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1株耐冷兼性嗜碱好氧反硝化菌的分离鉴定及反硝化特性 被引量：49
1
作者 王兆阳 陈国耀 +1 位作者 姜珂 许培雅 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第6期2341-2348,共8页
以传统微生物富集分离方法,从垃圾渗滤液活性污泥中筛选到1株高效好氧反硝化菌,通过形态观察、生理生化特征及16S rDNA序列分析,对菌株进行了鉴定,同时对其好氧反硝化特性和异养硝化功能进行了研究.结果表明,筛选到的好氧反硝化菌株为... 以传统微生物富集分离方法,从垃圾渗滤液活性污泥中筛选到1株高效好氧反硝化菌,通过形态观察、生理生化特征及16S rDNA序列分析,对菌株进行了鉴定,同时对其好氧反硝化特性和异养硝化功能进行了研究.结果表明,筛选到的好氧反硝化菌株为假单胞菌属(Pseudomonas sp.),命名为GL19,GenBank登录号为(KC710974).碳源、C/N、pH及温度对菌株反硝化活性影响较大.在柠檬酸钠为碳源、C/N不低于15、pH 6~10、溶解氧(DO)4.8~7.7 mg·L-1及温度为15~34℃,硝酸盐氮负荷为140 mg·L-1的条件下,硝酸盐去除率均达100%,总氮(TN)平均去除率为96.5%,最终无亚硝酸盐积累;菌株能以亚硝酸盐氮、氨氮为底物进行高效脱氮,20 h内可将140 mg·L-1的亚硝酸盐氮完全去除,28 h内可将280 mg·L-1的氨氮降至3.11 mg·L-1,氨氮去除率达98.9%.显示该菌具有耐冷、高效脱氮特性,可实现同步硝化反硝化,这对南方地区冬季废水处理具有潜在应用价值. 展开更多
关键词 耐冷兼性嗜碱菌 好氧反硝化菌 鉴定 16S rdna序列 反硝化特性
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一株拮抗辣椒疫霉的假单胞菌的分离与鉴定 被引量：32
2
作者 何延静 刘海明 +3 位作者 胡洪波 许煜泉 张雪洪 蒋海霞 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期516-521,共6页
从甜椒根际土壤中分离到一株对辣椒疫霉(Phytophthora capsici)具有强拮抗作用的假单胞属(Pseudomonasspp.)菌株GP72,研究其拮抗性表明,对多种植物病原真菌均有很强的抑制作用。对该菌株进行形态特征、生理生化、Biolog GN、(G+C)mol%... 从甜椒根际土壤中分离到一株对辣椒疫霉(Phytophthora capsici)具有强拮抗作用的假单胞属(Pseudomonasspp.)菌株GP72,研究其拮抗性表明,对多种植物病原真菌均有很强的抑制作用。对该菌株进行形态特征、生理生化、Biolog GN、(G+C)mol%含量测定及16S rDNA序列分析,鉴定为绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)。特征为单细胞,极生单个鞭毛,不能利用聚β-羟基丁酸盐,能够较强地利用Biolog系统95种碳源中的45种作为底物生长,较弱利用其中的6种底物,与绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)的相似性达到98%,相似指数为0.72。用热解链方法测得基因组DNA的(G+C)mol%含量为65.1mol%。以16S rDNA序列为基础构建了包括13株邻近种属细菌在内的系统发育树,其中与模式致金色假单胞菌的同源性最近。 展开更多
关键词 绿针假单胞菌 GP72 鉴定 BIOLOG GN 16S rdna
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细菌P-FS08的鉴定及其对几种植物病原真菌的拮抗作用 被引量：22
3
作者 石志琦 胡梁斌 +2 位作者 于淑池 徐朗莱 范永坚 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期48-52,共5页
