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一种流感病毒多宿主传播的量化研究方法
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作者 罗楠 王辛 +6 位作者 孟人杰 王博千 靳远 岳俊杰 胡明达 陈微 任洪广 《军事医学》 CAS CSCD 2023年第11期829-834,共6页
目的探究甲型流感病毒宿主分布规律,量化评估其多宿主传播趋势。方法从流感病毒公共数据库中下载流感病毒全基因组数据,对编码序列进行特征提取,采用自然聚类结果对流感病毒进行宿主分布与进化态势分析,建立宿主谱熵值计算方法量化评估... 目的探究甲型流感病毒宿主分布规律,量化评估其多宿主传播趋势。方法从流感病毒公共数据库中下载流感病毒全基因组数据,对编码序列进行特征提取,采用自然聚类结果对流感病毒进行宿主分布与进化态势分析,建立宿主谱熵值计算方法量化评估流感病毒多宿主传播扩散趋势,并使用机器学习方法对分析结果进行验证。结果H3N2型流感病毒多宿主分布界限清晰,具有最低宿主谱熵值;H9N2型流感病毒多宿主分布混乱,不同宿主的毒株序列相似程度高,具有最高宿主谱熵值。不同类型甲型流感病毒的宿主谱熵值大小与多宿主传播扩散趋势紧密相关。结论受传播环境与选择压力的影响,不同流感病毒的进化方向与多宿主传播趋势呈现出较为明显的差异,较为适应人类宿主的H3N2流感病毒的多宿主传播趋势更有序,而频繁发生跨宿主传播的H7N9、H9N2等禽流感病毒的多宿主传播趋势更混乱,进化方向也更多样。宿主谱熵值是衡量流感病毒多宿主传播趋势与进化方向有序性的高效计算方法,利用该方法有助于了解流感病毒的进化与多宿主分布,评估传播风险,可为流感病毒的监测和预警提供新的见解。 展开更多
关键词 甲型流感病毒 宿主传播趋势 宿主谱熵值 病毒进化
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