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利用荧光标记SSR构建百合种质资源分子身份证 被引量：50
1
作者 徐雷锋 葛亮 +5 位作者 袁素霞 任君芳 袁迎迎 李雅男 刘春 明军 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期2055-2064,共10页
以96份百合种质资源为材料,使用SSR标记进行百合种质分子身份证构建试验。从172对百合SSR引物中筛选出20对多态性好的核心引物,采用四重荧光毛细管电泳技术检测扩增条带分子量的方法对百合资源进行标记分析,获得供试样品相应的扩增带型... 以96份百合种质资源为材料,使用SSR标记进行百合种质分子身份证构建试验。从172对百合SSR引物中筛选出20对多态性好的核心引物,采用四重荧光毛细管电泳技术检测扩增条带分子量的方法对百合资源进行标记分析,获得供试样品相应的扩增带型。采用个位数字和小写英文字母对不同带型进行编码,按照20对引物扩增带型数由少到多顺序串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。结果显示:20对SSR引物共检测到69个SSR等位位点和170个带型,平均每对引物对品种扩增的等位位点3.45个,带型8.50个。对带型进行编码的结果表明:96份百合种质资源的SSR分子身份证互不相同,可以将材料完全区分开。 展开更多
关键词 百合 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证
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利用SSR荧光标记构建山东地方梨种质资源分子身份证 被引量：23
2
作者 冉昆 隋静 +5 位作者 王宏伟 魏树伟 张勇 董冉 董肖昌 王少敏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第A01期71-78,共8页
【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分... 【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分析,获得相应的扩增条带。采用个位数字和小写英文字母对不同带型进行编码,按照10对引物扩增带型数由少到多顺序串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。【结果】10对SSR引物共检测到111个SSR等位位点和189个带型,平均每对引物对品种扩增的等位位点11.1个,带型18.9个。采用个位数字和小写英文字母结合对不同带型进行编码,成功构建了45份山东地方梨种质资源的分子身份证,可以将材料完全区分开。【结论】构建了45份山东地方梨种质资源分子身份证,有利于山东地方梨种质资源的保护与利用。 展开更多
关键词 梨 种质资源 山东 ssr荧光标记 分子身份证
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利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证 被引量：17
3
作者 张嘉 刘爱青 +2 位作者 张淑玲 解莹然 刘燕 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期101-109,共9页
为了开发芍药品种分子鉴定方法,本研究采用SSR标记技术,在目前芍药SSR引物开发较少的情况下,采用文献相关引物84对,并结合自行设计的27对引物,将6%非变性聚丙烯酰胺凝胶与四重荧光毛细管电泳技术相结合,从111对引物中筛选出29对扩增稳... 为了开发芍药品种分子鉴定方法,本研究采用SSR标记技术,在目前芍药SSR引物开发较少的情况下,采用文献相关引物84对,并结合自行设计的27对引物,将6%非变性聚丙烯酰胺凝胶与四重荧光毛细管电泳技术相结合,从111对引物中筛选出29对扩增稳定、多态性高的核心引物;共检测到223个SSR等位位点,平均每对引物为7.69个,有效等位基因数（Ne）为3.658±0.328,Shannon多样性指数（I）为1.371±0.104,观测杂合度（Ho）为0.532±0.045,期望杂合度（He）为0.645±0.036,多态性信息含量PIC值介于0.20～0.84,平均0.60。基于最少引物鉴定最多种质的原则,按照PIC值由高到低顺序串联排序的方式,最终筛选出4对SSR引物（Pmg153、Knu73、Pmg209、J38）。结果表明：筛选出的4对SSR引物组合可以有效鉴定66个芍药品种;采用个位数字和大写英文字母结合对不同带型进行编码,成功绘制了66个中国传统芍药品种的分子身份证。本研究为芍药品种鉴定提供了一种快速、准确与高效的分子检测方法,也有助于中国传统芍药品种的遗传改良与芍药新品种保护。 展开更多
关键词 芍药 ssr荧光标记 分子身份证 品种鉴定
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应用SSR荧光标记法构建山东地方桃种质资源分子身份证 被引量：11
4
作者 刘伟 李淼 +3 位作者 李桂祥 董晓民 高晓兰 张安宁 《山东农业科学》 北大核心 2022年第2期6-13,共8页
