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胡萝卜软腐果胶杆菌鞭毛钩基因flgK的功能 被引量:2
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作者 杨钟灵 邓亚岷 +4 位作者 杜硕 李婷 蒋欢 刘凤权 范加勤 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期703-709,共7页
【目的】为了研究鞭毛钩基因flgK在胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种(Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum,P.c.c)的功能。【方法】本研究采用两亲同源交换法构建了基因缺失突变体ΔflgKpcc并构建了互补菌株ΔflgKpcc-KH,测定突... 【目的】为了研究鞭毛钩基因flgK在胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种(Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum,P.c.c)的功能。【方法】本研究采用两亲同源交换法构建了基因缺失突变体ΔflgKpcc并构建了互补菌株ΔflgKpcc-KH,测定突变体及其互补菌株的菌体形态、运动性、致病因子、致病性等表型。【结果】与野生菌株PccS1相比,ΔflgKpcc鞭毛缺失,菌体易沉降,在0.3%半固体培养基上运动能力明显降低,生长速率无明显变化,但是纤维素酶和蛋白酶的活性、生物膜形成能力明显下降,对感病寄主的致病力显著减弱。基因互补可以使上述突变表型恢复。【结论】实验表明,鞭毛基因flgK突变导致了菌体的运动性降低、病原菌毒性相关的酶活力下降,从而导致致病力下降。 展开更多
关键词 胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种 鞭毛 flgk 致病因子
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Transcriptomic and metabolomic insights into the role of the flgK gene in the pathogenicity of Pseudomonas plecoglossicida to orange-spotted grouper(Epinephelus coioides)
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作者 Biao Yuan Ling-Min Zhao +6 位作者 Zhi-Xia Zhuang Xiao-Ru Wang Qi Fu Hua-Bin Huang Li-Xing Huang Ying-Xue Qin Qing-Pi Yan 《Zoological Research》 SCIE CAS CSCD 2022年第6期952-965,共14页
Pseudomonas plecoglossicida is the pathogen responsible for visceral white spot disease in large yellow croaker(Larimichthys crocea)and orangespotted grouper(Epinephelus coioides).Previously,RNA sequencing showed that... Pseudomonas plecoglossicida is the pathogen responsible for visceral white spot disease in large yellow croaker(Larimichthys crocea)and orangespotted grouper(Epinephelus coioides).Previously,RNA sequencing showed that P.plecoglossicida flgK gene expression was significantly up-regulated in orange-spotted grouper spleens during infection.To explore the role of flgK in P.plecoglossicida pathogenicity,RNA interference(RNAi)was performed to silence the P.plecoglossicida flgK gene,and the mutant(flgK-RNAi strain)with the best silencing efficiency(89.40%)was chosen for further study.Results showed that flgK gene silencing significantly attenuated P.plecoglossicida motility,adhesion,and biofilm formation.Compared to those fish infected with the wild-type strain of P.plecoglossicida,orange-spotted grouper infected with the flgK-RNAi strain showed a 55%increase in the survival rate and a one-day delay in time of first death,with fewer pathogens in the spleen and fewer white spots on the spleen surface.RNAi of flgK significantly affected the transcriptome and metabolome of the spleen in infected orange-spotted grouper.Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)enrichment analysis showed that the C-type lectin receptor signaling pathway was the most significantly changed immune-related pathway and the mitogen-activated protein kinase(MAPK)signaling pathway was related to multiple immunerelated pathways.Furthermore,arginine biosynthesis and glycerophospholipid metabolism were the most significantly changed metabolism-related pathways.These findings suggest that flgK is a virulence gene of P.plecoglossicida.Furthermore,flgK appears to be involved in the regulation of motility,adhesion,and biofilm formation in P.plecoglossicida,as well as in the regulation of inflammatory and immune responses of orange-spotted grouper to P.plecoglossicida infection. 展开更多
关键词 Orange-spotted grouper Pseudomonas plecoglossicida flgk PATHOGENICITY Transcriptome METABOLOME
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一种用于Red同源重组的正反筛选表达盒的构建及其反向筛选性能分析 被引量:1
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作者 刘金泽 刘云惠 +6 位作者 余子豪 李永霞 王明晓 张远星 李统战 李倩文 余旭平 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期902-907,共6页
为建立能够应用于大肠杆菌基因无痕敲除的方法,本研究分别从大肠杆菌TG1基因组和pKD13质粒中扩增出链霉素敏感基因(str^S,即rpsL基因)和卡那抗性基因(kan^R),采用重叠延伸PCR方法将str^S基因和kan^R基因拼接,并将拼接片段分别克隆于pMD1... 为建立能够应用于大肠杆菌基因无痕敲除的方法,本研究分别从大肠杆菌TG1基因组和pKD13质粒中扩增出链霉素敏感基因(str^S,即rpsL基因)和卡那抗性基因(kan^R),采用重叠延伸PCR方法将str^S基因和kan^R基因拼接,并将拼接片段分别克隆于pMD18-T和pBAD33载体中,再以重组载体为模板,以带有flgK基因同源臂的引物扩增获得Placstr^S-kan^R打靶片段和Parastr^S-kan^R打靶片段,然后结合Red重组技术构建了相应的flgK基因敲除菌株placSK-ΔflgK/TOP10和paraSK-ΔflgK/TOP10,并通过链霉素最小抑菌浓度(MIC)试验检测两种筛选系统的反向筛选性能。结果显示,野生型TOP10菌株、placSK-ΔflgK/TOP10菌株和paraSK-ΔflgK/TOP10菌株的链霉素MIC值分别为8 000μg/mL、2 000μg/mL和500μg/mL。表明采用两种筛选系统构建的敲除菌株均有一定的链霉素敏感表型,具有反向筛选的能力,但含Para启动子的筛选系统反向筛选性能更好。本研究建立了可用于大肠杆菌Red重组技术的反向筛选系统,为获得更有效的Red重组筛选工具提供了依据。 展开更多
关键词 RED重组 RPSL基因 基因敲除 大肠杆菌 flgk基因
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钩端螺旋体赖型017鞭毛钩相关蛋白K基因的克隆及序列分析
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作者 于向华 鲍朗 +1 位作者 谢勇恩 张会东 《生命科学研究》 CAS CSCD 2002年第S1期101-107,共7页
在以抑制消减杂交比较强毒株赖型钩端螺旋体017株和无毒株双曲钩体Patoc I株 的基因组差异时,获得了一系列仅存在于强毒株而无毒株缺如的差异片段.选取差异片段AF325810设计特异性引物,以赖型钩端螺旋体017株基因组DNA为模板,进行巢式... 在以抑制消减杂交比较强毒株赖型钩端螺旋体017株和无毒株双曲钩体Patoc I株 的基因组差异时,获得了一系列仅存在于强毒株而无毒株缺如的差异片段.选取差异片段AF325810设计特异性引物,以赖型钩端螺旋体017株基因组DNA为模板,进行巢式PCR扩增,PCR纯化产物T载体克隆,选取阳性克隆测序,进一步进行生物信息学分析,以获得强毒株赖型钩端螺旋体017株特有的毒力相关基因,DOT BLOT显示其在钩端螺旋体各株间有不同分布PCR扩增得到了产物为2kb大小的DNA片段,序列分析结果显示得到了问号钩端螺旋体赖型017株的鞭毛钩相关蛋白K基因的上游序列,为进一步探索钩端螺旋体的致病机制奠定了基础. 展开更多
关键词 钩端螺旋体 巢式PCR 鞭毛钩相关蛋白K(flgk) 生物信息学
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