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基于RNA测序技术鉴定和分析绒山羊毛囊不同生长期mRNA的可变剪接
1
作者
李莹莹
董华娇
+6 位作者
梁千千
张洁
李甜甜
许赫
马月辉
韩吉龙
杨敏
《中国草食动物科学》
CAS
北大核心
2024年第4期1-7,共7页
可变剪接(Alternative splicing,AS)是在转录后水平调控基因表达的一种重要方式。为挖掘调控绒山羊毛囊周期性生长相关的关键可变剪接,通过比较绒山羊绒毛不同生长时期的皮肤转录组数据,以P<0.05,|Inc‐LevelDifference|>0.1为标...
可变剪接(Alternative splicing,AS)是在转录后水平调控基因表达的一种重要方式。为挖掘调控绒山羊毛囊周期性生长相关的关键可变剪接,通过比较绒山羊绒毛不同生长时期的皮肤转录组数据,以P<0.05,|Inc‐LevelDifference|>0.1为标准筛选差异的可变剪接,并进行功能分析。结果显示,转换期Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ中分别鉴定到1615、1667、1387和1522个差异可变剪接,分别对应了1202、1268、1073、1170个基因;这些基因主要富集于Notch、Hedgehog、mTOR、AMPK、PI3K-Akt、Wnt、TGF-β等与毛囊发育相关的信号通路;蛋白互作网络结合富集分析表明,Ctnnb1、Gsk3b、Tgfbr1、Vegfa、Gli1等基因产生的可变剪接可能参与调控毛囊周期性生长。综上可知,可变剪接在绒山羊毛囊周期性生长过程中普遍存在,且在不同发育阶段间存在差异;鉴定到调控绒山羊毛囊周期性生长发育相关的关键差异可变剪接基因及其重要信号通路。
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关键词
绒山羊
毛囊周期性生长
可变剪接
转录组测序
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职称材料
自噬在毛发再生中的作用
被引量:
1
2
作者
黄雨馨
梁文姿
+3 位作者
陈秀文
倪娜
赵颖琳
林常敏
《中国组织工程研究》
CAS
北大核心
2024年第7期1112-1117,共6页
背景:在生物医学界,自噬是一个快速发展的研究热点,许多研究人员正在积极探究多种疾病中自噬的分子调控机制,但是自噬在毛发生长中所起的作用仍存在许多未知。目的:综述目前自噬在毛发生长与再生中的研究进展及应用价值,了解自噬在毛发...
背景:在生物医学界,自噬是一个快速发展的研究热点,许多研究人员正在积极探究多种疾病中自噬的分子调控机制,但是自噬在毛发生长中所起的作用仍存在许多未知。目的:综述目前自噬在毛发生长与再生中的研究进展及应用价值,了解自噬在毛发生长中的作用,以探究自噬在病理性脱发中的发病机制,为研究治疗脱发的药物提供新思路。方法:应用计算机在中国知网(CNKI)、PubMed数据库中,以“毛囊生长,毛发生长,毛发再生,自噬相关蛋白,自噬活性,自噬相关基因,自噬”或“hair growth,hair follicle,hair regeneration,autophagy”为检索词进行检索。查阅国内外近年来关于自噬、毛发生长和自噬在毛发生长中作用的研究进展进行总结,排除与文章主题内容不相符的文献,最终纳入78篇文献进行结果分析。结果与结论:(1)自噬是真核生物的正常代谢过程,具有复杂的分子机制和功能特性,既有利于细胞生存,又可促进细胞死亡。(2)脱发相关疾病与自噬活性的改变有关,且自噬活性可调控毛发生长周期;敲除或过表达自噬相关基因可改变毛发生长状态,已发现有多条自噬相关信号通路与毛囊生长有关;自噬的激活剂或抑制剂可用于治疗或预防脱发疾病。
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关键词
毛囊
毛发
毛发再生
毛囊再生
毛囊生长周期
自噬
自噬活性
自噬激活剂
自噬抑制剂
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职称材料
小鼠出生后背部毛囊发育与Lef-1表达的研究
被引量:
4
3
作者
王海东
杨磊
+5 位作者
王祎
于秀菊
董彦君
赫晓燕
马淑慧
董常生
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期382-387,共6页
旨在研究Lef-1在小鼠背部毛囊生长周期中的表达规律及其与毛囊生长更替的关系。本试验采用石蜡切片HE染色、Western blotting以及免疫组织化学方法,研究小鼠毛囊的周期性变化,检测Lef-1在小鼠毛囊生长的不同时期皮肤组织中的蛋白表达水...
