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人NOD2蛋白的生物信息学分析
1
作者
刘颖
李萌萌
白莉
《生物技术》
CAS
2023年第3期301-304,共4页
[目的]对人NOD2蛋白进行生物信息学分析,预测其结构和功能,为儿童癫痫与肠道菌群之间的关系提供试验基础。[方法]利用生物信息学工具对人NOD2蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区域、空间结构、亚细胞定位、信号肽、磷酸化位点进行预测。...
[目的]对人NOD2蛋白进行生物信息学分析,预测其结构和功能,为儿童癫痫与肠道菌群之间的关系提供试验基础。[方法]利用生物信息学工具对人NOD2蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区域、空间结构、亚细胞定位、信号肽、磷酸化位点进行预测。[结果]人NOD2蛋白由1013个氨基酸残基组成,相对分子质量112530.04 Da,等电点为6.59,分子式为C_(5033)H_(7960)N_(1402)O_(1428)S_(49),带负电荷的残基总数(天冬氨酸+谷氨酸)103个,带正电荷的残基总数(精氨酸+赖氨酸)96个,蛋白不稳定系数为48.75,脂肪系数为101.46,总平均亲水性系数为0.008。二级结构由54.59%的α-螺旋、10.07%的延伸链、5.73%的β-转角、29.62%的无规卷曲构成。亚细胞被确认为定位在细胞膜、细胞质和线粒体中。[结论]人NOD2蛋白是一种不含信号肽和跨膜区的疏水性蛋白,具有激酶活性。该研究为探讨儿童癫痫与肠道菌群及炎症之间的关系提供了依据。
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关键词
人
nod
2
蛋白
儿童癫痫
肠道菌群
炎症
生物信息学分析
原文传递
NF-κB结合位点突变对人NOD2基因启动子调控的影响
被引量：
1
2
作者
孙丽萍
胡巢凤
《现代免疫学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期46-50,共5页
探讨NF-κB结合位点突变对人NOD2基因启动子调控的影响。采用PCR技术从人基因组DNA中扩增含有NF-κB结合位点的人NOD2基因启动子序列,并定向克隆入已切除启动子的表达载体pEGFP-N3中,构建含有NF-κB结合位点的人NOD2基因启动子驱动的绿...
探讨NF-κB结合位点突变对人NOD2基因启动子调控的影响。采用PCR技术从人基因组DNA中扩增含有NF-κB结合位点的人NOD2基因启动子序列,并定向克隆入已切除启动子的表达载体pEGFP-N3中,构建含有NF-κB结合位点的人NOD2基因启动子驱动的绿色荧光蛋白(green fluorescent proteins,GFP)载体pEGFP-N3-NOD2wt,并构建NF-κB结合位点2个碱基缺失突变的载体,将构建的重组质粒瞬时转染HEK293细胞,在倒置荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白的表达情况。结果显示重组质粒转染HEK293细胞后,在倒置荧光显微镜下均能看到绿色荧光,其中pEGFP-N3-NOD2wt重组质粒在HEK293细胞中荧光表达较强,而突变质粒mpEGFP-N3-NOD2荧光强度明显减弱。说明NF-κB结合位点是驱动NOD2基因转录的重要元件,且在NOD2基因启动子的调控中发挥了正调节作用,为进一步研究NOD2基因表达及调控机制提供了新的思路。
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关键词
人
nod
2
启动子
NF-κB结合位点
缺失突变
荧光表达
原文传递
题名
人NOD2蛋白的生物信息学分析
1
作者
刘颖
李萌萌
白莉
机构
南京医科大学康达学院病原生物学与免疫学教研室
出处
《生物技术》
CAS
2023年第3期301-304,共4页
基金
南京医科大学康达学院科研发展基金项目(KD2021KYJJZD108)。
文摘
[目的]对人NOD2蛋白进行生物信息学分析,预测其结构和功能,为儿童癫痫与肠道菌群之间的关系提供试验基础。[方法]利用生物信息学工具对人NOD2蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区域、空间结构、亚细胞定位、信号肽、磷酸化位点进行预测。[结果]人NOD2蛋白由1013个氨基酸残基组成,相对分子质量112530.04 Da,等电点为6.59,分子式为C_(5033)H_(7960)N_(1402)O_(1428)S_(49),带负电荷的残基总数(天冬氨酸+谷氨酸)103个,带正电荷的残基总数(精氨酸+赖氨酸)96个,蛋白不稳定系数为48.75,脂肪系数为101.46,总平均亲水性系数为0.008。二级结构由54.59%的α-螺旋、10.07%的延伸链、5.73%的β-转角、29.62%的无规卷曲构成。亚细胞被确认为定位在细胞膜、细胞质和线粒体中。[结论]人NOD2蛋白是一种不含信号肽和跨膜区的疏水性蛋白,具有激酶活性。该研究为探讨儿童癫痫与肠道菌群及炎症之间的关系提供了依据。
关键词
人
nod
2
蛋白
儿童癫痫
肠道菌群
炎症
生物信息学分析
Keywords
human
nod
2
epilepsy
in
children
intestinal
flora
inflammation
bioinformatic
analysis
分类号
R34 [医药卫生—基础医学]
Q39 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
NF-κB结合位点突变对人NOD2基因启动子调控的影响
被引量：
1
2
作者
孙丽萍
胡巢凤
机构
暨南大学医学院病理生理学教研室
出处
《现代免疫学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期46-50,共5页
基金
广东省自然科学基金资助项目(06025159)
广东省教育厅自然科学研究项目[粤财教(2005)126]
暨南大学重点实验室基金资助项目(2006)
文摘
探讨NF-κB结合位点突变对人NOD2基因启动子调控的影响。采用PCR技术从人基因组DNA中扩增含有NF-κB结合位点的人NOD2基因启动子序列,并定向克隆入已切除启动子的表达载体pEGFP-N3中,构建含有NF-κB结合位点的人NOD2基因启动子驱动的绿色荧光蛋白(green fluorescent proteins,GFP)载体pEGFP-N3-NOD2wt,并构建NF-κB结合位点2个碱基缺失突变的载体,将构建的重组质粒瞬时转染HEK293细胞,在倒置荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白的表达情况。结果显示重组质粒转染HEK293细胞后,在倒置荧光显微镜下均能看到绿色荧光,其中pEGFP-N3-NOD2wt重组质粒在HEK293细胞中荧光表达较强,而突变质粒mpEGFP-N3-NOD2荧光强度明显减弱。说明NF-κB结合位点是驱动NOD2基因转录的重要元件,且在NOD2基因启动子的调控中发挥了正调节作用,为进一步研究NOD2基因表达及调控机制提供了新的思路。
关键词
人
nod
2
启动子
NF-κB结合位点
缺失突变
荧光表达
Keywords
human
nod
2
promoter
regions
NF-κB
binding
site
deletion
mutation
fluorescence
expression
分类号
R730.23 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人NOD2蛋白的生物信息学分析
刘颖
李萌萌
白莉
《生物技术》
CAS
2023
0
原文传递
2
NF-κB结合位点突变对人NOD2基因启动子调控的影响
孙丽萍
胡巢凤
《现代免疫学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
原文传递
已选择
0
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参考文献
引证文献
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