为构建山东省地方桃种质资源分子身份证,本研究以60份山东省地方桃品种、名优特品种、选育品种为材料,从桃种质的SSR富集文库中开发并设计30对引物,选出10对具有良好多态性的引物进行PCR扩增,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条... 为构建山东省地方桃种质资源分子身份证,本研究以60份山东省地方桃品种、名优特品种、选育品种为材料,从桃种质的SSR富集文库中开发并设计30对引物,选出10对具有良好多态性的引物进行PCR扩增,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法进行带型分析,采用阿拉伯数字1~9和小写英文字母对不同带型进行编码,无带编码为0,按照10对引物扩增带型数由少到多的顺序将编码串联,构建供试样品的分子身份证。结果表明,10对SSR引物共检测到58个SSR等位位点和116个带型,平均每对引物扩增的等位位点为5.8个,带型11.6个;多态性信息含量变幅为0.2044~0.7378,平均0.5699,说明引物的多态性较高,能够有效揭示60份桃种质的遗传多样性。通过对扩增带型的分析并编码,成功构建了60份桃种质的分子身份证。遗传聚类分析的结果与分子身份证结果一致。本研究结果可为山东省桃种质资源的保护和利用奠定基础,对于桃产业的发展具有重要意义。 展开更多
关键词 桃 种质资源 山东省 ssr荧光标记 分子身份证
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应用SSR荧光标记法构建22个柚类品种的分子身份证 被引量：8
5
作者 吴仕蔓 娄兵海 +3 位作者 陈传武 唐艳 邓崇岭 武晓晓 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期605-614,共10页
【目的】应用荧光SSR分子标记构建柚类种质分子身份证,用于品种资源鉴定。【方法】收集22份柚类材料,筛选SSR荧光标记引物,采用荧光毛细管电泳检测技术分析扩增条带分子质量和等位基因,获得相应的扩增带型,从而对每份柚材料进行标记。... 【目的】应用荧光SSR分子标记构建柚类种质分子身份证,用于品种资源鉴定。【方法】收集22份柚类材料,筛选SSR荧光标记引物,采用荧光毛细管电泳检测技术分析扩增条带分子质量和等位基因,获得相应的扩增带型,从而对每份柚材料进行标记。采用个位阿拉伯数字和小写英文字母对不同等位基因分子质量大小进行编码,再按照引物扩增带型数由大到小顺序将各位点赋值编码的数字串联排序,构建供试样品的分子身份证。【结果】筛选出4对多态性较好的引物,使用这4对引物共检测到49个扩增带型和41个SSR等位位点,平均每对引物的有关带型数12.25个、位点数10.25个。【结论】通过扩增带型分析,构建了22份柚类种质的分子身份证,包括12条信息独特的身份证。遗传聚类与分子身份证分析结果一致,为柚类品种鉴定和保护提供了重要依据。 展开更多
关键词 柚类 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证
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42份云南玉米自交系基于SSR荧光标记的遗传多样性分析 被引量：10
6
作者 张鹏 管俊娇 +5 位作者 黄清梅 王江民 杨晓洪 刘艳芳 张建华 毛进 《江西农业学报》 CAS 2019年第10期29-33,共5页
通过分析云南常用42份玉米自交系品种的遗传多样性,以及云南近些年新育成自交系的遗传背景,为云南地区玉米育种提供参考依据。利用30对SSR多态性引物,对42个玉米自交系品种进行等位基因多样性和聚类分析,共检测到277个等位基因变异,平... 通过分析云南常用42份玉米自交系品种的遗传多样性,以及云南近些年新育成自交系的遗传背景,为云南地区玉米育种提供参考依据。利用30对SSR多态性引物,对42个玉米自交系品种进行等位基因多样性和聚类分析,共检测到277个等位基因变异,平均每个位点检测到的等位基因数为9.2个,变化范围4~17个,片段大小介于86~434 bp之间,每个SSR位点的多肽信息量(PIC)在0.7008~0.9979之间,平均为0.9712。基于UPGMA进行遗传聚类分析,供试材料分类不明显,遗传相似系数均大于0.82,遗传相似度较高。目前由于大部分的玉米自交系品种都由骨干自交系而来,品种资源狭窄、遗传多样性不够丰富,导致新育成的玉米品种遗传背景相似,血缘关系相近,因此亟需在品种资源的有效利用、资源评价、材料共享和交流等方面开展相关工作,促进玉米种业发展。 展开更多
关键词 玉米 ssr荧光标记 遗传多样性
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利用SSR荧光标记构建山楂种质分子身份证
7
作者 秦宇 郭荣琨 +3 位作者 农惠兰 王燕 崔凯 董宁光 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1227-1240,共14页
