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人eIF4A3真核表达载体构建及稳定表达细胞株筛选 被引量:2
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作者 李向云 徐祥 +2 位作者 李秉煦 黄宏 徐云升 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第18期1897-1899,共3页
目的构建人eIF4A3重组质粒载体,筛选高表达人eIF4A3的稳定细胞株。方法 RT-PCR克隆eIF4A3基因,将获得的基因片段分别连接到含有HA和c-myc标签的质粒载体上,转染HeLa细胞,经G418筛选获稳定表达细胞株,在体外翻译体系中进行体外翻译,通过... 目的构建人eIF4A3重组质粒载体,筛选高表达人eIF4A3的稳定细胞株。方法 RT-PCR克隆eIF4A3基因,将获得的基因片段分别连接到含有HA和c-myc标签的质粒载体上,转染HeLa细胞,经G418筛选获稳定表达细胞株,在体外翻译体系中进行体外翻译,通过免疫印迹鉴定eIF4A3的表达。结果成功构建人eIF4A3的真核表达载体,可在HeLa细胞中稳定表达,且能在体外翻译体系中翻译eIF4A3蛋白质。功能研究初步证明eIF4A3可以抑制荧光素酶报告基因的表达。结论获得了可稳定高表达人eIF4A3的HeLa细胞株及可用于体外翻译的真核表达载体。 展开更多
关键词 真核起始因子4A3 稳定细胞株 体外翻译
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ARID1A Inactivation Increases Expression of circ0008399 and Promotes Cisplatin Resistance in Bladder Cancer
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作者 Yang-kai JIANG Yu-jun SHUAI +7 位作者 Hua-min DING Hui ZHANG Chao HUANG Liang WANG Jia-yin SUN Wen-jie WEI Xing-yuan XIAO Guo-song JIANG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第3期560-571,共12页
Objective Cisplatin(CDDP)-based chemotherapy is a first-line,drug regimen for muscle-invasive bladder cancer(BC)and metastatic bladder cancer.Clinically,resistance to CDDP restricts the clinical benefit of some bladde... Objective Cisplatin(CDDP)-based chemotherapy is a first-line,drug regimen for muscle-invasive bladder cancer(BC)and metastatic bladder cancer.Clinically,resistance to CDDP restricts the clinical benefit of some bladder cancer patients.AT-rich interaction domain 1A(ARID1A)gene mutation occurs frequently in bladder cancer;however,the role of CDDP sensitivity in BC has not been studied.Methods We established ARID1A knockout BC cell lines using CRISPR/Cas9 technology.IC50 determination,flow cytometry analysis of apoptosis,and tumor xenograft assays were performed to verify changes in the CDDP sensitivity of BC cells losing ARID1A.qRT-PCR,Western blotting,RNA interference,bioinformatic analysis,and ChIP-qPCR analysis were performed to further explore the potential mechanism of ARID1A inactivation in CDDP sensitivity in BC.Results It was found that ARID1A inactivation was associated with CDDP resistance in BC cells.Mechanically,loss of ARID1A promoted the expression of eukaryotic translation initiation factor 4A3(EIF4A3)through epigenetic regulation.Increased expression of EIF4A3 promoted the expression of hsa_circ_0008399(circ0008399),a novel circular RNA(circRNA)identified in our previous study,which,to some extent,showed that ARID1A deletion caused CDDP resistance through the inhibitory effect of circ0008399 on the apoptosis of BC cells.Importantly,EIF4A3-IN-2 specifically inhibited the activity of EIF4A3 to reduce circ0008399 production and restored the sensitivity of ARID1A inactivated BC cells to CDDP.Conclusion Our research deepens the understanding of the mechanisms of CDDP resistance in BC and elucidates a potential strategy to improve the efficacy of CDDP in BC patients with ARID1A deletion through combination therapy targeting EIF4A3. 展开更多
