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华南虎源大肠杆菌的快速鉴定及致病特性的初步研究 被引量:11
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作者 谢和平 朱庆艳 +1 位作者 陈武 肖建雄 《野生动物》 2012年第3期109-112,133,共5页
从患病华南虎分离病原菌,进行快速鉴定,同时以大肠杆菌16S rRNA基因的通用引物和irp2、papC、iucD、tsh、iss毒力基因的特异性引物进行PCR扩增、测序,并将扩增出来的irp2、iucD、iss基因序列与Genbank相应序列进行同源性分析。测序鉴定... 从患病华南虎分离病原菌,进行快速鉴定,同时以大肠杆菌16S rRNA基因的通用引物和irp2、papC、iucD、tsh、iss毒力基因的特异性引物进行PCR扩增、测序,并将扩增出来的irp2、iucD、iss基因序列与Genbank相应序列进行同源性分析。测序鉴定为大肠埃希氏菌,与传统细菌鉴定方法结果相一致,分离菌携带irp2、iucD、iss毒力基因,从毒力试验得到证实。其序列与Genbank上发表的iucD、iss基因序列同源性分别高达98%、99%,而irp2基因序列的同源性仅为48%。采用16S rRNA基因序列分析法可以对华南虎大肠埃希氏菌感染进行快速鉴定,华南虎源性大肠杆菌同时携带有irp2、iucD、iss 3个毒力基因,可能与其致病性有关系。 展开更多
关键词 华南虎 大肠埃希氏菌 16S RRNA基因 irp2基因 iucD基因
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云南楚雄规模化猪场仔猪大肠杆菌HPI基因调查及耐药性分析 被引量:6
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作者 景麟稀 高飞龙 +4 位作者 单春兰 刘超英 王世玉 严玉霖 高洪 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第6期1849-1855,共7页
为研究规模化猪场大肠杆菌高致病性毒力岛(high pathogenicity island,HPI)基因流行特征及其耐药性,本试验从云南省楚雄州地方猪场采集粪便及肛门拭子,应用麦康凯培养基、生化鉴定管及PCR扩增对大肠杆菌进行分离鉴定,分别通过PCR反应、... 为研究规模化猪场大肠杆菌高致病性毒力岛(high pathogenicity island,HPI)基因流行特征及其耐药性,本试验从云南省楚雄州地方猪场采集粪便及肛门拭子,应用麦康凯培养基、生化鉴定管及PCR扩增对大肠杆菌进行分离鉴定,分别通过PCR反应、动物回归试验及纸片扩散法研究分离菌株的HPI基因携带情况、致病性及耐药性。结果显示,共分离获得78株大肠杆菌,分离率为83.87%,HPI基因携带率高达96.15%;24 h内,HPI阳性菌株致小鼠死亡率100%,HPI阴性菌株致小鼠死亡率75%,对照组无小鼠死亡,表明HPI基因可提高小鼠死亡率;药敏试验结果显示,分离菌株对四环素、氨苄西林、复方新诺明、卡那霉素、庆大霉素、头孢他啶及阿米卡星的耐药率分别为88.46%、84.62%、73.08%、53.85%、38.46%、19.23%和5.13%,对多黏菌素B不耐药。本试验结果可为防治大肠杆菌相关疾病提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 HPI基因 irp2基因 致病性 耐药性
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禽源性大肠杆菌HPI毒力岛irp2基因PCR检测方法的建立与应用 被引量:6
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作者 王艳萍 董林 +5 位作者 郭时金 徐倩倩 莫玲 王金良 刘吉山 沈志强 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2017年第1期86-89,共4页
