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利用杉木的F_1代群体构建遗传连锁图谱 被引量:13
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作者 童春发 施季森 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第10期1149-1156,共8页
对于杉木 1∶1分离的分子标记位点 ,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析 ,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序 ,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该... 对于杉木 1∶1分离的分子标记位点 ,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析 ,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序 ,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该作图方法比通常林木上所用的“拟测交”作图方法更有效。采用该作图策略 ,利用句容0号无性系 (♀ )×柔叶杉 (♂ )的F1代群体的AFLP分子标记数据重建了句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱。在句容 0号无性系的连锁图谱中 ,有 10 1个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 2 82 6cM ,平均图距为 2 2 6cM ,单个连锁群上最多含有 17个标记 ,最少含有 5个标记 ;在柔叶杉的连锁图谱中 ,有 94个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 5 6 5 8cM ,平均图距为 2 7 3cM ,单个连锁群上最多含有 16个标记 ,最少含有 4个标记。构建的句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱比原有的图谱分别增加了 2 6个标记和 2 8个标记 ,双亲的图谱共增加了 5 4个AFLP标记 ,使图谱上的分子标记总数达到 195个 ,双亲遗传图谱的跨度均超过了 2 0 0 0cM ,基本上达到了杉木基因组的长度 ,图谱的覆盖率接近于 10 0 %。利用新的作图方法可以较大提高分子标记在图谱上的分辨率 。 展开更多
关键词 杉木 遗传连锁图谱 F1代群体 连锁相 隐马尔可夫链模型
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现代分子生物学技术在林木遗传改良中的应用 被引量:23
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作者 张志毅 林善枝 +1 位作者 张德强 张谦 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期250-261,共12页
林木遗传改良是在研究林木遗传变异的基础上开展的遵循其遗传变异规律来改良林木的遗传组成 ,进而培育林木新品种的一项活动 .林木遗传改良的效果直接取决于在遗传改良活动中所采用的各项技术 .由于林木生长周期长 ,遗传杂合性高 ,许多... 林木遗传改良是在研究林木遗传变异的基础上开展的遵循其遗传变异规律来改良林木的遗传组成 ,进而培育林木新品种的一项活动 .林木遗传改良的效果直接取决于在遗传改良活动中所采用的各项技术 .由于林木生长周期长 ,遗传杂合性高 ,许多重要经济性状属于多基因控制的数量性状 ,遗传机理不明 ,利用常规育种手段往往难以满足不同目的定向培育树木新品种的要求 .因此 ,运用现代分子生物学技术进行林木遗传改良研究具有重要的现实意义 .该文概述了基因工程技术、遗传图谱构建、重要性状基因定位以及分子标记辅助选择育种等方面在林木遗传改良中的应用研究进展 ,并对现代分子生物学技术在林木遗传改良应用中存在的主要问题和应用前景进行了讨论 . 展开更多
关键词 分子生物学技术 林木 遗传改良 应用 基因工程 分子标记 遗传图谱 基因定位
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桉树分子育种研究进展 被引量:19
3
作者 欧阳乐军 曾富华 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第6期1146-1152,共7页
桉树生长周期长,遗传杂合性高,许多重要经济性状属于多基因控制的数量性状,遗传机理不明,利用常规育种手段往往难以满足不同目的定向培育桉树新品种的要求。依靠现代分子生物学技术与常规育种技术相结合,可极大地缩短桉树育种周期,加速... 桉树生长周期长,遗传杂合性高,许多重要经济性状属于多基因控制的数量性状,遗传机理不明,利用常规育种手段往往难以满足不同目的定向培育桉树新品种的要求。依靠现代分子生物学技术与常规育种技术相结合,可极大地缩短桉树育种周期,加速育种进程,对创造新种质,选育新品种具有重要意义。本文综述了国内外桉树基因工程育种、遗传图谱构建以及重要性状基因定位等分子育种的研究进展,提出了当前桉树分子育种中存在的问题,并展望了分子育种技术在桉树遗传改良中应用的前景。 展开更多
关键词 桉树 分子育种 分子标记 遗传图谱
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梯棱羊肚菌全基因组SNP/Indel分析及基于Indel标记的遗传连锁图谱构建 被引量:12
