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真菌核糖体基因间隔区研究概况 被引量：29
1
作者 余仲东 张星耀 曹支敏 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2000年第2期107-112,共6页
真菌基因组核糖体基因间隔区是分子生物技术研究的重要片段。本文综述了PCR:RFLP技术。
关键词 真菌 核糖体基因间隔区 PCR-RFLP 测序技术
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广东地区地中海贫血筛检者的基因检测和类型分析 被引量：38
2
作者 徐韫健 廖颖茵 +1 位作者 高俊 林卫虹 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第2期285-289,293,共6页
目的分析2016-2017年广东地区地中海贫血(地贫)的基因检测情况及少见地贫基因型病例,为临床诊断地贫及可疑病例提供理论参考。方法对1 814例在广州医科大学第一附属医院就诊的和PCR反向点杂交技术检测α珠蛋白的变异基因,应用PCR反向点... 目的分析2016-2017年广东地区地中海贫血(地贫)的基因检测情况及少见地贫基因型病例,为临床诊断地贫及可疑病例提供理论参考。方法对1 814例在广州医科大学第一附属医院就诊的和PCR反向点杂交技术检测α珠蛋白的变异基因,应用PCR反向点杂交技术检测β-珠蛋白的17种常见突变基因,同时联合分析部分患者的血常规和血红蛋白电泳检测数据,对疑似地贫但基因检测阴性的样本进一步采用测序技术或Gap-PCR技术进行检测分析。结果共检出地贫基因阳性496例,总阳性率27.34%,其中α地贫353例,阳性率19.46%,β地贫127例,阳性率7.00%,α+β地贫16例,阳性率0.88%。1814例中出现23例表型和基因型不一致的病例,进一步检测分析发现7例少见地贫基因型,分别为少见β地贫(CD54-58)1例、中国型Gγ+(Aγδβ)0缺失2例、东南亚型缺失1例,α地贫不确定基因型1例和香港型地贫基因2例。结论本地区α地贫阳性率高于β地贫;临床工作中应注意少见基因型地贫的出现,结合表型与基因型诊断疑难病例,必要时用基因测序和Gap-PCR等技术检测,以防漏检。 展开更多
关键词 地中海贫血 红细胞参数 基因测序
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中国东南沿海青蟹属不同种类的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育 被引量：26
3
作者 林琪 李少菁 +1 位作者 黎中宝 王桂忠 《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期268-273,共6页
对采自中国东南沿海青蟹属的4种青蟹锯缘青蟹Scylla serrata(Forskal,1775),紫螯青蟹S.tranquebarica(Fab-ricius,1798),榄绿青蟹S.olivacea(Herbst,1796),拟穴青蟹S.paramamosain(Estampador,1949)的线粒体COI基因片段进行了测定,分析... 对采自中国东南沿海青蟹属的4种青蟹锯缘青蟹Scylla serrata(Forskal,1775),紫螯青蟹S.tranquebarica(Fab-ricius,1798),榄绿青蟹S.olivacea(Herbst,1796),拟穴青蟹S.paramamosain(Estampador,1949)的线粒体COI基因片段进行了测定,分析研究了其种间遗传差异及系统发育关系.研究结果显示:4种青蟹在COI基因片段上存在差异,种间序列差异远大于种内差异.青蟹属在我国的优势种与GenBank上的S.paramamosain的遗传距离为0.001 3,与S.ser-rata的遗传距离为0.121 3.序列特征、遗传距离和系统进化等分析结果表明中国青蟹属的优势种为拟穴青蟹S.para-mamosain. 展开更多
关键词 青蟹属 MTDNA COI 基因序列 系统发育
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罕见的B(A)表型血清学及基因检测 被引量：28
4
作者 宿兰 杨世英 +2 位作者 廉维 高军 李执如 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期200-202,共3页