为了解临床禽源致病性大肠杆菌中高致病性毒力岛(High pathogenicity island HPI)流行情况和基因特征,根据Gen Bank已知禽源irp2基因序列,设计、合成一对特异性引物,建立irp2基因PCR检测方法,优化、确定PCR扩增特性,进行敏感性、特异性... 为了解临床禽源致病性大肠杆菌中高致病性毒力岛(High pathogenicity island HPI)流行情况和基因特征,根据Gen Bank已知禽源irp2基因序列,设计、合成一对特异性引物,建立irp2基因PCR检测方法,优化、确定PCR扩增特性,进行敏感性、特异性、重复性检测评价。对256份临床分离禽源大肠杆菌进行irp2基因PCR检测和基因遗传变异分析。结果显示,建立的PCR检测方法敏感性可达2.14×10^(-4)ng/μL;特异性显示与鸡沙门菌、副鸡嗜血杆菌、鸭疫里默菌、禽巴氏杆菌、鸡毒支原体、鸡新城疫病毒、禽流感病毒(H9N5)核酸均无交叉反应;重复性显示3份阳性样品重复5次检测,变异系数3.4%~5.0%。256份临床样品PCR检测irp2基因,阳性率30.6%。获得了9株分离株irp2基因序列,分析显示,与GenBank已知基因同源性高达96.2%以上。说明建立的禽源大肠杆菌HPI毒力岛irp2基因PCR检测方法具有良好的特异性、敏感性和重复性,可应用于临床致病性大肠杆菌毒力岛基因快速检测。 展开更多
关键词 禽源大肠杆菌 HPI 毒力岛 irp2基因
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新疆奶牛乳源大肠杆菌Irp2毒力岛的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 吐尔洪.努尔 王世民 苏艳 《新疆农业大学学报》 CAS 北大核心 2010年第6期492-495,共4页
采集新疆奶牛隐性乳腺炎乳样,经分离、鉴定,从中得到乳源大肠杆菌,并将大肠杆菌菌株用大肠杆菌O因子血清标定。根据GenBank已发表的Irp2基因序列,用Oligo 6.0生物软件设计一对特异性引物。对分离得到的大肠杆菌菌株提取基因组DNA,利用... 采集新疆奶牛隐性乳腺炎乳样,经分离、鉴定,从中得到乳源大肠杆菌,并将大肠杆菌菌株用大肠杆菌O因子血清标定。根据GenBank已发表的Irp2基因序列,用Oligo 6.0生物软件设计一对特异性引物。对分离得到的大肠杆菌菌株提取基因组DNA,利用聚合酶链式反应(PCR)进行扩增。结果表明,所分离大肠杆菌中Irp2基因阳性率为35.3%(12/34),阳性样品的测序结果与已发表的Irp2基因序列高度同源,同源率在98%以上。同时发现Irp2基因的阳性率与血清型并没有相关性。 展开更多
关键词 irp2基因 甜菜碱 牛乳腺炎 序列分析 进化树
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PEC HPI irp2基因缺失株的构建及蛋白结构功能预测 被引量:2
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作者 刘超英 吴程华 +3 位作者 高洪 严玉霖 富国文 赵汝 《中国兽药杂志》 2018年第2期12-18,共7页
为了探讨致病性大肠杆菌内HMWP2蛋白的生物学结构和功能,采用Red同源重组技术,对致病性E.coli的HPI irp2基因进行敲除,成功构建了致病性E.coli irp2基因缺失株,并利用测序结果对HMWP2蛋白进行了多重预测分析,以期为致病性大肠杆菌相关... 为了探讨致病性大肠杆菌内HMWP2蛋白的生物学结构和功能,采用Red同源重组技术,对致病性E.coli的HPI irp2基因进行敲除,成功构建了致病性E.coli irp2基因缺失株,并利用测序结果对HMWP2蛋白进行了多重预测分析,以期为致病性大肠杆菌相关疾病的防治和发生机理研究提供理论基础。 展开更多
关键词 致病性E.coli irp2基因 HMWP2 RED同源重组 基因敲除
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致病性大肠埃希菌高致病性毒力岛irp2基因序列的扩增与分析 被引量:2
