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几种动物病毒的基因芯片检测技术 被引量:25
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作者 杨素 花群义 +7 位作者 徐自忠 周晓黎 杨晶焰 董俊 杨云庆 贾建军 谭德勇 赖建华 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2004年第3期35-39,共5页
分别用水疱性口炎病毒、蓝舌病病毒、口蹄疫病毒、猪瘟病毒、牛病毒性腹泻病毒、鹿流行性出血热病毒和赤羽病病毒各一段高度保守的基因片段构建质粒 ,在此基础上制备了芯片探针。提取样品中的核酸 ,经反转录和荧光标记后滴加到芯片上进... 分别用水疱性口炎病毒、蓝舌病病毒、口蹄疫病毒、猪瘟病毒、牛病毒性腹泻病毒、鹿流行性出血热病毒和赤羽病病毒各一段高度保守的基因片段构建质粒 ,在此基础上制备了芯片探针。提取样品中的核酸 ,经反转录和荧光标记后滴加到芯片上进行特异性杂交 ,对杂交结果扫描检测 ,可同时对上述 7种动物传染病进行快速、准确的诊断 ,此方法敏感性高 ,特异性强 ,适合于大批动物高通量检疫。 展开更多
关键词 动物病毒 基因芯片 检测技术 水疱性口炎病毒 蓝舌病病毒 口蹄疫病毒 猪瘟病毒 牛病毒性腹泻病毒
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用基因芯片技术研究青少年肾阳虚体质差异表达基因 被引量:25
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作者 倪红梅 吴艳萍 何裕民 《上海中医药杂志》 北大核心 2004年第6期3-5,共3页
利用基因芯片技术筛选、分析青少年肾阳虚体质者外周血白细胞的差异表达基因 ,从基因水平初步探究青少年肾阳虚体质的机理。利用体外转录方法 ,将青少年肾阳虚体质组与同年龄段的正常体质组外周血白细胞mRNA合成为标记有不同荧光的cDNA... 利用基因芯片技术筛选、分析青少年肾阳虚体质者外周血白细胞的差异表达基因 ,从基因水平初步探究青少年肾阳虚体质的机理。利用体外转录方法 ,将青少年肾阳虚体质组与同年龄段的正常体质组外周血白细胞mRNA合成为标记有不同荧光的cDNA探针 ,运用杂交互补原理筛选差异表达基因。结果 :共筛选出 12 7条符合标准的差异表达基因 ,其中 6 3条呈上调表达 ,6 4条呈下调表达。提示 :与青少年肾阳虚体质相关的基因表达涉及到免疫相关、发育相关、细胞生长、细胞受体、细胞信号和传递蛋白、蛋白翻译合成等。 展开更多
关键词 基因芯片 肾阳虚 体质 筛选 差异表达
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禽流感病毒分型基因芯片的研制 被引量:27
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作者 韩雪清 林祥梅 +5 位作者 侯义宏 吴绍强 刘建 梅琳 贾广乐 杨泽晓 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1241-1249,共9页
【目的】禽流感病毒是一种全球重要的人和动物呼吸道病病原,快速确定其不同亚型对于全球流感监测具有重要的意义。本研究意在研制一种可同时鉴定禽流感病毒所有亚型的方法。【方法】根据GenBank上已发表的禽流感病毒不同亚型(16个HA亚型... 【目的】禽流感病毒是一种全球重要的人和动物呼吸道病病原,快速确定其不同亚型对于全球流感监测具有重要的意义。本研究意在研制一种可同时鉴定禽流感病毒所有亚型的方法。【方法】根据GenBank上已发表的禽流感病毒不同亚型(16个HA亚型和9个NA亚型)的基因序列,设计合成了25对特异性引物和1对通用引物,然后以各亚型病毒的参考株RNA作为模板,建立扩增不同亚型的多重RT-PCR方法。参考各亚型病毒靶cDNAs区域的保守序列设计了52条亚型特异的探针,进而利用扩增的各亚型病毒的靶cDNAs对其特异性进行评价。在此基础上,将设计好的探针点制到处理好的玻片上,制备了禽流感病毒分型鉴定基因芯片,结合所建立的扩增不同亚型的多重RT-PCR方法,开发了禽流感病毒亚型鉴定基因芯片试剂。利用收集自49个地区的2653份标本对其特异性和敏感性进行了初步评价。【结果】用于评价的各亚型参考毒株均出现良好的特异性杂交信号,检测的敏感度可达2.47PFU/mL或2.5ng靶DNA片段,而且与禽类常见的IBV、NDV等6种病毒均无交叉反应。【结论】证明该病毒分型基因芯片具有良好的特异性、敏感性。 展开更多
