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结构光照明显微中的超分辨图像重建研究 被引量:13
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作者 周兴 但旦 +2 位作者 千佳 姚保利 雷铭 《光学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第3期3-14,共12页
近年来,随着各种新型荧光探针的出现和成像方法的改进,远场光学成像的分辨率已经突破了衍射极限的限制。基于结构光照明的荧光显微技术凭借成像速度快、光毒性弱等优点,已成为目前主流的超分辨成像技术之一。实现结构光照明超分辨显微... 近年来,随着各种新型荧光探针的出现和成像方法的改进,远场光学成像的分辨率已经突破了衍射极限的限制。基于结构光照明的荧光显微技术凭借成像速度快、光毒性弱等优点,已成为目前主流的超分辨成像技术之一。实现结构光照明超分辨显微成像的关键在于照明光场的精准调控和后期的超分辨图像重建算法,否则将会在重建的超分辨图像中产生不可预估的伪影,混淆对观测结构真实形态的判断。详细对比了几种典型的结构光照明显微超分辨重建算法,证明基于图像重组变换的结构光照明超分辨图像重建算法可以有效解决极低结构光场调制度下的超分辨图像重建问题,降低结构光照明显微中的激发光功率。 展开更多
关键词 显微 荧光显微 图像重建 结构光照明 超分辨
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大庆喇萨杏油田油层水淹定量评价方法 被引量:7
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作者 耿长喜 马德华 +1 位作者 刘津侠 马红 《录井工程》 2011年第4期32-35,47,共5页
针对高含水后期调整挖潜的剩余油评价难题,根据水驱油实验资料、密闭取心与井壁取心对比分析实验资料、试油及投产资料,不仅全面系统地总结了随含水率上升,热解气相色谱和荧光显微图像特征的变化规律,而且揭示了水淹层录井响应机理,建... 针对高含水后期调整挖潜的剩余油评价难题,根据水驱油实验资料、密闭取心与井壁取心对比分析实验资料、试油及投产资料,不仅全面系统地总结了随含水率上升,热解气相色谱和荧光显微图像特征的变化规律,而且揭示了水淹层录井响应机理,建立了有效孔隙度与剩余油饱合度评价图板、饱合烃特征与参数评价图板、荧光显微图像多参数比值评价图板,形成了以热解气相色谱、荧光显微图像分析等新技术为手段的水淹层录井评价方法。该方法在新钻调整井应用中见到了明显的效果,成为在高含水主力油层深化挖潜和薄差层有效动用过程中剩余油评价和射孔选层的关键技术之一。该方法在大庆喇萨杏油田应用1106口井,水淹层解释符合率达87.2%,平均单井增射厚度2.35m,年增油产量154t。通过实例概要介绍了水淹层录井评价技术在油田开发应用中的实际效果和效益。 展开更多
关键词 水淹层 评价技术 热解气相色谱 荧光显微图像 井壁取心
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SBS改性沥青荧光显微图像的采集与处理 被引量:7
3
作者 康爱红 寇长江 张吴红 《江苏大学学报(自然科学版)》 EI CAS 北大核心 2012年第6期710-714,共5页
以苯乙烯-丁二烯-苯乙烯嵌段共聚物改性沥青荧光显微分析过程中荧光显微图像的采集与处理方法为研究对象,讨论了苯乙烯-丁二烯-苯乙烯嵌段共聚物改性沥青显微图像获取过程中的影响因素以及对显微图像进行处理时所采用的主要手段和注意点... 以苯乙烯-丁二烯-苯乙烯嵌段共聚物改性沥青荧光显微分析过程中荧光显微图像的采集与处理方法为研究对象,讨论了苯乙烯-丁二烯-苯乙烯嵌段共聚物改性沥青显微图像获取过程中的影响因素以及对显微图像进行处理时所采用的主要手段和注意点.通过具体实例给出了图像采集的最佳放大倍数、曝光时间的确定方法以及显微图像质量的灰度直方图评价方法,确定了显微图像进行量化表征之前进行景深扩展、图像增强、对象分割、目标分离等一系列处理方法的标准步骤和进行目标分离时改性粒子的区域选取原则,为苯乙烯-丁二烯-苯乙烯嵌段共聚物改性沥青荧光显微图像量化研究提供理论依据. 展开更多
关键词 SBS改性沥青 荧光显微 影响因素 图像处理 数字化
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面向荧光显微图像的斑点检测
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作者 何柯材 徐琳 +2 位作者 江金康 陶禹川 王学渊 《计算机系统应用》 2024年第8期205-213,共9页