从油菜茎秆内油菜菌核病菌(Sclerotiniasclerotiorum)菌核上分离得到拮抗菌P FS08,根据其形态特征和生理生化特性以及该细菌的16SrDNA部分序列的进化树分析,鉴定其为多粘芽孢杆菌(Paenibacilluspolymyxa)。经平皿测试表明,多粘芽孢杆菌P... 从油菜茎秆内油菜菌核病菌(Sclerotiniasclerotiorum)菌核上分离得到拮抗菌P FS08,根据其形态特征和生理生化特性以及该细菌的16SrDNA部分序列的进化树分析,鉴定其为多粘芽孢杆菌(Paenibacilluspolymyxa)。经平皿测试表明,多粘芽孢杆菌P FS08菌株及其无菌滤液对烟草赤星病菌(Alternariaalternata)、小麦赤霉病菌(Fusariumgraminea rum)等多种植物病原真菌均有抑制作用。P FS08培养液通过70%硫酸铵沉淀得到具有拮抗活性的蛋白粗提液,其具有良好的热稳定性;对蛋白酶K和胃蛋白酶均不敏感;能够使小麦赤霉病菌菌丝断裂,原生质浓缩。 展开更多
关键词 细菌鉴定 多粘芽孢杆菌 16S rdna 病原真菌 拮抗作用
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养殖大菱鲆的爱德华氏菌病 被引量：26
4
作者 王印庚 秦蕾 +2 位作者 张正 马爱军 张立敬 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期487-495,共9页
2004年5月至2005年9月间,先后对潍坊、烟台、威海和青岛等沿海区域养殖的大菱鲆自然发生的6宗爱德华氏菌感染病例进行了流行病学、病原分离鉴定和组织病理学等方面的调查研究。根据分离菌株的形态、生理生化特性,并结合16S rDNA序列分析... 2004年5月至2005年9月间,先后对潍坊、烟台、威海和青岛等沿海区域养殖的大菱鲆自然发生的6宗爱德华氏菌感染病例进行了流行病学、病原分离鉴定和组织病理学等方面的调查研究。根据分离菌株的形态、生理生化特性,并结合16S rDNA序列分析,将其鉴定为迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)。人工感染实验证实该菌为大菱鲆爱德华氏菌病的致病菌。大菱鲆迟钝爱德华氏菌病具有急性和慢性两种感染形式。迟钝爱德华氏菌感染可引起大菱鲆肾脏、脾脏、肝脏、肠、鳃、皮肤等器官组织发生不同程度的病理变化,其显著特点是单核巨噬细胞增生,使得各器官组织出现巨噬细胞浸润现象。病鱼的组织病理变化以肾脏最为明显,包括巨噬细胞大量增生,多发性局灶坏死伴有渗出性炎症反应以及肉芽肿的产生;肾脏外观则显示异常膨大,正常组织转变为白色脓疡或豆腐渣状。本文属国内首次报道爱德华氏菌感染大菱鲆致病,为该鱼类的健康养殖和疾病防治提供参考和依据。 展开更多
关键词 大菱鲆 迟钝爱德华氏菌 细菌鉴定 组织病理学 16S rdna
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高效石油烃降解菌的分离鉴定及降解特性 被引量：27
5
作者 李慧 陈冠雄 +3 位作者 张颖 徐慧 金寰宇 张成刚 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1664-1669,共6页
为获得更为丰富的石油降解微生物资源,从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度柴油胁迫土壤中筛选出了4株高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.这4株菌总石油烃（Total petroleum hydrocarbon/TPH）生物降解率为67.4%～73.... 为获得更为丰富的石油降解微生物资源,从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度柴油胁迫土壤中筛选出了4株高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.这4株菌总石油烃（Total petroleum hydrocarbon/TPH）生物降解率为67.4%～73.6%.经过16项生理生化特性实验和16S rDNA序列分析鉴定,SF-433,SF-428,SF-422和SYS-1分别为蜡状芽孢杆菌（Bacillus cereus）,木糖氧化无色杆菌（Achromobacter xylosoxidans）,施氏假单胞菌（Pseudomonas stutzeri）和洋葱伯克霍尔德氏菌（Burkholderia cepacia）.纯烃降解定性实验表明所筛选出的4株高效降解菌均能够利用正十六烷、苯、菲和环己烷为唯一碳源生长,其中菌株SF-428和SYS-1显示了对芳烃及环烷烃较强的利用能力. 展开更多