关键词 禽流感病毒 分型 基因芯片 杂交 检测
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二乙基亚硝胺所诱导大鼠肝癌表达上调的基因 被引量:22
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作者 阚卫兵 方肇勤 +4 位作者 管冬元 赵晓珍 吴中华 盛学仕 高必峰 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第20期2420-2426,共7页
目的:首次大范围地观察二乙基亚硝胺(DEN)诱导的大鼠肝癌组织基因表达的差异,探索DEN诱发肝癌的分子机制.方法:DEN诱导大鼠肝癌,常规抽提和纯化RNA,采用AffymetrixRat230AGeneChip及技术比较肝癌组织与正常大鼠肝组织基因表达的差异.结... 目的:首次大范围地观察二乙基亚硝胺(DEN)诱导的大鼠肝癌组织基因表达的差异,探索DEN诱发肝癌的分子机制.方法:DEN诱导大鼠肝癌,常规抽提和纯化RNA,采用AffymetrixRat230AGeneChip及技术比较肝癌组织与正常大鼠肝组织基因表达的差异.结果:在芯片的15710个基因中,肝癌有84.54%的基因阳性表达,肝癌基因表达在正常肝脏5倍以上的有509个,其中325个为EST片段,已知基因184个,其中的168个基因可以检索到有关文献的报道.在这168个基因中,有100个基因被发现与肿瘤有关,其中有36个与肝癌有关;有4个基因与肝脏有关;另有64个基因与肿瘤和肝脏无关.结论:?DEN诱发大鼠肝癌的后基因组变化中168个基因值得优先关注. 展开更多
关键词 肝癌 基因 基因芯片 大鼠 二乙基亚硝胺 癌基因表达 大鼠肝癌 表达上调 AFFYMETRIX genechip
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小鼠运动性疲劳相关基因筛选的初步研究 被引量:18
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作者 田振军 张志琪 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期4-6,F002,共4页
目的:运用基因芯片技术筛选运动性疲劳的相关基因。方法:将小鼠2304点阵的基因芯片中的2201条待研究基因,与对照组和疲劳组小鼠脑组织中抽提的mRNA并被Cy3和Cy5逆转录荧光标记制成的cDNA混合探针杂交,通过芯... 目的:运用基因芯片技术筛选运动性疲劳的相关基因。方法:将小鼠2304点阵的基因芯片中的2201条待研究基因,与对照组和疲劳组小鼠脑组织中抽提的mRNA并被Cy3和Cy5逆转录荧光标记制成的cDNA混合探针杂交,通过芯片扫描仪对其荧光强度进行扫描,经计算机进行分析。结果:在待研究的2201条基因中,与中枢疲劳相关的117条基因具有显著性表达差异,其中上调表达的基因有63条,下调表达的基因有54条。结论:应用基因芯片技术可同时检测与运动性中枢疲劳相关的多个基因的差异表达,具有高通量、并行性和快速准确等优点。 展开更多
关键词 运动性疲劳 基因表达 基因芯片 小鼠 实验研究
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生物芯片、基因组学和蛋白质组学在药物研发中的应用 被引量:13
6
作者 蔡钦生 冯美卿 +1 位作者 黄海 周珮 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第10期795-800,共6页
关键词 生物芯片 基因芯片 蛋白质芯片 基因组学 蛋白质组学 芯片药房 非典型肺炎
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Overexpression of microRNA-124 promotes the neuronal differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells 被引量:16
7
作者 Defeng Zou Yi Chen +2 位作者 Yaxin Han Chen Lv Guanjun Tu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2014年第12期1241-1248,共8页
