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苦瓜枯萎病菌Ⅱ型卤酸脱卤酶基因FoHAD-typeⅡ功能分析
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作者 张园园 文才艺 +4 位作者 李凤新 魏晨星 杜红岩 仲荣荣 赵莹 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期195-206,共12页
苦瓜枯萎病是由尖孢镰刀菌苦瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.momordicae Sun&Huang)侵染引起的一种严重制约苦瓜安全生产的土传病害。明确苦瓜枯萎病菌的致病机理对苦瓜枯萎病的防治具有重要的指导意义,但目前苦瓜枯萎病菌的致... 苦瓜枯萎病是由尖孢镰刀菌苦瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.momordicae Sun&Huang)侵染引起的一种严重制约苦瓜安全生产的土传病害。明确苦瓜枯萎病菌的致病机理对苦瓜枯萎病的防治具有重要的指导意义,但目前苦瓜枯萎病菌的致病机理尚不明确。前期分析苦瓜枯萎病菌强致病力菌株SD-1和弱致病力菌株SD-V(携带真菌病毒)转录组差异表达基因时,发现Ⅱ型卤酸脱卤酶(FoHAD-typeⅡ)基因在SD-V菌株中表达量显著下调,推测该基因与苦瓜枯萎病菌的致病性相关。本研究根据同源重组的原理,利用分割标记法(Split-Marker PCR)获得了FoHAD-typeⅡ基因的融合片段,分别通过PEG介导的原生质体转化和农杆菌介导的遗传转化获得该基因的敲除突变体和回补突变体,并对敲除和回补突变体的生物学特性和致病力进行了分析。结果表明,敲除突变体的生长速率和产孢量与野生型菌株相比没有显著差异,菌丝尖端形态和孢子形态也无明显差异,但气生菌丝减少,对渗透胁迫耐受性降低,致病力显著下降;回补突变体的生物学性状和致病力与野生型菌株一致。表明FoHAD-typeⅡ基因在苦瓜枯萎病菌的致病过程中发挥重要作用,但不参与苦瓜枯萎病菌生长和发育的调控。研究结果为后续探究苦瓜枯萎病菌的致病机制提供理论基础,同时,为研究真菌病毒的弱毒机理提供参考。 展开更多
关键词 苦瓜枯萎病菌 卤酸脱卤酶 基因功能 致病力
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水稻抗旱相关基因OsDR1的克隆、鉴定及表达分析
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作者 周立国 刘灶长 +4 位作者 孔德艳 徐凯 夏辉 吴金红 罗利军 《上海农业学报》 2022年第4期76-83,共8页
根据基因表达谱芯片结果,在陆稻品种‘IRAT109’中筛选到抗旱相关基因OsDR1,利用5’-RACE和3’-RACE方法,克隆OsDR1基因的全长cDNA序列,明确基因的转录起始和终止位点。结果显示:OsDR1基因编码的蛋白是卤酸脱卤素酶,具体分子功能未知。q... 根据基因表达谱芯片结果,在陆稻品种‘IRAT109’中筛选到抗旱相关基因OsDR1,利用5’-RACE和3’-RACE方法,克隆OsDR1基因的全长cDNA序列,明确基因的转录起始和终止位点。结果显示:OsDR1基因编码的蛋白是卤酸脱卤素酶,具体分子功能未知。qPCR定量表达分析结果表明,OsDR1基因受低温、盐、PEG模拟干旱等多种逆境诱导表达;在叶片中表达受光照诱导和调节,并且在24 h光周期内呈节律性变化。 展开更多
关键词 节水抗旱稻 OsDR1基因 卤酸脱卤素酶 抗旱性
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Purification and Characterization of 2-Haloacid Dehalogenase from Marine Bacterium Paracoccus sp. DEH99, Isolated from Marine Sponge Hymeniacidon perlevis 被引量:2
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作者 ZHANG Jinyou XIN Yanjuan +2 位作者 CAO Xupeng XUE Song ZHANG Wei 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2014年第1期91-96,共6页
2-haloacid dehalogenases constitute a group of dehalogenases which are capable of dehalogenating the halogenated organic compounds. So far, the 2-haloacid dehalogenases have been found in many bacteria, but not in Par... 2-haloacid dehalogenases constitute a group of dehalogenases which are capable of dehalogenating the halogenated organic compounds. So far, the 2-haloacid