目的对1例B(A)表现型用血清学及基因检测进行鉴定。方法使用2个厂家的单克隆抗-A、抗-B血型定型试剂;进口单克隆抗-A、抗-B血型定型试剂;Diamed凝胶系统;人源抗-A、抗-B、抗-H血型试剂和试剂红细胞,用常规血清学方法对被检血样进行ABO... 目的对1例B(A)表现型用血清学及基因检测进行鉴定。方法使用2个厂家的单克隆抗-A、抗-B血型定型试剂;进口单克隆抗-A、抗-B血型定型试剂;Diamed凝胶系统;人源抗-A、抗-B、抗-H血型试剂和试剂红细胞,用常规血清学方法对被检血样进行ABO血型定型。采用吸收放散方法;分子生物学PCR-RFLP方法;ABO基因第6、7外显子的PCR产物正反向测序方法进一步分析。结果被检血样红细胞及血清经2种单克隆抗-A、抗-B和试剂红细胞进行抗原抗体鉴定:正定型结果不一致;正反定型结果不符合。用吸收放散方法,人源抗-A、抗-B、抗-H;进口单克隆抗-A、抗-B血型定型试剂和Diamed凝胶系统检测:有弱A抗原、强H抗原检出;PCR-RFLP基因分型:检出B/O基因;基因克隆测序证实为:B(A)700/O*02。结论证实该例为B(A)700/O*02。 展开更多
关键词 单克隆抗体 血型血清学 基因克隆测序 B(A)型
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我国犬埃立克体病病原的分离与鉴定 Ⅰ.病原16S rRNA基因序列测定与分析 被引量：24
5
作者 潘华 孙洋 +3 位作者 佟世德 马玉海 温博海 陈香蕊 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期467-470,共4页
用实验动物接种法，分离保存我国某养犬基地犬埃立克体病病原。以此病原对易感犬接毒，接毒犬发病后采集急性期全血提取基因组，对病原 １６ Ｓｒ Ｒ Ｎ Ａ 基因进行扩增、克隆测序。结果，病原被保存在病犬血细胞内，并能成功地使健康... 用实验动物接种法，分离保存我国某养犬基地犬埃立克体病病原。以此病原对易感犬接毒，接毒犬发病后采集急性期全血提取基因组，对病原 １６ Ｓｒ Ｒ Ｎ Ａ 基因进行扩增、克隆测序。结果，病原被保存在病犬血细胞内，并能成功地使健康犬感染发病；检测到的 ２ 种致犬埃立克体病病原 １６ Ｓ ｒ Ｒ Ｎ Ａ 基因序列与国外已发现的相应病原基因序列有一定差异，显示其为不同菌株，分别命名为埃立克体 Ｇｚｈ ９８１ 株和 Ｇｚｈ９８２ 株。进一步分析表明，导致我国某养犬基地犬埃立克体病的病原为扁平埃立克体和犬埃立克体。 展开更多
关键词 犬埃立克体病 抗原 分离 鉴定 埃立克体 基因序列
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白蚁消化纤维素机理研究进展 被引量：17
6
作者 杨天赐 莫建初 程家安 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第1期110-115,共6页
白蚁利用自身及体内共生微生物分泌的纤维素酶降解食物中的纤维素成分,来满足新陈代谢需要。据美国国家生物技术信息中心GenBank数据库统计,目前已有4科6属9种白蚁及其体内共生物的纤维素酶基因被克隆测序。同源性分析表明,白蚁及其共... 白蚁利用自身及体内共生微生物分泌的纤维素酶降解食物中的纤维素成分,来满足新陈代谢需要。据美国国家生物技术信息中心GenBank数据库统计,目前已有4科6属9种白蚁及其体内共生物的纤维素酶基因被克隆测序。同源性分析表明,白蚁及其共生物编码内切β-1,4-葡聚糖酶的基因,在序列上有较高的相似性。 展开更多
关键词 白蚁 纤维素酶 共生微生物 基因克隆 基因序列
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阿尔茨海默病转基因动物模型:如何更接近病理特征? 被引量：21
7
作者 董贤慧 柴锡庆 《中国组织工程研究》 CAS CSCD 2013年第46期8075-8082,共8页
背景:目前阿尔茨海默病的病因、发病机制还不是十分清楚,很大程度上制约了阿尔茨海默病治疗药物的筛选,而主要障碍之一是缺少合适的动物模型。日趋成熟的转基因动物技术可以在活体上研究某一特定致病基因的作用,已成为阿尔茨海默病较为... 背景:目前阿尔茨海默病的病因、发病机制还不是十分清楚,很大程度上制约了阿尔茨海默病治疗药物的筛选,而主要障碍之一是缺少合适的动物模型。日趋成熟的转基因动物技术可以在活体上研究某一特定致病基因的作用,已成为阿尔茨海默病较为理想的动物模型。目的:综述近几年国内外阿尔茨海默病转基因动物模型的研究进展。方法:第一作者应用计算机检索2013年7月以前PubMed数据库、中国期刊全文数据库有关阿尔茨海默病转基因动物模型的文章,英文检索词为"Alzheimer’s disease,transgenic mouse,Animal model,dementia",中文检索词为"阿尔茨海默病,转基因动物,动物模型,痴呆"。