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作者 胡永轩 欧阳丹明 +3 位作者 余晓芬 李木兰 刘巧突 何志雄 《中国感染控制杂志》 CAS 2008年第3期167-169,共3页
目的探讨致病性大肠埃希菌(EPEC)中高致病性毒力岛(HPI)irp2基因与致病性的关系。方法根据Genebank中irp2基因设计特异性引物,应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增基因全长,克隆入pUCm-T载体,并通过酶切和测序鉴定。结果160株EPEC中有16株(10... 目的探讨致病性大肠埃希菌(EPEC)中高致病性毒力岛(HPI)irp2基因与致病性的关系。方法根据Genebank中irp2基因设计特异性引物,应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增基因全长,克隆入pUCm-T载体,并通过酶切和测序鉴定。结果160株EPEC中有16株(10.00%)扩增出278bp基因片段,该基因片段与GeneBank中公布的耶尔森菌HPIirp2基因的同源性高达97%以上。结论部分EPEC具有耶尔森菌毒力岛HPI基因序列,该毒力岛可能与EPEC的致病性有一定相关性。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 致病性大肠埃希菌 高致病性毒力岛 序列分析 irp2基因
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银川地区鸡源致病性大肠杆菌耶尔森菌强毒力岛相关基因的检测及序列分析 被引量:1
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作者 刘文淼 曾瑾 +1 位作者 王东 邓光存 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第10期93-95,共3页
为了研究耶尔森菌强毒力岛(HPI)在银川地区鸡源致病性大肠杆菌中的分布情况,试验根据HPI相关基因irp2和fyuA的参考序列设计引物,采用双重PCR方法对分离的20株鸡源致病性大肠杆菌进行这两种基因的扩增和检测,以及基因克隆和核苷酸序列分... 为了研究耶尔森菌强毒力岛(HPI)在银川地区鸡源致病性大肠杆菌中的分布情况,试验根据HPI相关基因irp2和fyuA的参考序列设计引物,采用双重PCR方法对分离的20株鸡源致病性大肠杆菌进行这两种基因的扩增和检测,以及基因克隆和核苷酸序列分析。结果表明:irp2和fyuA基因在鸡源致病性大肠杆菌分离株中的阳性率均为40%(8/20);这两种毒力岛相关基因的核苷酸序列与GenBank中报道的基因核苷酸同源性高达98%以上。说明irp2和fyuA基因具有较高的保守性。 展开更多
关键词 鸡源致病性大肠杆菌 耶尔森菌毒力岛(HPI) irp2基因 fyuA基因
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云南撒坝猪EPEC HPI irp2缺失株的摄铁能力研究
8
作者 刘超英 吴程华 +5 位作者 高洪 严玉霖 富国文 赵汝 苗淑淑 刘嫦 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1914-1917,共4页
【目的】本研究探讨了云南撒坝猪EPEC HPI毒力岛的摄铁功能与致病性之间的关系。【方法】本试验通过摄铁实验对5株肠致病性E.coli(A-E)和CVCC1565铁载体的合成和在不同2,2’-联吡啶含量下的最低生长抑制浓度及对数期生长速率进行了测定... 【目的】本研究探讨了云南撒坝猪EPEC HPI毒力岛的摄铁功能与致病性之间的关系。【方法】本试验通过摄铁实验对5株肠致病性E.coli(A-E)和CVCC1565铁载体的合成和在不同2,2’-联吡啶含量下的最低生长抑制浓度及对数期生长速率进行了测定,同时利用已构建的E.coli irp2基因缺失株和亲本株进行对比,检测HMWP2蛋白的表达,并通过半数致死量实验比较两者之间的毒力。【结果】除E.coli(D)外,其余菌株的2,2’-联吡啶最低生长抑制浓度为0.6 m M;亲本株能够表达HMWP2蛋白,irp2缺失株不表达该蛋白;CAS固体培养基中菌株能产生橘黄色的透明晕圈;当2,2’-联吡啶浓度高于0.2 m M时,亲本株的生长率高于irp2缺失株;亲本株的LD50(8.73×10~7cfu/m L)低于缺失株(9.95×10~7cfu/m L)。【结论】云南撒坝猪EPEC HPI铁摄取功能和致病性之间存在着一定关系。 展开更多