microRNAs (miRNAs) play an important regulatory role in the self-renewal and differentiation of stem cells. In this study, we examined the effects of miRNA-124 (miR-124) overexpression in bone marrow-derived mesen... microRNAs (miRNAs) play an important regulatory role in the self-renewal and differentiation of stem cells. In this study, we examined the effects of miRNA-124 (miR-124) overexpression in bone marrow-derived mesenchymal stem cells. In particular, we focused on the effect of overexpression on the differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells into neurons. First, we used GeneChip technology to analyze the expression of miRNAs in bone marrow-derived mesen- chymal stem cells, neural stem cells and neurons, miR-124 expression was substantially reduced in bone marrow-derived mesenchymal stem cells compared with the other cell types. We con- structed a lentiviral vector overexpressing miR-124 and transfected it into bone marrow-derived mesenchymal stem cells. Intracellular expression levels of the neuronal early markers [3-III tu- bulin and microtubule-associated protein-2 were significantly increased, and apoptosis induced by oxygen and glucose deprivation was reduced in transfected cells. After miR-124-transfected bone marrow-derived mesenchymal stem cells were transplanted into the injured rat spinal cord, a large number of cells positive for the neuronal marker neurofilament-200 were observed in the transplanted region. The Basso-Beattie-Bresnahan locomotion scores showed that the motor function of the hind limb of rats with spinal cord injury was substantially improved. These re- sults suggest that miR-124 plays an important role in the differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells into neurons. Our findings should facilitate the development of novel strategies for enhancing the therapeutic efficacy of bone marrow-derived mesenchymal stem cell transplantation for spinal cord injury. 展开更多
关键词 nerve regeneration microRNA-124 LENTIVIRUS OVEREXPRESSION bone marrow-de-rived mesenchymal stem cells neural stern cells spinal cord injury NEUROGENESIS genechip motor function NSFC grant neural regeneration
