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Study of pathogenic genes in a pedigree with familial dilated cardiomyopathy
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作者 Xin-Ru Zhang Hang Ren +2 位作者 Fang Yao Yang Liu Chun-Li Song 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第11期2412-2422,共11页
BACKGROUND Dilated cardiomyopathy(DCM)is a genetically heterogeneous cardiac disorder characterized by left ventricular dilation and contractile dysfunction.The substantial genetic heterogeneity evident in patients wi... BACKGROUND Dilated cardiomyopathy(DCM)is a genetically heterogeneous cardiac disorder characterized by left ventricular dilation and contractile dysfunction.The substantial genetic heterogeneity evident in patients with DCM contributes to variable disease severity and complicates overall prognosis,which can be very poor.AIM To identify pathogenic genes in DCM through pedigree analysis.METHODS Our research team identified a patient with DCM in the clinic.Through invest-igation,we found that the family of this patient has a typical DCM pedigree.High-throughput sequencing technology,next-generation sequencing,was used to sequence the whole exomes of seven samples in the pedigree.RESULTS A novel and potentially pathogenic gene mutation-ANK2p.F3067L-was discovered.The mutation was completely consistent with the clinical information for this DCM pedigree.Sanger sequencing was used to further verify the locus of the mutation in pedigree samples.These results were consistent with those of high-throughput sequencing.CONCLUSIONS ANK2p.F3067L is considered a novel and potentially pathogenic gene mutation in DCM. 展开更多
关键词 Dilated cardiomyopathy Gene mutation Whole exomes sequencing Sanger sequencing ANK2p.F3067L Potentially pathogenic gene
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智力障碍/全面性发育迟缓遗传学诊断策略探讨 被引量:2
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作者 周有峰 黄艳 刘光华 《临床荟萃》 2021年第9期820-823,共4页
目的探讨不明原因智力障碍/全面发育迟缓(ID/GDD)患儿遗传学检测策略。方法收集65例ID/GDD患儿外周血样本,行拷贝数变异(CNVs)检测,阴性样本行家系全外显子测序(trio-WES)。比较CNVs阳性组与单核苷酸变异(SNV)阳性组表型差异。将样本分... 目的探讨不明原因智力障碍/全面发育迟缓(ID/GDD)患儿遗传学检测策略。方法收集65例ID/GDD患儿外周血样本,行拷贝数变异(CNVs)检测,阴性样本行家系全外显子测序(trio-WES)。比较CNVs阳性组与单核苷酸变异(SNV)阳性组表型差异。将样本分为单独检测组(CNV-seq)和联合检测组(CNV-seq联合trio-WES),比较二者阳性率差异。结果联合检测组阳性率44.6%(29/65),单独检测组阳性率33.8%(22/65),阳性率有显著性差异。结论CNV-seq和trio-WES联合检测可提高阳性率。 展开更多
关键词 发育障碍 染色质 多态性 单核苷酸 外显子
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不明原因的癫痫和智力障碍/发育迟缓患儿的临床及相关致病基因分析 被引量:3
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作者 王文玉 戴园园 《中国临床神经科学》 2022年第1期39-48,共10页
目的分析不明原因的癫痫和智力障碍/发育迟缓(E-ID/DD)患儿的临床特征及基因型特点。方法回顾性分析32例2017年1月至2020年12月徐州医科大学附属医院儿科通过高通量二代测序技术基因检测阳性的不明原因的E-ID/DD患儿临床资料。结果 32... 目的分析不明原因的癫痫和智力障碍/发育迟缓(E-ID/DD)患儿的临床特征及基因型特点。方法回顾性分析32例2017年1月至2020年12月徐州医科大学附属医院儿科通过高通量二代测序技术基因检测阳性的不明原因的E-ID/DD患儿临床资料。结果 32例患儿中,男21例(65.6%),女11例(34.4%);癫痫首次发病年龄2日龄至11岁;E-ID/DD严重程度以中、重度为主(68.8%);呈药物难治性癫痫(46.9%)。28/32例为基因突变,4/32例为基因拷贝数(CNVs)变异,主要涉及动作电位形成、突触传递、转录调节、信号传导,等。本研究共检测出22个基因突变,包括10个离子通道相关基因(SCN1A、SCN2A、SCN8A、KCNQ2、KCNT1、CACNA1A、CLIC2、CLCN4、GRIN2A、ATP1A3),2个转录相关基因(ZMYND11、ATN1),3个突触相关基因(DLG3、DLG4、CNKSR2),2个细胞间相互作用基因(PCDH19、RELN),2个酶相关基因(PPP2R5D、CDK13),2个细胞功能相关基因(SHROOM4、CNNM2),1个蛋白激活相关基因(OPHN1)。结论 E-ID/DD临床表型呈多样性,离子通道基因变异最为常见;转录调控、细胞代谢、酶调节及细胞间相互作用等因素也可能参与E-ID/DD的共同发病机制。本研究发现了多个未报道致病性基因突变位点及CNVs变异,丰富了E-ID/DD患儿的基因型及表型。 展开更多
关键词 癫痫 智力障碍 发育迟缓 基因突变 全外显子测序
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儿童急性淋巴细胞白血病的代谢组学及外显子组学研究
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作者 王翔 徐煜皓 +1 位作者 孙宇 陆超 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第2期197-204,234,共9页
目的:探究儿童儿童急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)的基因改变及代谢产物的变化。方法:选取2021年9月—2022年5月首次在南京医科大学第一附属医院儿科就诊的初发且未经治疗的儿童ALL患儿4例为实验组,选取同期在... 目的:探究儿童儿童急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)的基因改变及代谢产物的变化。方法:选取2021年9月—2022年5月首次在南京医科大学第一附属医院儿科就诊的初发且未经治疗的儿童ALL患儿4例为实验组,选取同期在本院进行体检的正常儿童4例为对照组。留取临床资料,收集血清样本,利用液相色谱⁃质谱技术分析其血清代谢物水平,利用外显子测序技术分析基因变化。结果:代谢组学揭示了61种代谢物有差异变化,ALL中37种表达上升,表达量上升最显著的差异代谢物是对甲酚和脱氧胆酸等,24种表达下降,表达量下降最显著的差异代谢物是1⁃吡咯啉⁃5⁃羧酸和5⁃羟色胺等,外显子组学揭示了蛋白互作数量排名前10的基因有MUC17等。结论:ALL患儿与对照组血清的代谢物存在明显差异,涉及多种代谢通路改变,鉴定出的差异代谢物对ALL的诊断和治疗具有重要意义,外显子测序提示MUC17等基因可能对ALL的发生产生一定作用,可为研究ALL及临床用药提供新的思路和方法。 展开更多
关键词 急性淋巴细胞白血病 代谢组学 差异代谢物 外显子组学
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