关键词 EPEC HPI irp2基因 摄铁功能
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黑颈鹤源大肠杆菌的快速鉴定及致病特性的初步研究
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作者 余绍华 陈武 莫卓东 《野生动物》 2011年第4期224-227,共4页
对黑颈鹤病原菌进行快速鉴定及毒力因子分析。采用16S rRNA序列分析法鉴定黑颈鹤病原菌,其毒力基因分别用大肠杆菌的irp2、papC、iucD、tsh、iss毒力基因的特异性引物进行PCR检测,并将扩增出来的irp2基因序列与Genbank^(TM)相应序列进... 对黑颈鹤病原菌进行快速鉴定及毒力因子分析。采用16S rRNA序列分析法鉴定黑颈鹤病原菌,其毒力基因分别用大肠杆菌的irp2、papC、iucD、tsh、iss毒力基因的特异性引物进行PCR检测,并将扩增出来的irp2基因序列与Genbank^(TM)相应序列进行同源性分析。分离菌株鉴定为大肠埃希氏菌,鉴定结果与生化检测结果一致,分离菌携带irp2毒力基因,这从毒力试验得到证实,其序列与与Genbank^(TM)上发表的HPI irp2基因序列同源性高达98%以上。采用16S rRNA序列分析法可以对黑颈鹤大肠埃希氏菌感染进行快速鉴定,黑颈鹤源性大肠杆菌携带有irp2毒力基因。 展开更多
关键词 黑颈鹤 大肠埃希氏杆菌 16S RRNA irp2基因
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应用CRISPR/Cas9系统构建大肠埃希氏菌irp2基因缺失株 被引量:5
10
作者 富国文 单春兰 +4 位作者 敖平星 赵汝 高丽波 刘超英 高洪 《动物医学进展》 北大核心 2021年第1期50-55,共6页
CRISPR/Cas9是一个新兴的基因编辑技术,利用该技术对临床分离的撒坝猪致病性大肠埃希氏菌中的irp2基因进行编辑,为进一步研究该基因在致病中的作用提供基础。首先构建靶向irp2基因的sgRNA,PCR扩增上、下游同源臂,利用重叠PCR技术连接sg... CRISPR/Cas9是一个新兴的基因编辑技术,利用该技术对临床分离的撒坝猪致病性大肠埃希氏菌中的irp2基因进行编辑,为进一步研究该基因在致病中的作用提供基础。首先构建靶向irp2基因的sgRNA,PCR扩增上、下游同源臂,利用重叠PCR技术连接sgRNA与上、下游同源臂,再通过酶切与酶连构建出靶向irp2基因的pTargetF重组质粒。将pCas与pTargetF重组质粒转化临床分离的撒坝猪致病性大肠埃希氏菌中,成功构建了该菌株的irp2基因缺失菌株,为进一步研究其致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 大肠埃希氏菌 irp2基因缺失菌株
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一株多耐药撒坝猪致病性E. coli irp2基因缺失菌株的构建
11
作者 富国文 敖平星 +3 位作者 单春兰 赵汝 刘超英 高洪 《家畜生态学报》 北大核心 2021年第4期23-28,共6页
Red同源重组是大肠埃希菌基因编辑的一个重要工具,pKD46、pKD3/4和pCP20是该操作中常用的工程质粒,通常以氨苄青霉素、卡那霉素和氯霉素作为筛选标记。在对一株分离自腹泻撒坝仔猪的致病性大肠埃希菌进行irp2基因敲除时发现该菌对氨苄... Red同源重组是大肠埃希菌基因编辑的一个重要工具,pKD46、pKD3/4和pCP20是该操作中常用的工程质粒,通常以氨苄青霉素、卡那霉素和氯霉素作为筛选标记。在对一株分离自腹泻撒坝仔猪的致病性大肠埃希菌进行irp2基因敲除时发现该菌对氨苄青霉素、氯霉素等多种抗生素不敏感,是一株多耐药菌株,给筛选带来了困难。为了解决这个问题,我们构建了携带博来霉素抗性的打靶片段和携带FLP酶的重组质粒pCas-FLP,成功实现了该菌株的irp2基因缺失,为进一步研究该基因致病机制提供了基础,同时也为多耐药菌株的基因编辑提供了一种新的方法。 展开更多