最终选择41篇文献进行综述。结果与结论:阿尔茨海默病的病因是多元性的,遗传因素是其中的一个重要因素。现有的阿尔茨海默病转基因动物模型,包括单转基因模型、双转基因模型以及多重转基因模型。单转基因动物模型是通过重组DNA技术,将某一种突变的外源性基因片段整合到动物的基因组中,该模型只能研究阿尔茨海默病某一特定的病理变化;双转基因动物模型是通过重组DNA技术将两种外源性突变基因同时转染动物,相比单转基因模型,其病理变化与阿尔茨海默病更加吻合,但是仍然不能完全模拟疾病;多重转基因模型是利用不同的转基因鼠杂交或多个基因同时转入等方法,得到的多重转基因模型,该模型能更好的模拟临床阿尔茨海默病的发病过程和病理特征,但存在近亲衰退等缺点。各种动物模型都有其优点,但也存在着缺点,还需进一步建立更为完善的阿尔茨海默病转基因动物模型,更准确、完整地再现阿尔茨海默病的病理特征。 展开更多
关键词 组织构建 组织构建综述 阿尔茨海默病 痴呆 动物模型 转基因动物 病因 遗传因素 国家自然科学基金
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我国流行的4株狂犬病街毒株G基因序列及分子流行病学研究 被引量：18
8
作者 刘胜牙 严家新 +2 位作者 徐葛林 吴杰 郑新雄 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2004年第3期129-132,共4页
目的探讨我国流行的狂犬病毒(RV)基因差异,评价现有疫苗的适用性。方法通过RT-PCR并对其产物测序后获得4株RV街毒株的G基因序列以及G与M和L基因的区间序列。利用计算机分析软件比较4株RV与已经发表的毒株的核苷酸和推导的氨基酸序列。... 目的探讨我国流行的狂犬病毒(RV)基因差异,评价现有疫苗的适用性。方法通过RT-PCR并对其产物测序后获得4株RV街毒株的G基因序列以及G与M和L基因的区间序列。利用计算机分析软件比较4株RV与已经发表的毒株的核苷酸和推导的氨基酸序列。结果糖蛋白(GP)完整的编码基因序列长度为1575 bp。GP氨基酸序列同源性明显高于相应的核苷酸序列(除Mokola外),4株街毒与CTN的同源性高于aG株。GP不同区段比较显示,膜外区同源性高于膜内区。G-M区间核苷酸序列长度为5 bp;除广西4外,其余毒株100％同源。GL区间核苷酸序列长度为2,4 bp,越1与肥东同源性为100％。结论4株RV均属于基因I型。广西的毒株之间存在不同的来源。街毒与疫苗株之间基因存在差异。4株RV与SAD-B19进化途径相近,与PV株相差较远。越1与肥东株亲缘关系极近,可能是由同一毒株演化而来。 展开更多
关键词 狂犬病毒 糖蛋白 基因序列 GP G-L区间 G-M区间 分子流行病学 毒株
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血管生成抑制因子Arresten基因的分子克隆与序列测定 被引量：15
9
作者 郑启昌 宋自芳 +2 位作者 李毅清 舒晓钢 郑幼伟 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期46-47,共2页
目的　克隆血管生成抑制因子Arresten基因 ,测定并分析其基因序列。方法　从人胎盘组织中提取总RNA ,经逆转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)扩增出Arresten基因 ;采用T A突出端克隆 ,构建克隆载体 pGEM Arr ,测定Arresten基因序列。 结果　... 目的　克隆血管生成抑制因子Arresten基因 ,测定并分析其基因序列。方法　从人胎盘组织中提取总RNA ,经逆转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)扩增出Arresten基因 ;采用T A突出端克隆 ,构建克隆载体 pGEM Arr ,测定Arresten基因序列。 结果　Arresten基因的克隆中 ,以特异引物Pr2为反转录引物的Arresten基因的扩增比用OligodT的效果好。其序列测定证实Arresten基因克隆成功。结论　Arresten基因需用适当方法克隆 。 展开更多
关键词 Arresten基因 分子克隆 基因序列 血管生成抑制因子 肿瘤生成机制
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H9N2亚型猪流感病毒山东分离株的分离鉴定及其HA、NP、NS基因序列分析 被引量：15
10
作者 许传田 赵宏坤 范伟兴 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期528-530,共3页