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HIV亚型分析基因芯片的制备及应用 被引量:14
8
作者 黎志东 徐志凯 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 2003年第3期164-166,共3页
目的 建立新的HIV亚型分析方法 ,并检测其特异性及敏感性。方法 HIV 111个亚型及HIV 2的env基因C2 V3区一段核苷酸序列 ,用芯片点样机点样于经预处理的玻片 ,制备成HIV亚型分析基因芯片 ,并用其对 15份HIV阳性样本进行亚型分析 ,所... 目的 建立新的HIV亚型分析方法 ,并检测其特异性及敏感性。方法 HIV 111个亚型及HIV 2的env基因C2 V3区一段核苷酸序列 ,用芯片点样机点样于经预处理的玻片 ,制备成HIV亚型分析基因芯片 ,并用其对 15份HIV阳性样本进行亚型分析 ,所得结果与目前常用HIV亚型分析方法 基因序列分析法所得结果进行比较。结果 制备的基因芯片对 15份HIV阳性样本检测结果为 :样本 0 1、0 2、0 3、0 5、0 8、0 9、11、12、13、15为HIV 1B亚型 ;0 6、0 7为HIV 1C亚型 ;0 4、10、14为HIV 1E亚型。结论 制备的基因芯片亚型分析结果与基因序列分析法所得结果完全符合 ,敏感性高、特异性好 ,并且具有操作简单、省时、价廉等特点 ,有望推广应用。 展开更多
关键词 HIV 基因芯片 制备 临床应用 特异性 敏感性 检测 亚型
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基因芯片技术在检测痰涂阳肺结核患者结核分枝杆菌耐药性的应用效果 被引量:18
9
作者 陈林 沈静 +1 位作者 朱大冕 王晓英 《检验医学与临床》 CAS 2017年第9期1220-1223,共4页
目的探讨基因芯片技术在结核病耐多药快速检测中的应用效果。方法收集重庆市五个区县1 030例涂阳肺结核患者的痰标本,同时进行罗氏培养和基因芯片检测异烟肼、利福平耐药性,培养后的菌株用比例法药敏试验检测异烟肼、利福平的耐药性。... 目的探讨基因芯片技术在结核病耐多药快速检测中的应用效果。方法收集重庆市五个区县1 030例涂阳肺结核患者的痰标本,同时进行罗氏培养和基因芯片检测异烟肼、利福平耐药性,培养后的菌株用比例法药敏试验检测异烟肼、利福平的耐药性。以比例法药敏试验为判断标准,对基因芯片的检测效果进行分析。结果对同时有两种耐药性检测结果的958例患者进行了统计学分析,基因芯片对异烟肼检测结果和比例法药敏试验比较差异无统计学意义(P>0.05),符合率94.1%,灵敏度80.2%,特异度95.9%,阳性预测值71.8%,阴性预测值97.4%,Kappa值为0.724。基因芯片对利福平检测结果和比例法药敏试验比较差异无统计学意义(P>0.05),符合率96.3%,灵敏度86.4%,特异度97.5%,阳性预测值80.9%,阴性预测值98.3%,Kappa值为0.815。此外,基因芯片对异烟肼和利福平耐药结核病检测结果和比例法药敏试验比较差异无统计学意义(P>0.05),符合率96.9%,灵敏度78.3%,特异度98.3%,阳性预测值78.3%,阴性预测值98.3%,Kappa值为0.766。结论基因芯片技术可用于耐多药结核病早期快速筛查和诊断,以弥补传统药敏试验的不足,但该方法对检测环境要求较高,需对操作人员严格培训。 展开更多
关键词 肺结核 基因芯片 异烟肼 利福平 比例法药敏试验
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地中海实蝇及其近缘种基因芯片检测研究 被引量:17
10
作者 李文芬 余道坚 +3 位作者 颜亨梅 李建光 徐浪 任鲁风 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期61-67,共7页
