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植物质体型ω-3脂肪酸去饱和酶7基因的密码子偏性分析
被引量:
11
1
作者
王海波
郭俊云
+1 位作者
姚晴晴
颜岳辉
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2448-2456,共9页
脂肪酸去饱和酶7是不饱和脂肪酸合成途径中催化亚油酸(Δ^(9,12)-C_(18:2))形成α-亚麻酸(Δ^(9,12,15)-C_(18:3),ALA)的关键酶。本研究利用Codon W、CHIPS及CUSP等程序分析植物FAD7基因的密码子偏性。结果表明,FAD7基因偏好使用以A或T...
脂肪酸去饱和酶7是不饱和脂肪酸合成途径中催化亚油酸(Δ^(9,12)-C_(18:2))形成α-亚麻酸(Δ^(9,12,15)-C_(18:3),ALA)的关键酶。本研究利用Codon W、CHIPS及CUSP等程序分析植物FAD7基因的密码子偏性。结果表明,FAD7基因偏好使用以A或T结尾的密码子。其中,AGA(RSCU=2.46)、AGT(RSCU=1.60)、CCT(RSCU=1.51)等属于高频使用密码子。分析的36种植物中,大部分双子叶植物的GC3s含量小于50%,预示FAD7基因更适合导入双子叶植物。
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关键词
质体型
脂肪酸去饱和酶
7
密码子偏性
原文传递
凤丹牡丹PoFAD7基因的克隆及表达分析
被引量:
3
2
作者
李超琼
王雪芹
+3 位作者
刘红占
王会芳
朱英男
田辉辉
《中国油脂》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期114-118,127,共6页
3脂肪酸脱氢酶能将亚油酸催化合成ɑ-亚麻酸,是植物脂肪酸生物合成的关键酶。以凤丹牡丹(Paeonia ostii)种子为试验材料,采用RACE和RT-PCR方法克隆获得凤丹牡丹脂肪酸脱氢酶7基因cDNA片段,命名为PoFAD7(GenBank登录号:MK205360);生物信...
3脂肪酸脱氢酶能将亚油酸催化合成ɑ-亚麻酸,是植物脂肪酸生物合成的关键酶。以凤丹牡丹(Paeonia ostii)种子为试验材料,采用RACE和RT-PCR方法克隆获得凤丹牡丹脂肪酸脱氢酶7基因cDNA片段,命名为PoFAD7(GenBank登录号:MK205360);生物信息学分析表明其包含完整的开放阅读框,推测编码的蛋白质含有450个氨基酸,具有2个跨膜结构域。蛋白质氨基酸序列比对分析表明,PoFAD7含有3个保守的组氨酸基序,而系统进化树分析结果显示凤丹牡丹与同属芍药属的芍药亲缘关系较近。对不同发育时期种子中PoFAD7基因的表达分析结果表明,该基因在凤丹牡丹授粉100 d的种子中相对表达量最高,结合凤丹牡丹种子中亚油酸和α-亚麻酸的累积规律,推测PoFAD7在催化亚油酸合成α-亚麻酸的反应中发挥一定的功能,但可能并不是α-亚麻酸合成的主效基因。
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关键词
凤丹牡丹
脂肪酸脱氢酶
7
基因克隆
表达分析
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职称材料
题名
植物质体型ω-3脂肪酸去饱和酶7基因的密码子偏性分析
被引量:
11
1
作者
王海波
郭俊云
姚晴晴
颜岳辉
机构
曲靖师范学院生物资源与环境科学学院
云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2448-2456,共9页
基金
国家自然科学基金(31460179)资助
文摘
脂肪酸去饱和酶7是不饱和脂肪酸合成途径中催化亚油酸(Δ^(9,12)-C_(18:2))形成α-亚麻酸(Δ^(9,12,15)-C_(18:3),ALA)的关键酶。本研究利用Codon W、CHIPS及CUSP等程序分析植物FAD7基因的密码子偏性。结果表明,FAD7基因偏好使用以A或T结尾的密码子。其中,AGA(RSCU=2.46)、AGT(RSCU=1.60)、CCT(RSCU=1.51)等属于高频使用密码子。分析的36种植物中,大部分双子叶植物的GC3s含量小于50%,预示FAD7基因更适合导入双子叶植物。
关键词
质体型
脂肪酸去饱和酶
7
密码子偏性
Keywords
Plastid
type,
fatty
acid
desaturase
7
,Codon
bias
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
凤丹牡丹PoFAD7基因的克隆及表达分析
被引量:
3
2
作者
李超琼
王雪芹
刘红占
王会芳
朱英男
田辉辉
机构
周口师范学院生命科学与农学学院
周口师范学院新闻与传媒学院
出处
《中国油脂》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期114-118,127,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31500534)
河南省高等学校重点科研项目(15A180024)
+1 种基金
周口师范学院2014年高层次人才科研启动经费项目(ZKNU2014108)
周口师范学院校本项目(ZKUNB115203)
文摘
3脂肪酸脱氢酶能将亚油酸催化合成ɑ-亚麻酸,是植物脂肪酸生物合成的关键酶。以凤丹牡丹(Paeonia ostii)种子为试验材料,采用RACE和RT-PCR方法克隆获得凤丹牡丹脂肪酸脱氢酶7基因cDNA片段,命名为PoFAD7(GenBank登录号:MK205360);生物信息学分析表明其包含完整的开放阅读框,推测编码的蛋白质含有450个氨基酸,具有2个跨膜结构域。蛋白质氨基酸序列比对分析表明,PoFAD7含有3个保守的组氨酸基序,而系统进化树分析结果显示凤丹牡丹与同属芍药属的芍药亲缘关系较近。对不同发育时期种子中PoFAD7基因的表达分析结果表明,该基因在凤丹牡丹授粉100 d的种子中相对表达量最高,结合凤丹牡丹种子中亚油酸和α-亚麻酸的累积规律,推测PoFAD7在催化亚油酸合成α-亚麻酸的反应中发挥一定的功能,但可能并不是α-亚麻酸合成的主效基因。
关键词
凤丹牡丹
脂肪酸脱氢酶
7
基因克隆
表达分析
Keywords
Paeonia
ostii
fatty
acid
desaturase
7
gene
clon
expression
analysis
分类号
S685.11 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
植物质体型ω-3脂肪酸去饱和酶7基因的密码子偏性分析
王海波
郭俊云
姚晴晴
颜岳辉
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
11
原文传递
2
凤丹牡丹PoFAD7基因的克隆及表达分析
李超琼
王雪芹
刘红占
王会芳
朱英男
田辉辉
《中国油脂》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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