关键词 石油烃降解菌 分离鉴定 生物降解 16S rdna
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ε-聚赖氨酸生产菌株的筛选和鉴定 被引量：25
6
作者 朱宏阳 徐虹 +1 位作者 吴群 陈玮玮 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期127-130,共4页
建立了一种灵敏的ε-PL产生菌高通量的筛选方法。在分离培养基中加入150mg/LK2Cr2O7,以有利于放线菌的富集分离;并添加美蓝染料,利用产碱菌株碱性分泌物和美蓝之间的静电作用而形成独特的透明圈,从而灵敏地筛选得到产碱菌株;利用Dragend... 建立了一种灵敏的ε-PL产生菌高通量的筛选方法。在分离培养基中加入150mg/LK2Cr2O7,以有利于放线菌的富集分离;并添加美蓝染料,利用产碱菌株碱性分泌物和美蓝之间的静电作用而形成独特的透明圈,从而灵敏地筛选得到产碱菌株;利用Dragendorff试剂与生物碱特有的颜色反应从产碱菌株中检出得到46株生物碱产生株;最后对产生物碱的菌株的发酵液进行ε-PL含量分析,确定4株ε-PL产生菌株。对其中一株ε-PL高产菌PL6-3菌株进行形态、生理生化和16SrDNA分析,结果表明PL6-3为北里孢菌属(Kita-satospora)。 展开更多
关键词 菌株筛选 鉴定 Ε-聚赖氨酸 北里孢菌 16S rdna
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白菜黑斑病拮抗细菌Bacillus velezensis DL-59的筛选鉴定及田间防效实验 被引量：26
7
作者 杜淑涛 李术娜 朱宝成 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期51-56,共6页
以白菜黑斑病致病菌芸薹链格孢为测试菌,采用改良的琼脂平板扩散的筛选方法,从土壤中筛选出一株拮抗活性较高的产芽孢细菌。通过对其进行形态观察、生理生化特征和16S rDNA序列分析,鉴定其种属,同时通过室内、田间防治实验测定其防治效... 以白菜黑斑病致病菌芸薹链格孢为测试菌,采用改良的琼脂平板扩散的筛选方法,从土壤中筛选出一株拮抗活性较高的产芽孢细菌。通过对其进行形态观察、生理生化特征和16S rDNA序列分析,鉴定其种属,同时通过室内、田间防治实验测定其防治效果。结果表明:从土壤中分离到200株细菌,初筛获得具有拮抗作用的菌株20株,经过复筛获得一株具有较高拮抗活性的产芽孢细菌DL-59。该菌株的抑菌圈直径达到23 mm。鉴定该菌株为Bacillus velezensis。田间防治实验DL-59菌剂的病指防效达到79.07%,对白菜黑斑病具有一定的防治作用。此菌株为芽孢杆菌,芽孢对菌剂的仓储期具有重要意义。 展开更多
关键词 拮抗细菌 筛选 鉴定 16S rdna 防治效果
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1株军曹鱼病原弧菌的鉴定及其系统发育树分析 被引量：19
8
作者 郭明元 刘广锋 冯娟 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期823-828,共6页
从养殖的患病军曹鱼身上分离出1株病原菌JT2,革兰氏阴性,短杆状,有极生鞭毛,能运动,菌落半透明。经回归感染实验,证明该菌为军曹鱼病原菌。进行了常规生理生化实验,并用API-ID32E系统鉴定该菌。再经Biolog-GN细菌鉴定系统鉴定,结果JT2... 从养殖的患病军曹鱼身上分离出1株病原菌JT2,革兰氏阴性,短杆状,有极生鞭毛,能运动,菌落半透明。经回归感染实验,证明该菌为军曹鱼病原菌。进行了常规生理生化实验,并用API-ID32E系统鉴定该菌。再经Biolog-GN细菌鉴定系统鉴定,结果JT2与鲨鱼弧菌(Vibrio carchariae)相似度最高。为了进一步确定该菌的分类学地位,测定了其16SrDNA序列,分析了相关细菌的同源性,构建其系统发育树。结果表明,该菌株与V.carchariae的亲缘关系最近。综合上述几种方法的鉴定结果,最后鉴定该株菌为鲨鱼弧菌V.carchariae。 展开更多
