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7个地方山羊品种遗传多样性及遗传结构分析 被引量:11
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作者 张乐超 刘月琴 +3 位作者 段春辉 张英杰 王泳 郭云霞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期183-190,共8页
检测了7个地方山羊群体在15个微卫星位点的遗传多样性和遗传结构,旨为地方山羊群体的保护利用奠定基础。采集燕山绒山羊、辽宁绒山羊、承德无角山羊、济宁青山羊、太行山羊、武安山羊血液样品及内蒙古绒山羊的耳组织,利用微卫星方法分... 检测了7个地方山羊群体在15个微卫星位点的遗传多样性和遗传结构,旨为地方山羊群体的保护利用奠定基础。采集燕山绒山羊、辽宁绒山羊、承德无角山羊、济宁青山羊、太行山羊、武安山羊血液样品及内蒙古绒山羊的耳组织,利用微卫星方法分析遗传多样性及遗传结构。结果表明,7个山羊群体的平均有效等位基因数为4.2358、平均期望杂合度为0.7188、平均多态信息含量为0.7068,均具有高度的遗传多样性;总群体平均近交系数为0.0883,平均遗传分化系数为0.5442,平均基因流为0.2094。武安山羊和承德无角山羊的遗传距离最近,太行山羊和燕山绒山羊的遗传距离最远。系统进化树聚类分析表明,燕山绒山羊与辽宁绒山羊聚为一类,济宁青山羊、承德无角山羊、武安山羊、内蒙古绒山羊和太行山羊聚为一类。综上,7个地方山羊群体遗传多样性丰富,群体间遗传分化程度大,基因交流少,受近交程度影响小,具有较高的利用价值和潜力。 展开更多
关键词 地方山羊群体 微卫星 遗传多样性 遗传距离
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山西4个地方山羊品种的遗传多样性分析 被引量:5
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作者 毛杨毅 罗惠娣 +7 位作者 郭慧慧 王志武 李俊 张冠武 王栋才 李希 张喜忠 田辉 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期15-20,共6页
利用5个微卫星标记分析了山西省4个地方山羊品种的遗传多样性.结果表明:4个地方山羊品种共检测到等位基因数(Na)为67个,平均有效等位基因数(Ne)为4.94~6.05个,平均多态信息含量(PIC)在0.7053~0.7982之间,平均遗传杂合度(H)在0.7592~0... 利用5个微卫星标记分析了山西省4个地方山羊品种的遗传多样性.结果表明:4个地方山羊品种共检测到等位基因数(Na)为67个,平均有效等位基因数(Ne)为4.94~6.05个,平均多态信息含量(PIC)在0.7053~0.7982之间,平均遗传杂合度(H)在0.7592~0.8316之间,4个地方山羊品种间的遗传分化系数为0.0461;聚类分析表明,黎城青山羊与阳城白山羊先聚类,再与吕梁黑山羊聚类,最后与洪洞奶山羊聚类;山西省4个地方山羊品种遗传变异大,遗传多样性丰富,品种间遗传分化小,4个地方山羊品种分子系统发生关系与其地理位置和生产特性相一致. 展开更多
关键词 地方山羊品种 微卫星 遗传多样性 遗传距离
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四个山西地方山羊品种Pit-1基因多态性的研究 被引量:1
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作者 曹婵 刘文忠 +2 位作者 乔利英 袁亚男 白慧敏 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第5期389-392,共4页
垂体释放因子1基因(Pit-1)是动物经济性状的重要候选基因之一。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对4个山西地方山羊品种的Pit-1基因进行多态性检测和分析,以了解该基因在这些品种中的遗传变异。结果表明:该基因座存在HinfⅠ限制性酶切多态性... 垂体释放因子1基因(Pit-1)是动物经济性状的重要候选基因之一。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对4个山西地方山羊品种的Pit-1基因进行多态性检测和分析,以了解该基因在这些品种中的遗传变异。结果表明:该基因座存在HinfⅠ限制性酶切多态性,表现AA和BB两种基因型,频率分别为0.01和0.99。洪洞奶山羊和吕梁黑山羊因突变而显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。利用PCR-SSCP检测出5种基因型。优势等位基因均为B,基因型频率的品种间差异明显。吕梁黑山羊和黎城大青羊显著偏离平衡状态(P<0.05)。中性检验表明,4个品种处于中性突变或遗传漂变过程中。各群体的期望杂合度和观察杂合度较为接近。基于两种技术的Fst值分别为0.0102和0.0197,说明总群体中大约只有1%~2%的变异来自群体间,群体间的遗传分化较弱。 展开更多
关键词 地方山羊 PIT-1基因 多态性 PCR-RFLP PCR-SSCP