本研究选择线粒体DNA(mtDNA)细胞色素氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)为分子标记基因,以双翅目实蝇科昆虫DNA序列为目标,建立了我国进境植物检疫害虫地中海实蝇Ceratitis capitata、芒果小条实蝇C.cosyra和纳塔尔小条实蝇C.rosa等生物芯片检测方法... 本研究选择线粒体DNA(mtDNA)细胞色素氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)为分子标记基因,以双翅目实蝇科昆虫DNA序列为目标,建立了我国进境植物检疫害虫地中海实蝇Ceratitis capitata、芒果小条实蝇C.cosyra和纳塔尔小条实蝇C.rosa等生物芯片检测方法。地中海实蝇及其近缘种检测芯片由检测探针(实蝇科通用探针1条,小条实蝇属通用探针1条,地中海实蝇、芒果小条实蝇和纳塔尔小条实蝇近缘种探针2条和种特异探针4条)、质控探针(定位点探针、阳性质控、阴性质控和空白对照探针各1条)组成。芯片检测结果表明,检测探针特异性强,能实现上述3种实蝇的种类快速区分和准确鉴定;检测方法稳定性好,地中海实蝇不同虫态(卵、幼虫、蛹和成虫)和不同地理种群检测结果完全一致。地中海实蝇生物芯片检测技术将为我国进口果蔬中检疫性实蝇快速筛查和种类鉴定提供检测方法,同时,还可应用到其他属的实蝇以及相关害虫的检疫中,为有害生物的快速鉴定提供了新方法。 展开更多
关键词 实蝇科 近缘种 基因芯片 分类鉴定
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用基因芯片鉴别诊断四种水泡性疾病 被引量:13
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作者 秦智锋 钟安清 +1 位作者 杨宝华 叶奕优 《中国病毒学》 CSCD 2003年第2期174-177,F003,共5页
为了对临床上症状非常相似的四种水泡性动物疾病进行大批量、快速准确的检测,我们尝试用基因芯片技术来对这四种水泡性疾病进行快速鉴别诊断。用Qiaquick 96 plate Kit对扩增的39个基因目的片段进行纯化,TE调配浓度至0.36礸/礚,于GMS41... 为了对临床上症状非常相似的四种水泡性动物疾病进行大批量、快速准确的检测,我们尝试用基因芯片技术来对这四种水泡性疾病进行快速鉴别诊断。用Qiaquick 96 plate Kit对扩增的39个基因目的片段进行纯化,TE调配浓度至0.36礸/礚,于GMS417点样仪上按预选设计好的布阵方式点样,然后经紫外灯照射进行紫外交联等一系列处理。用Salmon进行非特异性杂交检测芯片点样的质量。大量抽提组织中FMDV和细胞上清液中的SVDV的总RNA,随机引物反转录的同时采用随机荧光标记法,标记FMDV和SVDV。标记好的cDNA超声波随机打断后进行特异性杂交,以最佳光扫描强度进行扫描,Imagene软件扫描结果,对两者信号进行对比,结合各病毒相对应的坐标,可鉴别诊断出四种动物的水泡性疾病病毒。本方法不但快速、灵敏、准确性高,而且可实现对大批量货物的集成化检测,满足我国快速通关的要求。 展开更多
关键词 水泡性疾病 鉴别诊断 基因芯片 口蹄疫病毒 猪水泡病病毒
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DEN诱发大鼠肝癌过程中肝组织基因表达谱的演变 被引量:17
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作者 盛学仕 方肇勤 +4 位作者 管冬元 赵晓珍 吴中华 阚卫兵 高必峰 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期737-746,共10页
目的:揭示肝癌诱发过程中肝组织基因表达谱的演变,为中医药防治原发性肝癌提供参考。方法:采用DEN诱发大鼠肝癌,分别于诱癌的第4周、8周、16周、20周(肝癌形成)切取肝(合肝癌)组织,常规提取RNA,Affymetrix Rat 230A GeneChip及技术检测... 目的:揭示肝癌诱发过程中肝组织基因表达谱的演变,为中医药防治原发性肝癌提供参考。方法:采用DEN诱发大鼠肝癌,分别于诱癌的第4周、8周、16周、20周(肝癌形成)切取肝(合肝癌)组织,常规提取RNA,Affymetrix Rat 230A GeneChip及技术检测大鼠肝组织基因表达的差异和演变。结果:在芯片的15710个基因中,正常组有9225个基因表达,诱癌4周表达增至9396个,8周增至9872个,16周增至10496个,20周有10420个。在肝癌诱发过程中,存在大量基因表达的消长以及高表达基因数的增加,其中部分已知基因的结果。结论:DEN诱发大鼠肝癌过程中基因组变化是十分复杂的,而且文献追踪表明,国内外对在这些基因的功能及其与肝癌发生、发展的关系大多不明确。因此,如何逐一找到那些起着关键作用的基因,进一步阐释其在肝癌的发生、发展和转归中的作用,及其与中医证候演变和相应治法的关系,是今后中医基础理论实验研究的重要方向。 展开更多