关键词 军曹鱼 细菌鉴定 鲨鱼弧菌 16S rdna 系统发育
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半夏细菌性软腐病原菌的分离及鉴定 被引量：24
9
作者 何煜波 胡秀芳 +3 位作者 陈海敏 陈集双 高必达 应飞翔 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期337-342,共6页
在浙江省人工栽培的半夏[Pinellia ternata（Thunb．）Breit．]上发现一种新的软腐病害，软腐症状常常表现在块茎上，高温高湿条件可导致叶面腐烂和整株死亡。为了对病原菌进行鉴定，从软腐的半夏病株块茎中分离到10个菌株，分别指定为... 在浙江省人工栽培的半夏[Pinellia ternata（Thunb．）Breit．]上发现一种新的软腐病害，软腐症状常常表现在块茎上，高温高湿条件可导致叶面腐烂和整株死亡。为了对病原菌进行鉴定，从软腐的半夏病株块茎中分离到10个菌株，分别指定为RF1～RF10，并进行了致病性测定、形态观察和细菌学特性分析，同时对RF1菌株进行了分子鉴定。结果表明，10个菌株均可经人工接种导致半夏、胡萝卜、马铃薯、番茄、黄瓜和白菜软腐。在电镜下菌体呈短杆状，两端钝圆，具有4～6根周生鞭毛。兼性厌氧、革兰氏阴性，DNA中G＋Cmol％为51。RF1菌株的16S rDNA测序和系统发育学分析表明，其与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜软腐亚种（Pectobacterium carotovorum subsp．carotovorum）M1菌株报告的序列相同点为99％，与该亚种另2个菌株（E161和441）的序列相同点达97％。结果表明，半夏软腐病原菌应归属于胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜软腐亚种。 展开更多
关键词 半夏 软腐病 果胶杆菌属 鉴定 16S rdna
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纤维素分解菌BSX5的分离、鉴定及产酶条件 被引量：18
10
作者 朱军莉 韩剑众 励建荣 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期15-18,共4页
利用透明圈法从袋装降解的笋干中分离到一株分解纤维素的细菌菌株. 该菌株呈长杆状、革兰氏染色为阳性、产芽孢,命名为BSX5.其生理生化特征和16S rDNA序列同源性分析,发现该菌株与Bacillus subtilis的同源性为99%,系统发育树分析与Bacil... 利用透明圈法从袋装降解的笋干中分离到一株分解纤维素的细菌菌株. 该菌株呈长杆状、革兰氏染色为阳性、产芽孢,命名为BSX5.其生理生化特征和16S rDNA序列同源性分析,发现该菌株与Bacillus subtilis的同源性为99%,系统发育树分析与Bacillus subtilis遗传关系最近,确定该菌株为Bacillus subtilis. 采用以3,5-二硝基水杨酸（DNS）为显色剂、羧甲基纤维素钠（CMC-Na）为底物,测定不同培养条件下BSX5菌株的酶活力,结果最适产酶时间为8-12 h,最适产酶温度为50 ℃,最适产酶pH值为5.5～6.5. 展开更多
关键词 纤维素酶 分离 鉴定 16S rdna 酶活
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天祝放牧牦牛生活环境土壤中一株产凝乳酶细菌的分离与鉴定 被引量：22
11
作者 宋曦 甘伯中 +3 位作者 贺晓玲 张卫兵 李帆 刘兴龙 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第11期158-162,共5页
