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kshv-mir-k12-1-5p相关基因在卡波西肉瘤中的表达 被引量：1
1
作者 张静 吴秀娟 普雄明 《山西医科大学学报》 CAS 2017年第10期1044-1047,共4页
目的探索kshv-mir-k12-1-5p相关基因在卡波西肉瘤(KS)组织中的表达意义。方法通过在线miRNA靶基因软件Mirbase、Miranda和Targetscan寻找kshv-mir-k12-1-5p的靶基因。通过GO和KEGG分析靶基因的信号通路及通路上的关键基因。使用免疫组... 目的探索kshv-mir-k12-1-5p相关基因在卡波西肉瘤(KS)组织中的表达意义。方法通过在线miRNA靶基因软件Mirbase、Miranda和Targetscan寻找kshv-mir-k12-1-5p的靶基因。通过GO和KEGG分析靶基因的信号通路及通路上的关键基因。使用免疫组化的方法检测靶基因、关键基因(kshv-mir-k12-1-5p相关基因)在卡波西肉瘤组织的表达。结果 kshvmir-k12-1-5p的靶基因为CDKN1A,CDKN1A信号通路为Cell cycle通路,通路下游关键基因为Cyclin D1、Cyclin E。CDKN1A、Cyclin D1、Cyclin E在肿瘤组织与瘤旁组织中的表达差异有统计学意义(P<0.05),CDKN1A在卡波西肉瘤中的阳性表达率低于瘤旁组织(P<0.05),Cyclin D1、Cyclin E在卡波西肉瘤中的阳性表达率高于瘤旁组织(P<0.05);在KS中Cyclin D1与年龄相关(P<0.05),Cyclin E与民族相关(P<0.05);在KS中CDKN1A与Cyclin D1、Cyclin E均呈负相关(P<0.05)。Cyclin D1与Cyclin E呈正相关(P<0.05)。结论 kshv-mir-k12-1-5p的相关基因:CDKN1A、Cyclin D1、Cyclin E表达异常在KS发生、发展中具有重要的作用。 展开更多
关键词 卡波西肉瘤 kshv-mir-k12-1-5p CDkN1A CYCLIND1 CYCLINE
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卡波西肉瘤病毒编码的kshv-miR-K12-1-5p靶基因预测及生物信息学分析
2
作者 龚海波 张慧 普雄明 《肿瘤预防与治疗》 2020年第12期916-922,共7页
目的:对卡波西肉瘤病毒(Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus,KSHV)编码的小分子RNA kshv-miR-K12-1-5p进行靶基因预测和靶基因生物信息学分析,为未来对kshv-miR-K12-1-5p靶基因的研究提供可行的方向。方法:利用数据库PubMed、miR... 目的:对卡波西肉瘤病毒(Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus,KSHV)编码的小分子RNA kshv-miR-K12-1-5p进行靶基因预测和靶基因生物信息学分析,为未来对kshv-miR-K12-1-5p靶基因的研究提供可行的方向。方法:利用数据库PubMed、miRTarBase、TargetScanHuman Custom、miRDB等对kshv-miR-K12-1-5p靶基因进行查询和预测,之后对这些靶基因进行GO和KEGG的富集分析以及蛋白互作网络的分析,并对互作网络的关键模块和关键基因进行提取和分析。结果:通过数据库miRTarBase查询到经过验证的靶基因有NF-Kappa-B抑制因子α和细胞转录因子MAF;通过PubMed查询到经过验证的靶基因有抑制细胞因子信号转导6。通过生物信息学分析预测得到8个靶基因,分别是PPIH、POLR2B、HNRNPU、MAGOHB、DNAJC8、HNRNPC、RBM22、HNRNPA3。结论:本次研究通过利用生物信息学的方法,对KSHV编码的kshv-miR-K12-1-5p靶基因进行预测,得到一些kshv-miR-K12-1-5p可能作用的靶点,为未来研究者提供可能的研究方向。 展开更多
关键词 卡波西肉瘤病毒 mirNA kshv-mir-k12-1-5p 生物信息学分析
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kshv-mir-k12-1-5p靶向调控CDKN1A影响卡波西肉瘤的细胞周期
3
作者 张静 彭靖淇 +1 位作者 吴秀娟 普雄明 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第12期1923-1927,共5页
目的研究kshv-mirT12VTp通过靶向调控细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1 A(CDKN1A)影响卡波西肉瘤(KS)的细胞周期&方法生物信息学软件预测kshwmu-kl2NVp是否有CDKNlA的结合位点;双荧光素酶实验检测kshv-mir-k12-1-5p是否靶向结合CDKN... 目的研究kshv-mirT12VTp通过靶向调控细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1 A(CDKN1A)影响卡波西肉瘤(KS)的细胞周期&方法生物信息学软件预测kshwmu-kl2NVp是否有CDKNlA的结合位点;双荧光素酶实验检测kshv-mir-k12-1-5p是否靶向结合CDKNlA;将kshv-mir-k12-1 Vp模拟物(mimic//抑制物(inhibitor)分别转染到卡波西肉瘤细胞株(SLK)中,Western blot和qRTTCR方法检测kshv-mir-k12-1-5p对CDKNlA的调控作用;PI法检测kshe-mU-k12-1-5p对KS细胞周期的影响&结果MiOee靶基因预测软件分析显示:kshwmiRkl2VTp与CDKNlA的3,非翻译区(3PTR)有结合位点;荧光素酶活性结果分析证实kshe-mi e-k12-1-5p的作用合位点(P<0.01);Western blot和qRTTCR结果显示:在蛋白水平和mRNA水平上,kshwmiRkl2NTp可显著降低CDKNlA的表达水平(P<0.01);PI实验结果显示:与其余各组比较,k/wmio kl2NTp mimics组PI值(51.43土0.75%)最高(P<0.01),能加速KS细胞周期进程;与其余各组比较,kshwmiRkl2N-5p inhibitor组PI值(3274±1.28)%最低#P<0.01),能减慢KS细胞周期进程&结论CDKNlA是kWiwmiRkl2NTp的靶基因,kshe-mi e-k12-1-5p通过靶CDKN1A的表达影响卡波西肉瘤的细胞周期. 展开更多
关键词 卡波西肉瘤相关病毒编码的微小核糖核酸T12N 5p 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A 卡波西肉瘤 细胞周
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