关键词 肝癌 基因 大鼠 二乙基亚硝胺 动物模型 基因芯片
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雄激素依赖性前列腺癌细胞在其雄激素受体阻断后细胞周期基因表达的改变 被引量:13
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作者 汪涌 邵晨 +3 位作者 师长宏 张运涛 刘凡 王禾 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1337-1338,共2页
目的 测定前列腺癌细胞系LNCaP在雄激素受体 (AR)阻断前后细胞周期基因表达的变化 ,探讨AR对细胞周期基因表达的影响。方法 在LNCaP细胞中加入氟他胺 ,然后抽提正常LNCaP细胞和加入氟他胺的LNCaP细胞中的mRNA制备cDNA探针 ,应用基因... 目的 测定前列腺癌细胞系LNCaP在雄激素受体 (AR)阻断前后细胞周期基因表达的变化 ,探讨AR对细胞周期基因表达的影响。方法 在LNCaP细胞中加入氟他胺 ,然后抽提正常LNCaP细胞和加入氟他胺的LNCaP细胞中的mRNA制备cDNA探针 ,应用基因芯片技术观察两者细胞周期基因表达差异情况。结果 TRIZOL法提取细胞mRNA合格 ,从 8465个点位中筛选出差异表达基因共 3 2 6个 ,占 3 .93 % ;其中 97条下调 ,2 19条上调。其中与细胞周期明显相关的共有 8条基因 ,分别为CDC10、NRAS、BTG1、Wee1hu、CLK3、DKFZP5 64A12 2、CDKN1A和Btg2。其中尤以Btg1和CDKN1A表达水平较高。结论 雄激素受体在前列腺癌细胞中对细胞周期有着巨大影响。雄激素受体引起的前列腺癌细胞周期变化有多种基因参与。其中 ,CDKN1A基因和Btg1基因作用较大 ,并可能以p5 3非依赖途径作用于前列腺癌细胞。 展开更多
关键词 前列腺癌细胞 细胞周期 雄激素受体 基因表达 阻断 氟他胺 LNCaP细胞 RNA CDC10 基因作用
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基因芯片技术在药物研究和开发中的应用 被引量:12
14
作者 陆祖宏 何农跃 孙啸 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期81-86,共6页
基因芯片技术能够对细胞或生物体中核酸序列信息进行快速、高通量和低成本的检测和分析。基因芯片已在化学药物的筛选和评价 ,新的药物作用靶分子的确定 ,药物的代谢和毒性及其个体化差异的检测 ,以及药物作用机理等方面得到了应用 ,并... 基因芯片技术能够对细胞或生物体中核酸序列信息进行快速、高通量和低成本的检测和分析。基因芯片已在化学药物的筛选和评价 ,新的药物作用靶分子的确定 ,药物的代谢和毒性及其个体化差异的检测 ,以及药物作用机理等方面得到了应用 ,并将为在分子水平上建立现代中药理论方面发挥重要的作用。 展开更多
关键词 基因芯片 药物基因组 中药现代化 药物研究 药物开发
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青少年肾阳虚体质差异表达基因研究 被引量:12
15
作者 倪红梅 何裕民 方盛泉 《辽宁中医杂志》 CAS 北大核心 2007年第9期1220-1222,共3页
目的:利用基因芯片技术筛选、分析青少年肾阳虚体质者外周血白细胞的差异表达基因,从基因水平初步探究青少年肾阳虚体质的机理。方法:利用体外转录方法,将青少年肾阳虚体质组与同年龄段的正常体质组外周血白细胞mRNA合成为标记有不同荧... 目的:利用基因芯片技术筛选、分析青少年肾阳虚体质者外周血白细胞的差异表达基因,从基因水平初步探究青少年肾阳虚体质的机理。方法:利用体外转录方法,将青少年肾阳虚体质组与同年龄段的正常体质组外周血白细胞mRNA合成为标记有不同荧光的cDNA探针,运用杂交互补原理筛选差异表达基因。结果:共筛选出127条符合标准的差异表达基因,63条呈上调表达,64条呈下调表达。提示:与青少年肾阳虚体质相关的基因表达涉及到免疫相关、发育相关、细胞生长、细胞受体、细胞信号和传递蛋白、蛋白翻译合成等。其中,PSMB7基因及CXCR4基因的表达差异均较明显,提示这两条基因可能与青少年肾阳虚体质密切相关。 展开更多
关键词 基因芯片 肾阳虚 青少年 体质 筛选 差异表达
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用基因芯片研究同一血管瘤增生和消退期差异表达基因 被引量:11
16