筛选高产凝乳酶细菌,并对其进行鉴定和产凝乳酶活力测定。利用酪蛋白培养基从天祝放牧牦牛生活环境土壤中筛选高产凝乳酶细菌,利用形态观察、生理生化检测、16SrDNA序列分析对其进行鉴定,并采用Arima法和福林法分别测定凝乳酶活力和蛋... 筛选高产凝乳酶细菌,并对其进行鉴定和产凝乳酶活力测定。利用酪蛋白培养基从天祝放牧牦牛生活环境土壤中筛选高产凝乳酶细菌,利用形态观察、生理生化检测、16SrDNA序列分析对其进行鉴定,并采用Arima法和福林法分别测定凝乳酶活力和蛋白水解活力。获得18株产凝乳酶细菌,其中菌株D3.11产凝乳酶活力相对最高,鉴定为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis),其在麸皮培养基中发酵72h产凝乳酶活力高达89.56SU/ml,蛋白水解力为21.27U/ml。菌株D3.11是一株高产凝乳酶细菌,可作为候选菌株进行进一步研究。 展开更多
关键词 凝乳酶 细菌 分离鉴定 16S rdna 地衣芽孢杆菌
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2株抗枯萎病尖镰孢菌内生细菌菌株的分离及鉴定 被引量：18
12
作者 徐雪莲 代鹏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期483-486,共4页
华南地区因尖镰孢菌引起的枯萎病发生较为严重,特别是近年来发现的香蕉枯萎病,对香蕉产业来说更是毁灭性的病害。分离、筛选有拮抗活性的内生细菌是防治枯萎病的有效措施之一。从海南红树林健康叶片中分离到102株非致病性内生细菌菌株,... 华南地区因尖镰孢菌引起的枯萎病发生较为严重,特别是近年来发现的香蕉枯萎病,对香蕉产业来说更是毁灭性的病害。分离、筛选有拮抗活性的内生细菌是防治枯萎病的有效措施之一。从海南红树林健康叶片中分离到102株非致病性内生细菌菌株,通过室内抗菌活性的测定,得到了2株对枯萎病尖镰孢菌具有明显抑制作用的拮抗菌株。通过对它进行形态、生理生化特性及16SrDNA序列等方面的研究,确定其中1株为枯草芽孢杆菌Bacillussubtilis,命名为BS-009;另一株确定为新发表种Bacillus Mojavensis的一个相似种,命名为BM-027。 展开更多
关键词 内生细菌 鉴定 芽孢杆菌 16Srdna
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利用16S r DNA序列分析和Biolog快速鉴定方法鉴定产脂肪酶菌株 被引量：22
13
作者 张朝正 郭兰珍 《河北工业大学学报》 CAS 北大核心 2009年第5期52-55,共4页
采用16S r DNA序列分析和Biolog快速鉴定两种方法对分离得到的7株产脂肪酶菌株进行了分类鉴定.16S r DNA序列分析结果表明,7株产脂肪酶菌株中TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170、TCCC 11180、TCCC 11181属于不动杆菌属,株TCCC 11092、... 采用16S r DNA序列分析和Biolog快速鉴定两种方法对分离得到的7株产脂肪酶菌株进行了分类鉴定.16S r DNA序列分析结果表明,7株产脂肪酶菌株中TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170、TCCC 11180、TCCC 11181属于不动杆菌属,株TCCC 11092、TCCC 11168属于假单胞菌属.Biolog快速鉴定结果显示,TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170、TCCC 11180、TCCC 11181属于溶血不动杆菌,TCCC 11092属于假单胞菌属,TCCC 11168属于荧光假单胞菌.说明两种鉴定方法得到的结果一致,但16S r DNA序列分析方法只能鉴定到属,而Biolog快速鉴定方法能对多数菌株鉴定到种. 展开更多
关键词 脂肪酶 菌种鉴定 16S r DNA BIOLOG
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16SrDNA序列分析在嗜尸性蝇类鉴定中的应用 被引量：13
14
作者 孙晓明 蔡继峰 +5 位作者 应斌武 方月琴 云利兵 袁万安 高山 侯一平 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第1期36-38,共3页