实体肿瘤学中,利用荧光原位杂交(FISH)技术处理后的间期细胞核荧光显微图像上,DNA扩增往往呈现为衍射极限斑点,成像条件限制了图像质量,导致图像信噪比较低、背景干扰严重且存在非斑点结构干扰.设计适用的斑点检测方法,提供客观且定量... 实体肿瘤学中,利用荧光原位杂交(FISH)技术处理后的间期细胞核荧光显微图像上,DNA扩增往往呈现为衍射极限斑点,成像条件限制了图像质量,导致图像信噪比较低、背景干扰严重且存在非斑点结构干扰.设计适用的斑点检测方法,提供客观且定量的数据,有助于医生对于癌症病情的诊断.算法首先采用3层小波多尺度求和对荧光图像去噪,随后利用多尺度高斯拉普拉斯算子增强斑点区域,最后通过4个方向的单边二阶高斯核抑制非斑点区域,完成斑点检测.实验结果表明,对于自建数据库中83张图像,算法平均F分数达到0.96,平均运行时间0.5 s以下. 展开更多
关键词 荧光显微图像 斑点检测 图像降噪 图像增强
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基于波前编码的大像面荧光显微成像系统景深延拓研究
5
作者 鲍猛 张磬瀚 +4 位作者 郑继红 韦晓孝 万新军 申桐 金旭东 《光学技术》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期411-418,共8页
大像面荧光显微成像系统可以对大尺寸dPCR生物基因芯片进行一次性成像,但其景深(DOF)较小,限制了系统的物方检测深度。文章采用波前编码技术在不降低分辨率的前提下,有效扩展了大像面荧光显微成像系统的景深,为后续高通量多层堆叠式dPC... 大像面荧光显微成像系统可以对大尺寸dPCR生物基因芯片进行一次性成像,但其景深(DOF)较小,限制了系统的物方检测深度。文章采用波前编码技术在不降低分辨率的前提下,有效扩展了大像面荧光显微成像系统的景深,为后续高通量多层堆叠式dPCR生物芯片实现一次性成像提供了技术支持。但考虑到显微成像系统正向设计仿真时不适合直接进行景深延拓分析,故对其倒置翻转后在像方(原物方)分析焦深延拓范围(即景深)。为确定最优的相位板参数值,编写遗传算法与ZEMAX的API接口链接,以动态交互的方式对相位板调制系数进行优化、筛选、定值。在大像面荧光显微成像系统孔径光阑前的平行光路处添加特定系数的相位板,对光学系统的波前相位进行调制,使得在焦点附近一段范围内产生成像一致的中间模糊像。采用维纳滤波对中间模糊像进行复原,由模拟的结果可见,在传统光学系统的±10倍景深内,编码复原图像具有较高的分辨率(达到6.5μm),能够实现系统的景深延拓。装配相位板的大像面荧光显微成像实际系统,其延拓倍数在±7倍景深范围内有较好的图像复原分辨率(6.5μm)。 展开更多
关键词 生物光学 波前编码 数字PCR 光学设计 荧光显微镜 图像处理
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生物超微弱发光的两维探测 被引量:2
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作者 王苏生 陈天明 +3 位作者 俞信 曹恩华 许娜飞 李景福 《激光生物学》 CSCD 1996年第1期771-774,共4页
本文介绍了自行研制的二套系统及其应用。1.高灵敏荧光显微镜系统,该系统探测灵敏度达到10-6lx量级,比普通CCD系统提高了104倍,系统用宽量程照度计对微弱光成象性能进行了标定,在给出细胞荧光图象的同时,可以给出每一象元的发光... 本文介绍了自行研制的二套系统及其应用。1.高灵敏荧光显微镜系统,该系统探测灵敏度达到10-6lx量级,比普通CCD系统提高了104倍,系统用宽量程照度计对微弱光成象性能进行了标定,在给出细胞荧光图象的同时,可以给出每一象元的发光强度,并可给出视觉更易分辨的光强的三维显示和伪彩色图象。在该系统上得到了分红菌甲素在Hela细胞中的分布图象,Hela细胞加入竹红菌甲素后的光照损伤及抗氧化剂维生素E等对细胞的保护图象。2.光子计数成象系统,该系统灵敏度达10-8lx量级,可探测到单个光子及其分布,在其上得到了绿豆芽,树叶,昆明鼠,人手及手指的超微弱发光的光子图象,并用统计理论进行了信号检验。 展开更多
关键词 生物光学 生物超微弱发光
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A comparative study of the morphometry of sperm head components in cattle, sheep, and pigs with a computer-assisted fluorescence method 被引量:1
7
作者 Jesus L Yaniz Sara Capistros +2 位作者 Sandra Vicente-Fiel Carlos O Hidalgo Pilar Santolaria 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2016年第6期840-843,共4页