dehalogenases have been found in many bacteria, but not in Paracoccus genus. In the present study, one enzyme 2-haloacid dehalogenase(designated as Deh99), induced by DL-2-chloropropionate(DL-2-CPA), was purified from the marine bacterium Paracoccus sp. DEH99, isolated from marine sponge Hymeniacidon perlevis. The enzyme of Deh99 was purified to homogeneity by ammonium sulfate precipitation, ion exchange chromatography(Q-Sepharose HP), and Superdex 200 gel filtration chromatography. The molecular weight of Deh99 was estimated to be 25.0 kDa by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE), and 50.0 kDa natively by gel filtration chromatography. The enzyme of Deh99 stereospecifically dehalogenated L-2-CPA to produce D-lactate, with an apparent Michaelis-Menten constant(Km) value of 0.21 mmol L-1 for L-2-CPA. The optimal pH and temperature for Deh99 activity were 10.0 and 40℃, respectively. The enzyme of Deh99 acted on short-carbon-chain 2-haloacids, with the highest activity towards monochloroacetate. The activity of Deh99 was slightly affected by DTT and EDTA, but strongly inhibited by Cu2+ and Zn2+. The enzyme of Deh99 shows unique substrate specificity and inhibitor sensitivities compared to previously characterized 2-haloacid dehalogenases and is the reported one about purified 2-haloacid dehalogenase isolated from the bacteria of Paracoccus genus. 展开更多
关键词 PARACOCCUS sp 2-haloacid dehalogenase PURIFICATION MARINE BACTERIUM MARINE SPONGE
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嗜热古细菌Sulfolobus tokodaii脱卤酶在D-乳酸生产中的应用 被引量:3
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作者 解桂秋 潘东 +2 位作者 何文龙 高贵 高仁钧 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2015年第4期698-703,共6页
将来源于嗜热古菌Sulfolobus tokodaii的脱卤酶(L-HADST)基因克隆到载体p ET28b,转化大肠杆菌BL21(DE3)进行表达,在蛋白的N末端带有6个组氨酸融合标签,纯化后经聚丙烯酰胺凝胶电泳显示融合蛋白的分子量约为25000.融合蛋白催化2-氯丙酸(2... 将来源于嗜热古菌Sulfolobus tokodaii的脱卤酶(L-HADST)基因克隆到载体p ET28b,转化大肠杆菌BL21(DE3)进行表达,在蛋白的N末端带有6个组氨酸融合标签,纯化后经聚丙烯酰胺凝胶电泳显示融合蛋白的分子量约为25000.融合蛋白催化2-氯丙酸(2-CPA)的最适反应温度为70℃,最适p H值为9.5.以外消旋2-CPA为底物生产D-乳酸,利用HPLC检测反应液中2-CPA及乳酸的变化,发现L-HADST只催化L-2-CPA脱氯反应.对酶催化反应条件进行了优化,结果表明,在p H值为9.5,温度为60℃的条件下,当反应体系中缓冲液浓度为3 mol/L,底物浓度为0.5 mol/L,酶浓度为3×104U/L时有较高的底物转化率及乳酸生成量.依据条件优化结果可知,影响反应速度的因素有底物浓度、缓冲液浓度以及酶浓度,其中底物浓度变化对转换率的影响最明显. 展开更多
关键词 L-2-卤代酸脱卤酶 2-氯丙酸 乳酸
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R-2-卤代酸脱卤酶的同源模建及底物对映体选择性研究 被引量:2