目的通过mtDNA上16SrDNA中551bp基因序列分析,解决依据COI和COII上278bp和635bp基因序列难以鉴别丝光绿蝇、铜绿蝇种类的难题,为法医学嗜尸性苍蝇种类的鉴别提供依据。方法随机采集放置在呼和浩特及成都地区室外草地家兔尸体上的铜绿蝇... 目的通过mtDNA上16SrDNA中551bp基因序列分析,解决依据COI和COII上278bp和635bp基因序列难以鉴别丝光绿蝇、铜绿蝇种类的难题,为法医学嗜尸性苍蝇种类的鉴别提供依据。方法随机采集放置在呼和浩特及成都地区室外草地家兔尸体上的铜绿蝇和丝光绿蝇,对其mtDNA上16SrDNA中551bp基因序列进行分析、比对,构建系统发育树。结果通过对嗜尸性蝇类mtDNA上16SrDNA的551bp基因序列分析可以对丝光绿蝇和铜绿蝇进行鉴别。结论16SrDNA上551bp基因序列分析是对嗜尸性蝇类(尤其是铜绿蝇和丝光绿蝇)进行种类鉴定的有效方法,是对依据COⅠ和COⅡ序列分析方法鉴别嗜尸性苍蝇种类的重要补充。 展开更多
关键词 嗜尸性蝇类 种类鉴定 线粒体 16S rdna 法医学
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变质豆浆中腐败微生物的分离与初步鉴定 被引量：21
15
作者 汪立平 张庆华 +3 位作者 赵勇 陈有容 齐凤兰 张闻 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期621-624,共4页
从5种变质豆浆中分离得到3株腐败菌株S1、S2和S3。3株菌均能在1×10^5Pa、30min杀菌条件下和添加300mg/kgNisin杀菌条件下存活。对分离菌株进行了菌落形态、生理生化特征和16SrDNA序列分析,鉴定结果表明3株菌均为革兰氏阴性细菌,分... 从5种变质豆浆中分离得到3株腐败菌株S1、S2和S3。3株菌均能在1×10^5Pa、30min杀菌条件下和添加300mg/kgNisin杀菌条件下存活。对分离菌株进行了菌落形态、生理生化特征和16SrDNA序列分析,鉴定结果表明3株菌均为革兰氏阴性细菌,分别为地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis）、短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus）和短芽孢杆菌（Brevibacillus borstelensis）,GenBank登录号为EF439666-EF439668。 展开更多
关键词 豆浆 腐败微生物 分离 鉴定 生理生化特征 16S rdna
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双酚A降解菌的分离鉴定及其降解特性 被引量：16
16
作者 袁理 曾光明 +2 位作者 张长 余健 徐建明 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第10期2095-2099,共5页
从好氧堆肥反应器的渗滤液中分离到1株降解内分泌干扰物双酚A的细菌B-16.经过对其形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,该菌株初步鉴定为Achromobacter xylosoxidans.通过摇瓶实验考察了生长条件对双酚A降解的影响,得出该菌株降解双... 从好氧堆肥反应器的渗滤液中分离到1株降解内分泌干扰物双酚A的细菌B-16.经过对其形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,该菌株初步鉴定为Achromobacter xylosoxidans.通过摇瓶实验考察了生长条件对双酚A降解的影响,得出该菌株降解双酚A的最佳条件是接种量为0.6%,初始pH值为7.0,温度为30℃.在该条件下,对菌株B-16对不同初始浓度双酚A的降解反应过程进行动力学分析,该降解反应在低浓度(3、5、10mg/L)时符合一级反应动力学特征,而在较高底物浓度(20 mg/L5、0 mg/L)下不能用一级反应动力学描述,双酚A的降解率在初始浓度为10 mg/L时达到最大值46.93%. 展开更多