The aim of this study was to compare the sperm nuclear and acrosomal morphometry of three species of domestic artiodactyls; cattle (Bos taurus), sheep (Ovis aries), and pigs (Sus scrofa). Semen smears of twenty ... The aim of this study was to compare the sperm nuclear and acrosomal morphometry of three species of domestic artiodactyls; cattle (Bos taurus), sheep (Ovis aries), and pigs (Sus scrofa). Semen smears of twenty ejaculates from each species were fixed and labeled with a propidium iodide-Pisum sativum agglutinin (PI/PSA) combination. Digital images of the sperm nucleus, acrosome, and whole sperm head were captured and analyzed. The use of the PI/PSA combination and CASA-Morph fluorescence-based method allowed the capture, morphometric analysis, and differentiation of most sperm nuclei, acrosomes and whole heads, and the assessment of acrosomal integrity with a high precision in the three species studied. For the size of the head and nuclear area, the relationship between the three species may be summarized as bull 〉 ram 〉 boar. However, for the other morphometric parameters (length, width, and perimeter), there were differences in the relationships between species for sperm nuclei and whole sperm heads. Bull sperm acrosomes were clearly smaller than those in the other species studied and covered a smaller proportion of the sperm head. The acrosomal morphology, small in the bull, large and broad in the sheep, and large, long, and with a pronounced equatorial segment curve in the boar, was species-characteristic. It was concluded that there are clear variations in the size and shape of the sperm head components between the three species studied, the acrosome being the structure showing the most variability, allowing a clear distinction of the spermatozoa of each species. 展开更多
关键词 artiodactyls computer-assisted sperm morphometry analysis fluorescence microscopy image analysis sperm morphometry
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高分辨阿达玛变换显微荧光图像分析(Ⅲ)——系统分辨率和图像恢复过程对单细胞分析结果的影响 被引量:1
8
作者 唐宏武 李涛 +2 位作者 罗美娜 吴琼水 陈观铨 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第1期31-34,共4页