从山东地区疑似流感发病猪分离到 10株流感病毒 ,经国家流感中心鉴定均为 A型流感病毒 H9N2亚型。将其中 1株 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )的血凝素基因 (HA)、核蛋白基因 (NP)和非结构蛋白基因 (NS)进行克隆与测序 ,与Gen Bank收录的其... 从山东地区疑似流感发病猪分离到 10株流感病毒 ,经国家流感中心鉴定均为 A型流感病毒 H9N2亚型。将其中 1株 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )的血凝素基因 (HA)、核蛋白基因 (NP)和非结构蛋白基因 (NS)进行克隆与测序 ,与Gen Bank收录的其他猪流感和禽流感 H9N2亚型的相关基因进行比较 ,推测 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )可能源于禽流感病毒 H9N2亚型和 H5 N1亚型的重组病毒 ;Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3的 HA氨基酸裂解位点与其他 H9N2亚型不同 ,Sw/ SD/1/ 2 0 0 3的 HA氨基酸裂解位点是 R- S- L- R- G,而其他猪流感和禽流感 H9N2亚型都是 R- S- S- R- G。 展开更多
关键词 H9N2亚型 猪 流感病毒 山东分离株 分离鉴定 HA NP NS基因 序列分析
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18SrDNA序列与同翅目昆虫的分类系统 被引量：7
11
作者 赵惠燕 袁锋 张改生 《西北农业学报》 CAS CSCD 1997年第2期102-105,共4页
大量文献资料分析发现，昆虫１８ＳｒＤＮＡ序列可以用作种上分类的指标。同翅目中所有胸喙亚目昆虫的１８ＳｒＤＮＡ序列（２２００～２５００ｂｐ）比头喙亚目及部分半翅目昆虫的１８ＳｒＤＮＡ序列（１９００～１９２５ｂｐ）长，是... 大量文献资料分析发现，昆虫１８ＳｒＤＮＡ序列可以用作种上分类的指标。同翅目中所有胸喙亚目昆虫的１８ＳｒＤＮＡ序列（２２００～２５００ｂｐ）比头喙亚目及部分半翅目昆虫的１８ＳｒＤＮＡ序列（１９００～１９２５ｂｐ）长，是典型的分子分类特征。粉虱类１８ＳｒＤＮＡ序列最长，其碱基替换率比全半翅目（Ｅｕｈｅｍｉｐｔｅｒａ）的部分昆虫高３倍，蚜虫与蚧壳虫的碱基替换率比半翅目部分昆虫高１．５倍。胸喙类是单源起源，与头喙类和部分半翅目昆虫种类形成姐妹群。这些发现具有化石记录、繁殖生物学、地理分布。 展开更多
关键词 基因序列 同翅目 昆虫分类
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长江、辽河、瓯江三水系中华绒螯蟹mt12SrDNA片断序列的比较 被引量：13
12
作者 张凤英 马凌波 《海洋渔业》 CSCD 2004年第2期147-151,共5页
本实验根据马蹄铁鲎mtDNA 12SrRNA基因序列进行了中华绒螯蟹mtDNA 12SrRNA基因的引物设计,并对长江、辽河、瓯江三水系各5个个体共15个个体进行了PCR扩增及其序列测定。结果表明,12SrRNA基因序列在长江种群、辽河种群、瓯江种群间几乎... 本实验根据马蹄铁鲎mtDNA 12SrRNA基因序列进行了中华绒螯蟹mtDNA 12SrRNA基因的引物设计,并对长江、辽河、瓯江三水系各5个个体共15个个体进行了PCR扩增及其序列测定。结果表明,12SrRNA基因序列在长江种群、辽河种群、瓯江种群间几乎没有差异,仅在3号瓯江蟹415bp处发现有一碱基颠换,去掉两端引物共测定得到415bp的碱基序列、其中A、T、G、C含量分别为145bp(34.9%),165bp(39.8%),45bp(10.8%)和60bp(14.5%)。 展开更多
关键词 长江 辽河 瓯江 水系 中华绒螯蟹 mt12SrDNA 序列 基因 种群
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105株携带耶尔森菌强毒力岛大肠杆菌的毒力基因型和部分菌株毒力因子序列研究 被引量：14
13
作者 吕殿红 魏文康 +1 位作者 黄忠 温肖会 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期71-73,共3页