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贵州地方山羊品种H-FABP基因第3外显子SNP研究 被引量:5
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作者 钱成 罗卫星 +3 位作者 孙岩岩 黄兰 刘彬 蔡惠芬 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期349-354,共6页
[目的]研究3种贵州地方山羊品种H-FABP基因第3外显子的多态性以及进行该基因多态性生物信息学分析,以期筛选出适合的突变位点,研究其与山羊生长性状关联性影响。[方法]以3种贵州地方山羊品种为试验材料构建DNA池,结合直接测序技术筛选H-... [目的]研究3种贵州地方山羊品种H-FABP基因第3外显子的多态性以及进行该基因多态性生物信息学分析,以期筛选出适合的突变位点,研究其与山羊生长性状关联性影响。[方法]以3种贵州地方山羊品种为试验材料构建DNA池,结合直接测序技术筛选H-FABP基因SNPs,并利用在线软件分析H-FABP基因RNA二级结构及其蛋白二、三级结构。[结果]仅在黔北麻羊和贵州白山羊H-FABP基因第3外显子处分别筛选到T120A和G152C两个SNPs,其中exon3-T120A为导致编码氨基酸发生的Phe→Ile改变的错义突变,而exon3-G152C为苏氨酸(Thr)的同义突变。[结论]exon3-T120A位点影响黔北麻羊H-FABP基因RNA二级结构,最小自由能由-189.40 kcal/mol变为-190.00 kcal/mol,其蛋白二级结构无规则卷曲由49变为48,延伸链由36变为37,exon3-G152C位点仅影响贵州白山羊RNA二级结构,最小自由能变为-185.40 kcal/mol。 展开更多
关键词 H—FABP基因 SNPS 生物信息学 贵州地方山羊品种 错义突变 同义突变
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贵州山羊品种DQA1基因第3外显子遗传变异分析 被引量:4
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作者 刘彬 蔡惠芬 +2 位作者 张依裕 刘若余 罗卫星 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期13-16,共4页
目的:通过筛选3个贵州地方山羊种DQA1基因Exon3的SNPs位点并做相应的遗传变异分析,为今后山羊抗病育种及地方山羊品种的选育提供理论依据。方法:采用构建品种DNA池与直接测序的方法,对三个贵州地方山羊种群共514只个体的DQA1基因外显子... 目的:通过筛选3个贵州地方山羊种DQA1基因Exon3的SNPs位点并做相应的遗传变异分析,为今后山羊抗病育种及地方山羊品种的选育提供理论依据。方法:采用构建品种DNA池与直接测序的方法,对三个贵州地方山羊种群共514只个体的DQA1基因外显子3进行遗传变异分析。结果:在3个山羊品种中共筛选得到4个SNPs,G71A(同义突变)、T100C(Asn→Ser)、G202A(Pro→Leu)、A223G(Met→Thr)。生物信息学分析发现,G202A位点变异虽未引起mRNA二级结构的变化,但最小自由能降低,结构稳定性增强;DQA1基因Exon3的不同基因型的蛋白质二级结构中均不含有α螺旋。结论:三个贵州地方山羊种DQA1基因外显子3中含有较丰富的多态性,G202A位点变异在mRNA二级结构及蛋白质二级结构中与其他基因型具有较明显的差异。 展开更多
关键词 贵州山羊品种 DQA1基因 SNPS 生物信息学
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贵州地方山羊DRA基因Exon5的多态性分析
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作者 黄兰 封竣淇 +5 位作者 徐伟 刘彬 康建兵 钱成 蔡惠芬 罗卫星 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1686-1689,共4页
本研究通过构建3个贵州地方山羊品种的DNA池,并对其MHC-DRA基因第5外显子进行SNPs位点的筛选和生物信息学分析,以丰富山羊抗病育种的基础理论资料。分析发现,在3个山羊品种的DRA基因Exon5中发现两个共同突变位点,分别是C^(172)T和T^(176... 本研究通过构建3个贵州地方山羊品种的DNA池,并对其MHC-DRA基因第5外显子进行SNPs位点的筛选和生物信息学分析,以丰富山羊抗病育种的基础理论资料。分析发现,在3个山羊品种的DRA基因Exon5中发现两个共同突变位点,分别是C^(172)T和T^(176)G,而贵州白山羊中多一个突变位点G^(205)A;生物信息学分析发现,C^(172)T和G^(205)A位点均引起RNA二级结构和最小自由能的改变。结果表明贵州地方山羊DRA基因具有较丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 贵州山羊 DRA基因 SNPS 生物信息学
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