提出了一种改进的阿达玛变换 (HT)显微荧光图像分析系统 ,以单细胞试样分析为基础 ,分别对系统的分辨率和解码后的图像恢复过程进行了讨论 .结果表明 ,该系统可应用于单细胞形态分析和定量分析 .图像在 x和 y方向的像素分辨率相同 ,并... 提出了一种改进的阿达玛变换 (HT)显微荧光图像分析系统 ,以单细胞试样分析为基础 ,分别对系统的分辨率和解码后的图像恢复过程进行了讨论 .结果表明 ,该系统可应用于单细胞形态分析和定量分析 .图像在 x和 y方向的像素分辨率相同 ,并达到了同一成像物镜下的空间分辨率水平 ,因此在获取微米级单细胞试样的微弱荧光信号的二维图像时 ,系统的成像能力较好 ,可用于单细胞形态分析 .对花粉细胞的荧光衰退过程的定量分析结果表明 ,对不同 HT图像提供的同一系列试样的定量数据进行比较时 ,必须对所有该系列试样的图像恢复过程进行归一化处理 . 展开更多
关键词 阿达玛变换 光谱成像 荧光显微术 图像恢复 单细胞分析
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薄膜生长荧光显微图像实时采集与分析系统 被引量:2
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作者 鄢志丹 孙立东 +2 位作者 胡春光 胡小唐 Peter Zeppenfeld 《光学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第9期309-315,共7页
设计了一套具有一定实用意义和科学价值的薄膜生长荧光显微图像实时采集与分析系统,可以实现透明衬底上有机荧光分子薄膜生长的实时原位监测。进一步阐明了系统的硬件构筑思路和软件设计架构,并依据薄膜的形貌特征,给出8个主要生长信息... 设计了一套具有一定实用意义和科学价值的薄膜生长荧光显微图像实时采集与分析系统,可以实现透明衬底上有机荧光分子薄膜生长的实时原位监测。进一步阐明了系统的硬件构筑思路和软件设计架构,并依据薄膜的形貌特征,给出8个主要生长信息参数及其求取算法,并利用自行搭建的实验系统,针对联六苯(p-6P)分子在云母衬底上的纳米纤维生长过程,得出了其准一维的线性生长规律。该系统作为重要的薄膜生长成像监测技术,有望在薄膜与衬底表面相互作用和衬底微区结构特性研究等方面起到积极的作用。 展开更多
关键词 薄膜 荧光显微术 成像系统 图像处理 薄膜生长参量
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显微荧光去卷积成像评价方法的研究 被引量:1
10
作者 孔艺颖 钱翔 +1 位作者 方滨 叶大田 《北京生物医学工程》 2014年第4期374-378,共5页
目的为了降低荧光显微图像的噪声和离焦平面的信息,提高图像清晰度,并评价去卷积成像方法的性能,本文进行显微荧光去卷积成像评价方法的研究。方法首先,将测得的系统点扩散函数作用于共聚焦显微镜采集的endoG-GFP标记的人乳腺癌细胞MCF-... 目的为了降低荧光显微图像的噪声和离焦平面的信息,提高图像清晰度,并评价去卷积成像方法的性能,本文进行显微荧光去卷积成像评价方法的研究。方法首先,将测得的系统点扩散函数作用于共聚焦显微镜采集的endoG-GFP标记的人乳腺癌细胞MCF-7图像,得到模糊图像,然后采用Richardson-Lucy(R-L)算法对模糊的荧光图像进行去卷积运算,并对去卷积成像方法的性能进行了分析和评估。结果显微荧光去卷积成像方法可有效去除焦平面外荧光信息,显著提高荧光图像的清晰度。结论显微荧光去卷积算法结合有效的评价方法在未来有望用于微流控细胞培养的成像,对活体细胞和组织的三维结构的研究有一定的参考价值。 展开更多
关键词 荧光显微成像 去卷积 图像质量评价
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用萤光显微镜测定纤维板的含胶量 被引量:1
11
作者 保昆雁 郭梦麟 《林产工业》 北大核心 2010年第2期28-31,共4页
萤光显微法常用于实验室研究胶黏剂在人造板里的分布,用这个方法作为人造板生产线品质控制的指标还不广泛。本实验利用萤光显微技术配合电脑图像分析,先测定实验室制作的一组高密度纤维样板里的异氰酸酯含胶量,再用同法测定工厂产的高... 萤光显微法常用于实验室研究胶黏剂在人造板里的分布,用这个方法作为人造板生产线品质控制的指标还不广泛。本实验利用萤光显微技术配合电脑图像分析,先测定实验室制作的一组高密度纤维样板里的异氰酸酯含胶量,再用同法测定工厂产的高密度纤维板里的异氰酸酯含胶量。实验室样板施胶量为2%、3%、4%、6%及8%的高密度纤维板各2张,3张高密度纤维样板是从工厂生产线上在4h之内不同时间取得。结果显示,实验室各种施胶量的样板,用萤光显微法测得的含胶量分别为2.06%,2.901%,4.00%,6.17%及9.07%,测得含胶量与施胶量的相关系数为r=0.996 0。用同法测得3张工厂样板的含胶量分别为3.53%、3.54%及3.56%,与生产时设定的3.50%施胶极为接近。本实验结果显示,萤光显微分析法可迅速并准确地测出高密度纤维板里的异氰酸酯含胶量,用该法检测工厂样板的结果表示,该工厂在4h取样期间内施胶情形良好而且稳定,胶黏剂效率高,产品品质优良。 展开更多