旨在研究Lef-1在小鼠背部毛囊生长周期中的表达规律及其与毛囊生长更替的关系。本试验采用石蜡切片HE染色、Western blotting以及免疫组织化学方法,研究小鼠毛囊的周期性变化,检测Lef-1在小鼠毛囊生长的不同时期皮肤组织中的蛋白表达水平,并对其进行组织定位。结果,昆明系小鼠毛囊生长呈周期性变化,处于不同生长时期的毛囊具有各期的特殊结构;Western blotting结果显示,在各阶段皮肤组织中存在Lef-1蛋白的表达,其在毛囊生长初期的表达量显著高于中期和末期;免疫组织化学结果显示,Lef-1在不同毛囊生长时期的皮脂腺、根鞘和真皮乳头均有不同程度的表达。Lef-1的表达与毛囊的周期性变化存在相关性。
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关键词
毛囊生长周期
Lef-1
WESTERN
BLOTTING
免疫组织化学
小鼠
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职称材料
题名
基于RNA测序技术鉴定和分析绒山羊毛囊不同生长期mRNA的可变剪接
1
作者
李莹莹
董华娇
梁千千
张洁
李甜甜
许赫
马月辉
韩吉龙
杨敏
机构
石河子大学动物科技学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《中国草食动物科学》
CAS
北大核心
2024年第4期1-7,共7页
基金
国家自然基金项目(32060745,31802045)
石河子大学国际科技合作推进计划项目(GJHZ202307)。
文摘
可变剪接(Alternative splicing,AS)是在转录后水平调控基因表达的一种重要方式。为挖掘调控绒山羊毛囊周期性生长相关的关键可变剪接,通过比较绒山羊绒毛不同生长时期的皮肤转录组数据,以P<0.05,|Inc‐LevelDifference|>0.1为标准筛选差异的可变剪接,并进行功能分析。结果显示,转换期Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ中分别鉴定到1615、1667、1387和1522个差异可变剪接,分别对应了1202、1268、1073、1170个基因;这些基因主要富集于Notch、Hedgehog、mTOR、AMPK、PI3K-Akt、Wnt、TGF-β等与毛囊发育相关的信号通路;蛋白互作网络结合富集分析表明,Ctnnb1、Gsk3b、Tgfbr1、Vegfa、Gli1等基因产生的可变剪接可能参与调控毛囊周期性生长。综上可知,可变剪接在绒山羊毛囊周期性生长过程中普遍存在,且在不同发育阶段间存在差异;鉴定到调控绒山羊毛囊周期性生长发育相关的关键差异可变剪接基因及其重要信号通路。
关键词
绒山羊
毛囊周期性生长
可变剪接
转录组测序
Keywords
cashmere
goat
hair
follicles
growth
cycle
alternative
splicing
RNA-seq
分类号
S827.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
自噬在毛发再生中的作用
被引量:
1
2
作者
黄雨馨
梁文姿
陈秀文
倪娜
赵颖琳
林常敏
机构
汕头大学医学院
汕头大学精神卫生中心
出处
《中国组织工程研究》
CAS
北大核心
2024年第7期1112-1117,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(007-41369023),项目负责人:林常敏。
文摘
