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基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义
被引量:
1
1
作者
黄逸婷
王珂
方晨
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期1115-1124,共10页
目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平...
目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性。通过TIMER2.0数据库评估ccRCC免疫细胞浸润,筛选ELTD1相关免疫检查点基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1相关的基因。结果:与癌旁组织比较,ELTD1在ccRCC组织中呈高表达(P<0.05)。TCGA-KIRC队列中,ELTD1的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01)。ELTD1转录表达在ccRCC患者年龄、T分期、M分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1与较长的OS和PFS密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1高表达是ccRCC的独立保护因素。ELTD1表达与B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关(R=-0.16、-0.27、-0.25、-0.31、-0.27,均P<0.01)。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,血管生成及肿瘤相关信号通路在ELTD1高表达表型中显著富集(均P<0.01)。ELTD1共表达基因的生存分析提示,其肿瘤抑制作用与共表达网络有关。结论:ELTD1在ccRCC组织中高表达和低甲基化是患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。
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关键词
肾透明细胞癌
表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白
1
甲基化
免疫浸润
预后标志物
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职称材料
题名
基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义
被引量:
1
1
作者
黄逸婷
王珂
方晨
机构
苏州大学附属第二医院临床营养科
南京医科大学附属苏州医院泌尿外科
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期1115-1124,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82070814)。
文摘
目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性。通过TIMER2.0数据库评估ccRCC免疫细胞浸润,筛选ELTD1相关免疫检查点基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1相关的基因。结果:与癌旁组织比较,ELTD1在ccRCC组织中呈高表达(P<0.05)。TCGA-KIRC队列中,ELTD1的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01)。ELTD1转录表达在ccRCC患者年龄、T分期、M分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1与较长的OS和PFS密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1高表达是ccRCC的独立保护因素。ELTD1表达与B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关(R=-0.16、-0.27、-0.25、-0.31、-0.27,均P<0.01)。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,血管生成及肿瘤相关信号通路在ELTD1高表达表型中显著富集(均P<0.01)。ELTD1共表达基因的生存分析提示,其肿瘤抑制作用与共表达网络有关。结论:ELTD1在ccRCC组织中高表达和低甲基化是患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。
关键词
肾透明细胞癌
表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白
1
甲基化
免疫浸润
预后标志物
Keywords
clear
cell
renal
cell
carcinoma(ccRCC)
epidermal
growth
factor
latrophilin
and
seven
transmembrane
domain
-
containing
1(
eltd
1)
methylation
immune
infiltration
prognostic
marker
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
R730.7 [医药卫生—临床医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义
黄逸婷
王珂
方晨
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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