关键词 萤光显微 图像分析 高密度纤维板 异氰酸酯胶 含胶量
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中、高渗透性油层水驱油实验及水淹机理分析 被引量:1
12
作者 马德华 《录井工程》 2012年第1期5-9,76,共5页
通过开展中、高渗透性油层模拟注水驱油实验,以稳态法测定油-水相对渗透率,制备饱含油至残余油的不同含水率岩样,对岩样进行岩石热解、饱和烃气相色谱及荧光显微图像分析,研究岩石热解、饱和烃气相色谱参数及荧光显微图像特征随含水率... 通过开展中、高渗透性油层模拟注水驱油实验,以稳态法测定油-水相对渗透率,制备饱含油至残余油的不同含水率岩样,对岩样进行岩石热解、饱和烃气相色谱及荧光显微图像分析,研究岩石热解、饱和烃气相色谱参数及荧光显微图像特征随含水率上升的变化规律及趋势,总结中、高渗透性油层水淹变化录井资料响应特征,探讨其水淹机理并对实验数据中产生的特殊现象进行分析。实验证明录井各单项资料能够反映中、高渗透性油层不同水洗状况下的特征,为今后录井资料评价中、高渗透性油层水淹程度奠定了理论基础。 展开更多
关键词 高渗透性油层 水驱油实验 岩石热解 饱和烃气相色谱 荧光显微图像 响应特征 水淹机理
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利用MAP评估提高表面等离子体结构光照明技术成像质量
13
作者 余慕欣 周文超 吴一辉 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第4期15-21,共7页
经典的恢复算法不能有效地恢复被观测物的全频域信息,空间频率的缺失导致超分辨图像伴有较为严重的旁瓣.本文提出利用最大后验概率(MAP)评估解决表面等离子体结构光照明技术中的光学旁瓣问题.结果表明MAP评估恢复算法可以有效恢复物质... 经典的恢复算法不能有效地恢复被观测物的全频域信息,空间频率的缺失导致超分辨图像伴有较为严重的旁瓣.本文提出利用最大后验概率(MAP)评估解决表面等离子体结构光照明技术中的光学旁瓣问题.结果表明MAP评估恢复算法可以有效恢复物质的高空间频率信息,并且通过合理选择优化参数达到抑制光学旁瓣的目的.在波长520nm,数值孔径1.3下,可获得半高全宽65nm的横向分辨力,约为传统荧光显微镜的3.6倍.该技术在生命科学观测中具有潜在应用价值. 展开更多
关键词 显微 荧光显微 超分辨 表面等离子体 金属光学 图像重建技术
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活体细胞三维图像科学可视化方法的研究
14
作者 熊俊 李栋栋 +1 位作者 瞿安连 徐涛 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期286-290,共5页
科学可视化是指运用计算机图形学和图像处理技术,将科学计算过程中或者是计算结果的数据转换为图形或图像,在屏幕上显示出来并进行交互式处理的理论技术或方法。介绍了用反卷积荧光显微成像技术获得活体大鼠胰腺β细胞三维图像及对其进... 科学可视化是指运用计算机图形学和图像处理技术,将科学计算过程中或者是计算结果的数据转换为图形或图像,在屏幕上显示出来并进行交互式处理的理论技术或方法。介绍了用反卷积荧光显微成像技术获得活体大鼠胰腺β细胞三维图像及对其进行科学可视化的主要过程和两种常用可视化算法,并运用这两种方法对所得到的三维图像进行处理以分析和研究细胞内分泌囊泡的空间分布。结果显示,当仅观察细胞三维图像的二维切片时,三维图像中的某些重要信息会被忽略,而使用科学可视化方法则可以从三维角度直观观察活体细胞内分泌囊泡的空间分布,并且可以观察到分泌囊泡的释放趋势和整体分布,从而为细胞生物学研究提供重要的信息。 展开更多
关键词 活体细胞 三维图像 反卷积荧光显微技术 光学切片 科学可视化
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北部凹陷新安村组、乌云组储集层解释评价
15
作者 寇海亮 张丽艳 《录井工程》 2012年第4期36-39,81,共4页
方正断陷北部凹陷是大庆油田外围盆地重点勘探地区之一,该凹陷新安村组、乌云组为主要目的层,储集层埋深变化大,受构造、岩性、断层活动的多期性等因素的影响,油水分布特征呈多样性,无统一的油水界面,储集层评价困难。基于这一状况,在... 方正断陷北部凹陷是大庆油田外围盆地重点勘探地区之一,该凹陷新安村组、乌云组为主要目的层,储集层埋深变化大,受构造、岩性、断层活动的多期性等因素的影响,油水分布特征呈多样性,无统一的油水界面,储集层评价困难。基于这一状况,在实践研究的基础上综合分析了不同储集层的荧光显微图像和热解气相色谱谱图特征,给出了利用岩石热解含油气总量与原油轻重组分指数初步评价储集层的判别标准和根据含油气总量与测井孔隙度解释评价储集层的交会图板。实例分析表明,应用上述方法可实现该地区不同储集层的有效解释评价。 展开更多