关键词 双酚A 生物降解 降解菌鉴定 16S rdna
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桃蚜自然种群初级和次级共生菌的分子鉴定 被引量：16
17
作者 李正西 李定旭 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期810-814,共5页
蚜虫不仅带有专性初级内共生菌,还常常带有不同类群的兼性次级共生菌.本研究采用真细菌16S rDNA的通用引物,从桃蚜Myzus persicae(Sulzer)烟草种群体内扩增出1.5kb的共迁移目的条带,然后将其克隆,并在阳性克隆筛选时进行了RFLP分析.当采... 蚜虫不仅带有专性初级内共生菌,还常常带有不同类群的兼性次级共生菌.本研究采用真细菌16S rDNA的通用引物,从桃蚜Myzus persicae(Sulzer)烟草种群体内扩增出1.5kb的共迁移目的条带,然后将其克隆,并在阳性克隆筛选时进行了RFLP分析.当采用EcoRⅠ进行单酶切分析时,目的片段被切割成～650 bp和～850 bp两个小片段;当采用EcoRⅠ和HindⅢ进行双酶切分析时,该蚜群共生菌酶切谱带被分成2组,其中1组(Group Ⅰ)只具有一个EcoRⅠ酶切位点,而另1组(GroupⅡ)不仅具有一个EcoRⅠ酶切位点,还具有一个HindⅢ酶切位点,而且Group Ⅰ为优势共生菌群.在此基础上分别对2组共生菌的16S rDNA全序列(～1.5kb)进行了测定,结果表明:GroupⅠ属于泛菌属Pantoea,与成团泛菌Pantoea agglomerans亲缘关系最近(同源性达99.70%),而GroupⅡ属于蚜虫的专性内共生菌,即Buchnera aphidicola(同源性达99.50%).这是在蚜虫体内存在泛菌次级共生菌的首次报道. 展开更多
关键词 桃蚜 共生菌 BUCHNERA aphidicola 泛菌 分子鉴定 16S rdna
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16S rDNA序列分析法快速鉴定西藏地区传统乳制品中的乳酸菌 被引量：20
18
作者 夏雪娟 陈芝兰 +2 位作者 陈宗道 阚建全 杨吉霞 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第14期245-249,共5页
对14株乳酸菌进行菌种鉴定。提取基因组DNA,采用属特异性聚合酶链式反应(PCR)、16S rDNA序列同源性分析、种特异性PCR与NEBcutter分析相结合的方法对乳酸菌进行鉴定。结果表明,14株菌中,除123-2和23-3外,其余12株菌均属于乳杆菌属;11-2... 对14株乳酸菌进行菌种鉴定。提取基因组DNA,采用属特异性聚合酶链式反应(PCR)、16S rDNA序列同源性分析、种特异性PCR与NEBcutter分析相结合的方法对乳酸菌进行鉴定。结果表明,14株菌中,除123-2和23-3外,其余12株菌均属于乳杆菌属;11-2、13-3、14-3、16-4、23-3、24-3、26-1、122-1、123-4为干酪乳杆菌或副干酪乳杆菌,17-5、20-2、28-1属于植物乳杆菌,123-2为肠膜状明串株菌,125-2为类布氏乳杆菌,除23-3外均与属特异性PCR结果相匹配;11-2、13-3、14-3、16-4、23-3、24-3、26-1、122-1、123-4均为副干酪乳杆菌。NEBcutter分析结果进一步验证了菌株划分的准确性。该方法快速可靠,且误差较小。 展开更多
关键词 乳酸菌 鉴定 属特异性聚合酶链式反应 16Srdna 种特异性聚合酶链式反应 NEBcutter
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高效生物除铁除锰工程菌MSB-4的特性研究 被引量：17
19
作者 赵焱 李冬 +2 位作者 李相昆 吴小莉 张杰 《中国给水排水》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期40-44,共5页