以91份山楂种质资源为材料,使用SSR标记对其进行分子身份证构建,并进行遗传多样性分析。从山楂基因组数据库中开发并设计了96对引物,筛选出了12对多态性好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带的分子量,并分析参试样品的... 以91份山楂种质资源为材料,使用SSR标记对其进行分子身份证构建,并进行遗传多样性分析。从山楂基因组数据库中开发并设计了96对引物,筛选出了12对多态性好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带的分子量,并分析参试样品的扩增带型。采用数字与字母组合的方式,依据12对引物的多态性信息含量由高到低排列引物扩增结果,生成各材料的指纹编码。基于非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)对91份山楂资源进行聚类分析。结果表明,12对SSR引物从91个山楂种质资源样品中共扩增到67个等位基因,其平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度分别为5.583、2.730、0.490、0.593,Shannon’s信息指数平均值为1.195,多态性信息含量介于0.300~0.715之间,平均为0.551。91份山楂资源的遗传相似系数范围为0.25~0.98,平均值为0.529,在遗传相似系数0.46处时可分为5大类群。根据引物的多态性信息含量高低选择引物组合,构建了山楂种质区分需要的最少引物组合。 展开更多
关键词 山楂 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证
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梨多倍体种质资源的鉴定 被引量：2
8
作者 齐丹 田路明 +8 位作者 董星光 张莹 霍宏亮 徐家玉 刘超 张小双 詹俊宇 张思梦 曹玉芬 《中国果树》 北大核心 2023年第6期10-15,共6页
使用SSR荧光分子标记技术与流式细胞术相结合的方法,对保存于国家果树种质兴城梨、苹果圃内的100份梨种质资源进行倍性鉴定。结果表明:共鉴定出18份新的梨多倍体种质,其中三倍体梨种质17份,二、三倍体嵌合体1份;4份存在争议的三倍体种质... 使用SSR荧光分子标记技术与流式细胞术相结合的方法,对保存于国家果树种质兴城梨、苹果圃内的100份梨种质资源进行倍性鉴定。结果表明:共鉴定出18份新的梨多倍体种质,其中三倍体梨种质17份,二、三倍体嵌合体1份;4份存在争议的三倍体种质,分别是其力阿木提、骚梨、六月鲜、窝窝。少量SSR位点的多等位基因扩增不能作为梨多倍体种质资源的判断依据,多个SSR位点的3个等位基因扩增,并结合流式细胞术可以准确鉴别梨多倍体种质资源。 展开更多
关键词 梨种质资源 ssr荧光标记 流式细胞术
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利用荧光标记SSR鉴定西瓜杂交种的纯度研究 被引量：5
9
作者 程维舜 罗茜 +6 位作者 洪娟 王素萍 黄翔 杜雷 姜利 张利红 陈钢 《中国果菜》 2020年第12期36-41,共6页
为建立准确、快速、稳定、实用的西瓜杂交种SSR分子标记纯度鉴定体系,保障西瓜杂交种的制种质量,本文以小果型西瓜杂交种武农8号及其亲本为试验材料,用荧光标记SSR技术对杂交种及其亲本间的扩增谱带多态性进行了引物筛选和种子纯度鉴定... 为建立准确、快速、稳定、实用的西瓜杂交种SSR分子标记纯度鉴定体系,保障西瓜杂交种的制种质量,本文以小果型西瓜杂交种武农8号及其亲本为试验材料,用荧光标记SSR技术对杂交种及其亲本间的扩增谱带多态性进行了引物筛选和种子纯度鉴定研究。结果表明,供试的23对西瓜SSR核心引物中,可筛选出1对稳定性强、可重复性好、在武农8号杂交种及其亲本具有多态性的引物BVWS01897。利用这对引物对武农8号进行了100粒单种子SSR纯度鉴定,鉴定结果为99%,与田间形态学鉴定结果一致,说明SSR标记技术可用于武农8号杂交种纯度室内快速检测。 展开更多
关键词 西瓜 ssr荧光标记 杂交种 纯度鉴定
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利用SSR荧光标记分析山西糯玉米农家种的遗传多样性 被引量：4
10
作者 李锐 白建荣 +3 位作者 张丛卓 张效梅 闫蕾 杨瑞娟 《山西农业科学》 2016年第10期1433-1436,共4页
采取混合取样策略,利用荧光SSR技术对来源于山西省的45份糯玉米地方品种和40个位点进行了分析。结果表明,在45个糯玉米地方品种中,共检测出等位变异241个,每个位点检测出3~11个等位变异,平均每个位点6个;多态性信息量（PIC）变化范围在0... 采取混合取样策略,利用荧光SSR技术对来源于山西省的45份糯玉米地方品种和40个位点进行了分析。结果表明,在45个糯玉米地方品种中,共检测出等位变异241个,每个位点检测出3~11个等位变异,平均每个位点6个;多态性信息量（PIC）变化范围在0.27~0.87,平均每个位点0.71;标记索引指数（MI）变化范围在1.35~9.53,平均每个位点4.42;聚类分析可将45份糯玉米地方品种划分为4个类群。结果显示,部分品种有许多特有的等位变异,应引起特别的注意,需作进一步的分析与研究。 展开更多
关键词 ssr荧光标记 糯玉米 地方品种 遗传多样性 山西
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