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苹果苦痘病对果实类黄酮总含量的影响及其分子生物学机制
被引量:
1
1
作者
余贤美
薛晓敏
+4 位作者
王金政
王贵平
聂佩显
陈汝
韩雪平
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第18期1896-1908,共13页
类黄酮在多种植物生物学功能和人类慢性病的治疗上发挥了重要的作用.苹果苦痘病是苹果生产上的一种重要生理性病害,严重影响了果品的品质,造成了巨大经济损失.研究苹果苦痘病对苹果果实类黄酮的影响及其分子生物学机制,可为医用类黄酮...
类黄酮在多种植物生物学功能和人类慢性病的治疗上发挥了重要的作用.苹果苦痘病是苹果生产上的一种重要生理性病害,严重影响了果品的品质,造成了巨大经济损失.研究苹果苦痘病对苹果果实类黄酮的影响及其分子生物学机制,可为医用类黄酮的获得挖掘新的资源.采用氯化铝比色法测定了健康果实和苦痘病果的类黄酮总含量,结果显示,苦痘病果的类黄酮总含量为健康果实的4.28倍.通过转录组测序和qRT-PCR对类黄酮总含量变化的分子生物学机制进行了研究.经测序,从苹果健康果实和苦痘病果2组样品中,分别获得226.702和202.951 M Clean reads,包含32.807和29.626 Gb测序数据,其碱基百分比(Q30)大于95.0%.以健康果实为参考,苦痘病果共获得2632个差异表达基因,其中上调基因2080个,下调基因552个.经GO基因功能注释和KEGG代谢通路富集分析,获得与类黄酮合成相关的差异表达基因26个(24个上调基因和2个下调基因),选取其中8个差异表达基因:CYP98A3(1), CYP98A3 (1), BADH, DAT, MdHCT (1), MdHCT (2), CHI (1)和CHI (2)进行qRT-PCR分析验证,结果显示,该8个基因均表现为上调表达,上调倍数为1.05~7.17倍.研究表明,苹果苦痘病的发生刺激了苹果果实中类黄酮的大量表达和积累,可为医学研究中类黄酮的获得,提供更广泛的资源.
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关键词
全转录组测序分析
苹果苦痘病
qRT-PCR分析
类黄酮生物合成与积累
类黄酮总含量
原文传递
苹果苦痘病果不同部位类黄酮含量及其差异表达基因分析
被引量:
1
2
作者
余贤美
王金政
+4 位作者
薛晓敏
王贵平
聂佩显
陈汝
韩雪平
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期501-510,共10页
类黄酮是一类重要的多酚类次生代谢产物,苹果(Malus pumila)果实因富含类黄酮等人体易于吸收利用的游离多酚,在抗癌、抗氧化活性、预防心脑血管病、抗肿瘤等人类慢性疾病方面有较好的功效,具有较高的营养和医疗保健价值。本文采用氯化...
类黄酮是一类重要的多酚类次生代谢产物,苹果(Malus pumila)果实因富含类黄酮等人体易于吸收利用的游离多酚,在抗癌、抗氧化活性、预防心脑血管病、抗肿瘤等人类慢性疾病方面有较好的功效,具有较高的营养和医疗保健价值。本文采用氯化铝比色法测定苹果苦痘病果不同部位的类黄酮总含量,通过全转录组测序和实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术分析苹果苦痘病果不同部位转录组水平的差异表达,以研究苹果苦痘病对病果不同部位类黄酮含量的影响及分子机理,并探讨苹果苦痘病果的潜在医疗保健价值。结果显示,苹果苦痘病果病斑部位的类黄酮总含量为健康部分的8.26倍。经全转录组测序分析,获得的20个与类黄酮生物合成相关的差异表达基因(DEG)均为mRNA,选取其中8个FPKM值差异倍数大于4.0 (4.10~80.15)的DEG进行qRTPCR验证,结果显示,苹果苦痘病果病斑部位这8个DEG的相对表达量为健康部分的3.05~24.50倍,说明苹果苦痘病的发生极大地促进了苹果苦痘病果病斑部位类黄酮的大量合成和积累,表明苹果苦痘病果病斑部位比健康部分在类黄酮资源获取方面具有更高的潜在价值。
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关键词
苹果苦痘病
类黄酮总含量
类黄酮合成与积累
全转录组测序分析
qRT-PCR分析
原文传递
题名
苹果苦痘病对果实类黄酮总含量的影响及其分子生物学机制
被引量:
1
1
作者
余贤美
薛晓敏
王金政
王贵平
聂佩显
陈汝
韩雪平
机构
山东省果树研究所
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第18期1896-1908,共13页
基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-27)
国家重点研发计划(2014BAD16B02-2)
+1 种基金
山东省重点研发计划(2017CXGC0210)
国家自然科学基金(31600021)资助
文摘