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作者 刘伟 张倩倩 +3 位作者 舒芳 蔡英丽 马晓龙 边银丙 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2195-2204,共10页
基于梯棱羊肚菌Morchella importuna两个子囊孢子培养物的全基因组测序数据,对全基因组范围内的变异位点进行分析。共鉴定到18438个变异位点,平均每Mbp的变异位点数量为361个;变异位点以单核苷酸多态性SNP为主,共计17 104个,基因组中SN... 基于梯棱羊肚菌Morchella importuna两个子囊孢子培养物的全基因组测序数据,对全基因组范围内的变异位点进行分析。共鉴定到18438个变异位点,平均每Mbp的变异位点数量为361个;变异位点以单核苷酸多态性SNP为主,共计17 104个,基因组中SNP的频率为335SNPs/Mbp;Indel多态性位点1 334个,以2–10bp的插入缺失为主;73.4%SNP/Indel位于基因间隔区域,外显子区域共检测到3 042个变异位点,占总数的16.50%;对基因功能产生确定影响的移码突变有1 088个,占5.90%,错义突变916个,占比4.97%;不同Scaffold上的SNP/Indel出现频率不同,SNP频率最大的为Scaffold80,平均每Mbp包含2 856个SNP,频率最低为Scaffold60和Scaffold75,分别为16SNPs/Mbp和30SNPs/Mbp;对≥11bp的Indel变异位点进行标记开发和多态性群体分析,成功开发出75对Indel标记。采用原生质体单细胞分离技术,获得了梯棱羊肚菌M04的两个可亲和的同核体菌株M04P01和M04P40,同时采用来自M04子囊果的58个单孢菌株作为作图群体,初步构建了包含75个Indel标记和1个交配型基因的梯棱羊肚菌遗传连锁图谱,共获得12个连锁群,连锁群总长度273.7cM。 展开更多
关键词 共显性标记 原生质体技术 同核体 单孢群体 遗传连锁图谱
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牧草遗传连锁图谱构建研究概述 被引量:6
5
作者 方程 韩建国 《草地学报》 CAS CSCD 2006年第3期287-291,共5页
高密度分子连锁遗传图谱对分析植物遗传变异、标记目标性状、数量性状定位和分子辅助选择改良性状均具重要价值。由于大多数牧草的多倍性和高度异质特点,牧草遗传连锁图谱的构建相对复杂。目前,一定数量牧草的遗传连锁图谱已经产生。本... 高密度分子连锁遗传图谱对分析植物遗传变异、标记目标性状、数量性状定位和分子辅助选择改良性状均具重要价值。由于大多数牧草的多倍性和高度异质特点,牧草遗传连锁图谱的构建相对复杂。目前,一定数量牧草的遗传连锁图谱已经产生。本文简要综述了牧草遗传图谱研究现状和常用策略,提出了构建高质量牧草遗传图谱的建议。 展开更多
关键词 牧草 遗传连锁图谱 概述
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SRAP标记在植物性状标记和遗传图谱构建中的应用研究进展 被引量:7
6
作者 王从彦 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第9期1-5,21,共6页
由于SRAP标记简便、快速、不需预知物种的序列信息,近年来已广泛应用于植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因连锁标记、基因定位、比较基因组学研究及杂种优势预测等研究。基于此,综述了SRAP分子标记在植物性状标记和... 由于SRAP标记简便、快速、不需预知物种的序列信息,近年来已广泛应用于植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因连锁标记、基因定位、比较基因组学研究及杂种优势预测等研究。基于此,综述了SRAP分子标记在植物性状标记和遗传连锁图谱构建方面的应用进展,以便为今后的研究提供相应的理论依据。 展开更多
关键词 遗传多样性 遗传连锁图谱 植物 相关序列扩增多态性
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Progress in the Study of Molecular Genetic Improvements of Poplar in China 被引量:4
7
作者 Shan-Zhi Lin Zhi-Yi Zhang Qian Zhang Yuan-Zhen Lin 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第9期1001-1007,共7页
The poplar is one of the most economically important and intensively studied tree species owing to its wide application in the timber industry and as a model material for the study of woody plants. The natural resourc... The poplar is one of the most economically important and intensively studied tree species owing to its wide application in the timber industry and as a model material for the study