关键词 RED同源重组 多耐药 irp2基因缺失
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肠产志贺样毒素的大肠杆菌菌株中小肠结肠炎耶尔森菌毒力岛基因irp-2的检测 被引量:10
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作者 程伯鲲 叶长芸 +3 位作者 伍建宏 孙晖 赵斌秀 徐建国 《中华微生物学和免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2000年第6期489-492,共4页
目的 了解肠产志贺样毒素且具侵袭力的大肠杆菌 (ESIEC)菌株中的小肠结肠炎耶尔森菌HPI毒力岛基因irp 2的存在情况。方法 使用菌落原位杂交、DNA打点杂交和PCR扩增方法。结果 用菌落原位杂交的方法发现在检测从各地收集的 371株ESIE... 目的 了解肠产志贺样毒素且具侵袭力的大肠杆菌 (ESIEC)菌株中的小肠结肠炎耶尔森菌HPI毒力岛基因irp 2的存在情况。方法 使用菌落原位杂交、DNA打点杂交和PCR扩增方法。结果 用菌落原位杂交的方法发现在检测从各地收集的 371株ESIEC菌株中 ,6 7株和irp 2基因探针杂交 ,占 18 0 6 %。在这 6 7株菌种中 ,6 4株菌可使用PCR方法扩增出irp 2基因 ,占 95 5 %。鉴于在一部分肠侵袭性大肠杆菌 (EIEC)中可检测到irp 2基因 ,因而检测了EIEC的侵袭性基因ipaB基因。在 6 7株与irp 2探针杂交呈阳性反应的菌株中只有 1株为ipaB探针杂交阳性。为了比较菌落原位杂交和DNA打点杂交方法的特异性 ,随机挑选了 2 0株irp 2基因菌落原位杂交和PCR试验阳性的ES IEC菌株、2 0株菌落原位杂交和PCR试验阴性的ESIEC菌株 ,进行irp 2、ipaB的全菌DNA打点杂交试验。其中有 38株菌的试验结果和菌落原位杂交结果一致 ,符合率为 95 %。结论 从我国不同地区分离的ESIEC菌株中可检出小肠结肠炎耶尔森菌毒力岛基因irp 2 ,比例达 18 0 6 %。irp 2 + ipaB-可以作为鉴定部分ESIEC菌株的指标之一。PCR方法和菌落原位杂交方法均可采用。 展开更多
关键词 肠产志贺样毒素 小肠结肠炎耶尔森菌 irp-2基因
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狐源大肠杆菌毒力基因的检测 被引量:6
13
作者 王绍红 柴荣 +4 位作者 李政志 张艳芳 刘伟石 薛原 孙颖 《野生动物学报》 北大核心 2018年第4期933-937,共5页
为检测东北地区135株狐源大肠杆菌主要毒力基因,并研究其流行情况,采用PCR法检测分析了狐源大肠杆菌irp2,fyu A,fim H,iuc D,iss,ybt A 6个毒力基因。结果显示irp2,fyu A, fim H, iuc D, iss, ybt A的阳性率分别为42. 22%, 9. 63%, 41. ... 为检测东北地区135株狐源大肠杆菌主要毒力基因,并研究其流行情况,采用PCR法检测分析了狐源大肠杆菌irp2,fyu A,fim H,iuc D,iss,ybt A 6个毒力基因。结果显示irp2,fyu A, fim H, iuc D, iss, ybt A的阳性率分别为42. 22%, 9. 63%, 41. 48%,12. 59%,0. 07%,8. 15%,黏附相关基因fim H及铁载体相关基因irp2检出率较高,fim H,irp2是狐源大肠杆菌主要毒力基因。 展开更多
关键词 大肠杆菌 fimH毒力基因 irp2毒力基因