采用贫营养培养基，从运行多年的生物除铁除锰水厂的跌水曝气池壁上筛选获得了生物除铁除锰菌种MSB-4。16SrDNA的测序表明，菌株MSB-4为金黄杆菌属，同源性为99％。MSB-4是具有除铁除锰功能的好氧菌，具有异染颗粒、类脂粒，易形成菌胶... 采用贫营养培养基，从运行多年的生物除铁除锰水厂的跌水曝气池壁上筛选获得了生物除铁除锰菌种MSB-4。16SrDNA的测序表明，菌株MSB-4为金黄杆菌属，同源性为99％。MSB-4是具有除铁除锰功能的好氧菌，具有异染颗粒、类脂粒，易形成菌胶团。除锰最适温度为8—12℃，最适pH值为8，少量的Fe^2＋对Mn^2＋的去除具有明显的促进作用。在模拟高锰高铁地下水环境（即水温为12℃，pH值为7．5，Mn^2＋和Fe^2＋的初始浓度分别为5．6mg／L和14mg／L）中，菌株MSB-4于48h内对Mn^2＋的去除率达94．44％，对Fe^2＋的去除率达90％。该工程菌株的获得将为高效生物除锰滤池的构建，及生物除铁除锰水厂的快速启动提供有力的技术支持。 展开更多
关键词 生物除锰 生物除铁 高效工程菌 分离鉴定 16S rdna
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冬季刺参养殖环境与肠道内细菌菌群的研究 被引量：19
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作者 李彬 荣小军 +4 位作者 廖梅杰 陈贵平 张正 王印庚 薛太山 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期64-69,共6页
运用传统细菌分离培养与分子生物学技术相结合的方法,对2008年11月至2009年1月冬季刺参(Apostichopus japonicus Liao)养殖池塘环境(养殖水、底泥、附着基)及刺参肠道内的细菌菌群进行了分析。应用平板稀释涂布培养计数法测得刺参养殖... 运用传统细菌分离培养与分子生物学技术相结合的方法,对2008年11月至2009年1月冬季刺参(Apostichopus japonicus Liao)养殖池塘环境(养殖水、底泥、附着基)及刺参肠道内的细菌菌群进行了分析。应用平板稀释涂布培养计数法测得刺参养殖池塘水体、底泥、附着基和肠道细菌数量分别为0.75×102～1.4×104cfu/mL、8.7×104～8.1×105cfu/g、3.8×105～2.8×106cfu/g、7.1×105～1.5×107cfu/g;根据形态学差异从培养所得的细菌中筛选得到22株菌,用限制性内切酶Rsa I和Msp I对所分离菌株进行ARDRA(Amplified rDNA Restriction Analysis)分析,这22株菌被分为8种不同的分类单元(Operational Taxonomic Unit,OTU),其中OTU2与OTU3所包含的菌株分别占分离菌株种数的30%和20%;此外,作者对不同环境培养所得的优势度最高的细菌进行分子鉴定分析。结果表明:水环境中优势菌为施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)、门多萨假单胞菌(Pseudomonas mendocina)及巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium),沉积物中优势菌为巨大芽孢杆菌(B.megaterium)、施氏假单胞菌(P.stutzeri)、苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis),附着基中优势菌为巨大芽孢杆菌(B.megaterium)、苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis),灿烂弧菌(Vibrio splendidus),肠道中优势菌为巨大芽孢杆菌(B.megaterium)、苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis),灿烂弧菌(V.splendidus)、施氏假单胞菌(P.stutzeri)。通过对冬季刺参池塘细菌菌群多样性分析和优势菌鉴定,为筛选低温益生菌和防治刺参疾病提供了有益参考。 展开更多
关键词 刺参(Apostichopus JAPONICUS Liao) 肠道菌群 ARDRA 分子鉴定 16S rdna
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