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二联咪唑环芳识别氨基酸甲酯的理论研究
1
作者
刘祥均
娄永峰
+2 位作者
肖蓉
杨明理
向明礼
《成都工业学院学报》
2013年第1期7-10,13,共5页
对二联咪唑环芳(DBICP)受体和氨基酸甲酯(AME)配体间的相互作用,重点从受配体间的电荷转移和配体溶剂可及表面积2个方面进行研究。受配体各单体经G03在B3LYP/6-31G(d)水平上优化后,用CDOCKER将配体与受体对接,为每对复合物获得了一组最...
对二联咪唑环芳(DBICP)受体和氨基酸甲酯(AME)配体间的相互作用,重点从受配体间的电荷转移和配体溶剂可及表面积2个方面进行研究。受配体各单体经G03在B3LYP/6-31G(d)水平上优化后,用CDOCKER将配体与受体对接,为每对复合物获得了一组最低能量的初始构象。将构成复合物的单体及每个复合物初始构象用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平进行几何构型优化。之后对收敛后的复合物最低能量构象及各单体作NBO分析。以受配体间的电荷转移量及配体带负电荷原子的溶剂可及表面积构建了表达复合物稳定性的2参数定量关系模型。该模型能准确地计算DBICP-AME复合物的结合常数,计算值与实验值间的相关系数高达0.997。最后对DBICP与AME间的相互作用进行讨论,揭示了一些共同作用特征。
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关键词
咪唑环芳
分子间相互作用
密度泛函理论
溶剂可及表面积
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职称材料
题名
二联咪唑环芳识别氨基酸甲酯的理论研究
1
作者
刘祥均
娄永峰
肖蓉
杨明理
向明礼
机构
四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室
出处
《成都工业学院学报》
2013年第1期7-10,13,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(批准号:20873088)
文摘
对二联咪唑环芳(DBICP)受体和氨基酸甲酯(AME)配体间的相互作用,重点从受配体间的电荷转移和配体溶剂可及表面积2个方面进行研究。受配体各单体经G03在B3LYP/6-31G(d)水平上优化后,用CDOCKER将配体与受体对接,为每对复合物获得了一组最低能量的初始构象。将构成复合物的单体及每个复合物初始构象用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平进行几何构型优化。之后对收敛后的复合物最低能量构象及各单体作NBO分析。以受配体间的电荷转移量及配体带负电荷原子的溶剂可及表面积构建了表达复合物稳定性的2参数定量关系模型。该模型能准确地计算DBICP-AME复合物的结合常数,计算值与实验值间的相关系数高达0.997。最后对DBICP与AME间的相互作用进行讨论,揭示了一些共同作用特征。
关键词
咪唑环芳
分子间相互作用
密度泛函理论
溶剂可及表面积
Keywords
imidazole
containing
cyclophane
intermolecular
interaction
density
functional
theory
solvent
accessible
surface
area
分类号
O621.1 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
二联咪唑环芳识别氨基酸甲酯的理论研究
刘祥均
娄永峰
肖蓉
杨明理
向明礼
《成都工业学院学报》
2013
0
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