目的采用网络药理学与分子对接方法探究银翘散“异病同治”小儿急性上呼吸道感染(acute upper respiratory infection in children,AURIC)及小儿病毒性心肌炎(viral myocarditis in children,VMC)的共同分子机制。方法利用TCMSP数据库及...目的采用网络药理学与分子对接方法探究银翘散“异病同治”小儿急性上呼吸道感染(acute upper respiratory infection in children,AURIC)及小儿病毒性心肌炎(viral myocarditis in children,VMC)的共同分子机制。方法利用TCMSP数据库及CNKI数据库筛选银翘散的活性成分及靶点;通过GeneCards数据库和OMIM数据库分别筛选AURIC和VMC的相关靶点,获取银翘散与AURIC、VMC三者的交集靶点;利用Cytoscape 3.9.1软件构建“银翘散—成分—靶点”网络,分析重点活性成分;使用STRING数据库通过构建交集靶点的PPI网络以分析核心靶点;使用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;利用Autodock Tools软件对核心靶点及主要成分进行分子对接。结果筛选出银翘散129个活性成分,264个作用靶点;银翘散与AURIC、VMC共119个交集靶点;银翘散—成分—靶点网络的构建得出槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、豆甾醇为排名前5的主要成分;PPI网络构建后得出STAT3、RELA、TNF、MAPK3、AKT1为排名前5的核心靶点;GO功能富集分析获得生物过程533条、细胞组成57条、分子功能94条,其中涉及基因表达的调控、凋亡过程的调控、激素的调控、代谢产物的调控、变老、对外来刺激的反应等生物过程,KEGG通路富集分析获得144条通路。分子对接结果显示,核心靶点与重点活性成分均具有良好的结合活性。结论银翘散主要通过STAT3、RELA、TNF、MAPK3、AKT1等靶点,槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、豆甾醇等主要活性成分和癌症信号通路、PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路、AGE/RAGE信号、IL-17信号通路及Toll样受体信号通路等途径对AURIC、VMC发挥“异病同治”作用。展开更多
目的应用网络药理学探究益心健脾方治疗冠心病及慢性心力衰竭的作用机制。方法借助中药系统药理学(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)数据库、中药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated databas...目的应用网络药理学探究益心健脾方治疗冠心病及慢性心力衰竭的作用机制。方法借助中药系统药理学(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)数据库、中药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)等结合文献资料筛选益心健脾方的活性成分靶标,应用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)等检索疾病靶标。STRING平台结合Cytoscape软件构建“药物-成分-靶标-疾病”网络图和蛋白互作网络。使用DAVID数据库等进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。关键成分与关键靶标利用AutoDuck工具进行分子对接。结果得到益心健脾方潜在靶点265个,其“异病同治”的共同靶点106个;关键活性成分为槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等,核心靶点分别是SRC、AKT1、MAPK1、TP53等;生物过程涉及基因表达的正调控、凋亡过程的负调控、信号转导等方式,参与脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化及炎症反应等途径;分子对接验证关键成分槲皮素、山奈酚与SRC、AKT1、MAPK1靶点稳定对接。结论本研究揭示益心健脾方“异病同治”冠心病和慢性心力衰竭多成分、多靶点、多通路的作用机制,为探索其新的临床应用提供依据。展开更多
文摘目的应用网络药理学探究益心健脾方治疗冠心病及慢性心力衰竭的作用机制。方法借助中药系统药理学(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)数据库、中药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)等结合文献资料筛选益心健脾方的活性成分靶标,应用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)等检索疾病靶标。STRING平台结合Cytoscape软件构建“药物-成分-靶标-疾病”网络图和蛋白互作网络。使用DAVID数据库等进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。关键成分与关键靶标利用AutoDuck工具进行分子对接。结果得到益心健脾方潜在靶点265个,其“异病同治”的共同靶点106个;关键活性成分为槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等,核心靶点分别是SRC、AKT1、MAPK1、TP53等;生物过程涉及基因表达的正调控、凋亡过程的负调控、信号转导等方式,参与脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化及炎症反应等途径;分子对接验证关键成分槲皮素、山奈酚与SRC、AKT1、MAPK1靶点稳定对接。结论本研究揭示益心健脾方“异病同治”冠心病和慢性心力衰竭多成分、多靶点、多通路的作用机制,为探索其新的临床应用提供依据。
