略的FALCON,Canu和MECAT组装方法,基于...
目的指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷,并提出改进措施,以提高组装的准确率与运行效率。方法深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法,包括基于“校正后组装”策略的FALCON,Canu和MECAT组装方法,基于“组装后校正”策略的Flye和Wtdbg2组装方法,指出不同策略的优缺点。结果与结论综合2种组装策略的优势,提出了可以融合2种组装策略优势的新的基因组组装方案,解决了当前基于三代测序数据的基因组组装中的难点。
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关键词
三代测序数据
基因组组装
生物信息学
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职称材料
题名
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
被引量:
1
1
作者
吕利
王晓利
张文娟
韩芝侠
机构
宝鸡文理学院电子电气工程学院
出处
《宝鸡文理学院学报(自然科学版)》
CAS
2023年第1期54-61,共8页
基金
宝鸡文理学院重点科研项目(ZK16120)
宝鸡文理学院第十五批教学改革项目(20JGYB57)。
文摘
目的指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷,并提出改进措施,以提高组装的准确率与运行效率。方法深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法,包括基于“校正后组装”策略的FALCON,Canu和MECAT组装方法,基于“组装后校正”策略的Flye和Wtdbg2组装方法,指出不同策略的优缺点。结果与结论综合2种组装策略的优势,提出了可以融合2种组装策略优势的新的基因组组装方案,解决了当前基于三代测序数据的基因组组装中的难点。
关键词
三代测序数据
基因组组装
生物信息学
Keywords
long
-
read
sequencing
data
genome
assembly
bioinformatics
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
吕利
王晓利
张文娟
韩芝侠
《宝鸡文理学院学报(自然科学版)》
CAS
2023
1
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