为了解105株携带耶尔森菌强毒力岛(HPI)的大肠杆菌(E.coli)中相关毒力因子的流行情况和基因序列,根据GenBank中参考序列设计引物,采用PCR方法对广东地区养殖场来源的105分离株HPI+E.coli的fyuA、tsh、iucD、iss 4种毒力基因进行检测,统... 为了解105株携带耶尔森菌强毒力岛(HPI)的大肠杆菌(E.coli)中相关毒力因子的流行情况和基因序列,根据GenBank中参考序列设计引物,采用PCR方法对广东地区养殖场来源的105分离株HPI+E.coli的fyuA、tsh、iucD、iss 4种毒力基因进行检测,统计基因类型;并对部分分离株的5种毒力基因(irp2和fyuA、tsh、iucD、iss)进行了克隆与序列分析。结果显示105株HPI+E.coli中4种毒力因子携带情况不尽一致,基因fyuA、tsh、iucD和iss的阳性率分别为55.24%、17.14%、49.52%和23.81%,105株HPI+E.coli共有13种基因型;分析表明,除iss基因与参考序列的同源性在88.0%～90.9%外,irp2、fyuA、tsh、iucD 4种基因与GenBank中参考序列的同源性高达96%以上;广东省养殖场E.coli毒力因子基因型复杂,并以基因型irp2+fyuA+iucD+和仅含irp2+的菌株分离率最高,分别为17.14%和28%。 展开更多
关键词 大肠杆菌 强毒力岛 毒力基因型 基因序列
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7号淀粉酶链霉菌M1033木糖异构酶基因序列分析 被引量：11
14
作者 王玉珍 黄震 +5 位作者 戴新华 刘兢 崔涛 牛立文 王淳 徐洵 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第2期118-123,共6页
测定了来自海南的7号淀粉酶M1033木糖异构酶(Ⅺ)基因的DNA序列。该酶的结构基因由1161bp组成,相当于387个氨基酸残基。其GC含量为72.1克分子％,密码子第三位的GC利用率达98克分子％。在氨基酸序列上,M1033的木糖异构酶与其它放线菌菌株... 测定了来自海南的7号淀粉酶M1033木糖异构酶(Ⅺ)基因的DNA序列。该酶的结构基因由1161bp组成,相当于387个氨基酸残基。其GC含量为72.1克分子％,密码子第三位的GC利用率达98克分子％。在氨基酸序列上,M1033的木糖异构酶与其它放线菌菌株的相比具有较高的同源性;特别是与3种链霉菌菌株的同源性高达90％左右。 展开更多
关键词 木糖异构酶 基因序列 淀粉酶链霉菌
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3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段的序列比较 被引量：11
15
作者 陈子安 杜晓东 +1 位作者 王庆恒 邓岳文 《广东海洋大学学报》 CAS 2007年第4期3-10,共8页
对裸体方格星虫(Sipunculus nudus)、可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)和澳洲管体星虫(Siphonosoma australe)的线粒体16S rRNA、COI和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨。采用PCR方法得到总长度... 对裸体方格星虫(Sipunculus nudus)、可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)和澳洲管体星虫(Siphonosoma australe)的线粒体16S rRNA、COI和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨。采用PCR方法得到总长度分别为531～544bp(16S)、652～675bp(COI)和406～453bp(Cytb)的线粒体片段。片段碱基A+T比例较高(16S rRNA基因58.3%,COI基因56.9%,Cytb基因59.5%)。16S rRNA片段存在169个碱基变异位点(其中包括167个简约信息位点)和44个碱基插入/缺失,种内个体间变异较小;COI片段有512个碱基(333个简约信息位点)存在变异,79个碱基插入/缺失;Cytb片段存在347个碱基(318个简约信息位点)变异位点,16个碱基插入/缺失。数据分析结果支持3种星虫和环节动物的分类地位较近,与软体动物较远的分类观点。此外,裸体方格星虫与澳洲管体星虫之间亲缘关系较近(D=0.3159、0.3156、0.2361)。认为3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cytb基因在种间存在明显的多态性,证实了三种基因序列均普遍适用于星虫种及以上阶元的系统学分析。 展开更多
关键词 星虫 线粒体 16SRRNA基因 COⅠ基因 CYT B基因 基因序列