类黄酮在多种植物生物学功能和人类慢性病的治疗上发挥了重要的作用.苹果苦痘病是苹果生产上的一种重要生理性病害,严重影响了果品的品质,造成了巨大经济损失.研究苹果苦痘病对苹果果实类黄酮的影响及其分子生物学机制,可为医用类黄酮的获得挖掘新的资源.采用氯化铝比色法测定了健康果实和苦痘病果的类黄酮总含量,结果显示,苦痘病果的类黄酮总含量为健康果实的4.28倍.通过转录组测序和qRT-PCR对类黄酮总含量变化的分子生物学机制进行了研究.经测序,从苹果健康果实和苦痘病果2组样品中,分别获得226.702和202.951 M Clean reads,包含32.807和29.626 Gb测序数据,其碱基百分比(Q30)大于95.0%.以健康果实为参考,苦痘病果共获得2632个差异表达基因,其中上调基因2080个,下调基因552个.经GO基因功能注释和KEGG代谢通路富集分析,获得与类黄酮合成相关的差异表达基因26个(24个上调基因和2个下调基因),选取其中8个差异表达基因:CYP98A3(1), CYP98A3 (1), BADH, DAT, MdHCT (1), MdHCT (2), CHI (1)和CHI (2)进行qRT-PCR分析验证,结果显示,该8个基因均表现为上调表达,上调倍数为1.05~7.17倍.研究表明,苹果苦痘病的发生刺激了苹果果实中类黄酮的大量表达和积累,可为医学研究中类黄酮的获得,提供更广泛的资源.
关键词
全转录组测序分析
苹果苦痘病
qRT-PCR分析
类黄酮生物合成与积累
类黄酮总含量
Keywords
transcriptome
sequencing
analysis
bitter
pit
in
apples
qRT-PCR
analysis
flavonoid
biosynthesis
and
accumulation
the
total
flavonoid
content
分类号
S436.611.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
苹果苦痘病果不同部位类黄酮含量及其差异表达基因分析
被引量:
1
2
作者
余贤美
王金政
薛晓敏
王贵平
聂佩显
陈汝
韩雪平
机构
山东省果树研究所
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期501-510,共10页
基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-27)
国家重点研发计划(2014BAD16B02-2)
+1 种基金
山东省重点研发计划(2017-CXGC0210)
国家自然科学基金(31600021)。
文摘
类黄酮是一类重要的多酚类次生代谢产物,苹果(Malus pumila)果实因富含类黄酮等人体易于吸收利用的游离多酚,在抗癌、抗氧化活性、预防心脑血管病、抗肿瘤等人类慢性疾病方面有较好的功效,具有较高的营养和医疗保健价值。本文采用氯化铝比色法测定苹果苦痘病果不同部位的类黄酮总含量,通过全转录组测序和实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术分析苹果苦痘病果不同部位转录组水平的差异表达,以研究苹果苦痘病对病果不同部位类黄酮含量的影响及分子机理,并探讨苹果苦痘病果的潜在医疗保健价值。结果显示,苹果苦痘病果病斑部位的类黄酮总含量为健康部分的8.26倍。经全转录组测序分析,获得的20个与类黄酮生物合成相关的差异表达基因(DEG)均为mRNA,选取其中8个FPKM值差异倍数大于4.0 (4.10~80.15)的DEG进行qRTPCR验证,结果显示,苹果苦痘病果病斑部位这8个DEG的相对表达量为健康部分的3.05~24.50倍,说明苹果苦痘病的发生极大地促进了苹果苦痘病果病斑部位类黄酮的大量合成和积累,表明苹果苦痘病果病斑部位比健康部分在类黄酮资源获取方面具有更高的潜在价值。
关键词
苹果苦痘病
类黄酮总含量
类黄酮合成与积累
全转录组测序分析
qRT-PCR分析
Keywords
bitter
pit
disease
in
apple
total
flavonoid
content
flavonoid
biosynthesis
and
accumulation
whole-transcriptome
sequencing
analysis
qRT-PCR
analysis
分类号
S436.611.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苹果苦痘病对果实类黄酮总含量的影响及其分子生物学机制
余贤美
薛晓敏
王金政
王贵平
聂佩显
陈汝
韩雪平
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
原文传递
2
苹果苦痘病果不同部位类黄酮含量及其差异表达基因分析
余贤美
王金政
薛晓敏
王贵平
聂佩显
陈汝
韩雪平
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
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