关键词 荧光显微图像 岩石热解 热解气相色谱 孔隙度 含油气总量 原油轻重组分指数 交会图板 储集层 评价
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光片荧光显微镜长时间的稳定成像 被引量:7
16
作者 张球 梁东 +1 位作者 白丽华 刘军 《中国激光》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期271-276,共6页
利用4f(f为焦距)系统和电子耦合器件相机跟踪样品的位置,通过纳米平移台对机械漂移进行了补偿,使样品始终处于光片的束腰位置,从而获得了最优图像。所提方法可以对几纳米的机械偏移进行补偿。使用自主搭建的光片荧光显微镜对直径为几微... 利用4f(f为焦距)系统和电子耦合器件相机跟踪样品的位置,通过纳米平移台对机械漂移进行了补偿,使样品始终处于光片的束腰位置,从而获得了最优图像。所提方法可以对几纳米的机械偏移进行补偿。使用自主搭建的光片荧光显微镜对直径为几微米的荧光微球进行了长时间成像,验证了所提方法的可行性。 展开更多
关键词 成像系统 光片荧光显微镜 机械偏移 4f系统 补偿 最优图像
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荧光显微图像技术评价油水层及水淹层方法研究
17
作者 王建伟 《录井工程》 2013年第2期44-48,91-92,共5页
荧光显微图像技术以紫外光或蓝光作为光源,通过激发岩石中石油沥青物质后产生出可见的荧光图像,可直观观察石油沥青物质在岩石中的分布状况,为油层评价提供微观可视化信息。为进一步推广该项技术的应用,对荧光显微图像特征量化处理的18... 荧光显微图像技术以紫外光或蓝光作为光源,通过激发岩石中石油沥青物质后产生出可见的荧光图像,可直观观察石油沥青物质在岩石中的分布状况,为油层评价提供微观可视化信息。为进一步推广该项技术的应用,对荧光显微图像特征量化处理的18项参数进行了研究,以试油、投产资料为优选依据,建立了不同油质的油层和油水层定性判别方法,归纳总结了喇萨杏油田水淹层评价方法,并根据定量参数分别建立了油水层、水淹层评价图板,在新井中验证应用,见到较好的效果。 展开更多
关键词 大庆油田 荧光显微图像技术 定量化参数 色差 发光面积 油水层评价 水淹层评价
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聚合物改性沥青显微结构及量化研究 被引量:37
18
作者 黄卫东 孙立军 《公路交通科技》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期9-11,共3页
荧光显微照相技术不会破坏聚合物相在沥青中的形态 ,是评价改性沥青机理的有效手段。本文介绍用荧光显微照相观测到聚合物相在沥青中真实的相态结构及如何利用改进的方法获得大量重现性很好的显微图像 ,本文还对目前改性沥青显微结构的... 荧光显微照相技术不会破坏聚合物相在沥青中的形态 ,是评价改性沥青机理的有效手段。本文介绍用荧光显微照相观测到聚合物相在沥青中真实的相态结构及如何利用改进的方法获得大量重现性很好的显微图像 ,本文还对目前改性沥青显微结构的研究现状及存在的问题进行了评价与分析 ,并提出改进的方法 ,配备了数字化处理所需的硬件设备及功能完善的图像处理软件 ,可以对聚合物改性沥青的显微结构进行量化分析。 展开更多
关键词 聚合物改性沥青 显微结构 荧光显微照相 图像处理 量化分析
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酵母自体荧光寿命显微图像的自动分析方法 被引量:2
19
作者 钟佳慧 伍君鑫 +3 位作者 孔亚伟 苏文华 马炯 糜岚 《激光与光电子学进展》 CSCD 北大核心 2022年第6期265-275,共11页
酿酒酵母是最具有吸引力的微生物之一,监测其在不同生长时期的新陈代谢状态变化对基础生物学和工业研究都具有重要意义。依据酵母的生成曲线规律培养了不同时间的酵母细胞,基于荧光寿命显微成像(FLIM)进行自体荧光寿命图像的采集,并提... 酿酒酵母是最具有吸引力的微生物之一,监测其在不同生长时期的新陈代谢状态变化对基础生物学和工业研究都具有重要意义。依据酵母的生成曲线规律培养了不同时间的酵母细胞,基于荧光寿命显微成像(FLIM)进行自体荧光寿命图像的采集,并提出了一种基于机器学习的自动分析方法,可无标记快速鉴别年轻和衰老的酵母细胞。首先,采用深度监督U-Net实现酵母细胞的自动分割;然后,提取每个酵母细胞的荧光寿命特征和形态特征;最后,采用无监督聚类方法实现分类。实验结果表明,酵母的衰老伴随着新陈代谢的变化。FLIM作为一种无标记成像技术可应用于酵母细胞的代谢分析中,结合自动化分析流程可快速准确地区分具有不同代谢差异的细胞,为后续单细胞的筛选奠定了基础。 展开更多