作者 张莉 王炜 +4 位作者 祁佐良 董佳生 宋怀东 杨劲松 林晓曦 《中华整形外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期452-455,共4页
目的 利用基因表达谱芯片技术寻找血管瘤增生期到消退期之间差异表达的基因 ,初步探索血管瘤增生与自然消退的分子机制。方法 将 4 0 96条cDNA用点样仪点在特制玻片上制备成表达谱芯片 ;将同一血管瘤患儿的增生期和消退期瘤体组织的m... 目的 利用基因表达谱芯片技术寻找血管瘤增生期到消退期之间差异表达的基因 ,初步探索血管瘤增生与自然消退的分子机制。方法 将 4 0 96条cDNA用点样仪点在特制玻片上制备成表达谱芯片 ;将同一血管瘤患儿的增生期和消退期瘤体组织的mRNA逆转录为cDNA、分别标记Cy3和Cy5两种荧光 ,制备成cDNA探针 ,与表达谱芯片杂交 ,通过计算机扫描、数据处理筛选出差异表达的基因。结果 差异表达的基因有 194条 ,其中 115基因条上调 ,79条下调 :①增生期一些细胞因子和生长因子高表达 ;②消退期细胞凋亡因子表达增加 ;③血管形成和原癌基因参与血管瘤的增生 ;④线粒体激活的细胞凋亡通路和Wnt β catenin通路可能与血管瘤的发生和发展有关。 结论 血管瘤的发生可能是细胞增殖和凋亡比例失调所致。 展开更多
关键词 基因芯片 表达谱 血管瘤 细胞增殖 细胞凋亡 差异表达基因
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猪传染性胃肠炎病毒检测基因芯片的构建 被引量:14
17
作者 曹三杰 黄小波 +1 位作者 文心田 肖国生 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期121-124,共4页
采用PCR扩增制备TGEV的靶基因并进行纯化,对基因芯片的最佳靶基因点样质量浓度、探针质量浓度、杂交温度、杂交时间进行筛选,选择构建检测芯片的最适靶基因,进行基因芯片探针最佳标记方法试验。结果表明,质粒PCR扩增和采用异丙醇沉... 采用PCR扩增制备TGEV的靶基因并进行纯化,对基因芯片的最佳靶基因点样质量浓度、探针质量浓度、杂交温度、杂交时间进行筛选,选择构建检测芯片的最适靶基因,进行基因芯片探针最佳标记方法试验。结果表明,质粒PCR扩增和采用异丙醇沉淀纯化的靶基因质量好,基因芯片最佳靶基因点样质量浓度为200mg/L,最佳探针质量浓度为3000μg/L,预杂交时间为1h,杂交时间为3~6h,杂交温度为48℃,以S、S3、sM、M、N、ORF7、POL等7个靶基因为构建TGEV检测芯片的最适靶基因,确定了多重PCR扩增标记TGEV探针的最佳体系,Cy3-dCTP标记浓度为2.5μmol/L,构建的TGEV检测芯片与标记的混合探针杂交效果好。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 检测 基因芯片 构建
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用主成分分析探索不同中药组分配伍干预脑缺血的基因表达模式 被引量:15
18
作者 荆志伟 周才秀 +7 位作者 王忠 张占军 王丽颖 胡木林 武红莉 张亮 李澎涛 王永炎 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2010年第2期164-167,共4页
目的比较清开灵主要组分黄芩苷、栀子苷及其配伍干预脑缺血损伤的基因表达模式。方法12只4周龄小鼠随机分为黄芩苷组(BA组)、栀子苷组(JA组)、栀子苷+黄芩苷组(BJ组)、尼莫地平组(NM组),建立全脑缺血再灌注小鼠模型后,各组分别给予尾静... 目的比较清开灵主要组分黄芩苷、栀子苷及其配伍干预脑缺血损伤的基因表达模式。方法12只4周龄小鼠随机分为黄芩苷组(BA组)、栀子苷组(JA组)、栀子苷+黄芩苷组(BJ组)、尼莫地平组(NM组),建立全脑缺血再灌注小鼠模型后,各组分别给予尾静脉注射黄芩苷、栀子苷、栀子苷+黄芩苷以及尼莫地平。抽提小鼠脑组织的总RNA,制备小鼠全基因组表达谱,对其进行基因本体论功能分类,构建相关系数矩阵,对差异表达的细胞黏附相关基因进行主成分分析。结果获取16463个小鼠脑测全基因组表达谱,筛选出32个差异表达的细胞黏附相关基因。主成分分析结果显示,4组的前2个主成分的累积贡献度为100%,BJ组总得分大于单一组分组,NM组对细胞黏附相关基因干预的总得分高于BA和JA组。各次检测的主成分分布显示,NM组和3个中药组均距离较远,BJ组和BA组的距离均近于JA组。结论黄芩苷、栀子苷及其配伍均能有效干预细胞黏附相关基因,配伍后的干预对黏附相关功能基因的影响大于单一组分组,其基因表达模式和黄芩苷相近。 展开更多