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作者 林春娇 杨立荣 +1 位作者 徐刚 吴坚平 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期191-198,共8页
对来自假单胞菌ZJU26中的R-2-卤代酸脱卤酶(DehI-R)进行同源模建,分析其与底物的相互作用,为解析酶的底物对映体选择性提供理论依据。采用Sybyl中的APM模块首次构建并优化了R-2-卤代酸脱卤酶的三维结构,并用Procheck验证结构模型的合理... 对来自假单胞菌ZJU26中的R-2-卤代酸脱卤酶(DehI-R)进行同源模建,分析其与底物的相互作用,为解析酶的底物对映体选择性提供理论依据。采用Sybyl中的APM模块首次构建并优化了R-2-卤代酸脱卤酶的三维结构,并用Procheck验证结构模型的合理性。使用Surflex-Docking模块将结构模型与底物分别进行对接,分析相互之间的作用。序列比对结果显示,R-2-卤代酸脱卤酶与恶臭假单胞菌PP3中DehI的相似性达23.71%。Deh-R模建后的结构与模板很好的吻合。模型比对分析DehI-R中参与催化的残基,除Asn203外大部分都比较保守。分子对接结果表明,R-2-氯丙酸和S-2-氯丙酸都可以结合到活性位点上,决定其选择性的是位点Asn203,在RS-2-卤代酸脱卤酶所对应位点的残基为Ala,相比之下,Asn具备较大的空间位阻,从而阻止了S-2-氯丙酸的反应。利用Sybyl中的Biopolymer模块对R-2-卤代酸脱卤酶中的Asn203突变成具有不同空间位阻的Ala、Gly和Gln。突变酶与底物对接结果进一步证实了Asn203位点对R-2-卤代酸脱卤酶的底物对映体选择性作用。 展开更多
关键词 R-2-卤代酸脱卤酶 同源模建 分子对接 假单胞菌ZJU26 对映体选择性
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2-卤代酸脱卤酶的表达优化
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作者 王亚月 董超群 +2 位作者 靳志远 张萌萌 裴冬丽 《商丘师范学院学报》 CAS 2022年第9期46-49,共4页
2-卤代酸脱卤酶是催化2-卤代酸脱卤产生相应2-羟基酸的一类酶,其水解脱卤能力和对映体选择性使其在环境修复与光学纯手性化合物绿色合成领域具有广阔应用前景.然而天然2-卤代酸脱卤酶产量通常很低,本文以分离自Pseudomonas putida PP3... 2-卤代酸脱卤酶是催化2-卤代酸脱卤产生相应2-羟基酸的一类酶,其水解脱卤能力和对映体选择性使其在环境修复与光学纯手性化合物绿色合成领域具有广阔应用前景.然而天然2-卤代酸脱卤酶产量通常很低,本文以分离自Pseudomonas putida PP3菌株的DL-2-卤代酸脱卤酶DehI为研究对象,构建DehI-pET28a重组质粒,在大肠杆菌中进行原核表达,并对其表达条件进行优化.经优化获得其最佳表达条件:当细胞OD_(600)nm为0.8,IPTG为0.2 mM,30℃诱导9 h时,活性蛋白量最高,为1.36 U/mL,与常用诱导条件相比提高7.5倍.本研究为2-卤代酸脱卤酶构效关系及其改造研究奠定基础. 展开更多
关键词 2-卤代酸脱卤酶 异源表达 优化
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X射线衍射晶体法解析脱卤酶DehDIV-R结构的研究 被引量:1
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作者 童超迪 吴坚平 +1 位作者 杨立荣 徐刚 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期19-25,共7页
R-2-卤代酸脱卤酶能立体选择性水解R-2-卤代酸。解析酶的单晶结构对提高酶的选择性和活性提供了直接的结构指导,是目前酶结构领域研究的前沿。以实验室前期得到的来自假单胞菌ZJU26的R-2-氯丙酸脱卤酶(Deh DIV-R)为研究对象,采用X射... R-2-卤代酸脱卤酶能立体选择性水解R-2-卤代酸。解析酶的单晶结构对提高酶的选择性和活性提供了直接的结构指导,是目前酶结构领域研究的前沿。以实验室前期得到的来自假单胞菌ZJU26的R-2-氯丙酸脱卤酶(Deh DIV-R)为研究对象,采用X射线衍射晶体法进行结构解析。采用pp SUMO载体融合表达Deh DIV-R蛋白,依次通过Ni-NTA亲和层析、透析酶切、二次NiNTA亲和层析以及凝胶过滤层析纯化得到单一条带,且均一性好的蛋白。接着对结晶条件进行初筛与优化,得到的最佳结晶条件为0.1mol/L HEPES p H 7,12%PEG 6 000,0.2mol/L Mg Cl2,8mmol/L CHAPS。晶体在上海同步辐射光源BL18U1线站上收集衍射数据,采用分子置换法成功解析获得了分辨率为2.35的Deh DIV-R的晶体结构。Ramachandran图表明98.02%的氨基酸位于最适区,证明了该结构的合理性。Deh DIV-R的纯化、结晶以及结构解析为进一步深入了解其结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 R-2-卤代酸脱卤酶 纯化 结晶 X射线衍射
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