关键词 生物技术 荧光寿命显微成像 机器学习 图像处理 酵母细胞分类
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A Method for Astral Microtubule Tracking in Fluorescence Images of Cells Doped with Taxol and Nocodazole
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作者 Marilena Varrecchia Joshua Levine +3 位作者 Gabriella Olmo Marco Grangetto Marta Gai Ferdinando Di Cunto 《Advances in Molecular Imaging》 2019年第4期60-86,共27页
In this paper, we describe an algorithm that performs automatic detection and tracking of astral microtubules in fluorescence confocal images. This sub-population of microtubules only exists during and immediately bef... In this paper, we describe an algorithm that performs automatic detection and tracking of astral microtubules in fluorescence confocal images. This sub-population of microtubules only exists during and immediately before mitosis and aids in the spindle orientation by connecting it to the cell cortex. Anomalies in their dynamic behaviour play a causal role in many diseases, such as development disorders and cancer. The main novelty of the proposed algorithm lies in the fact it provides a fully automated estimation of parameters related to microtubule dynamic instability (growth velocity, track length and track lifetime), and helps in understanding the effects of intermediate drug concentrations. Its performance has been objectively assessed using publicly available synthetic data and largely employed metrics. Moreover, we present experiments addressing cell cultures doped with different concentrations of taxol and nocodazole. Such drugs are known to suppress the microtubule dynamic instability, but their effects at intermediate concentrations are not completely assessed. The algorithm has been compared with other state-of-the-art approaches, tested on consistent real datasets. The results are encouraging in terms of performance, robustness and simplicity of use, and the algorithm is now routinely employed in our Department of Molecular Biotechnology. 展开更多
关键词 Medical Diagnostic Imaging fluorescence CONFOCAL microscopy image Segmentation MICROTUBULES
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