背景:在生物医学界,自噬是一个快速发展的研究热点,许多研究人员正在积极探究多种疾病中自噬的分子调控机制,但是自噬在毛发生长中所起的作用仍存在许多未知。目的:综述目前自噬在毛发生长与再生中的研究进展及应用价值,了解自噬在毛发生长中的作用,以探究自噬在病理性脱发中的发病机制,为研究治疗脱发的药物提供新思路。方法:应用计算机在中国知网(CNKI)、PubMed数据库中,以“毛囊生长,毛发生长,毛发再生,自噬相关蛋白,自噬活性,自噬相关基因,自噬”或“hair growth,hair follicle,hair regeneration,autophagy”为检索词进行检索。查阅国内外近年来关于自噬、毛发生长和自噬在毛发生长中作用的研究进展进行总结,排除与文章主题内容不相符的文献,最终纳入78篇文献进行结果分析。结果与结论:(1)自噬是真核生物的正常代谢过程,具有复杂的分子机制和功能特性,既有利于细胞生存,又可促进细胞死亡。(2)脱发相关疾病与自噬活性的改变有关,且自噬活性可调控毛发生长周期;敲除或过表达自噬相关基因可改变毛发生长状态,已发现有多条自噬相关信号通路与毛囊生长有关;自噬的激活剂或抑制剂可用于治疗或预防脱发疾病。
关键词
毛囊
毛发
毛发再生
毛囊再生
毛囊生长周期
自噬
自噬活性
自噬激活剂
自噬抑制剂
Keywords
hair
follicl
e
hair
hair
regeneration
hair
follicl
e
regeneration
hair
follicl
e
growth
cycle
autophagy
autophagy
activity
autophagy
activator
autophagy
inhibitor
分类号
R459.9 [医药卫生—治疗学]
R318 [医药卫生—临床医学]
R758.71
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职称材料
题名
小鼠出生后背部毛囊发育与Lef-1表达的研究
被引量:
4
3
作者
王海东
杨磊
王祎
于秀菊
董彦君
赫晓燕
马淑慧
董常生
机构
山西农业大学动物科技学院
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期382-387,共6页
基金
山西省科技攻关项目(2006031060)
山西农业大学创新基金(2009001)
文摘
旨在研究Lef-1在小鼠背部毛囊生长周期中的表达规律及其与毛囊生长更替的关系。本试验采用石蜡切片HE染色、Western blotting以及免疫组织化学方法,研究小鼠毛囊的周期性变化,检测Lef-1在小鼠毛囊生长的不同时期皮肤组织中的蛋白表达水平,并对其进行组织定位。结果,昆明系小鼠毛囊生长呈周期性变化,处于不同生长时期的毛囊具有各期的特殊结构;Western blotting结果显示,在各阶段皮肤组织中存在Lef-1蛋白的表达,其在毛囊生长初期的表达量显著高于中期和末期;免疫组织化学结果显示,Lef-1在不同毛囊生长时期的皮脂腺、根鞘和真皮乳头均有不同程度的表达。Lef-1的表达与毛囊的周期性变化存在相关性。
关键词
毛囊生长周期
Lef-1
WESTERN
BLOTTING
免疫组织化学
小鼠
Keywords
hair
follicl
e
growth
cycle
Lef-1
Western
blotting
immunohistochemistry
murine
分类号
Q054.539 [生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于RNA测序技术鉴定和分析绒山羊毛囊不同生长期mRNA的可变剪接
李莹莹
董华娇
梁千千
张洁
李甜甜
许赫
马月辉
韩吉龙
杨敏
《中国草食动物科学》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
自噬在毛发再生中的作用
黄雨馨
梁文姿
陈秀文
倪娜
赵颖琳
林常敏
《中国组织工程研究》
CAS
北大核心
2024
1
下载PDF
职称材料
3
小鼠出生后背部毛囊发育与Lef-1表达的研究
王海东
杨磊
王祎
于秀菊
董彦君
赫晓燕
马淑慧
董常生
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
4
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职称材料
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