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基于转录组学和蛋白组学的鸡蛋绿壳性状形成分子机制研究
1
作者
石钰仕
肖涛
+5 位作者
陈有波
余欢
赵德鹏
龙霞
谭启松
李辉
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期638-649,共12页
【目的】挖掘参与绿壳蛋形成的潜在调控基因和蛋白,为开展赤水乌骨鸡品种选育及揭示家禽蛋壳颜色形成分子机制提供理论依据。【方法】以280日龄的绿壳纯系赤水乌骨鸡为研究对象,分别采集产深绿(SL)和白壳(BK)鸡蛋的母鸡蛋壳腺组织样品,...
【目的】挖掘参与绿壳蛋形成的潜在调控基因和蛋白,为开展赤水乌骨鸡品种选育及揭示家禽蛋壳颜色形成分子机制提供理论依据。【方法】以280日龄的绿壳纯系赤水乌骨鸡为研究对象,分别采集产深绿(SL)和白壳(BK)鸡蛋的母鸡蛋壳腺组织样品,通过转录组测序和TMT定量蛋白组学技术分别筛选出差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白(DEPs),并对转录组学和蛋白组学进行联合分析,筛选出调控绿壳鸡蛋颜色深浅的候选基因和候选蛋白。【结果】经转录组测序,从SL组与BK组间共筛选出82个DEGs,其中46个DEGs呈上调表达、36个DEGs呈下调表达;有4个DEGs与蛋壳色素的合成及沉积相关,分别是SLC22A4、SPP1、FAM26E和HSP5基因,且均为上调表达的DEGs;KEGG信号通路分析结果显示,DEGs显著富集的信号通路有α-亚麻酸代谢和花生四烯酸代谢等。通过TMT定量蛋白组学分析,共鉴定获得167个DEPs,其中104个DEPs呈上调表达、63个DEPs呈下调表达;KEGG信号通路富集分析发现,DEPs主要富集于甘油磷脂代谢、半胱氨酸和蛋氨酸代谢及醚脂质代谢等信号通路。转录组学和蛋白组学的联合分析结果表明,转录组与蛋白组无共同注释的GO功能条目,而82个DEGs和167个DEPs富集到19条KEGG信号通路上,其中甘油磷脂代谢和醚脂类代谢2条信号通路在转录组与蛋白组中均有出现。【结论】SLC22A4、SPP1、FAM26E和HSP5基因及FAM102A、FAM107B和SLCO1B1蛋白可能参与蛋壳色素的合成、转运和沉积,尤其是SLC家族发挥着重要作用,故推测这些基因和蛋白是影响赤水乌骨鸡蛋绿壳形成的候选基因和候选蛋白,且富集到的甘油磷脂代谢和醚脂类代谢可能是调节鸡蛋绿壳形成的关键信号通路。
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关键词
赤水乌骨鸡
胆绿素
绿壳性状
转录组学
蛋白组学
下载PDF
职称材料
现代分子育种技术及其在蛋鸭选育中的应用
2
作者
孙思维
王德前
卢立志
《安徽农业科学》
CAS
2013年第2期609-610,624,共3页
随着分子生物技术的发展,DNA重组技术、转基因技术和分子标记技术等分子育种技术成为畜禽育种领域的研究热点。简要介绍了分子标记育种技术及其在改善蛋鸭青壳性状和生产性状等方面的研究进展,旨在为蛋鸭的分子育种研究提供技术资料。
关键词
分子标记
青壳性状
生产性能
下载PDF
职称材料
题名
基于转录组学和蛋白组学的鸡蛋绿壳性状形成分子机制研究
1
作者
石钰仕
肖涛
陈有波
余欢
赵德鹏
龙霞
谭启松
李辉
机构
贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
安顺市畜牧技术推广站
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期638-649,共12页
基金
贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2022]重点34)
贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教技[2022]061号)。
文摘
【目的】挖掘参与绿壳蛋形成的潜在调控基因和蛋白,为开展赤水乌骨鸡品种选育及揭示家禽蛋壳颜色形成分子机制提供理论依据。【方法】以280日龄的绿壳纯系赤水乌骨鸡为研究对象,分别采集产深绿(SL)和白壳(BK)鸡蛋的母鸡蛋壳腺组织样品,通过转录组测序和TMT定量蛋白组学技术分别筛选出差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白(DEPs),并对转录组学和蛋白组学进行联合分析,筛选出调控绿壳鸡蛋颜色深浅的候选基因和候选蛋白。【结果】经转录组测序,从SL组与BK组间共筛选出82个DEGs,其中46个DEGs呈上调表达、36个DEGs呈下调表达;有4个DEGs与蛋壳色素的合成及沉积相关,分别是SLC22A4、SPP1、FAM26E和HSP5基因,且均为上调表达的DEGs;KEGG信号通路分析结果显示,DEGs显著富集的信号通路有α-亚麻酸代谢和花生四烯酸代谢等。通过TMT定量蛋白组学分析,共鉴定获得167个DEPs,其中104个DEPs呈上调表达、63个DEPs呈下调表达;KEGG信号通路富集分析发现,DEPs主要富集于甘油磷脂代谢、半胱氨酸和蛋氨酸代谢及醚脂质代谢等信号通路。转录组学和蛋白组学的联合分析结果表明,转录组与蛋白组无共同注释的GO功能条目,而82个DEGs和167个DEPs富集到19条KEGG信号通路上,其中甘油磷脂代谢和醚脂类代谢2条信号通路在转录组与蛋白组中均有出现。【结论】SLC22A4、SPP1、FAM26E和HSP5基因及FAM102A、FAM107B和SLCO1B1蛋白可能参与蛋壳色素的合成、转运和沉积,尤其是SLC家族发挥着重要作用,故推测这些基因和蛋白是影响赤水乌骨鸡蛋绿壳形成的候选基因和候选蛋白,且富集到的甘油磷脂代谢和醚脂类代谢可能是调节鸡蛋绿壳形成的关键信号通路。
关键词
赤水乌骨鸡
胆绿素
绿壳性状
转录组学
蛋白组学
Keywords
Chishui
black
bone
chicken
biliverdin
green
shell
traits
transcriptomics
proteomics
分类号
S831.89 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
现代分子育种技术及其在蛋鸭选育中的应用
2
作者
孙思维
王德前
卢立志
机构
浙江师范大学化学与生命科学学院
浙江省农业科学院畜牧兽医研究所
出处
《安徽农业科学》
CAS
2013年第2期609-610,624,共3页
基金
国家水禽产业技术体系项目(CARS-43-2)
畜禽健康养殖创新团队项目(2010R50027)
文摘
随着分子生物技术的发展,DNA重组技术、转基因技术和分子标记技术等分子育种技术成为畜禽育种领域的研究热点。简要介绍了分子标记育种技术及其在改善蛋鸭青壳性状和生产性状等方面的研究进展,旨在为蛋鸭的分子育种研究提供技术资料。
关键词
分子标记
青壳性状
生产性能
Keywords
Molecular
markers
green
shell
traits
Production
traits
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组学和蛋白组学的鸡蛋绿壳性状形成分子机制研究
石钰仕
肖涛
陈有波
余欢
赵德鹏
龙霞
谭启松
李辉
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
现代分子育种技术及其在蛋鸭选育中的应用
孙思维
王德前
卢立志
《安徽农业科学》
CAS
2013
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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