of woody plants. The natural resource of poplars in China is replete. Over the past 10 years, the application of molecular biological techniques to genetic improvements in poplar species has been widely studied in China. Recent advances in molecular genetic improvements of poplar, including cDNA library construction, gene cloning and identification, genetic engineering, gene expression, genetic linkage map construction, mapping of quantitative trait loci (QTL) and molecular-assisted selection, are reviewed in the present paper. In addition, the application of modern biotechnology to molecular improvements in the genetic traits of the poplar and some unsolved problems are discussed. 展开更多
关键词 POPLAR gene engineering genetic improvement genetic linkage maps molecular marker quantitative trait loci (QTL) mapping
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杨树基因工程研究进展 被引量:4
8
作者 贺成林 李云 《河北林果研究》 2004年第1期82-89,共8页
运用现代分子生物学技术进行林木遗传改良研究具有重要的现实意义。介绍了杨树基因工程方面的研究进展 ,综述了杨树遗传图谱构建、基因克隆及转基因应用研究方面的状况 ,并对杨树基因工程研究存在的问题和前景进行了讨论。总结了杨树基... 运用现代分子生物学技术进行林木遗传改良研究具有重要的现实意义。介绍了杨树基因工程方面的研究进展 ,综述了杨树遗传图谱构建、基因克隆及转基因应用研究方面的状况 ,并对杨树基因工程研究存在的问题和前景进行了讨论。总结了杨树基因工程研究的规律 ,以促进林木基因工程研究的发展。 展开更多
关键词 基因工程 遗传图谱 克隆 遗传改良
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普通菜豆基因组学及抗炭疽病遗传研究进展 被引量:5
9
作者 陈明丽 王兰芬 +1 位作者 赵晓彦 王述民 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期941-947,共7页
普通菜豆是重要的食用豆类之一,在世界各地普遍种植。近年来,普通菜豆在遗传图谱构建、新标记开发与利用、抗性基因定位以及比较基因组学等方面取得了很大进展。遗传连锁图谱的构建是基因定位与克隆的基础,是遗传研究的重要内容;利用分... 普通菜豆是重要的食用豆类之一,在世界各地普遍种植。近年来,普通菜豆在遗传图谱构建、新标记开发与利用、抗性基因定位以及比较基因组学等方面取得了很大进展。遗传连锁图谱的构建是基因定位与克隆的基础,是遗传研究的重要内容;利用分子连锁图谱鉴定、标记和定位抗病基因将在种质改良和分子标记辅助育种方面发挥重要作用。豆科植物比较基因组学的研究成果为菜豆遗传连锁图谱的发展提供了新的思路。本研究从普通菜豆遗传连锁图谱的获得、普通菜豆与大豆同线性比较以及抗炭疽病基因定位等方面进行了综述,以期为普通菜豆遗传改良和抗病育种提供参考。 展开更多
关键词 普通菜豆 遗传连锁图 同线性比较 抗菜豆炭疽病
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棉花遗传连锁图谱及其应用研究进展 被引量:4
10
作者 张轲 张正圣 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第6期460-469,共10页
基于DNA标记的遗传连锁图谱,是研究植物基因组结构、功能以及进化的重要工具。随着分子标记技术的发明和应用,RFLP,RAPD,AFLP,SSR等多种DNA标记技术被用于棉花遗传连锁图谱的构建以及棉花重要农艺性状基因的定位。本文通过对现有异源四... 基于DNA标记的遗传连锁图谱,是研究植物基因组结构、功能以及进化的重要工具。随着分子标记技术的发明和应用,RFLP,RAPD,AFLP,SSR等多种DNA标记技术被用于棉花遗传连锁图谱的构建以及棉花重要农艺性状基因的定位。本文通过对现有异源四倍体棉种的遗传图谱的分析,发现异源四倍体棉花种间遗传图谱已相对饱和,但所构建陆地棉种内遗传连锁图的基因组覆盖率低;同时QTL定位研究较多,MAS、图位克隆和物理图谱构建工作已经展开。今后棉花遗传图谱的研究任务,一方面是增加现有种间图谱的标记密度,另一方面是构建覆盖陆地棉全基因组的遗传图谱。 展开更多
关键词 棉花 分子标记 遗传连锁图谱 应用
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Status and Advances of Molecular Genetic Improvement of Poplar Species in China 被引量:1
11
