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多肽中氢键强度的理论研究 被引量:12
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作者 王长生 齐学洁 +1 位作者 马英格 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2004年第6期1111-1114,共4页
用 B3 LYP/6-3 1 G* 方法优化了多肽分子的几何构型 ,计算了各个构型的电荷分布和氢键酸度 ,进而对多肽分子中的氢键强度进行了研究 .结果表明 ,多肽分子中氢键的强度同时取决于形成氢键的 H…O原子间距 R和 N—H… O之间的键角 β;多... 用 B3 LYP/6-3 1 G* 方法优化了多肽分子的几何构型 ,计算了各个构型的电荷分布和氢键酸度 ,进而对多肽分子中的氢键强度进行了研究 .结果表明 ,多肽分子中氢键的强度同时取决于形成氢键的 H…O原子间距 R和 N—H… O之间的键角 β;多肽分子倾向于形成 R值小、β值大的大环氢键 .3 1 0 螺旋结构的多肽分子中的氢键具有协同效应 ,分子越大 ,分子中氢键越多 ,氢键的协同效应越强 . 展开更多
关键词 氢键 氢键酸度 多肽 氢键的协同效应
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DFT和热力学研究氢键协同效应及对关联~1H NMR的影响 被引量:7
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作者 蓝蓉 李浩然 韩世钧 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第14期1288-1292,i002,共6页
用DFT方法在B3LYP/6-311++G(d,p)水平下研究了甲醇线性和环状分子簇.对于不同大小的分子簇之间定义了协同因子.计算得到的协同因子可以验证氢键的强协同效应,环状分子簇之间的协同效应远远大于线性分子簇.做为理论验证和比较,热力学模... 用DFT方法在B3LYP/6-311++G(d,p)水平下研究了甲醇线性和环状分子簇.对于不同大小的分子簇之间定义了协同因子.计算得到的协同因子可以验证氢键的强协同效应,环状分子簇之间的协同效应远远大于线性分子簇.做为理论验证和比较,热力学模型分别采用含氢键缔合的格子流体状态方程(LFHB),以及含氢键协同效应的LFHB,关联醇-惰性体系的1H核磁共振化学位移.考虑协同效应的关联结果优于原始的LFHB.比较量子化学计算的和热力学模型中采用的协同因子,认为甲醇和乙醇在溶液中更可能大部分以线性缔合形式存在. 展开更多
关键词 协同效应 ^1H 力学研究 对关联 NMR 热力学模型 量子化学计算 B3LYP DFT方法 分子簇 理论验证 状态方程 氢键缔合 化学位移 核磁共振 因子 线性 环状 甲醇 流体 格子 溶液
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取代基对1-甲基尿嘧啶与N-甲基乙酰胺氢键复合物中氢键强度的影响 被引量:5
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作者 刘冬佳 王长生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2809-2816,共8页
使用密度泛函理论B3LYP方法和二阶微扰理论MP2方法对由1-甲基尿嘧啶与N-甲基乙酰胺所形成的氢键复合物中的氢键强度进行了理论研究,探讨了不同取代基取代氢键受体分子1-甲基尿嘧啶中的氢原子对氢键强度的影响和氢键的协同性.研究表明:... 使用密度泛函理论B3LYP方法和二阶微扰理论MP2方法对由1-甲基尿嘧啶与N-甲基乙酰胺所形成的氢键复合物中的氢键强度进行了理论研究,探讨了不同取代基取代氢键受体分子1-甲基尿嘧啶中的氢原子对氢键强度的影响和氢键的协同性.研究表明:供电子取代基使N-H…O=C氢键键长r(H…O)缩短,氢键强度增强;吸电子取代基使N-H…O=C氢键键长r(H…O)伸长,氢键强度减弱.自然键轨道(NBO)分析表明:供电子基团使参与形成氢键的氢原子的正电荷增加,使氧原子的负电荷增加,使质子供体和受体分子间的电荷转移量增多;吸电子基团则相反.供电子基团使N-H…O=C氢键中氧原子的孤对电子轨道n(O)对N-H的反键轨道σ*(N-H)的二阶相互作用稳定化能增强,吸电子基团使这种二阶相互作用稳定化能减弱.取代基对与其相近的N-H…O=C氢键影响更大. 展开更多
关键词 氢键复合物 取代基 氢键强度 自然键轨道分析 氢键协同性
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Evaluation of the individual hydrogen bonding energies in N-methylacetamide chains 被引量:1
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作者 XiaoNan Jiang ChangSheng Wang 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2010年第8期1754-1761,共8页
The individual hydrogen bonding energies in N-methylacetamide chains were evaluated at the MP2/6-31+G** level including BSSE correction and at the B3LYP/6-311++G(3df,2pd) level including BSSE and van der Waals correct... The individual hydrogen bonding energies in N-methylacetamide chains were evaluated at the MP2/6-31+G** level including BSSE correction and at the B3LYP/6-311++G(3df,2pd) level including BSSE and van der Waals correction.The calculation results indicate that compared with MP2 results,B3LYP calculations without van der Waals correction underestimate the individual hydrogen bonding energies about 5.4 kJ m ol-1 for both the terminal and central hydrogen bonds,whereas B3LYP calculations with van der Waals correction produce almost the same individual hydrogen bonding energies as MP2 does for those terminal hydrogen bonds,but still underestimate the individual hydrogen bonding energies about 2.5 kJ mol-1 for the hydrogen bonds near the center.Our calculation results show that the individual hydrogen bonding energy becomes more negative (more attractive) as the chain becomes longer and that the hydrogen bonds close to the interior of the chain are stronger than those near the ends.The weakest individual hydrogen bonding energy is about-29.0 kJ m ol-1 found in the dimer,whereas with the growth of the N-methylacetamide chain the individual hydrogen bonding energy was estimated to be as large as-62.5 kJ mol-1 found in the N-methylacetamide decamer,showing that there is a significant hydrogen bond cooperative effect in N-methylacetamide chains.The natural bond orbital analysis indicates that a stronger hydrogen bond corresponds to a larger positive charge for the H atom and a larger negative charge for the O atom in the N-H···O=C bond,corresponds to a stronger second-order stabilization energy between the oxygen lone pair and the N-H antibonding orbital,and corresponds to more charge transfer between the hydrogen bonded donor and acceptor molecules. 展开更多
关键词 N-METHYLACETAMIDE chain the INDIVIDUAL hydrogen bonding energy hydrogen bond cooperativity
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(H_2O)_5环状异构体的氢键协同作用和相互作用能的多体效应 被引量:1
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作者 李文海 李亚平 杨作银 《北京化工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期23-29,共7页
在量子化学计算的基础上,采用一种简便的能量分解方案,讨论了(H2O)5四种环状异构体的稳定性、氢键协同作用、多体效应与水分子排布方式之间的关系。结果表明,虽然总相互作用能主要来自二体作用项的贡献,但异构体之间的稳定性的差异主要... 在量子化学计算的基础上,采用一种简便的能量分解方案,讨论了(H2O)5四种环状异构体的稳定性、氢键协同作用、多体效应与水分子排布方式之间的关系。结果表明,虽然总相互作用能主要来自二体作用项的贡献,但异构体之间的稳定性的差异主要由三体作用项决定;环形结构中,以da-da-da方式形成的三联体,其三体作用会增加总的相互作用,从而增强环结构的稳定性;将此推广到六元环中,发现亦存在这种关系,因此da-da-da三联体的数目可作为环稳定性的直观判据。 展开更多
关键词 五元环水合簇 异构体稳定性 分子取向 能量分解 多体相互作用 氢键协同性
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