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白羊草NAC转录因子基因的克隆及表达分析 被引量：12
16
作者 方志红 王学敏 +3 位作者 李俊 董洁 高洪文 董宽虎 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期590-597,共8页
NAC转录因子是植物特有的转录因子并在植物的生长发育过程中发挥重要的作用,根据其他植物NAC转录因子基因的氨基酸保守序列设计简并引物,通过RT-PCR和RACE技术从白羊草(Bothriochloa ischaemum)中获得了全长cDNA,命名为BiNAC。序列分析... NAC转录因子是植物特有的转录因子并在植物的生长发育过程中发挥重要的作用,根据其他植物NAC转录因子基因的氨基酸保守序列设计简并引物,通过RT-PCR和RACE技术从白羊草(Bothriochloa ischaemum)中获得了全长cDNA,命名为BiNAC。序列分析表明,该cDNA片段全长为1549bp,开放阅读框1125bp,编码374个氨基酸,具有典型的NAC类蛋白的结构特征。进化树分析表明,该蛋白属于ATAF亚族,与高粱(Sorghum bi-color)亲缘关系最近,同源性达到94%。Real-time PCR检测结果表明,BiNAC基因在茎中的表达量最高,根中表达量最少,并且受NaCl胁迫表达上调。同时成功构建了植物表达载体pBI121-BiNAC-GUS,为进一步开展NAC基因的功能研究创造了条件。 展开更多
关键词 白羊草 NAC转录因子 表达分析 基因序列
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烟草JAZ1基因的克隆和功能分析 被引量：12
17
作者 潘婷 胡利伟 +9 位作者 王中 刘瑞霞 张剑锋 李娟 张林 李锋 王晨 杨玉珍 杨军 武明珠 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第12期15-22,共8页
JAZ(Jasmonate ZIM-domain)蛋白作为E3泛素连接蛋白降解复合体SCFCOI1受体的靶蛋白,是茉莉酸信号转导途径的关键组分。为了明确JAZ基因在烟草中的功能和调控方式,通过同源克隆技术从烟草中克隆到1个JAZ1基因,并结合生物信息学和基因表... JAZ(Jasmonate ZIM-domain)蛋白作为E3泛素连接蛋白降解复合体SCFCOI1受体的靶蛋白,是茉莉酸信号转导途径的关键组分。为了明确JAZ基因在烟草中的功能和调控方式,通过同源克隆技术从烟草中克隆到1个JAZ1基因,并结合生物信息学和基因表达模式分析进一步预测其生物学功能。结果表明:NtJAZ1基因cDNA序列长720 bp,具有完整的开放阅读框,编码239个氨基酸。NtJAZ1蛋白含有TIFY和CCT-2(Jas结构域)两个保守结构域,其二级结构由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲组成,其三级结构具有TIFY超家族蛋白的结构特征。进化分析表明,NtJAZ1和番茄SlJAZ1同属1个分支,亲缘关系较近。在被黑胫病侵染发病的烟草根部,NtJAZ1的表达量最高,其次是茎和叶,推测NtJAZ1的高表达抑制了JA响应基因的表达,从而引发烟草黑胫病。 展开更多
关键词 烟草 NtJAZ1 基因序列 功能分析
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一种新厌氧氨氧化菌的16S rRNA基因序列测试 被引量：10
18
作者 祖波 张代钧 阎青 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期469-473,共5页
运用序批式试验测定厌氧氨氧化污泥的氨氮和亚硝态氮消耗量,求得厌氧氨氧化活性为9.84×10-4mg.(mg.h)-1,厌氧氨氧化菌消耗NO2--N与NH4+-N之比为1.311;采用分子生物学方法从EGSB反应器颗粒污泥中提取细菌总DNA,经纯化、特异引物PCR... 运用序批式试验测定厌氧氨氧化污泥的氨氮和亚硝态氮消耗量,求得厌氧氨氧化活性为9.84×10-4mg.(mg.h)-1,厌氧氨氧化菌消耗NO2--N与NH4+-N之比为1.311;采用分子生物学方法从EGSB反应器颗粒污泥中提取细菌总DNA,经纯化、特异引物PCR扩增、克隆、测序等过程,得到厌氧氨氧化菌部分16S rDNA序列;通过系统发育树分析可以发现,在EGSB反应器中富集得到的厌氧氨氧化菌种(anaerobic ammonium-oxidizingPlanctomycete cquenviron-1)与Candidatus'Anammoxoglobus propionicus'和Candidatus'Jettenia asiatica'同属,anaerobic ammonium-oxidizingPlanctomycete cquenviron-1与其他厌氧氨氧化菌基因序列的同源性最大为93%.结果表明,前期EGSB反应器富集得到了一种新型厌氧氨氧化菌,该菌株命名为anaerobic ammonium-oxidizing Planctomycete cquenviron-1. 展开更多