关键词 黄芩苷 栀子苷 组分配伍 脑缺血 基因芯片 主成分分析 细胞黏附
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基因芯片技术在肝癌转移相关基因筛选中的应用 被引量:10
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作者 叶青海 汤钊猷 +6 位作者 钦伦秀 马曾辰 吴志全 叶胜龙 刘银坤 樊嘉 王心伟 《中华肝胆外科杂志》 CAS CSCD 2004年第10期679-682,共4页
目的 在全基因组范围内筛选与肝细胞癌转移相关的基因。方法 采用基因芯片技术比较 2 0例不伴与伴有肝内转移 (门静脉癌栓 )的肝细胞癌之间基因表达谱的差异 ,寻找与肝癌转移相关的基因。基因芯片由美国国立卫生研究院癌症研究所 (NCI... 目的 在全基因组范围内筛选与肝细胞癌转移相关的基因。方法 采用基因芯片技术比较 2 0例不伴与伴有肝内转移 (门静脉癌栓 )的肝细胞癌之间基因表达谱的差异 ,寻找与肝癌转移相关的基因。基因芯片由美国国立卫生研究院癌症研究所 (NCI)制定 ,每张芯片有 9984个点、含 9180个基因。基因芯片实验采用双色荧光直接标记法 ,每例病人的无瘤肝组织总RNA 10 0 μg用红色荧光素Cy3 dUTP标记 ,其相应肝癌组织总RNA 2 0 0 μg用绿色荧光素Cy5 dUTP标记。混合后与芯片上的基因进行杂交。采用NCI开发的BRB -阵列软件包中先导的“分类比较法”(ClassComparisonTool)对基因芯片资料进行统计分析以寻找伴和不伴转移的肝癌之间表达有差异的基因。结果 伴有转移的肝癌与不伴转移的肝癌之间基因表达谱差异明显 ,在 9180个基因中 2 2 4个基因表达差异有显著性 (P <0 0 0 2 ) ,从中筛选出 36个在两组间差异更加明显、可能与肝癌转移密切相关的候选基因 ,其中许多基因是属于细胞黏附和基质降解方面的 ,如骨桥蛋白 ,alpha 9integrin ,interleukin 2receptor,serineproteinaseinhibitormember 5 ,MMP9,leukocyteimmunoglobulin likereceptorAmember2及CD37antigen等 ,这些基因在肝癌转移过程中可能起了非常重要的作用。结? 展开更多
关键词 肝癌 癌转移 基因芯片技术 NCI 肝细胞癌 相关基因 细胞黏附 总RNA 红色荧光 美国国立卫生研究院
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创伤性深静脉血栓形成中补体相关基因表达变化的实验研究 被引量:15
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作者 莫建文 黄河 +7 位作者 张春强 王兵 何飞 殷亮 徐军 陈昊 赵学凌 李世和 《中国急救医学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期244-246,共3页
目的应用基因芯片技术研究创伤性深静脉血栓(TDVT)形成过程中补体相关基因的表达变化规律,探讨其在创伤性深静脉血栓形成中的意义。方法将150只SD大鼠随机分为正常对照(A)组和模型组。模型组根据造模后的不同生物学状态再分为6组:创伤即... 目的应用基因芯片技术研究创伤性深静脉血栓(TDVT)形成过程中补体相关基因的表达变化规律,探讨其在创伤性深静脉血栓形成中的意义。方法将150只SD大鼠随机分为正常对照(A)组和模型组。模型组根据造模后的不同生物学状态再分为6组:创伤即刻(B)组、血栓形成前期(C)组、高峰期血栓形成(D)组、血栓消退期(E)组、血栓不消退(F)组和血栓不形成(G)组,在相应时相点无创切取股静脉血管组织,随后抽取总RNA,用Genechip RatGenome4302.0芯片测定股静脉RNA表达并分析补体基因表达变化情况。结果在深静脉血栓形成演化过程中,共找到与补体相关基因73个,其中已知功能基因共33个,未知基因共40个,48个基因无差异表达,包括Acdc、Adn、Bf、C1qb、C2、C3、C4bpa、C5r1、C6、Cfi、Masp1、Masp2、Pfc、S100b等在内的25个基因呈显著差异性表达。结论在创伤性肢体深静脉血栓形成中,补体相关基因是影响血栓生物学状态的重要因素之一。 展开更多
关键词 创伤 深静脉血栓形成 补体系统 基因芯片
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