关键词 AT-rich interaction domain 1A hsa_circ_0008399 eukaryotic translation initiation factor 4A3 cisplatin resistance bladder cancer
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EIF4A3 shRNA慢病毒载体的构建及其稳定转染细胞系的建立
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作者 何嘉文 李友 +1 位作者 廖科棋 李胜男 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期831-839,共9页
目的:构建真核细胞翻译起始因子4A3(EIF4A3)-短发夹RNA(shRNA)慢病毒载体,建立Neuro-2a-EIF4A3-shRNA稳定转染细胞系。方法:通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库检索EIF4A3基因序列,设计并合成PCR鉴定引物,并将其连接至经EcoRⅠ和... 目的:构建真核细胞翻译起始因子4A3(EIF4A3)-短发夹RNA(shRNA)慢病毒载体,建立Neuro-2a-EIF4A3-shRNA稳定转染细胞系。方法:通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库检索EIF4A3基因序列,设计并合成PCR鉴定引物,并将其连接至经EcoRⅠ和AgeⅠ酶切的慢病毒GV493载体,构建GV493-EIF4A3-shRNA慢病毒质粒,PCR筛选阳性克隆并测序鉴定。将GV493空载质粒和GV493-EIF4A3-shRNA重组质粒分别转染至HEK293T细胞中,分别为GV493对照慢病毒和GV493-EIF4A3-shRNA慢病毒,转染48 h后收集慢病毒进行包装并测定病毒滴度。将Neuro-2a细胞分为空白组、GV493对照组和GV493-EIF4A3 shRNA组,空白组不作处理,GV493对照组和GV493-EIF4A3 shRNA组分别采用相应慢病毒感染Neuro-2a细胞,慢病毒感染复数(MOI)为100,使用10 mg·L-1嘌呤霉素筛选成功感染慢病毒的Neuro-2a细胞,荧光显微镜观察各组Neuro-2a细胞的生长状态和绿色荧光表达情况;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法和Western blotting法检测各组Neuro-2a细胞中EIF4A3 mRNA及蛋白表达水平。结果:PCR测序结果显示GV493-EIF4A3-shRNA重组质粒基因序列与设计合成的EIF4A3-shRNA序列一致,成功构建GV493-EIF4A3慢病毒载体。荧光显微镜观察可见HEK293T细胞荧光表达强烈,生长状态良好,慢病毒包装成功。GV493-对照慢病毒和GV493-EIF4A3-shRNA慢病毒的滴度均为2×10~8 TU·mL^(-1),GV493对照组和GV493-EIF4A3 shRNA组Neuro-2a细胞生长状态良好且表达绿色荧光,表明慢病毒感染稳定细胞系构建成功。RT-qPCR法,与空白组和GV493对照组比较,GV493-EIF4A3shRNA组Neuro-2a细胞EIF4A3mRNA表达水平明显降低(P<0.01)。Western blotting法,各组在相对分子质量49000处出现特异性条带,提示Neuro-2a细胞中EIF4A3蛋白表达成功;与空白组和GV493对照组比较,GV493-EIF4A3 shRNA组Neuro-2a细胞中EIF4A3蛋白表达水平明显降低(P<0.01)。结论:成功构建GV493-EIF4A3-shRNA慢病毒载体,建立了Neuro-2a-EIF4A3-shRNA 展开更多
关键词 真核细胞翻译起始因子4A3 短发夹RNA 慢病毒 稳定转染细胞系 Neuro-2a细胞
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eIF4E3与肝细胞癌患者预后的关联性及其作用机制分析 被引量:1
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作者 祖玲 李万里 刘天奇 《中国临床新医学》 2023年第6期601-608,共8页
目的分析真核翻译起始因子4E家族成员3(eIF4E3)与肝细胞癌(HCC)患者预后的关联性及其作用机制。方法通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库、癌症基因集分析(GSCA)数据库、肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)以及UALCAN数据库分析eIF4E3在HCC... 目的分析真核翻译起始因子4E家族成员3(eIF4E3)与肝细胞癌(HCC)患者预后的关联性及其作用机制。方法通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库、癌症基因集分析(GSCA)数据库、肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)以及UALCAN数据库分析eIF4E3在HCC和正常肝组织中的表达差异。应用UALCAN数据库分析eIF4E3的转录水平与HCC患者临床病理特征的关系。应用GSCA数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析。应用Linked Omics数据库对eIF4E3的共表达基因进行探索,对其共表达基因作基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。通过肿瘤免疫相互作用数据库(TISIDB)和Sanger Box平台分析eIF4E3与肿瘤微环境中免疫浸润的关系。结果HCC组织中eIF4E3的表达水平显著低于正常肝组织(P<0.05)。在HCC患者中,eIF4E3低表达组的总生存期(OS)、无病生存期(DFS)、无病进展生存期(PFS)和无疾病间隔(DFI)均较eIF4E3高表达组显著缩短(P<0.05)。功能富集分析结果显示,eIF4E3的功能主要富集于细胞黏附、细胞周期以及免疫反应(P<0.05)。eIF4E3表达水平与初始CD4+T细胞、静息自然杀伤(NK)细胞、单核细胞、静息肥大细胞及嗜酸性粒细胞的浸润丰度呈显著负相关(P<0.05),与静息CD4记忆T细胞、活化CD4记忆T细胞、M1巨噬细胞、活化树突状细胞、静息树突状细胞及中性粒细胞浸润丰度呈正相关(P<0.05)。结论eIF4E3是一种潜在的抑癌基因,可能通过影响HCC肿瘤微环境的免疫浸润状态来影响患者预后,有作为HCC免疫治疗靶点的应用前景。 展开更多
关键词 真核翻译起始因子4E家族成员3 预后 免疫浸润 肝细胞癌 肿瘤微环境
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