作者 张志毅 林善枝 张谦 《Forestry Studies in China》 CAS 2002年第2期1-8,共8页
Poplars are among the most important deciduous tree species in China. China is replete with natural resources of poplars. Poplars have a number of good characteristics, including fast growth rate, high yield, many use... Poplars are among the most important deciduous tree species in China. China is replete with natural resources of poplars. Poplars have a number of good characteristics, including fast growth rate, high yield, many uses, easiness of tissue culture and small gene group that make them well suited as a model system for the application of genetic engineering in forest trees. In the last decade, much progress has been made in genetic improvement of poplar species in China. Modern biotechnology is an important tool for genetic improvement in forest trees, and its applications to genetic improvement in poplars, which covers genetic transformation, gene expression, construction of genetic linkage map, QTLs (quantitative trait loci) identification and molecular assisted selection are reviewed in this paper. At the same time, the existing problems and outlook about the application of modern biotechnology to genetic improvement in forest trees are also discussed. 展开更多
关键词 POPLAR gene engineering molecular marker genetic linkage maps QTLS genetic improvement
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梨遗传连锁图谱研究进展 被引量:4
12
作者 张校立 艾沙江.买买提 +2 位作者 薛华柏 闫鹏 王继勋 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第A01期1-8,共8页
梨遗传连锁图谱的构建是梨基因组研究中的重要环节,是梨基因定位与克隆、分子标记辅助育种的基础。目前,国内外已经构建了26张梨遗传连锁图谱,并对梨的叶片性状、生长性状、果皮颜色、果实硬度、果形指数、抗黑星病、抗火疫病、抗梨木... 梨遗传连锁图谱的构建是梨基因组研究中的重要环节,是梨基因定位与克隆、分子标记辅助育种的基础。目前,国内外已经构建了26张梨遗传连锁图谱,并对梨的叶片性状、生长性状、果皮颜色、果实硬度、果形指数、抗黑星病、抗火疫病、抗梨木虱等性状进行了QLT定位。笔者详细概括了已构建梨遗传图谱的研究现状和应用,以期为以后梨高密度遗传连锁图谱构建和分子标记辅助梨树育种提供借鉴。 展开更多
关键词 遗传连锁图谱 分子标记 QTL定位
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蚕豆遗传图谱与QTL定位研究进展 被引量:3
13
作者 周仙莉 滕长才 +5 位作者 张红岩 林夕 刘玉玲 吴小燕 侯万伟 刘玉皎 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第1期237-245,共9页
作为一种粮食、蔬菜、饲料、绿肥兼用的食用豆类,蚕豆在人类健康、土壤改良等方面发挥了重要作用。高密度遗传图谱的构建是蚕豆基因组研究的基础和主要手段,至今共构建了24张蚕豆遗传图谱,最为饱和的图谱覆盖长度为1439 cM,平均遗传距离... 作为一种粮食、蔬菜、饲料、绿肥兼用的食用豆类,蚕豆在人类健康、土壤改良等方面发挥了重要作用。高密度遗传图谱的构建是蚕豆基因组研究的基础和主要手段,至今共构建了24张蚕豆遗传图谱,最为饱和的图谱覆盖长度为1439 cM,平均遗传距离为0.8 cM。同时基于图谱开展了产量相关性状、品质相关性状以及抗性相关性状的QTL定位,有效地促进了蚕豆的遗传与基因研究。 展开更多
关键词 蚕豆 遗传连锁图谱 QTL定位
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分子标记技术在西瓜遗传育种上的应用研究进展 被引量:2
14
作者 李晓慧 王从彦 常高正 《河南科学》 2008年第5期557-561,共5页
综述了目前分子标记的主要类型及在西瓜亲缘关系和遗传多样性分析、图谱构建、重要性状基因的连锁标记和杂种纯度鉴定等方面上的应用情况,提出了在西瓜上分子标记的研究趋势.