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阴沟肠杆菌菌株中携带小肠结肠炎耶尔森菌毒力岛irp-2基因的检测 被引量:2
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作者 李刚山 王意银 +15 位作者 朱琼媛 朱姝媛 张琳 张超雄 侯敏 古良琪 邓波 王惠萱 李丽娇 刘德华 赵丽芝 周丽华 胡挺松 邱薇 李作生 范泉水 《中国卫生检验杂志》 CAS 2011年第6期1317-1318,1321,共3页
目的:了解从云南战区感染性腹泻患者粪便标本中分离的阴沟肠杆菌是否携带小肠结肠炎耶尔森菌H IP(H ighPathogen ic ity Island)毒力岛irp-2基因,并研究菌株的毒力及耐药情况。方法:用PCR扩增法检测毒力岛irp-2基因,小白鼠腹腔注射检测... 目的:了解从云南战区感染性腹泻患者粪便标本中分离的阴沟肠杆菌是否携带小肠结肠炎耶尔森菌H IP(H ighPathogen ic ity Island)毒力岛irp-2基因,并研究菌株的毒力及耐药情况。方法:用PCR扩增法检测毒力岛irp-2基因,小白鼠腹腔注射检测毒力。结果:从1040例腹泻病人粪便分离的25株阴沟肠杆菌中,检测出18株携带小肠结肠炎耶尔森菌H IP毒力岛irp-2基因,毒力试验证实有较强毒力,药敏试验筛选出了敏感、中度敏感及耐药三类药敏谱。结论:云南战区检出的阴沟肠杆菌含有小肠结肠炎耶尔森菌H IP毒力岛irp-2基因且为毒力较强的菌株,对人类的健康具有潜在性的威胁。建立的药敏谱,为军队和地方今后在治疗由此菌引起的感染提供重要参考。 展开更多
关键词 阴沟肠杆菌 小肠结肠炎耶尔森菌 毒力岛irp-2基因 聚合酶链反应
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西南战区腹泻患者携带耶尔森菌HPI毒力岛大肠艾希菌调查 被引量:2
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作者 李刚山 王意银 +17 位作者 古良琪 邓波 王惠萱 张超雄 杨川莉 李明 周奕帆 朱姝媛 朱琼媛 侯敏 刘德华 赵丽芝 周丽华 王霞 周卫国 覃敏 邱薇 范泉水 《中国热带医学》 CAS 2011年第11期1305-1307,共3页
目的收集西南战区部队和地方医院腹泻患者粪便标本,做细菌分离与鉴定,分析病原菌组成。对分离的部分生化反应符合大肠艾希菌,但血清学证明不属于肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)、肠产毒性大肠杆菌(ETEC)、肠致病性大肠杆菌(EPEC)和肠出血性大... 目的收集西南战区部队和地方医院腹泻患者粪便标本,做细菌分离与鉴定,分析病原菌组成。对分离的部分生化反应符合大肠艾希菌,但血清学证明不属于肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)、肠产毒性大肠杆菌(ETEC)、肠致病性大肠杆菌(EPEC)和肠出血性大肠杆菌(EHEC)的菌株,做耶尔森菌HPI毒力岛irp-2基因检测,了解西南战区腹泻病人粪便中分离的大肠艾希菌携带耶尔森菌HPI毒力岛irp-2基因的存在情况。方法常规法分离,用肠杆菌科细菌生化鉴定编码系列(API-20E或GYZ-11e系统)和VITEK32全自动微生物生化分析仪以及弧菌科细菌生化鉴定编码系列(GYZ-9V系统)进行系统鉴定,PCR扩增法检测耶尔森菌HPI毒力岛。结果在1 352例腹泻病人中检出36个属种594株病原菌,检出率为43.93%,弗劳地枸橼酸杆菌检出率为6.14%、肺炎克雷伯菌为5.62%、变形杆菌4.66%、志贺菌4.07%,EIEC 1.85%,检出36株携带耶尔森菌HPI毒力岛irp-2基因大肠艾希菌,检出率为2.66%。结论从1352例腹泻患者粪便标本中分离到弗劳地枸橼酸杆菌占首位,肺炎克雷伯菌次之,变形杆菌、志贺菌分别居第三、第四位。西南战区存在携带耶尔森菌HPI毒力岛irp-2基因的大肠艾希菌。 展开更多
关键词 腹泻 大肠艾希菌 毒力岛irp-2基因
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