关键词 厌氧氨氧化菌 16SrRNA 基因序列
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rDNA-ITS序列分析对临床少见丝状真菌鉴定作用的评估 被引量：11
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作者 郑冰 应春妹 +2 位作者 汪雅萍 叶杨芹 张灏旻 《检验医学》 CAS 北大核心 2011年第10期648-652,共5页
目的评价内转录间隔区(ITS)的多态性序列分析(rDNA-ITS序列分析)对临床少见丝状真菌的鉴定作用,以形态学鉴定方法加以补充验证。方法将3株待检真菌通过聚合酶链反应(PCR)扩增和基因测序方法分析rDNA-ITS序列,从GenBank获取相似序列,使用... 目的评价内转录间隔区(ITS)的多态性序列分析(rDNA-ITS序列分析)对临床少见丝状真菌的鉴定作用,以形态学鉴定方法加以补充验证。方法将3株待检真菌通过聚合酶链反应(PCR)扩增和基因测序方法分析rDNA-ITS序列,从GenBank获取相似序列,使用BLAST工具对rDNA-ITS序列进行对比分析,利用GenBank中的系统发育软件自动生成系统,构建系统发育树,根据系统发育树并结合对比指标确定距离与同源性均有较大鉴定意义的对比序列,并与真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段的序列分析结果及形态学鉴定结果进行比较。结果 2株菌株能通过rDNA-ITS序列分析的方法鉴定到种,另1株由于相似序列较多,需要形态学方法加以配合鉴定。rDNA-ITS序列分析相对真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段有更好的真菌鉴定作用。结论相对于传统形态学方法,利用rDNA-ITS序列分析鉴定丝状真菌不受检验人员经验水平影响,较为客观,同时由于其包含的信息量相对丰富,因此,较其他靶序列具有更好的真菌鉴定作用。但该方法也存在一定局限,因此,仍需结合形态学方法进行鉴定。 展开更多
关键词 内转录间隔区 基因测序 丝状真菌 形态学鉴定
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2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播研究 被引量：11
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作者 董永慧 王莉 +7 位作者 何翠 佐合拉·吐尔地 王凤英 廖玲洁 关晓霞 刘伟 赵杰 邢辉 《中国艾滋病性病》 CAS 北大核心 2015年第1期20-23,共4页
目的 通过对新疆艾滋病病毒（HIV）感染者的病毒基因序列分析,了解2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播情况。方法 采集当年新报告的16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,... 目的 通过对新疆艾滋病病毒（HIV）感染者的病毒基因序列分析,了解2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播情况。方法 采集当年新报告的16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 4年共获得pol区序列150条,主要以CRF07_BC为主（96.7%,145/150）,共有3例出现耐药,分别针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）和核苷类抑制剂（NRTIs）。耐药株主要出现在性传播人群中。结论 各传播途径中仍主要流行CRF07_BC,新疆HIV-1耐药传播目前处于低度传播水平,但仍需进一步加强对感染者的耐药监测和病人的治疗管理。 展开更多
关键词 艾滋病病毒 基因序列 耐药毒株
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