关键词 分子标记 西瓜 遗传图谱
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苜蓿遗传连锁图谱构建研究进展
15
作者 苏东 于林清 +2 位作者 周延林 王富贵 乌日娜 《草业与畜牧》 2011年第4期13-16,共4页
高密度分子标记的连锁遗传图谱对分析植物遗传变异、目标性状的标记、数量性状的定位和分子标记辅助育种均具有重要价值。由于大多数苜蓿的多倍性和高度异质特点,苜蓿遗传连锁图谱的构建相对复杂,目前,已经产生了一定数量的苜蓿遗传连... 高密度分子标记的连锁遗传图谱对分析植物遗传变异、目标性状的标记、数量性状的定位和分子标记辅助育种均具有重要价值。由于大多数苜蓿的多倍性和高度异质特点,苜蓿遗传连锁图谱的构建相对复杂,目前,已经产生了一定数量的苜蓿遗传连锁图谱。本文简要综述了苜蓿遗传图谱研究现状和常用策略,提出了构建高质量苜蓿遗传图谱的建议。 展开更多
关键词 苜蓿 遗传连锁图谱 研究进展
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Construction of AFLP-based genetic linkage maps for the Chinese shrimp Fenneropaeneus chinensis
16
作者 TIAN Yi1,2,3,4, KONG Jie1↑ & WANG WeiJi1 1 Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Science, Qingdao 266071, China 2 College of Life Science and Technology, Dalian Fisheries University, Dalian 116023, China +1 位作者 3 Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China 4 Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2008年第8期1205-1216,共12页
Fenneropaeneus chinensis is an important species in marine fishery resources and aquaculture in China. A genetic linkage map is essential for improving the efficiency of its breeding by marker-as- sisted selection and... Fenneropaeneus chinensis is an important species in marine fishery resources and aquaculture in China. A genetic linkage map is essential for improving the efficiency of its breeding by marker-as- sisted selection and identifying commercially important genes. Linkage maps of F. chinensis were constructed with an F2 mapping population (110 progenies) using amplified fragment length polymor- phic (AFLP) marker in this study. Fifty-five AFLP primer combinations produced 532 AFLP markers fitting for map strategy in mapping family. The markers with 3:1 segregating ratios were analyzed using F2 intercross model for the common linkage map, while the markers with 1:1 ratio were analyzed using the pseudo-testcross strategy. The maps of male, female and common were constructed. The female map included 103 markers that formed 28 linkage groups, covering a total length of 1090 cM. All mark- ers were linked with the linkage groups. Segregation distortion was observed for 6 of 103 markers in the female map. The average distance between markers was 14.53 cM and ranged from 4.4 to 24.8 cM. The male map included 144 markers that formed 35 linkage groups. Ten markers remained unlinked in male map. Segregation distortion was observed for 7 of 144 markers in the male map. The total dis- tance of male map covered 1617 cM. The average distance between markers was 16.36 cM. The male map was 32.6% longer than the female map, which may reflect sex-specific recombination rates in Chinese shrimp. The common map was composed of 216 markers, including in 44 linkage groups covering a total distance of 1772.1 cM. Two markers remained unlinked. No distorted markers of 216 markers were shown in the common map. The distance between markers was 10.42 cM. An average estimated genome size for the Chinese shrimp was 2420 cM, which was consistent with the relative size of the Penaeid genome. The distribution of AFLP markers was relatively even in chromosomes of Chi- nese shrimp maps. The linkage analysis presented in this work provided some insight in 展开更多
关键词 AFLP 海洋渔业 中国
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