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不同绵羊品种发情期卵巢组织lncRNA和mRNA的差异表达分析
被引量:
2
1
作者
杨帆
姚晓磊
+5 位作者
李康
李晓丹
唐轮
尤佩华
蔡庆贤
王锋
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1142-1152,共11页
[目的]本文旨在探究不同绵羊品种发情期卵巢组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,筛选绵羊繁殖力相关的分子标记。[方法]根据羊场生产记录,挑选2~3岁体型、生理状态相似的空怀蒙古...
[目的]本文旨在探究不同绵羊品种发情期卵巢组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,筛选绵羊繁殖力相关的分子标记。[方法]根据羊场生产记录,挑选2~3岁体型、生理状态相似的空怀蒙古羊(Mon)和湖羊(HBB)各4只,对其进行同期发情处理,发情时密集采血3 h(每次隔12 min),检测血清中促卵泡刺激素(FSH)和促黄体生成素(LH)含量;各组随机挑选3只屠宰,采集卵巢组织用于转录组测序(RNA-seq);从NCBI数据库中下载小尾寒羊(HanBB)和陶赛特羊(Dorset)发情期卵巢RNA-seq数据,整合分析不同绵羊品种卵巢中lncRNA和mRNA的表达特征。[结果]湖羊血清中FSH和LH含量均显著高于蒙古羊(P<0.05);RNA-seq共鉴定到87 874个lncRNA转录本;在5个差异分组均获得一定数量的差异lncRNA和mRNA,并从中筛选与繁殖相关的共有和特有lncRNA和mRNA,去除新基因后,分别构建mRNA-mRNA和lncRNA-mRNA互作网络;筛选到MMP2、CHAD、HOXA10、GNB2、COL4A1、ACTB、COL6A3、CREB3L2和LOC101115805等与繁殖相关的共有差异基因;与繁殖相关的共有差异lncRNA主要注释到受精、卵母细胞成熟和配子发生等条目,富集于PI3K-Akt和Wnt等信号通路;关键基因MMP2(matrix metalloproteinases 2)在蒙古羊和湖羊全身组织中表达趋势一致,均在卵巢组织中高表达,且在湖羊垂体、卵巢和子宫组织中均检测到MMP2蛋白阳性信号。[结论]本研究绘制了湖羊和蒙古羊卵巢组织中差异lncRNA和mRNA表达图谱,筛选到与繁殖相关的lncRNA和mRNA,为绵羊繁殖调控及育种分子标记奠定基础。关键基因MMP2可能通过生殖轴调控绵羊的繁殖性能。
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关键词
lncRNA
绵羊
发情期
繁殖性状
卵巢
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题名
不同绵羊品种发情期卵巢组织lncRNA和mRNA的差异表达分析
被引量:
2
1
作者
杨帆
姚晓磊
李康
李晓丹
唐轮
尤佩华
蔡庆贤
王锋
机构
南京农业大学动物科技学院
广西大化瑶族自治县畜牧管理站
江苏波杜农牧股份有限公司
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1142-1152,共11页
基金
国家自然科学基金项目(32002174,32072728)。
文摘
[目的]本文旨在探究不同绵羊品种发情期卵巢组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,筛选绵羊繁殖力相关的分子标记。[方法]根据羊场生产记录,挑选2~3岁体型、生理状态相似的空怀蒙古羊(Mon)和湖羊(HBB)各4只,对其进行同期发情处理,发情时密集采血3 h(每次隔12 min),检测血清中促卵泡刺激素(FSH)和促黄体生成素(LH)含量;各组随机挑选3只屠宰,采集卵巢组织用于转录组测序(RNA-seq);从NCBI数据库中下载小尾寒羊(HanBB)和陶赛特羊(Dorset)发情期卵巢RNA-seq数据,整合分析不同绵羊品种卵巢中lncRNA和mRNA的表达特征。[结果]湖羊血清中FSH和LH含量均显著高于蒙古羊(P<0.05);RNA-seq共鉴定到87 874个lncRNA转录本;在5个差异分组均获得一定数量的差异lncRNA和mRNA,并从中筛选与繁殖相关的共有和特有lncRNA和mRNA,去除新基因后,分别构建mRNA-mRNA和lncRNA-mRNA互作网络;筛选到MMP2、CHAD、HOXA10、GNB2、COL4A1、ACTB、COL6A3、CREB3L2和LOC101115805等与繁殖相关的共有差异基因;与繁殖相关的共有差异lncRNA主要注释到受精、卵母细胞成熟和配子发生等条目,富集于PI3K-Akt和Wnt等信号通路;关键基因MMP2(matrix metalloproteinases 2)在蒙古羊和湖羊全身组织中表达趋势一致,均在卵巢组织中高表达,且在湖羊垂体、卵巢和子宫组织中均检测到MMP2蛋白阳性信号。[结论]本研究绘制了湖羊和蒙古羊卵巢组织中差异lncRNA和mRNA表达图谱,筛选到与繁殖相关的lncRNA和mRNA,为绵羊繁殖调控及育种分子标记奠定基础。关键基因MMP2可能通过生殖轴调控绵羊的繁殖性能。
关键词
lncRNA
绵羊
发情期
繁殖性状
卵巢
Keywords
lncRNA
sheep
esturs
reproductive traits
ovary
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同绵羊品种发情期卵巢组织lncRNA和mRNA的差异表达分析
杨帆
姚晓磊
李康
李晓丹
唐轮
尤佩华
蔡庆贤
王锋
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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职称材料
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