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基于分子模拟优化筛选甲磺隆特异性多肽
1
作者
尚华
赵雷兴
+1 位作者
秦月
刘冰
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2023年第1期28-33,共6页
该研究通过分子模拟技术优化筛选甲磺隆的高特异性多肽,并应用量子点荧光淬灭免疫层析试纸条验证模拟筛选结果。运行CDOCKER程序对乙酰乳酸合成酶晶体结构与甲磺隆分子进行对接,结合蛋白中对甲磺隆的活性空腔结构和受配体相互作用的关...
该研究通过分子模拟技术优化筛选甲磺隆的高特异性多肽,并应用量子点荧光淬灭免疫层析试纸条验证模拟筛选结果。运行CDOCKER程序对乙酰乳酸合成酶晶体结构与甲磺隆分子进行对接,结合蛋白中对甲磺隆的活性空腔结构和受配体相互作用的关键氨基酸设计多肽。运行虚拟氨基酸突变对所有多肽进一步优化并建库。根据结合能初步筛选出S1、S2和S3三条多肽,应用试纸条方法进一步验证3条多肽可成功识别甲磺隆目标物并筛选出S1为最优序列,试验结果与模拟结果一致性良好。
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关键词
甲磺隆
分子模拟
分子对接
虚拟氨基酸突变
荧光淬灭免疫层析试纸条
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职称材料
题名
基于分子模拟优化筛选甲磺隆特异性多肽
1
作者
尚华
赵雷兴
秦月
刘冰
机构
天津科技大学食品科学与工程学院
出处
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2023年第1期28-33,共6页
基金
国家重点研发计划(2018YFC1604003)。
文摘
该研究通过分子模拟技术优化筛选甲磺隆的高特异性多肽,并应用量子点荧光淬灭免疫层析试纸条验证模拟筛选结果。运行CDOCKER程序对乙酰乳酸合成酶晶体结构与甲磺隆分子进行对接,结合蛋白中对甲磺隆的活性空腔结构和受配体相互作用的关键氨基酸设计多肽。运行虚拟氨基酸突变对所有多肽进一步优化并建库。根据结合能初步筛选出S1、S2和S3三条多肽,应用试纸条方法进一步验证3条多肽可成功识别甲磺隆目标物并筛选出S1为最优序列,试验结果与模拟结果一致性良好。
关键词
甲磺隆
分子模拟
分子对接
虚拟氨基酸突变
荧光淬灭免疫层析试纸条
Keywords
metsulfuron-methyl
molecular
simulation
molecular
docking
virtual
amino
acid
mutation
fluorescence
quenching
immunochromatographic
strip
分类号
TQ450.263 [化学工程—农药化工]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于分子模拟优化筛选甲磺隆特异性多肽
尚华
赵雷兴
秦月
刘冰
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2023
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